MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398 plasmid pS0385-3

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017336	TAA	2	6	797	802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387603997
2	NC_017336	TCT	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603997
3	NC_017336	TGT	2	6	859	864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387603997
4	NC_017336	ATTA	2	8	883	890	50 %	50 %	0 %	0 %	387603997
5	NC_017336	TCT	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603997
6	NC_017336	CCA	2	6	947	952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387603997
7	NC_017336	TTTC	2	8	1010	1017	0 %	75 %	0 %	25 %	387603997
8	NC_017336	ATC	3	9	1018	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387603997
9	NC_017336	A	6	6	1031	1036	100 %	0 %	0 %	0 %	387603997
10	NC_017336	GCT	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387603997
11	NC_017336	T	7	7	1204	1210	0 %	100 %	0 %	0 %	387603997
12	NC_017336	AC	3	6	1229	1234	50 %	0 %	0 %	50 %	387603997
13	NC_017336	TTA	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387603997
14	NC_017336	A	6	6	1301	1306	100 %	0 %	0 %	0 %	387603997
15	NC_017336	CCA	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387603997
16	NC_017336	TTA	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387603997
17	NC_017336	CTT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603997
18	NC_017336	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387603997
19	NC_017336	TATC	2	8	1671	1678	25 %	50 %	0 %	25 %	387603997
20	NC_017336	TC	3	6	1685	1690	0 %	50 %	0 %	50 %	387603997
21	NC_017336	GTT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387603997
22	NC_017336	TAT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387603997
23	NC_017336	TAG	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387603997
24	NC_017336	TAT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387603997
25	NC_017336	CGT	2	6	1808	1813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387603997
26	NC_017336	ATT	2	6	1987	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387603998
27	NC_017336	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387603998
28	NC_017336	TAT	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387603998
29	NC_017336	TGT	2	6	2224	2229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387603998
30	NC_017336	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603998
31	NC_017336	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387603998
32	NC_017336	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387603998
33	NC_017336	CAT	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387603998
34	NC_017336	TCT	2	6	2342	2347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603998
35	NC_017336	TTC	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603998
36	NC_017336	T	7	7	2422	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	387603998
37	NC_017336	CTA	2	6	2433	2438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387603998
38	NC_017336	TCC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387603998
39	NC_017336	TTC	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387603998
40	NC_017336	AT	3	6	2542	2547	50 %	50 %	0 %	0 %	387603998
41	NC_017336	TTTA	2	8	2641	2648	25 %	75 %	0 %	0 %	387603998
42	NC_017336	T	8	8	2679	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	387603998
43	NC_017336	ATAA	2	8	2720	2727	75 %	25 %	0 %	0 %	387603998
44	NC_017336	CAA	2	6	2754	2759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387603998
45	NC_017336	TA	3	6	2806	2811	50 %	50 %	0 %	0 %	387603998
46	NC_017336	T	6	6	2831	2836	0 %	100 %	0 %	0 %	387603998
47	NC_017336	ATATC	2	10	2838	2847	40 %	40 %	0 %	20 %	387603998

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.