MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_017342	CTT	2	6	2237061	2237066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868004
44002	NC_017342	ACG	2	6	2237074	2237079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868004
44003	NC_017342	T	6	6	2237912	2237917	0 %	100 %	0 %	0 %	384868005
44004	NC_017342	TCT	2	6	2237928	2237933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868005
44005	NC_017342	TGT	3	9	2237947	2237955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868005
44006	NC_017342	TGA	2	6	2238033	2238038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868005
44007	NC_017342	CCA	2	6	2238040	2238045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868005
44008	NC_017342	ATGGCA	2	12	2238056	2238067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384868005
44009	NC_017342	TTG	2	6	2238083	2238088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868005
44010	NC_017342	ACC	2	6	2238096	2238101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868005
44011	NC_017342	AC	4	8	2238145	2238152	50 %	0 %	0 %	50 %	384868005
44012	NC_017342	ATG	3	9	2238167	2238175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868005
44013	NC_017342	TAA	2	6	2238224	2238229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868005
44014	NC_017342	TCC	2	6	2238237	2238242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868005
44015	NC_017342	TTC	2	6	2238255	2238260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868005
44016	NC_017342	AAT	2	6	2238264	2238269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868005
44017	NC_017342	AAAAT	2	10	2238274	2238283	80 %	20 %	0 %	0 %	384868005
44018	NC_017342	GCAA	2	8	2238364	2238371	50 %	0 %	25 %	25 %	384868005
44019	NC_017342	AACC	2	8	2238457	2238464	50 %	0 %	0 %	50 %	384868005
44020	NC_017342	TAC	2	6	2238486	2238491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868005
44021	NC_017342	CTG	2	6	2238506	2238511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868005
44022	NC_017342	A	6	6	2238554	2238559	100 %	0 %	0 %	0 %	384868005
44023	NC_017342	TAAT	2	8	2238575	2238582	50 %	50 %	0 %	0 %	384868005
44024	NC_017342	AATT	2	8	2238660	2238667	50 %	50 %	0 %	0 %	384868005
44025	NC_017342	T	7	7	2238692	2238698	0 %	100 %	0 %	0 %	384868005
44026	NC_017342	AT	3	6	2238715	2238720	50 %	50 %	0 %	0 %	384868005
44027	NC_017342	TAA	2	6	2238738	2238743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868005
44028	NC_017342	TAA	2	6	2238825	2238830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868005
44029	NC_017342	CATT	2	8	2238890	2238897	25 %	50 %	0 %	25 %	384868005
44030	NC_017342	A	6	6	2238909	2238914	100 %	0 %	0 %	0 %	384868005
44031	NC_017342	ACC	2	6	2238984	2238989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868005
44032	NC_017342	TA	3	6	2239028	2239033	50 %	50 %	0 %	0 %	384868005
44033	NC_017342	CAATA	2	10	2239056	2239065	60 %	20 %	0 %	20 %	384868005
44034	NC_017342	TAA	2	6	2239074	2239079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868005
44035	NC_017342	TTC	2	6	2239135	2239140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868005
44036	NC_017342	AT	3	6	2239141	2239146	50 %	50 %	0 %	0 %	384868005
44037	NC_017342	TTCT	2	8	2239492	2239499	0 %	75 %	0 %	25 %	384868006
44038	NC_017342	TTTG	2	8	2239515	2239522	0 %	75 %	25 %	0 %	384868006
44039	NC_017342	CTT	2	6	2239566	2239571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868006
44040	NC_017342	CTT	2	6	2239602	2239607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868006
44041	NC_017342	TCA	2	6	2239670	2239675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868006
44042	NC_017342	TTG	2	6	2239713	2239718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868006
44043	NC_017342	TA	3	6	2239846	2239851	50 %	50 %	0 %	0 %	384868007
44044	NC_017342	GAT	2	6	2239935	2239940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868007
44045	NC_017342	AAATA	2	10	2240071	2240080	80 %	20 %	0 %	0 %	384868007
44046	NC_017342	A	6	6	2240082	2240087	100 %	0 %	0 %	0 %	384868007
44047	NC_017342	ACT	2	6	2240163	2240168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868007
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44049	NC_017342	TTTA	2	8	2240286	2240293	25 %	75 %	0 %	0 %	384868007
44050	NC_017342	AAG	2	6	2240299	2240304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868007
44051	NC_017342	GAT	2	6	2240461	2240466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868008
44052	NC_017342	AAC	2	6	2240492	2240497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868008
44053	NC_017342	ATT	2	6	2240661	2240666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868009
44054	NC_017342	CAT	2	6	2240677	2240682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868009
44055	NC_017342	CTT	2	6	2240700	2240705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868009
44056	NC_017342	TCTT	2	8	2240733	2240740	0 %	75 %	0 %	25 %	384868009
44057	NC_017342	CAA	2	6	2240766	2240771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868009
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44060	NC_017342	TTGT	2	8	2240832	2240839	0 %	75 %	25 %	0 %	384868009
44061	NC_017342	ACGT	2	8	2240860	2240867	25 %	25 %	25 %	25 %	384868009
44062	NC_017342	TGTTT	2	10	2240876	2240885	0 %	80 %	20 %	0 %	384868009
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44068	NC_017342	TAA	2	6	2241333	2241338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868009
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44101	NC_017342	TAC	2	6	2242763	2242768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868010
44102	NC_017342	A	6	6	2242773	2242778	100 %	0 %	0 %	0 %	384868010
44103	NC_017342	ATT	2	6	2242955	2242960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868011
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44110	NC_017342	AAT	2	6	2243328	2243333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868011
