MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398 plasmid pS0385-2

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017335	A	6	6	177	182	100 %	0 %	0 %	0 %	384551504
2	NC_017335	ATT	2	6	251	256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
3	NC_017335	A	7	7	289	295	100 %	0 %	0 %	0 %	384551504
4	NC_017335	T	6	6	322	327	0 %	100 %	0 %	0 %	384551504
5	NC_017335	CA	3	6	349	354	50 %	0 %	0 %	50 %	384551504
6	NC_017335	GAA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551504
7	NC_017335	ATT	2	6	385	390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
8	NC_017335	AGA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551504
9	NC_017335	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
10	NC_017335	TA	3	6	452	457	50 %	50 %	0 %	0 %	384551504
11	NC_017335	ATTA	2	8	493	500	50 %	50 %	0 %	0 %	384551504
12	NC_017335	ATT	2	6	606	611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
13	NC_017335	A	7	7	616	622	100 %	0 %	0 %	0 %	384551504
14	NC_017335	AGA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551504
15	NC_017335	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
16	NC_017335	AAT	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551504
17	NC_017335	ATT	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
18	NC_017335	TTTAG	2	10	800	809	20 %	60 %	20 %	0 %	384551504
19	NC_017335	TGT	2	6	920	925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551504
20	NC_017335	ATT	2	6	928	933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
21	NC_017335	ATT	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551504
22	NC_017335	GTT	2	6	957	962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551504
23	NC_017335	A	7	7	990	996	100 %	0 %	0 %	0 %	384551504
24	NC_017335	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551504
25	NC_017335	AATT	2	8	1028	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	384551504
26	NC_017335	CAA	2	6	1687	1692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551505
27	NC_017335	ATTA	2	8	1728	1735	50 %	50 %	0 %	0 %	384551505
28	NC_017335	AGA	2	6	1739	1744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
29	NC_017335	AGA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
30	NC_017335	A	6	6	1756	1761	100 %	0 %	0 %	0 %	384551505
31	NC_017335	A	7	7	1923	1929	100 %	0 %	0 %	0 %	384551505
32	NC_017335	ATCACA	2	12	1981	1992	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384551505
33	NC_017335	TTA	3	9	1993	2001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551505
34	NC_017335	CAA	2	6	2024	2029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551505
35	NC_017335	CAAA	2	8	2038	2045	75 %	0 %	0 %	25 %	384551505
36	NC_017335	AAC	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551505
37	NC_017335	A	6	6	2063	2068	100 %	0 %	0 %	0 %	384551505
38	NC_017335	GAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
39	NC_017335	TCA	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551505
40	NC_017335	CAGAA	2	10	2143	2152	60 %	0 %	20 %	20 %	384551505
41	NC_017335	GATA	2	8	2156	2163	50 %	25 %	25 %	0 %	384551505
42	NC_017335	GAA	2	6	2205	2210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
43	NC_017335	GAA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
44	NC_017335	AACGT	2	10	2295	2304	40 %	20 %	20 %	20 %	384551505
45	NC_017335	GAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
46	NC_017335	A	6	6	2325	2330	100 %	0 %	0 %	0 %	384551505
47	NC_017335	ACGAGA	2	12	2405	2416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384551505
48	NC_017335	AGA	3	9	2414	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
49	NC_017335	AGA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
50	NC_017335	GAA	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
51	NC_017335	GAA	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551505
52	NC_017335	TAA	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551505
53	NC_017335	AT	4	8	2547	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	384551505
54	NC_017335	AAC	2	6	2567	2572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551505
55	NC_017335	GA	3	6	2580	2585	50 %	0 %	50 %	0 %	384551505
56	NC_017335	GAC	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551505
57	NC_017335	GGA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384551505
58	NC_017335	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	384551506
59	NC_017335	AGA	2	6	2709	2714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551506
60	NC_017335	GAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551506
61	NC_017335	ATTC	2	8	2761	2768	25 %	50 %	0 %	25 %	384551506
62	NC_017335	A	6	6	2807	2812	100 %	0 %	0 %	0 %	384551506
63	NC_017335	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551506
64	NC_017335	TTA	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551506
65	NC_017335	AGCA	2	8	2937	2944	50 %	0 %	25 %	25 %	384551506
66	NC_017335	TA	3	6	3004	3009	50 %	50 %	0 %	0 %	384551506
67	NC_017335	TATT	2	8	3023	3030	25 %	75 %	0 %	0 %	384551506
68	NC_017335	TAAA	2	8	3221	3228	75 %	25 %	0 %	0 %	384551507
69	NC_017335	CAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551507
70	NC_017335	GAA	2	6	3258	3263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551507
71	NC_017335	AAG	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551507
72	NC_017335	AGT	3	9	3309	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551507
73	NC_017335	A	6	6	3364	3369	100 %	0 %	0 %	0 %	384551507
74	NC_017335	TAA	2	6	3379	3384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551507

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.