MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 plasmid p11819-97

Total Repeats: 385

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017350	TAG	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
2	NC_017350	A	7	7	314	320	100 %	0 %	0 %	0 %	385782933
3	NC_017350	GAAA	2	8	342	349	75 %	0 %	25 %	0 %	385782933
4	NC_017350	TAAT	2	8	359	366	50 %	50 %	0 %	0 %	385782933
5	NC_017350	TAA	4	12	467	478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
6	NC_017350	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
7	NC_017350	TA	3	6	529	534	50 %	50 %	0 %	0 %	385782933
8	NC_017350	ATA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
9	NC_017350	ATT	2	6	550	555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782933
10	NC_017350	AGT	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
11	NC_017350	TAA	2	6	579	584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782933
12	NC_017350	CAT	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782933
13	NC_017350	AAAT	2	8	722	729	75 %	25 %	0 %	0 %	385782933
14	NC_017350	TTA	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782933
15	NC_017350	AGT	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
16	NC_017350	ATG	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782933
17	NC_017350	TGCTTT	2	12	835	846	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385782933
18	NC_017350	T	6	6	844	849	0 %	100 %	0 %	0 %	385782933
19	NC_017350	TA	3	6	1403	1408	50 %	50 %	0 %	0 %	385782934
20	NC_017350	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782934
21	NC_017350	CAAA	2	8	1538	1545	75 %	0 %	0 %	25 %	385782934
22	NC_017350	TAA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782934
23	NC_017350	GTA	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782934
24	NC_017350	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	385782934
25	NC_017350	GAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782934
26	NC_017350	AT	3	6	1725	1730	50 %	50 %	0 %	0 %	385782934
27	NC_017350	AT	3	6	1732	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	385782934
28	NC_017350	A	8	8	1745	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	385782934
29	NC_017350	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782934
30	NC_017350	ATT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782934
31	NC_017350	A	7	7	1881	1887	100 %	0 %	0 %	0 %	385782934
32	NC_017350	TA	3	6	1894	1899	50 %	50 %	0 %	0 %	385782934
33	NC_017350	CATT	2	8	1911	1918	25 %	50 %	0 %	25 %	385782934
34	NC_017350	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782934
35	NC_017350	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
36	NC_017350	GTA	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
37	NC_017350	ATG	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
38	NC_017350	GAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782935
39	NC_017350	GAA	3	9	2430	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782935
40	NC_017350	GGA	2	6	2517	2522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385782935
41	NC_017350	TGT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782935
42	NC_017350	ACA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385782935
43	NC_017350	A	6	6	2575	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	385782935
44	NC_017350	ATG	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782936
45	NC_017350	TA	3	6	2691	2696	50 %	50 %	0 %	0 %	385782936
46	NC_017350	TCTT	2	8	2760	2767	0 %	75 %	0 %	25 %	385782936
47	NC_017350	GTTTAA	2	12	2835	2846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385782936
48	NC_017350	ATT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782936
49	NC_017350	TGC	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385782936
50	NC_017350	ATGT	2	8	2994	3001	25 %	50 %	25 %	0 %	385782936
51	NC_017350	TCA	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782936
52	NC_017350	TAA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782936
53	NC_017350	T	6	6	3088	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	385782936
54	NC_017350	TTC	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782936
55	NC_017350	ATG	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782936
56	NC_017350	AT	3	6	3198	3203	50 %	50 %	0 %	0 %	385782936
57	NC_017350	TAG	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782936
58	NC_017350	CAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782937
59	NC_017350	TTAA	2	8	3579	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	385782937
60	NC_017350	TAT	2	6	3601	3606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782937
61	NC_017350	T	6	6	3629	3634	0 %	100 %	0 %	0 %	385782937
62	NC_017350	TTTA	2	8	3668	3675	25 %	75 %	0 %	0 %	385782937
63	NC_017350	AGC	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385782937
64	NC_017350	T	6	6	3710	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	385782937
65	NC_017350	TAATT	2	10	3732	3741	40 %	60 %	0 %	0 %	385782937
66	NC_017350	GTT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782937
67	NC_017350	T	6	6	3803	3808	0 %	100 %	0 %	0 %	385782937
68	NC_017350	TAT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782937
69	NC_017350	ATC	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782937
70	NC_017350	T	7	7	3961	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	385782937
71	NC_017350	TTA	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782937
72	NC_017350	T	8	8	4118	4125	0 %	100 %	0 %	0 %	385782937
73	NC_017350	GCAATT	2	12	4185	4196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385782937
74	NC_017350	TAA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
75	NC_017350	GTA	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782938
76	NC_017350	T	6	6	4383	4388	0 %	100 %	0 %	0 %	385782938
77	NC_017350	TA	3	6	4392	4397	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
78	NC_017350	TGCT	2	8	4450	4457	0 %	50 %	25 %	25 %	385782938
79	NC_017350	TAA	2	6	4502	4507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
80	NC_017350	AAT	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
81	NC_017350	CATAA	2	10	4557	4566	60 %	20 %	0 %	20 %	385782938
82	NC_017350	ACC	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385782938
83	NC_017350	ATA	2	6	4630	4635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
84	NC_017350	TTA	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
85	NC_017350	TTA	2	6	4695	4700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
86	NC_017350	A	7	7	4747	4753	100 %	0 %	0 %	0 %	385782938
87	NC_017350	GATAC	2	10	4761	4770	40 %	20 %	20 %	20 %	385782938