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44118	NC_017342	CTT	2	6	2243744	2243749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868011
44119	NC_017342	CAT	2	6	2243786	2243791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868011
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44125	NC_017342	CATG	2	8	2244248	2244255	25 %	25 %	25 %	25 %	384868012
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44222	NC_017342	T	6	6	2248932	2248937	0 %	100 %	0 %	0 %	384868016
44223	NC_017342	A	6	6	2249027	2249032	100 %	0 %	0 %	0 %	384868016
44224	NC_017342	ATT	2	6	2249039	2249044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868016
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44226	NC_017342	TTAT	2	8	2249071	2249078	25 %	75 %	0 %	0 %	384868017
44227	NC_017342	ATA	2	6	2249094	2249099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868017
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44231	NC_017342	TCC	2	6	2249277	2249282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868017
44232	NC_017342	AAT	3	9	2249307	2249315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868017
44233	NC_017342	TAA	2	6	2249322	2249327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868017
44234	NC_017342	GCA	2	6	2249356	2249361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868017
44235	NC_017342	ATT	3	9	2249370	2249378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868017
44236	NC_017342	ATG	2	6	2249510	2249515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868017
44237	NC_017342	GAT	2	6	2249533	2249538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868017
44238	NC_017342	ATT	2	6	2249550	2249555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868017
44239	NC_017342	ATA	2	6	2249595	2249600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868017
44240	NC_017342	GCT	2	6	2249644	2249649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868017
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44243	NC_017342	GAT	2	6	2249871	2249876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868018
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44251	NC_017342	TA	3	6	2250206	2250211	50 %	50 %	0 %	0 %	384868018
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44292	NC_017342	TTG	2	6	2251604	2251609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868019
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44337	NC_017342	TTC	2	6	2253433	2253438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868022
44338	NC_017342	GAC	3	9	2253462	2253470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868022
44339	NC_017342	TTC	2	6	2253553	2253558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868022
44340	NC_017342	TTTC	2	8	2253600	2253607	0 %	75 %	0 %	25 %	384868022
44341	NC_017342	T	6	6	2253613	2253618	0 %	100 %	0 %	0 %	384868022
44342	NC_017342	TCC	2	6	2253733	2253738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868022
44343	NC_017342	CAACTA	2	12	2253741	2253752	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384868022
44344	NC_017342	CTT	2	6	2253765	2253770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868022
44345	NC_017342	TAAG	2	8	2253966	2253973	50 %	25 %	25 %	0 %	384868022
44346	NC_017342	ACC	2	6	2253982	2253987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868022
44347	NC_017342	AAC	2	6	2254000	2254005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868022
44348	NC_017342	TGA	2	6	2254006	2254011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868022
44349	NC_017342	TGT	2	6	2254079	2254084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868022
44350	NC_017342	CAA	2	6	2254089	2254094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868022
44351	NC_017342	GTA	2	6	2254110	2254115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868022
44352	NC_017342	ACC	2	6	2254153	2254158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868022
44353	NC_017342	TGC	2	6	2254213	2254218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868022
44354	NC_017342	CCA	2	6	2254226	2254231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868022
44355	NC_017342	TAA	3	9	2254303	2254311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868023
44356	NC_017342	ATT	2	6	2254318	2254323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868023
44357	NC_017342	TAA	2	6	2254324	2254329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868023
44358	NC_017342	TGC	2	6	2254414	2254419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868023
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44455	NC_017342	GAT	2	6	2259163	2259168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868027
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44457	NC_017342	GAT	2	6	2259271	2259276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868027
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44461	NC_017342	AGA	2	6	2260051	2260056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868028
44462	NC_017342	CGT	2	6	2260064	2260069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868028
44463	NC_017342	AAT	2	6	2260176	2260181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868028
44464	NC_017342	TGA	2	6	2260308	2260313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868029
44465	NC_017342	TTA	2	6	2260318	2260323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868029
44466	NC_017342	GATT	2	8	2260326	2260333	25 %	50 %	25 %	0 %	384868029
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44469	NC_017342	TGG	2	6	2260464	2260469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868029
44470	NC_017342	TAA	2	6	2260494	2260499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868029
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44499	NC_017342	TA	3	6	2261654	2261659	50 %	50 %	0 %	0 %	384868029
44500	NC_017342	GA	3	6	2261661	2261666	50 %	0 %	50 %	0 %	384868029

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