MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017342	TA	3	6	216608	216613	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
4002	NC_017342	CAT	2	6	216635	216640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4003	NC_017342	T	6	6	216644	216649	0 %	100 %	0 %	0 %	384866099
4004	NC_017342	GAA	2	6	216682	216687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866099
4005	NC_017342	ACTA	2	8	216702	216709	50 %	25 %	0 %	25 %	384866099
4006	NC_017342	TTC	2	6	216750	216755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4007	NC_017342	ATGA	2	8	216756	216763	50 %	25 %	25 %	0 %	384866099
4008	NC_017342	T	6	6	216764	216769	0 %	100 %	0 %	0 %	384866099
4009	NC_017342	CAT	2	6	216816	216821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4010	NC_017342	TG	3	6	216940	216945	0 %	50 %	50 %	0 %	384866099
4011	NC_017342	ATC	2	6	216951	216956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4012	NC_017342	T	6	6	216993	216998	0 %	100 %	0 %	0 %	384866099
4013	NC_017342	AAT	2	6	217008	217013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4014	NC_017342	CTTGAT	2	12	217093	217104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866099
4015	NC_017342	ATG	2	6	217114	217119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866099
4016	NC_017342	CAT	2	6	217158	217163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4017	NC_017342	TTC	2	6	217164	217169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4018	NC_017342	TTC	2	6	217173	217178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4019	NC_017342	GAATT	2	10	217235	217244	40 %	40 %	20 %	0 %	384866099
4020	NC_017342	TAT	2	6	217256	217261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
4021	NC_017342	ACT	2	6	217276	217281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4022	NC_017342	CT	4	8	217280	217287	0 %	50 %	0 %	50 %	384866099
4023	NC_017342	ATA	2	6	217315	217320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4024	NC_017342	TCT	2	6	217354	217359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4025	NC_017342	TGT	2	6	217487	217492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866099
4026	NC_017342	GTT	2	6	217501	217506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866099
4027	NC_017342	T	6	6	217548	217553	0 %	100 %	0 %	0 %	384866099
4028	NC_017342	TTC	2	6	217584	217589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4029	NC_017342	CTT	2	6	217622	217627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4030	NC_017342	CAT	2	6	217631	217636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4031	NC_017342	CTA	2	6	217664	217669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4032	NC_017342	TCT	2	6	217672	217677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4033	NC_017342	TGG	2	6	217698	217703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866099
4034	NC_017342	CTT	2	6	217721	217726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4035	NC_017342	TCTTCA	2	12	217801	217812	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384866099
4036	NC_017342	TTG	2	6	217828	217833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866099
4037	NC_017342	CAC	2	6	217919	217924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866099
4038	NC_017342	AAT	2	6	217939	217944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4039	NC_017342	ATT	2	6	217956	217961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
4040	NC_017342	GTAAT	2	10	217988	217997	40 %	40 %	20 %	0 %	384866099
4041	NC_017342	CTG	2	6	218000	218005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866099
4042	NC_017342	TGTCT	2	10	218033	218042	0 %	60 %	20 %	20 %	384866099
4043	NC_017342	AATTTA	2	12	218062	218073	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
4044	NC_017342	TCA	2	6	218092	218097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4045	NC_017342	ACA	2	6	218098	218103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866099
4046	NC_017342	AACG	2	8	218143	218150	50 %	0 %	25 %	25 %	384866099
4047	NC_017342	GTT	2	6	218192	218197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866099
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4049	NC_017342	CTT	2	6	218264	218269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4050	NC_017342	CAT	2	6	218303	218308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4051	NC_017342	TGAT	2	8	218348	218355	25 %	50 %	25 %	0 %	384866099
4052	NC_017342	TCAA	2	8	218455	218462	50 %	25 %	0 %	25 %	384866099
4053	NC_017342	AAT	2	6	218520	218525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4054	NC_017342	CTT	2	6	218696	218701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4055	NC_017342	AT	3	6	218791	218796	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
4056	NC_017342	TTCTTT	2	12	218847	218858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866099
4057	NC_017342	AAT	2	6	218895	218900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4058	NC_017342	CAA	2	6	218939	218944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866099
4059	NC_017342	AAT	2	6	219006	219011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4060	NC_017342	AAT	2	6	219054	219059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4061	NC_017342	CTG	2	6	219073	219078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866099
4062	NC_017342	AAAC	2	8	219158	219165	75 %	0 %	0 %	25 %	384866099
4063	NC_017342	CAAC	2	8	219201	219208	50 %	0 %	0 %	50 %	384866099
4064	NC_017342	TTC	2	6	219312	219317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4065	NC_017342	AT	3	6	219340	219345	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
4066	NC_017342	TCG	2	6	219424	219429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866099
