MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 54730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017338	GCT	2	6	25219	25224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548942
502	NC_017338	AAG	2	6	25235	25240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
503	NC_017338	TTA	2	6	25334	25339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
504	NC_017338	ATT	3	9	25397	25405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
505	NC_017338	CGA	3	9	25407	25415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548942
506	NC_017338	AATC	2	8	25435	25442	50 %	25 %	0 %	25 %	384548942
507	NC_017338	GGT	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548942
508	NC_017338	TA	3	6	25545	25550	50 %	50 %	0 %	0 %	384548942
509	NC_017338	ATA	2	6	25632	25637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
510	NC_017338	TTG	2	6	25653	25658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548942
511	NC_017338	ATT	2	6	25672	25677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
512	NC_017338	ACCAA	2	10	25718	25727	60 %	0 %	0 %	40 %	384548942
513	NC_017338	ATG	2	6	25800	25805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548942
514	NC_017338	TAA	2	6	25831	25836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
515	NC_017338	AAG	2	6	25854	25859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
516	NC_017338	ATT	2	6	25925	25930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
517	NC_017338	CCG	2	6	25939	25944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384548942
518	NC_017338	AGA	2	6	25999	26004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
519	NC_017338	CAT	2	6	26005	26010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548942
520	NC_017338	TTA	2	6	26014	26019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
521	NC_017338	GAA	2	6	26060	26065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
522	NC_017338	AAT	2	6	26075	26080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
523	NC_017338	TTA	2	6	26090	26095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
524	NC_017338	GAA	3	9	26105	26113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
525	NC_017338	AAC	3	9	26202	26210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548942
526	NC_017338	CGT	2	6	26225	26230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548942
527	NC_017338	TTG	2	6	26235	26240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548942
528	NC_017338	GAA	2	6	26303	26308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
529	NC_017338	GAA	2	6	26324	26329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
530	NC_017338	CAC	2	6	26334	26339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548942
531	NC_017338	GAA	2	6	26360	26365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
532	NC_017338	ATCAA	2	10	26430	26439	60 %	20 %	0 %	20 %	384548942
533	NC_017338	TAA	2	6	26470	26475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
534	NC_017338	ATT	2	6	26477	26482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
535	NC_017338	ACA	2	6	26510	26515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548942
536	NC_017338	GGT	2	6	26777	26782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548942
537	NC_017338	ATCT	2	8	26869	26876	25 %	50 %	0 %	25 %	384548942
538	NC_017338	AAT	2	6	26922	26927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
539	NC_017338	TGA	2	6	26968	26973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548943
540	NC_017338	AT	3	6	26987	26992	50 %	50 %	0 %	0 %	384548943
541	NC_017338	AAG	2	6	27042	27047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548943
542	NC_017338	GAAAC	2	10	27051	27060	60 %	0 %	20 %	20 %	384548943
543	NC_017338	ATT	2	6	27114	27119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548943
544	NC_017338	ATC	2	6	27133	27138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548943
545	NC_017338	GAAGT	2	10	27201	27210	40 %	20 %	40 %	0 %	384548943
546	NC_017338	TCG	2	6	27224	27229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548943
547	NC_017338	TGA	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548943
548	NC_017338	ATT	2	6	27272	27277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548943
549	NC_017338	ATTTCA	2	12	27352	27363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384548943
550	NC_017338	ATG	2	6	27382	27387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548943
551	NC_017338	TGA	2	6	27389	27394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548943
552	NC_017338	AAC	2	6	27446	27451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548943
553	NC_017338	T	6	6	27470	27475	0 %	100 %	0 %	0 %	384548943
554	NC_017338	AGC	2	6	27485	27490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548943
555	NC_017338	A	6	6	27495	27500	100 %	0 %	0 %	0 %	384548943
556	NC_017338	ATC	2	6	27522	27527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548943
557	NC_017338	ACAA	2	8	27528	27535	75 %	0 %	0 %	25 %	384548943
558	NC_017338	ACG	2	6	27552	27557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548943
559	NC_017338	AATG	2	8	27632	27639	50 %	25 %	25 %	0 %	384548943
560	NC_017338	TCGT	2	8	27664	27671	0 %	50 %	25 %	25 %	384548943
561	NC_017338	GTG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548943
562	NC_017338	TAC	2	6	27689	27694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548943
563	NC_017338	ACA	2	6	27697	27702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548943
