MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 54730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	TAT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
2	NC_017338	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548924
3	NC_017338	TGT	2	6	201	206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548924
4	NC_017338	TAC	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548924
5	NC_017338	GAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
6	NC_017338	TAA	2	6	261	266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548924
7	NC_017338	ACA	2	6	289	294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548924
8	NC_017338	AAC	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548924
9	NC_017338	AG	3	6	337	342	50 %	0 %	50 %	0 %	384548924
10	NC_017338	ATT	2	6	453	458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
11	NC_017338	ATGC	2	8	496	503	25 %	25 %	25 %	25 %	384548924
12	NC_017338	TCA	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548924
13	NC_017338	ATA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548924
14	NC_017338	TTA	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
15	NC_017338	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
16	NC_017338	GAT	2	6	655	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548924
17	NC_017338	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
18	NC_017338	ACC	2	6	762	767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548924
19	NC_017338	AGA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
20	NC_017338	TTG	2	6	824	829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548924
21	NC_017338	CCA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548924
22	NC_017338	AGA	2	6	872	877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
23	NC_017338	GAA	3	9	883	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
24	NC_017338	CCA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548924
25	NC_017338	TA	3	6	922	927	50 %	50 %	0 %	0 %	384548924
26	NC_017338	CAAAT	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	384548924
27	NC_017338	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
28	NC_017338	CTG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548924
29	NC_017338	A	6	6	1094	1099	100 %	0 %	0 %	0 %	384548924
30	NC_017338	A	7	7	1143	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	384548924
31	NC_017338	AG	3	6	1198	1203	50 %	0 %	50 %	0 %	384548924
32	NC_017338	GAA	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
33	NC_017338	TGG	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548924
34	NC_017338	TCAT	2	8	1265	1272	25 %	50 %	0 %	25 %	384548924
35	NC_017338	A	6	6	1280	1285	100 %	0 %	0 %	0 %	384548924
36	NC_017338	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
37	NC_017338	AAG	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
38	NC_017338	TAAT	2	8	1634	1641	50 %	50 %	0 %	0 %	384548925
39	NC_017338	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
40	NC_017338	TTA	2	6	1671	1676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
41	NC_017338	AAC	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548925
42	NC_017338	AGT	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
43	NC_017338	TTG	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548925
44	NC_017338	A	7	7	1900	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	384548925
45	NC_017338	ATTA	2	8	1954	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	384548925
46	NC_017338	AATTT	2	10	1977	1986	40 %	60 %	0 %	0 %	384548925
47	NC_017338	TTA	2	6	2015	2020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
48	NC_017338	CAATT	2	10	2043	2052	40 %	40 %	0 %	20 %	384548925
49	NC_017338	GACT	2	8	2176	2183	25 %	25 %	25 %	25 %	384548925
50	NC_017338	AGA	2	6	2215	2220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548925
51	NC_017338	TCA	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548925
52	NC_017338	TAAA	2	8	2271	2278	75 %	25 %	0 %	0 %	384548925
53	NC_017338	GAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548925
54	NC_017338	TCT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548925
55	NC_017338	TTTA	2	8	2332	2339	25 %	75 %	0 %	0 %	384548925
56	NC_017338	ATT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
57	NC_017338	ACA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548925
58	NC_017338	AAATT	2	10	2421	2430	60 %	40 %	0 %	0 %	384548925
59	NC_017338	TTA	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
60	NC_017338	GGT	2	6	2492	2497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548925
61	NC_017338	TTA	2	6	2505	2510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
62	NC_017338	TGA	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
63	NC_017338	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548925
64	NC_017338	TCT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548925
65	NC_017338	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548925
66	NC_017338	GGT	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548925
67	NC_017338	TTCA	2	8	2620	2627	25 %	50 %	0 %	25 %	384548925
68	NC_017338	AT	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	384548925
69	NC_017338	GATG	2	8	2641	2648	25 %	25 %	50 %	0 %	384548925
70	NC_017338	ATG	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
71	NC_017338	GTTGAA	2	12	2675	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
72	NC_017338	TTC	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548925
73	NC_017338	GAC	2	6	2729	2734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548925
74	NC_017338	AATT	2	8	2745	2752	50 %	50 %	0 %	0 %	384548925
75	NC_017338	AAG	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548926
76	NC_017338	GTA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548926
