MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 29921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	T	8	8	203	210	0 %	100 %	0 %	0 %	386085706
2	NC_017563	AGA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085706
3	NC_017563	ATT	2	6	262	267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085706
4	NC_017563	TCA	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085706
5	NC_017563	GAA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085706
6	NC_017563	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085706
7	NC_017563	AAC	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085706
8	NC_017563	AGTA	2	8	534	541	50 %	25 %	25 %	0 %	386085706
9	NC_017563	AGC	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085706
10	NC_017563	TAGCTG	2	12	598	609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386085706
11	NC_017563	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085706
12	NC_017563	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085706
13	NC_017563	GTTT	2	8	761	768	0 %	75 %	25 %	0 %	386085706
14	NC_017563	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085706
15	NC_017563	ATA	3	9	916	924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085706
16	NC_017563	TGAA	2	8	964	971	50 %	25 %	25 %	0 %	386085706
17	NC_017563	GGA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085706
18	NC_017563	TGCT	2	8	1489	1496	0 %	50 %	25 %	25 %	386085706
19	NC_017563	TAA	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085707
20	NC_017563	A	6	6	1776	1781	100 %	0 %	0 %	0 %	386085707
21	NC_017563	AGA	2	6	1887	1892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085707
22	NC_017563	ATTA	2	8	1905	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	386085707
23	NC_017563	GTA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085707
24	NC_017563	T	6	6	1944	1949	0 %	100 %	0 %	0 %	386085707
25	NC_017563	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085707
26	NC_017563	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085707
27	NC_017563	AAAGG	2	10	2050	2059	60 %	0 %	40 %	0 %	386085707
28	NC_017563	AAG	2	6	2084	2089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085707
29	NC_017563	GCA	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085707
30	NC_017563	GTC	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085707
31	NC_017563	GTA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085707
32	NC_017563	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085707
33	NC_017563	TCT	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085707
34	NC_017563	CAAAT	2	10	2387	2396	60 %	20 %	0 %	20 %	386085707
35	NC_017563	AC	3	6	2426	2431	50 %	0 %	0 %	50 %	386085707
36	NC_017563	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085707
37	NC_017563	TGAA	2	8	2636	2643	50 %	25 %	25 %	0 %	386085707
38	NC_017563	TGATT	2	10	2673	2682	20 %	60 %	20 %	0 %	386085707
39	NC_017563	ACTT	2	8	2698	2705	25 %	50 %	0 %	25 %	386085707
40	NC_017563	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085707
41	NC_017563	AATT	2	8	2813	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	386085707
42	NC_017563	GAA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085708
43	NC_017563	A	7	7	2957	2963	100 %	0 %	0 %	0 %	386085708
44	NC_017563	ATG	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085708
45	NC_017563	GTC	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085708
46	NC_017563	AAG	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085708
47	NC_017563	AAAT	3	12	3286	3297	75 %	25 %	0 %	0 %	386085709
48	NC_017563	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085709
49	NC_017563	GCT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085709
50	NC_017563	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085709
51	NC_017563	TCGT	2	8	3603	3610	0 %	50 %	25 %	25 %	386085709
52	NC_017563	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
53	NC_017563	AAAGAT	2	12	3770	3781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386085709
54	NC_017563	TTC	2	6	3801	3806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085709
55	NC_017563	AGA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
56	NC_017563	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
57	NC_017563	A	6	6	3873	3878	100 %	0 %	0 %	0 %	386085709
58	NC_017563	ACA	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085709
59	NC_017563	TGA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
60	NC_017563	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
61	NC_017563	AGT	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
62	NC_017563	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
63	NC_017563	GAT	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
64	NC_017563	GCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085709
65	NC_017563	AGC	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085709
66	NC_017563	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
67	NC_017563	GAA	2	6	4349	4354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
68	NC_017563	TGT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085709
69	NC_017563	CAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085709
70	NC_017563	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085710
71	NC_017563	TAG	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085710
72	NC_017563	CAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085710
73	NC_017563	ATCT	2	8	4686	4693	25 %	50 %	0 %	25 %	386085710
74	NC_017563	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085710
75	NC_017563	GGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085710
76	NC_017563	GAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085710
77	NC_017563	CAG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085710
78	NC_017563	TACT	2	8	4965	4972	25 %	50 %	0 %	25 %	386085710
79	NC_017563	ACT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085710