564	NC_017338	ATA	2	6	27703	27708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548943
565	NC_017338	GAA	2	6	27792	27797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548943
566	NC_017338	TTA	2	6	27820	27825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548943
567	NC_017338	TGG	2	6	27833	27838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548943
568	NC_017338	AAT	2	6	27873	27878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548943
569	NC_017338	TAA	2	6	27929	27934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548943
570	NC_017338	TCG	2	6	27989	27994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548943
571	NC_017338	ATA	2	6	28033	28038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548943
572	NC_017338	ATG	2	6	28210	28215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548943
573	NC_017338	TAA	2	6	28331	28336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548944
574	NC_017338	CA	3	6	28348	28353	50 %	0 %	0 %	50 %	384548944
575	NC_017338	AAG	2	6	28393	28398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548944
576	NC_017338	GCA	2	6	28515	28520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548944
577	NC_017338	TGG	2	6	28523	28528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548944
578	NC_017338	ATT	2	6	28532	28537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548944
579	NC_017338	GT	3	6	28612	28617	0 %	50 %	50 %	0 %	384548944
580	NC_017338	GTTCTG	2	12	28651	28662	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384548944
581	NC_017338	AAT	2	6	28701	28706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548944
582	NC_017338	AGA	2	6	28733	28738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548944
583	NC_017338	CAAT	2	8	28761	28768	50 %	25 %	0 %	25 %	384548944
584	NC_017338	GATG	2	8	28769	28776	25 %	25 %	50 %	0 %	384548944
585	NC_017338	ATTAT	2	10	28844	28853	40 %	60 %	0 %	0 %	384548944
586	NC_017338	A	6	6	28866	28871	100 %	0 %	0 %	0 %	384548944
587	NC_017338	TGA	2	6	28874	28879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548944
588	NC_017338	TAC	2	6	28902	28907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548944
589	NC_017338	AACGA	2	10	28917	28926	60 %	0 %	20 %	20 %	384548944
590	NC_017338	TACT	2	8	28991	28998	25 %	50 %	0 %	25 %	384548944
591	NC_017338	ATA	2	6	29014	29019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548944
592	NC_017338	ATT	2	6	29028	29033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548944
593	NC_017338	GTA	2	6	29468	29473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548945
594	NC_017338	GAA	2	6	29548	29553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548945
595	NC_017338	AAAG	2	8	29703	29710	75 %	0 %	25 %	0 %	384548945
596	NC_017338	ATG	2	6	29804	29809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548945
597	NC_017338	ATA	2	6	29837	29842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548945
598	NC_017338	AAG	2	6	29848	29853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548945
599	NC_017338	AAC	2	6	29987	29992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548945
600	NC_017338	ATA	2	6	30101	30106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548945
601	NC_017338	GAAC	2	8	30147	30154	50 %	0 %	25 %	25 %	384548945
602	NC_017338	AAG	2	6	30173	30178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548945
603	NC_017338	AT	3	6	30217	30222	50 %	50 %	0 %	0 %	384548945
604	NC_017338	TTA	2	6	30467	30472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548946
605	NC_017338	AGC	2	6	30543	30548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548946
606	NC_017338	AAC	2	6	30574	30579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548946
607	NC_017338	CAA	2	6	30591	30596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548946
608	NC_017338	CAA	2	6	30605	30610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548946
609	NC_017338	CCAA	2	8	30617	30624	50 %	0 %	0 %	50 %	384548946
610	NC_017338	TCA	2	6	30634	30639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548946
611	NC_017338	GAA	2	6	30647	30652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548946
612	NC_017338	CAAC	2	8	30657	30664	50 %	0 %	0 %	50 %	384548946
613	NC_017338	ATCAGC	2	12	30667	30678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384548946
614	NC_017338	TGA	2	6	30691	30696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548946
615	NC_017338	CAG	2	6	30744	30749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548946
616	NC_017338	CAA	2	6	30753	30758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548946
617	NC_017338	AAACG	2	10	30763	30772	60 %	0 %	20 %	20 %	384548946
618	NC_017338	CAA	2	6	30788	30793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548946
619	NC_017338	CAC	2	6	30861	30866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548946
620	NC_017338	TGC	2	6	30874	30879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548946
621	NC_017338	CAC	2	6	30885	30890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548946
622	NC_017338	ACA	3	9	30893	30901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548946
623	NC_017338	TACA	2	8	30912	30919	50 %	25 %	0 %	25 %	384548946
624	NC_017338	GAA	2	6	30944	30949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548946
625	NC_017338	GAA	2	6	31070	31075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548946
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