77	NC_017338	ATT	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548926
78	NC_017338	TGG	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548926
79	NC_017338	ATTA	2	8	3276	3283	50 %	50 %	0 %	0 %	384548926
80	NC_017338	TTCT	2	8	3366	3373	0 %	75 %	0 %	25 %	384548926
81	NC_017338	TCAT	2	8	3377	3384	25 %	50 %	0 %	25 %	384548926
82	NC_017338	ATG	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548927
83	NC_017338	A	6	6	3660	3665	100 %	0 %	0 %	0 %	384548927
84	NC_017338	GTC	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548927
85	NC_017338	AT	3	6	3713	3718	50 %	50 %	0 %	0 %	384548927
86	NC_017338	AGA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548927
87	NC_017338	CTC	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384548927
88	NC_017338	GAC	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548927
89	NC_017338	CTG	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548927
90	NC_017338	AAT	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548927
91	NC_017338	A	7	7	3907	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	384548927
92	NC_017338	CAG	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548927
93	NC_017338	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548927
94	NC_017338	ATT	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548927
95	NC_017338	GAA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548927
96	NC_017338	ATA	2	6	4144	4149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548927
97	NC_017338	GAT	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548927
98	NC_017338	TTA	3	9	4332	4340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548927
99	NC_017338	GAT	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548927
100	NC_017338	TTA	2	6	4383	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548927
101	NC_017338	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548928
102	NC_017338	GTAT	2	8	4615	4622	25 %	50 %	25 %	0 %	384548928
103	NC_017338	AG	4	8	4637	4644	50 %	0 %	50 %	0 %	384548928
104	NC_017338	ATA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548928
105	NC_017338	CAAAT	2	10	4708	4717	60 %	20 %	0 %	20 %	384548928
106	NC_017338	GTT	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548928
107	NC_017338	A	6	6	4792	4797	100 %	0 %	0 %	0 %	384548928
108	NC_017338	TGG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548928
109	NC_017338	CGG	2	6	4853	4858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548928
110	NC_017338	TGG	2	6	4877	4882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548928
111	NC_017338	TCA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548928
112	NC_017338	TA	3	6	4958	4963	50 %	50 %	0 %	0 %	384548928
113	NC_017338	TCA	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548928
114	NC_017338	A	6	6	4977	4982	100 %	0 %	0 %	0 %	384548928
115	NC_017338	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
116	NC_017338	AG	3	6	5115	5120	50 %	0 %	50 %	0 %	384548928
117	NC_017338	TGA	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548928
118	NC_017338	AGA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
119	NC_017338	GGC	2	6	5208	5213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548928
120	NC_017338	AGAA	2	8	5245	5252	75 %	0 %	25 %	0 %	384548928
121	NC_017338	TA	3	6	5274	5279	50 %	50 %	0 %	0 %	384548928
122	NC_017338	GAT	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548928
123	NC_017338	ATA	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548928
124	NC_017338	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548928
125	NC_017338	AGA	2	6	5462	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
126	NC_017338	TATC	2	8	5518	5525	25 %	50 %	0 %	25 %	384548928
127	NC_017338	ATT	2	6	5603	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
128	NC_017338	TAT	2	6	5675	5680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
129	NC_017338	GGC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548928
130	NC_017338	TGC	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548928
131	NC_017338	A	6	6	5706	5711	100 %	0 %	0 %	0 %	384548928
132	NC_017338	CGT	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548928
133	NC_017338	GAA	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
134	NC_017338	G	6	6	5835	5840	0 %	0 %	100 %	0 %	384548928
135	NC_017338	TAGA	2	8	5923	5930	50 %	25 %	25 %	0 %	384548928
136	NC_017338	TGGA	2	8	6049	6056	25 %	25 %	50 %	0 %	384548928
137	NC_017338	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
138	NC_017338	TTC	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548928
139	NC_017338	TAT	2	6	6177	6182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
140	NC_017338	TGAAT	2	10	6218	6227	40 %	40 %	20 %	0 %	384548928
141	NC_017338	AATG	2	8	6272	6279	50 %	25 %	25 %	0 %	384548928
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163	NC_017338	TCGT	2	8	7327	7334	0 %	50 %	25 %	25 %	384548929
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253	NC_017338	TGG	2	6	11343	11348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548931
254	NC_017338	CTTTG	2	10	11373	11382	0 %	60 %	20 %	20 %	384548931
255	NC_017338	ATC	2	6	11384	11389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548931
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257	NC_017338	GTG	2	6	11507	11512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548931
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261	NC_017338	ATT	2	6	11659	11664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548931
262	NC_017338	GT	3	6	11694	11699	0 %	50 %	50 %	0 %	384548931
263	NC_017338	AGC	2	6	11712	11717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548931
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