80	NC_017563	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085711
81	NC_017563	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
82	NC_017563	TAG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
83	NC_017563	T	7	7	5288	5294	0 %	100 %	0 %	0 %	386085711
84	NC_017563	GAT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
85	NC_017563	GCT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
86	NC_017563	A	6	6	5338	5343	100 %	0 %	0 %	0 %	386085711
87	NC_017563	GGAA	2	8	5482	5489	50 %	0 %	50 %	0 %	386085711
88	NC_017563	G	6	6	5578	5583	0 %	0 %	100 %	0 %	386085711
89	NC_017563	T	6	6	5634	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	386085711
90	NC_017563	GAGAT	2	10	5641	5650	40 %	20 %	40 %	0 %	386085711
91	NC_017563	TGT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
92	NC_017563	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085711
93	NC_017563	AGA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085711
94	NC_017563	TC	3	6	5883	5888	0 %	50 %	0 %	50 %	386085711
95	NC_017563	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
96	NC_017563	TCA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
97	NC_017563	ACT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
98	NC_017563	CAGC	2	8	6090	6097	25 %	0 %	25 %	50 %	386085711
99	NC_017563	CTT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085711
100	NC_017563	CA	3	6	6161	6166	50 %	0 %	0 %	50 %	386085711
101	NC_017563	TCG	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
102	NC_017563	TAG	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
103	NC_017563	GTT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
104	NC_017563	A	6	6	6444	6449	100 %	0 %	0 %	0 %	386085711
105	NC_017563	CGT	2	6	6456	6461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
106	NC_017563	TGT	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
107	NC_017563	ACT	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
108	NC_017563	TGC	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
109	NC_017563	TC	3	6	6668	6673	0 %	50 %	0 %	50 %	386085711
110	NC_017563	TAA	2	6	6710	6715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085711
111	NC_017563	ATG	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
112	NC_017563	CAAA	2	8	6743	6750	75 %	0 %	0 %	25 %	386085711
113	NC_017563	AAGC	2	8	6755	6762	50 %	0 %	25 %	25 %	386085711
114	NC_017563	GAT	3	9	6840	6848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
115	NC_017563	TTGG	2	8	6960	6967	0 %	50 %	50 %	0 %	386085711
116	NC_017563	TGC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
117	NC_017563	ATG	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
118	NC_017563	A	6	6	7149	7154	100 %	0 %	0 %	0 %	386085711
119	NC_017563	ATT	3	9	7200	7208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085711
120	NC_017563	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
121	NC_017563	TGA	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
122	NC_017563	AAC	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085711
123	NC_017563	ATT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085711
124	NC_017563	TTATG	2	10	7448	7457	20 %	60 %	20 %	0 %	386085711
125	NC_017563	T	6	6	7519	7524	0 %	100 %	0 %	0 %	386085711
126	NC_017563	CT	3	6	7642	7647	0 %	50 %	0 %	50 %	386085711
127	NC_017563	T	6	6	7652	7657	0 %	100 %	0 %	0 %	386085711
128	NC_017563	GTA	2	6	7798	7803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
129	NC_017563	TGCCTA	2	12	7811	7822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386085711
130	NC_017563	ATC	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
131	NC_017563	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
132	NC_017563	CCTT	2	8	8105	8112	0 %	50 %	0 %	50 %	386085711
133	NC_017563	A	6	6	8137	8142	100 %	0 %	0 %	0 %	386085711
134	NC_017563	TTGA	2	8	8208	8215	25 %	50 %	25 %	0 %	386085711
135	NC_017563	TGC	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
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141	NC_017563	A	6	6	8523	8528	100 %	0 %	0 %	0 %	386085711
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259	NC_017563	AACC	2	8	13676	13683	50 %	0 %	0 %	50 %	386085718
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263	NC_017563	GCT	2	6	13890	13895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085718
264	NC_017563	ACG	2	6	13907	13912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085718
265	NC_017563	TGA	2	6	13943	13948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085718
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267	NC_017563	GTT	2	6	14016	14021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085718
268	NC_017563	TTG	2	6	14047	14052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085718
269	NC_017563	CT	3	6	14061	14066	0 %	50 %	0 %	50 %	386085718
270	NC_017563	AGA	2	6	14141	14146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085718
271	NC_017563	TGT	2	6	14152	14157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085718
272	NC_017563	GGA	2	6	14199	14204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085718
273	NC_017563	AGA	2	6	14213	14218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085718
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283	NC_017563	GTTG	2	8	15096	15103	0 %	50 %	50 %	0 %	386085719
284	NC_017563	A	6	6	15286	15291	100 %	0 %	0 %	0 %	386085719
285	NC_017563	GTA	2	6	15308	15313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085719
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287	NC_017563	TCTT	2	8	15427	15434	0 %	75 %	0 %	25 %	386085719
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293	NC_017563	AT	3	6	16165	16170	50 %	50 %	0 %	0 %	386085720
294	NC_017563	GATT	2	8	16176	16183	25 %	50 %	25 %	0 %	386085720
295	NC_017563	TGAT	2	8	16254	16261	25 %	50 %	25 %	0 %	386085720
296	NC_017563	CAA	2	6	16286	16291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085720
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