MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	ATTT	2	8	6662	6669	25 %	75 %	0 %	0 %	384865887
2	NC_017342	AAT	3	9	6686	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
3	NC_017342	TGAT	2	8	6702	6709	25 %	50 %	25 %	0 %	384865887
4	NC_017342	TAA	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
5	NC_017342	ACC	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865887
6	NC_017342	TCA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
7	NC_017342	CAA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865887
8	NC_017342	CT	3	6	6913	6918	0 %	50 %	0 %	50 %	384865887
9	NC_017342	TTC	2	6	6971	6976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
10	NC_017342	TTC	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
11	NC_017342	CTT	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
12	NC_017342	CTT	2	6	7170	7175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
13	NC_017342	CAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865887
14	NC_017342	AATC	2	8	7218	7225	50 %	25 %	0 %	25 %	384865887
15	NC_017342	ATTGT	2	10	7234	7243	20 %	60 %	20 %	0 %	384865887
16	NC_017342	ATG	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865887
17	NC_017342	AGC	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865887
18	NC_017342	CCA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865887
19	NC_017342	CAT	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
20	NC_017342	TAT	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865887
21	NC_017342	AAT	2	6	7584	7589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
22	NC_017342	TAC	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
23	NC_017342	TAA	2	6	7620	7625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
24	NC_017342	TTCG	2	8	7642	7649	0 %	50 %	25 %	25 %	384865887
25	NC_017342	TAGT	2	8	7734	7741	25 %	50 %	25 %	0 %	384865887
26	NC_017342	TTC	2	6	7751	7756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
27	NC_017342	CTTTAC	2	12	7926	7937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865887
28	NC_017342	CTT	2	6	7983	7988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
29	NC_017342	TTC	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
30	NC_017342	CTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
31	NC_017342	TCAT	2	8	8132	8139	25 %	50 %	0 %	25 %	384865887
32	NC_017342	TTC	2	6	8140	8145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
33	NC_017342	TC	3	6	8157	8162	0 %	50 %	0 %	50 %	384865887
34	NC_017342	TTG	2	6	8170	8175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865887
35	NC_017342	ATT	2	6	8689	8694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865888
36	NC_017342	CTTTCA	2	12	8731	8742	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865888
37	NC_017342	TGC	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865888
38	NC_017342	TTCA	2	8	8807	8814	25 %	50 %	0 %	25 %	384865888
39	NC_017342	TCT	2	6	8856	8861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865888
40	NC_017342	ACA	2	6	8866	8871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865888
41	NC_017342	TTC	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865888
42	NC_017342	ACA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865888
43	NC_017342	GTT	2	6	8976	8981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865888
44	NC_017342	AC	3	6	8991	8996	50 %	0 %	0 %	50 %	384865888
45	NC_017342	GAA	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384865888
46	NC_017342	CAT	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865888
47	NC_017342	ATTC	2	8	9082	9089	25 %	50 %	0 %	25 %	384865888
48	NC_017342	TAC	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865888
49	NC_017342	CAT	2	6	9198	9203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865889
50	NC_017342	A	6	6	9543	9548	100 %	0 %	0 %	0 %	384865890
51	NC_017342	ATA	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865890
52	NC_017342	CAT	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865890
53	NC_017342	TAA	2	6	9716	9721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865890
54	NC_017342	CAA	2	6	9739	9744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865890
55	NC_017342	CTT	2	6	9772	9777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865890
56	NC_017342	TGTGCT	2	12	9855	9866	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384865890
57	NC_017342	TTC	2	6	9884	9889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865890
58	NC_017342	TCA	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865890
59	NC_017342	GAT	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865890
60	NC_017342	TAA	2	6	10003	10008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865890
61	NC_017342	CAA	2	6	10096	10101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865890
62	NC_017342	CTT	2	6	10123	10128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865890
63	NC_017342	CATC	2	8	10195	10202	25 %	25 %	0 %	50 %	384865890
64	NC_017342	CTG	2	6	10222	10227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865890
65	NC_017342	ATT	2	6	10235	10240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865890