4067	NC_017342	TCA	2	6	219436	219441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4068	NC_017342	TTC	3	9	219456	219464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4069	NC_017342	TGA	2	6	219529	219534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866099
4070	NC_017342	T	6	6	219542	219547	0 %	100 %	0 %	0 %	384866099
4071	NC_017342	AT	3	6	219549	219554	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
4072	NC_017342	GATAAT	2	12	219602	219613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384866099
4073	NC_017342	TTA	2	6	219643	219648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
4074	NC_017342	TAT	2	6	219662	219667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
4075	NC_017342	TC	3	6	219689	219694	0 %	50 %	0 %	50 %	384866099
4076	NC_017342	TTTTC	2	10	219719	219728	0 %	80 %	0 %	20 %	384866099
4077	NC_017342	ATC	2	6	219778	219783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
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4080	NC_017342	TGG	2	6	219900	219905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866099
4081	NC_017342	ATC	2	6	219921	219926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4082	NC_017342	AAT	2	6	219942	219947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4083	NC_017342	ATC	2	6	219975	219980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4084	NC_017342	TAA	2	6	220220	220225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
4085	NC_017342	TCA	2	6	220235	220240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4086	NC_017342	TCA	2	6	220258	220263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4087	NC_017342	ATG	2	6	220313	220318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866099
4088	NC_017342	TGTAA	2	10	220342	220351	40 %	40 %	20 %	0 %	384866099
4089	NC_017342	TCA	2	6	220354	220359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
4090	NC_017342	TTA	2	6	220384	220389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
4091	NC_017342	ATT	2	6	220422	220427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
4092	NC_017342	ATGA	2	8	220437	220444	50 %	25 %	25 %	0 %	384866099
4093	NC_017342	TTGT	2	8	220533	220540	0 %	75 %	25 %	0 %	384866099
4094	NC_017342	T	7	7	220590	220596	0 %	100 %	0 %	0 %	384866100
4095	NC_017342	CTT	2	6	220604	220609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866100
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4101	NC_017342	TCA	2	6	220903	220908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866100
4102	NC_017342	TGTCCT	2	12	220912	220923	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866100
4103	NC_017342	TCCA	2	8	220927	220934	25 %	25 %	0 %	50 %	384866100
4104	NC_017342	ATA	2	6	220937	220942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866100
4105	NC_017342	AGT	2	6	220943	220948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866100
4106	NC_017342	TTTG	2	8	220950	220957	0 %	75 %	25 %	0 %	384866100
4107	NC_017342	TTA	2	6	220972	220977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866100
4108	NC_017342	TCTT	2	8	220987	220994	0 %	75 %	0 %	25 %	384866100
4109	NC_017342	TTTG	2	8	221017	221024	0 %	75 %	25 %	0 %	384866100
4110	NC_017342	CTT	2	6	221054	221059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866100
4111	NC_017342	T	6	6	221067	221072	0 %	100 %	0 %	0 %	384866100
4112	NC_017342	ATC	2	6	221082	221087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866100
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4114	NC_017342	TCTTGT	2	12	221290	221301	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384866100
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4117	NC_017342	CTT	2	6	221603	221608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866100
4118	NC_017342	AGTA	2	8	221626	221633	50 %	25 %	25 %	0 %	384866100
4119	NC_017342	TGT	2	6	221761	221766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866100
4120	NC_017342	TAA	2	6	221769	221774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866100
4121	NC_017342	TC	4	8	221819	221826	0 %	50 %	0 %	50 %	384866100
4122	NC_017342	GCT	2	6	221851	221856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866100
4123	NC_017342	CATTT	2	10	221889	221898	20 %	60 %	0 %	20 %	384866100
4124	NC_017342	TCC	2	6	221929	221934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866101
4125	NC_017342	GTCG	2	8	221981	221988	0 %	25 %	50 %	25 %	384866101
4126	NC_017342	CAA	2	6	221993	221998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866101
4127	NC_017342	TCA	2	6	222014	222019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866101
4128	NC_017342	T	6	6	222085	222090	0 %	100 %	0 %	0 %	384866101
4129	NC_017342	TAATTA	2	12	222130	222141	50 %	50 %	0 %	0 %	384866101
4130	NC_017342	TCGT	2	8	222180	222187	0 %	50 %	25 %	25 %	384866102
4131	NC_017342	A	6	6	222204	222209	100 %	0 %	0 %	0 %	384866102
4132	NC_017342	A	6	6	222227	222232	100 %	0 %	0 %	0 %	384866102
4133	NC_017342	T	7	7	222264	222270	0 %	100 %	0 %	0 %	384866102
4134	NC_017342	T	6	6	222346	222351	0 %	100 %	0 %	0 %	384866102
4135	NC_017342	CGAGT	2	10	222365	222374	20 %	20 %	40 %	20 %	384866102
4136	NC_017342	T	6	6	222401	222406	0 %	100 %	0 %	0 %	384866102
4137	NC_017342	TGT	3	9	222410	222418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866102
4138	NC_017342	T	6	6	222424	222429	0 %	100 %	0 %	0 %	384866102
4139	NC_017342	CAT	2	6	222444	222449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866102
4140	NC_017342	TTA	2	6	222467	222472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866102
4141	NC_017342	ATT	2	6	222502	222507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866102
4142	NC_017342	CTT	2	6	222522	222527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866102
4143	NC_017342	ATT	2	6	222553	222558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866102