88	NC_017350	A	8	8	4788	4795	100 %	0 %	0 %	0 %	385782938
89	NC_017350	AT	3	6	4853	4858	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
90	NC_017350	AT	3	6	4910	4915	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
91	NC_017350	TCT	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782938
92	NC_017350	AAAG	2	8	5023	5030	75 %	0 %	25 %	0 %	385782938
93	NC_017350	TAA	2	6	5072	5077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
94	NC_017350	TAT	2	6	5114	5119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
95	NC_017350	T	6	6	5142	5147	0 %	100 %	0 %	0 %	385782938
96	NC_017350	AT	3	6	5155	5160	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
97	NC_017350	CATT	2	8	5166	5173	25 %	50 %	0 %	25 %	385782938
98	NC_017350	AGA	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782938
99	NC_017350	TTAA	2	8	5205	5212	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
100	NC_017350	AAG	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782938
101	NC_017350	A	6	6	5232	5237	100 %	0 %	0 %	0 %	385782938
102	NC_017350	AATT	2	8	5245	5252	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
103	NC_017350	T	6	6	5276	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	385782938
104	NC_017350	ATTATA	2	12	5329	5340	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
105	NC_017350	GAA	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782938
106	NC_017350	AAAG	2	8	5457	5464	75 %	0 %	25 %	0 %	385782938
107	NC_017350	ATTT	2	8	5499	5506	25 %	75 %	0 %	0 %	385782938
108	NC_017350	CAT	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782938
109	NC_017350	CTCAA	2	10	5689	5698	40 %	20 %	0 %	40 %	385782938
110	NC_017350	AATTA	2	10	5701	5710	60 %	40 %	0 %	0 %	385782938
111	NC_017350	TGGA	2	8	5745	5752	25 %	25 %	50 %	0 %	385782938
112	NC_017350	ATG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385782938
113	NC_017350	A	6	6	5829	5834	100 %	0 %	0 %	0 %	385782938
114	NC_017350	TCT	2	6	5850	5855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782938
115	NC_017350	ATT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
116	NC_017350	ACAGGT	2	12	5901	5912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385782938
117	NC_017350	TAA	2	6	5930	5935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782938
118	NC_017350	GGT	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385782938
119	NC_017350	TAT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782938
120	NC_017350	A	6	6	6040	6045	100 %	0 %	0 %	0 %	385782938
121	NC_017350	AATAT	2	10	6118	6127	60 %	40 %	0 %	0 %	385782939
122	NC_017350	A	6	6	6133	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	385782939
123	NC_017350	AAG	2	6	6182	6187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
124	NC_017350	TA	3	6	6224	6229	50 %	50 %	0 %	0 %	385782939
125	NC_017350	A	6	6	6229	6234	100 %	0 %	0 %	0 %	385782939
126	NC_017350	ATTT	2	8	6265	6272	25 %	75 %	0 %	0 %	385782939
127	NC_017350	TCA	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782939
128	NC_017350	AGA	2	6	6291	6296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
129	NC_017350	TAA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782939
130	NC_017350	GAA	2	6	6385	6390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
131	NC_017350	GAA	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782939
132	NC_017350	AAATTT	2	12	6752	6763	50 %	50 %	0 %	0 %	385782940
133	NC_017350	TTG	2	6	6886	6891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782940
134	NC_017350	TAGA	2	8	6901	6908	50 %	25 %	25 %	0 %	385782940
135	NC_017350	TAA	2	6	6953	6958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782940
136	NC_017350	AGA	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782940
137	NC_017350	GCA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385782940
138	NC_017350	TTC	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385782940
139	NC_017350	GTC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385782940
140	NC_017350	TAAA	2	8	7147	7154	75 %	25 %	0 %	0 %	385782940
141	NC_017350	AAT	2	6	7266	7271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782940
142	NC_017350	ATAA	2	8	7285	7292	75 %	25 %	0 %	0 %	385782940
143	NC_017350	TTG	2	6	7422	7427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782941
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146	NC_017350	AAG	2	6	7557	7562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782941
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152	NC_017350	ATC	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782941
153	NC_017350	AAGA	2	8	7785	7792	75 %	0 %	25 %	0 %	385782941
154	NC_017350	GAAA	2	8	7834	7841	75 %	0 %	25 %	0 %	385782941
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162	NC_017350	TTAC	2	8	8437	8444	25 %	50 %	0 %	25 %	385782942
163	NC_017350	TG	3	6	8467	8472	0 %	50 %	50 %	0 %	385782942
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171	NC_017350	GAA	3	9	8686	8694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
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173	NC_017350	AGA	2	6	8943	8948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782943
174	NC_017350	A	6	6	8965	8970	100 %	0 %	0 %	0 %	385782943
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179	NC_017350	TTG	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385782943
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250	NC_017350	ATC	2	6	13832	13837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385782947
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254	NC_017350	ACA	2	6	13983	13988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385782947
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257	NC_017350	TAA	2	6	14197	14202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385782947
258	NC_017350	CAAA	2	8	14215	14222	75 %	0 %	0 %	25 %	385782947
259	NC_017350	ATT	2	6	14249	14254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385782947
260	NC_017350	AAC	2	6	14299	14304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385782947
261	NC_017350	AT	3	6	14350	14355	50 %	50 %	0 %	0 %	385782947
262	NC_017350	AT	3	6	14648	14653	50 %	50 %	0 %	0 %	385782948
263	NC_017350	CTG	2	6	14744	14749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385782948
264	NC_017350	TG	4	8	14748	14755	0 %	50 %	50 %	0 %	385782948
265	NC_017350	TACT	2	8	14882	14889	25 %	50 %	0 %	25 %	385782948
266	NC_017350	GAA	2	6	15207	15212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385782949
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.