66	NC_017342	CCA	2	6	10248	10253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865890
67	NC_017342	GAAT	2	8	10259	10266	50 %	25 %	25 %	0 %	384865890
68	NC_017342	ATTA	2	8	10520	10527	50 %	50 %	0 %	0 %	384865891
69	NC_017342	TAC	2	6	10588	10593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865891
70	NC_017342	GCA	2	6	10631	10636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
71	NC_017342	GCA	2	6	10643	10648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
72	NC_017342	TGA	2	6	10651	10656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865891
73	NC_017342	CGA	2	6	10691	10696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
74	NC_017342	TAA	2	6	10728	10733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
75	NC_017342	CAC	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865891
76	NC_017342	CAA	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865891
77	NC_017342	T	6	6	10876	10881	0 %	100 %	0 %	0 %	384865891
78	NC_017342	TTG	2	6	10960	10965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865891
79	NC_017342	TAA	2	6	10966	10971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
80	NC_017342	TTG	2	6	11023	11028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865891
81	NC_017342	TTC	2	6	11047	11052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865891
82	NC_017342	T	6	6	11068	11073	0 %	100 %	0 %	0 %	384865891
83	NC_017342	TAA	2	6	11134	11139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
84	NC_017342	ACG	2	6	11143	11148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
85	NC_017342	AGC	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
86	NC_017342	ACC	2	6	11329	11334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865891
87	NC_017342	CTG	2	6	11367	11372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865891
88	NC_017342	CTA	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865891
89	NC_017342	AAT	2	6	11419	11424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
90	NC_017342	TAAAT	2	10	11627	11636	60 %	40 %	0 %	0 %	384865892
91	NC_017342	TTC	3	9	11666	11674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
92	NC_017342	TATATT	2	12	11677	11688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865892
93	NC_017342	TCT	2	6	11727	11732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
94	NC_017342	AATT	2	8	11897	11904	50 %	50 %	0 %	0 %	384865892
95	NC_017342	TCC	2	6	11990	11995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865892
96	NC_017342	TGC	2	6	11996	12001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865892
97	NC_017342	TAT	2	6	12010	12015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865892
98	NC_017342	ATA	3	9	12071	12079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865892
99	NC_017342	AAC	2	6	12155	12160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865892
100	NC_017342	ATA	2	6	12162	12167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865892
101	NC_017342	GCAC	2	8	12252	12259	25 %	0 %	25 %	50 %	384865892
102	NC_017342	AAT	2	6	12284	12289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865892
103	NC_017342	CAT	2	6	12356	12361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865892
104	NC_017342	TTC	2	6	12379	12384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
105	NC_017342	GCA	2	6	12390	12395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865892
106	NC_017342	CTT	2	6	12430	12435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
107	NC_017342	AGC	2	6	12455	12460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865892
108	NC_017342	AATGCT	2	12	12483	12494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865892
109	NC_017342	GT	3	6	12509	12514	0 %	50 %	50 %	0 %	384865892
110	NC_017342	ATT	2	6	12516	12521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865892
111	NC_017342	ATT	2	6	12629	12634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865893
112	NC_017342	ATT	2	6	12636	12641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865893
113	NC_017342	A	6	6	12679	12684	100 %	0 %	0 %	0 %	384865893
114	NC_017342	TCG	2	6	12691	12696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865893
115	NC_017342	A	6	6	12770	12775	100 %	0 %	0 %	0 %	384865893
116	NC_017342	ACT	2	6	12806	12811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865893
117	NC_017342	ATT	2	6	12930	12935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865894
118	NC_017342	TCA	2	6	13007	13012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
119	NC_017342	CTT	2	6	13023	13028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
120	NC_017342	T	6	6	13027	13032	0 %	100 %	0 %	0 %	384865894
121	NC_017342	TCT	2	6	13052	13057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
122	NC_017342	TCT	2	6	13088	13093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
123	NC_017342	CAT	2	6	13137	13142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
124	NC_017342	AAC	2	6	13165	13170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865894
125	NC_017342	CAT	2	6	13179	13184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