4144	NC_017342	A	6	6	222572	222577	100 %	0 %	0 %	0 %	384866102
4145	NC_017342	TCA	2	6	222597	222602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866102
4146	NC_017342	TC	3	6	222615	222620	0 %	50 %	0 %	50 %	384866103
4147	NC_017342	AAT	2	6	222660	222665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
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4151	NC_017342	GCA	2	6	222826	222831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866103
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4153	NC_017342	CAT	2	6	222897	222902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
4154	NC_017342	CTA	2	6	222992	222997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
4155	NC_017342	ATT	2	6	223032	223037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866103
4156	NC_017342	TAC	2	6	223052	223057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
4157	NC_017342	ATC	2	6	223062	223067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
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4161	NC_017342	AAT	2	6	223156	223161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
4162	NC_017342	ATT	2	6	223188	223193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866103
4163	NC_017342	TGTC	2	8	223261	223268	0 %	50 %	25 %	25 %	384866103
4164	NC_017342	T	6	6	223293	223298	0 %	100 %	0 %	0 %	384866103
4165	NC_017342	ATT	2	6	223407	223412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866103
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4195	NC_017342	ATG	2	6	225130	225135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866103
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4197	NC_017342	TTAC	2	8	225184	225191	25 %	50 %	0 %	25 %	384866103
4198	NC_017342	CTT	3	9	225215	225223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866103
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4201	NC_017342	GTTG	2	8	225457	225464	0 %	50 %	50 %	0 %	384866103
4202	NC_017342	TAT	2	6	225494	225499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866103
4203	NC_017342	TTAC	2	8	225505	225512	25 %	50 %	0 %	25 %	384866103
4204	NC_017342	TGAT	2	8	225531	225538	25 %	50 %	25 %	0 %	384866103
4205	NC_017342	A	6	6	225558	225563	100 %	0 %	0 %	0 %	384866103
4206	NC_017342	ACTA	2	8	225570	225577	50 %	25 %	0 %	25 %	384866103
4207	NC_017342	TAA	2	6	225587	225592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
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4213	NC_017342	TCT	2	6	225800	225805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866104
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4215	NC_017342	GTT	2	6	225840	225845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866104
4216	NC_017342	CCT	2	6	226021	226026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866104
4217	NC_017342	TTA	2	6	226254	226259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866105
4218	NC_017342	GAA	2	6	226261	226266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866105
4219	NC_017342	TTTA	2	8	226297	226304	25 %	75 %	0 %	0 %	384866105
4220	NC_017342	AGA	2	6	226354	226359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866105
4221	NC_017342	AAAG	2	8	226363	226370	75 %	0 %	25 %	0 %	384866105
4222	NC_017342	TATACT	2	12	226415	226426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866105
4223	NC_017342	ACA	2	6	226449	226454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866105
4224	NC_017342	ATC	2	6	226455	226460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866105
4225	NC_017342	ATC	2	6	226485	226490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866105
4226	NC_017342	AAC	2	6	226514	226519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866105
4227	NC_017342	TTC	2	6	226531	226536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866105
4228	NC_017342	CA	4	8	226578	226585	50 %	0 %	0 %	50 %	384866105
4229	NC_017342	TTA	2	6	226689	226694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866105
4230	NC_017342	CAAAG	2	10	226750	226759	60 %	0 %	20 %	20 %	384866105
4231	NC_017342	CTG	2	6	226761	226766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866105
4232	NC_017342	CTTTAG	2	12	226776	226787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866105
4233	NC_017342	AAC	2	6	226829	226834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866105
4234	NC_017342	TA	3	6	226836	226841	50 %	50 %	0 %	0 %	384866105
4235	NC_017342	CTG	2	6	226842	226847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866105
4236	NC_017342	AC	3	6	226891	226896	50 %	0 %	0 %	50 %	384866105
4237	NC_017342	TAGA	2	8	226962	226969	50 %	25 %	25 %	0 %	384866105
4238	NC_017342	AT	3	6	227089	227094	50 %	50 %	0 %	0 %	384866105
4239	NC_017342	TCA	2	6	227099	227104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866105
4240	NC_017342	TCA	2	6	227129	227134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866105
4241	NC_017342	ATTAA	2	10	227148	227157	60 %	40 %	0 %	0 %	384866105
4242	NC_017342	TAT	3	9	227511	227519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866106
4243	NC_017342	TTA	3	9	227524	227532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866106
4244	NC_017342	T	6	6	227563	227568	0 %	100 %	0 %	0 %	384866106
4245	NC_017342	AC	3	6	227573	227578	50 %	0 %	0 %	50 %	384866106
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4357	NC_017342	T	6	6	232539	232544	0 %	100 %	0 %	0 %	384866110
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4360	NC_017342	GT	3	6	232645	232650	0 %	50 %	50 %	0 %	384866110
4361	NC_017342	GAT	2	6	232651	232656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866110
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4372	NC_017342	ATC	2	6	233235	233240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866111
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