MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017566	GAT	2	6	333185	333190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312101
5002	NC_017566	AGA	2	6	333203	333208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312101
5003	NC_017566	GGT	2	6	333272	333277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312101
5004	NC_017566	GTT	2	6	333377	333382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312101
5005	NC_017566	CTG	2	6	333432	333437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312101
5006	NC_017566	GCTG	2	8	333499	333506	0 %	25 %	50 %	25 %	386312101
5007	NC_017566	CAAAG	2	10	333567	333576	60 %	0 %	20 %	20 %	386312101
5008	NC_017566	CAG	2	6	333627	333632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312101
5009	NC_017566	AAG	2	6	333652	333657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312101
5010	NC_017566	CAA	2	6	333669	333674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312101
5011	NC_017566	TTG	2	6	333687	333692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312101
5012	NC_017566	ACC	2	6	333740	333745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312101
5013	NC_017566	CAAG	2	8	333746	333753	50 %	0 %	25 %	25 %	386312101
5014	NC_017566	GTA	2	6	333825	333830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312101
5015	NC_017566	CAA	2	6	334081	334086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312102
5016	NC_017566	AACTC	2	10	334108	334117	40 %	20 %	0 %	40 %	386312102
5017	NC_017566	TTG	2	6	334163	334168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312102
5018	NC_017566	CTT	2	6	334216	334221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312102
5019	NC_017566	CAG	2	6	334226	334231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312102
5020	NC_017566	CATC	2	8	334267	334274	25 %	25 %	0 %	50 %	386312102
5021	NC_017566	CGT	2	6	334297	334302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312102
5022	NC_017566	CTTAC	2	10	334386	334395	20 %	40 %	0 %	40 %	386312102
5023	NC_017566	AAT	2	6	334445	334450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312102
5024	NC_017566	TGC	2	6	334455	334460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312102
5025	NC_017566	ATT	3	9	334481	334489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312102
5026	NC_017566	TGT	2	6	334509	334514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312102
5027	NC_017566	ACG	2	6	334554	334559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312102
5028	NC_017566	GTTT	2	8	334601	334608	0 %	75 %	25 %	0 %	386312102
5029	NC_017566	GTT	2	6	334614	334619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312102
5030	NC_017566	GTT	2	6	334623	334628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312102
5031	NC_017566	TCT	2	6	334638	334643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312102
5032	NC_017566	GAT	2	6	334677	334682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312102
5033	NC_017566	GTA	2	6	334745	334750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312102
5034	NC_017566	ATA	2	6	334751	334756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312102
5035	NC_017566	TCC	2	6	334757	334762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386312102
5036	NC_017566	ACG	2	6	334776	334781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312102
5037	NC_017566	TGC	2	6	334810	334815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312102
5038	NC_017566	AGA	2	6	334817	334822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312102
5039	NC_017566	CTGT	2	8	335065	335072	0 %	50 %	25 %	25 %	386312103
5040	NC_017566	AAT	2	6	335089	335094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312103
5041	NC_017566	TG	3	6	335148	335153	0 %	50 %	50 %	0 %	386312103
5042	NC_017566	ATG	2	6	335264	335269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312103
5043	NC_017566	CAT	2	6	335274	335279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312103
5044	NC_017566	AC	3	6	335343	335348	50 %	0 %	0 %	50 %	386312103
5045	NC_017566	CGAC	2	8	335369	335376	25 %	0 %	25 %	50 %	386312103
5046	NC_017566	GAT	2	6	335428	335433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312103
5047	NC_017566	TGCC	2	8	335502	335509	0 %	25 %	25 %	50 %	386312103
5048	NC_017566	TTC	2	6	335599	335604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312103
5049	NC_017566	CGG	2	6	335616	335621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312103
5050	NC_017566	AC	3	6	335659	335664	50 %	0 %	0 %	50 %	386312103
5051	NC_017566	TGA	2	6	335688	335693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312103
5052	NC_017566	CGG	2	6	335726	335731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312103
5053	NC_017566	TGC	2	6	335930	335935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312103
5054	NC_017566	ATA	2	6	335942	335947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312103
5055	NC_017566	TGC	2	6	335975	335980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312103
5056	NC_017566	GCCTT	2	10	336053	336062	0 %	40 %	20 %	40 %	386312103
5057	NC_017566	TAA	2	6	336142	336147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312103
5058	NC_017566	CAT	2	6	336160	336165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312103
5059	NC_017566	GCC	2	6	336200	336205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312103
5060	NC_017566	CGC	2	6	336208	336213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312103
5061	NC_017566	CAT	2	6	336256	336261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312103
5062	NC_017566	TTC	2	6	336445	336450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312103
5063	NC_017566	GA	3	6	336501	336506	50 %	0 %	50 %	0 %	386312103
5064	NC_017566	AGG	2	6	336514	336519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312103
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5068	NC_017566	ATC	2	6	336791	336796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312103
5069	NC_017566	AAG	2	6	336839	336844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312103
5070	NC_017566	TCG	2	6	336866	336871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312103
5071	NC_017566	GAT	2	6	336907	336912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312103
5072	NC_017566	GGC	2	6	336964	336969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312103
5073	NC_017566	CAG	2	6	337018	337023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312103
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5075	NC_017566	TGC	2	6	337115	337120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312103
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5091	NC_017566	GACC	2	8	338417	338424	25 %	0 %	25 %	50 %	386312105
5092	NC_017566	GCA	2	6	338495	338500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312105
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5101	NC_017566	TTTG	2	8	338993	339000	0 %	75 %	25 %	0 %	386312105
5102	NC_017566	GAT	2	6	339041	339046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312105
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5105	NC_017566	TGTA	2	8	339175	339182	25 %	50 %	25 %	0 %	386312105
5106	NC_017566	TGC	2	6	339215	339220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312105
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5108	NC_017566	TGC	2	6	339252	339257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312105
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5110	NC_017566	ATT	2	6	339396	339401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312105
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5118	NC_017566	A	7	7	339860	339866	100 %	0 %	0 %	0 %	386312106
5119	NC_017566	AAC	2	6	339915	339920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312106
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5121	NC_017566	A	6	6	339957	339962	100 %	0 %	0 %	0 %	386312106
5122	NC_017566	GTC	2	6	340013	340018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312106
5123	NC_017566	ATC	2	6	340020	340025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312106
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5125	NC_017566	TAA	2	6	340395	340400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312107
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5130	NC_017566	GT	3	6	340799	340804	0 %	50 %	50 %	0 %	386312108
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5235	NC_017566	CGG	2	6	348814	348819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312116
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5241	NC_017566	CGC	2	6	349177	349182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312116
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5362	NC_017566	TCG	2	6	356009	356014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312124
5363	NC_017566	TTGA	2	8	356194	356201	25 %	50 %	25 %	0 %	386312124
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5488	NC_017566	TCAA	2	8	363759	363766	50 %	25 %	0 %	25 %	386312130
5489	NC_017566	GATG	2	8	363815	363822	25 %	25 %	50 %	0 %	386312130
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