MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 56183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017333	ATACG	2	10	148918	148927	40 %	20 %	20 %	20 %	387601433
3002	NC_017333	TAA	2	6	148935	148940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601433
3003	NC_017333	TGG	2	6	149014	149019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601433
3004	NC_017333	AAG	2	6	149184	149189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601433
3005	NC_017333	TTTA	2	8	149335	149342	25 %	75 %	0 %	0 %	387601434
3006	NC_017333	TTA	2	6	149361	149366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3007	NC_017333	T	6	6	149378	149383	0 %	100 %	0 %	0 %	387601434
3008	NC_017333	ATT	2	6	149394	149399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3009	NC_017333	ATT	2	6	149418	149423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3010	NC_017333	T	6	6	149439	149444	0 %	100 %	0 %	0 %	387601434
3011	NC_017333	GAT	2	6	149445	149450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601434
3012	NC_017333	TTA	2	6	149458	149463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3013	NC_017333	ATTT	2	8	149511	149518	25 %	75 %	0 %	0 %	387601434
3014	NC_017333	GAT	2	6	149528	149533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601434
3015	NC_017333	A	6	6	149556	149561	100 %	0 %	0 %	0 %	387601434
3016	NC_017333	TTATA	2	10	149576	149585	40 %	60 %	0 %	0 %	387601434
3017	NC_017333	TAT	2	6	149612	149617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3018	NC_017333	ATT	2	6	149651	149656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3019	NC_017333	TGA	2	6	149663	149668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601434
3020	NC_017333	AATG	2	8	149687	149694	50 %	25 %	25 %	0 %	387601434
3021	NC_017333	ATT	2	6	149721	149726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3022	NC_017333	ATTT	2	8	149853	149860	25 %	75 %	0 %	0 %	387601434
3023	NC_017333	TTA	2	6	149863	149868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3024	NC_017333	TAG	2	6	149879	149884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601434
3025	NC_017333	TATAA	2	10	149946	149955	60 %	40 %	0 %	0 %	387601434
3026	NC_017333	ACT	2	6	149956	149961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601434
3027	NC_017333	CAT	2	6	150037	150042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601434
3028	NC_017333	TTG	2	6	150172	150177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601434
3029	NC_017333	ATA	2	6	150181	150186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601434
3030	NC_017333	TTAT	2	8	150231	150238	25 %	75 %	0 %	0 %	387601434
3031	NC_017333	ATTT	2	8	150249	150256	25 %	75 %	0 %	0 %	387601434
3032	NC_017333	ATT	2	6	150257	150262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3033	NC_017333	ATT	2	6	150266	150271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601434
3034	NC_017333	TTG	2	6	150307	150312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601434
3035	NC_017333	TAA	2	6	150353	150358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601434
3036	NC_017333	TTTTA	2	10	150374	150383	20 %	80 %	0 %	0 %	387601434
3037	NC_017333	ATT	2	6	150460	150465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3038	NC_017333	ATT	2	6	150520	150525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3039	NC_017333	GTG	2	6	150545	150550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601435
3040	NC_017333	TTTC	2	8	150566	150573	0 %	75 %	0 %	25 %	387601435
3041	NC_017333	TGA	2	6	150593	150598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3042	NC_017333	CAG	2	6	150673	150678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601435
3043	NC_017333	ATT	2	6	150702	150707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3044	NC_017333	AT	4	8	150730	150737	50 %	50 %	0 %	0 %	387601435
3045	NC_017333	GAT	2	6	150760	150765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3046	NC_017333	CTA	2	6	150781	150786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601435
3047	NC_017333	TAT	2	6	150798	150803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3048	NC_017333	GCA	2	6	150808	150813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601435
3049	NC_017333	TTG	2	6	150875	150880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601435
3050	NC_017333	GTT	2	6	150904	150909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601435
3051	NC_017333	ATCA	2	8	150923	150930	50 %	25 %	0 %	25 %	387601435