126	NC_017342	AAT	2	6	13214	13219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
127	NC_017342	TCT	2	6	13247	13252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
128	NC_017342	TAA	2	6	13255	13260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
129	NC_017342	AATTAA	2	12	13270	13281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
130	NC_017342	TAA	2	6	13297	13302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
131	NC_017342	CTT	2	6	13347	13352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
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257	NC_017342	ATC	2	6	18822	18827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
258	NC_017342	TTC	2	6	18861	18866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865900
259	NC_017342	TCA	2	6	18928	18933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
260	NC_017342	ATCA	2	8	18942	18949	50 %	25 %	0 %	25 %	384865900
261	NC_017342	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865900
262	NC_017342	TCA	2	6	19039	19044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
263	NC_017342	ATC	2	6	19125	19130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
264	NC_017342	AGC	2	6	19164	19169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865900
265	NC_017342	CTT	2	6	19226	19231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865900
266	NC_017342	ATG	2	6	19235	19240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865900
267	NC_017342	CAT	2	6	19262	19267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
268	NC_017342	CAT	2	6	19295	19300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
269	NC_017342	AGC	2	6	19434	19439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865900
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271	NC_017342	TA	3	6	19601	19606	50 %	50 %	0 %	0 %	384865900
272	NC_017342	ATC	2	6	19620	19625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865900
273	NC_017342	CAA	2	6	19646	19651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865900
274	NC_017342	CAATG	2	10	19769	19778	40 %	20 %	20 %	20 %	384865901
275	NC_017342	CTG	2	6	19789	19794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865901
276	NC_017342	ATA	2	6	19798	19803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865901
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279	NC_017342	ATACC	2	10	19876	19885	40 %	20 %	0 %	40 %	384865901
280	NC_017342	ACA	2	6	19890	19895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865901
281	NC_017342	A	6	6	19901	19906	100 %	0 %	0 %	0 %	384865901
282	NC_017342	TAAT	2	8	19969	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	384865901
283	NC_017342	ACA	2	6	19980	19985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865901
284	NC_017342	AAT	2	6	20003	20008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865901
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286	NC_017342	TAA	2	6	20105	20110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865901
287	NC_017342	CAT	2	6	20120	20125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865901
288	NC_017342	A	6	6	20192	20197	100 %	0 %	0 %	0 %	384865901
289	NC_017342	ATTA	2	8	20222	20229	50 %	50 %	0 %	0 %	384865901
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291	NC_017342	TTA	2	6	20251	20256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865901
292	NC_017342	ATT	2	6	20306	20311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865901
293	NC_017342	TGT	2	6	20357	20362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865901
294	NC_017342	CAAT	2	8	20368	20375	50 %	25 %	0 %	25 %	384865901
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302	NC_017342	AT	3	6	20672	20677	50 %	50 %	0 %	0 %	384865901
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341	NC_017342	GTTT	2	8	22555	22562	0 %	75 %	25 %	0 %	384865902
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371	NC_017342	TTTC	2	8	23909	23916	0 %	75 %	0 %	25 %	384865902
372	NC_017342	CTT	2	6	23978	23983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
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374	NC_017342	CTT	2	6	24041	24046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
375	NC_017342	ATA	2	6	24157	24162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
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378	NC_017342	TCA	2	6	24398	24403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
379	NC_017342	ATA	2	6	24436	24441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
380	NC_017342	TTC	2	6	24465	24470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
381	NC_017342	ATT	2	6	24522	24527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865902
382	NC_017342	TAAT	2	8	24530	24537	50 %	50 %	0 %	0 %	384865902
383	NC_017342	ATC	2	6	24574	24579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
384	NC_017342	GT	3	6	24614	24619	0 %	50 %	50 %	0 %	384865902
385	NC_017342	TCT	2	6	24661	24666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
386	NC_017342	ATT	2	6	24691	24696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865902
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