3052	NC_017333	TCGT	2	8	151056	151063	0 %	50 %	25 %	25 %	387601435
3053	NC_017333	TTA	2	6	151075	151080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3054	NC_017333	TA	3	6	151100	151105	50 %	50 %	0 %	0 %	387601435
3055	NC_017333	GTT	2	6	151120	151125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601435
3056	NC_017333	TAG	2	6	151133	151138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3057	NC_017333	CAA	2	6	151147	151152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601435
3058	NC_017333	TAA	2	6	151287	151292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601435
3059	NC_017333	CAT	2	6	151352	151357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601435
3060	NC_017333	TTTA	2	8	151358	151365	25 %	75 %	0 %	0 %	387601435
3061	NC_017333	TGA	2	6	151403	151408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3062	NC_017333	TTA	2	6	151468	151473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3063	NC_017333	AATAA	2	10	151480	151489	80 %	20 %	0 %	0 %	387601435
3064	NC_017333	TA	3	6	151493	151498	50 %	50 %	0 %	0 %	387601435
3065	NC_017333	TAT	2	6	151535	151540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3066	NC_017333	AT	3	6	151552	151557	50 %	50 %	0 %	0 %	387601435
3067	NC_017333	TGC	2	6	151575	151580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601435
3068	NC_017333	TGC	2	6	151686	151691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601435
3069	NC_017333	ATG	2	6	151696	151701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3070	NC_017333	ATT	2	6	151727	151732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601435
3071	NC_017333	CCT	2	6	151735	151740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387601435
3072	NC_017333	TACGC	2	10	151747	151756	20 %	20 %	20 %	40 %	387601435
3073	NC_017333	TAG	2	6	151778	151783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3074	NC_017333	ATG	2	6	151798	151803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601435
3075	NC_017333	CATATG	2	12	152156	152167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601436
3076	NC_017333	AT	3	6	152181	152186	50 %	50 %	0 %	0 %	387601436
3077	NC_017333	TCA	2	6	152208	152213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601436
3078	NC_017333	TACG	2	8	152229	152236	25 %	25 %	25 %	25 %	387601436
3079	NC_017333	ATCA	2	8	152279	152286	50 %	25 %	0 %	25 %	387601436
3080	NC_017333	TAA	2	6	152346	152351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601436
3081	NC_017333	GGT	2	6	152356	152361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601436
3082	NC_017333	CATT	2	8	152371	152378	25 %	50 %	0 %	25 %	387601436
3083	NC_017333	GAA	2	6	152407	152412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601436
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3085	NC_017333	CAA	2	6	152489	152494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601436
3086	NC_017333	ATT	2	6	152496	152501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601436
3087	NC_017333	GTT	2	6	152524	152529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601436
3088	NC_017333	ATG	2	6	152531	152536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601436
3089	NC_017333	CTA	2	6	152628	152633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601436
3090	NC_017333	A	6	6	152695	152700	100 %	0 %	0 %	0 %	387601436
3091	NC_017333	TGA	2	6	152703	152708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601436
3092	NC_017333	AGC	2	6	152718	152723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601436
3093	NC_017333	ATA	2	6	152727	152732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601436
3094	NC_017333	A	6	6	153102	153107	100 %	0 %	0 %	0 %	387601437
3095	NC_017333	AATG	2	8	153194	153201	50 %	25 %	25 %	0 %	387601437
3096	NC_017333	ATC	2	6	153232	153237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601437
3097	NC_017333	AGT	2	6	153251	153256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601437
3098	NC_017333	ATG	2	6	153355	153360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601437
3099	NC_017333	TGG	2	6	153518	153523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601437
3100	NC_017333	CAA	2	6	153561	153566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601437
3101	NC_017333	AC	4	8	153583	153590	50 %	0 %	0 %	50 %	387601437
3102	NC_017333	CA	3	6	153604	153609	50 %	0 %	0 %	50 %	387601437
3103	NC_017333	ATC	2	6	153629	153634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601437
3104	NC_017333	ATG	2	6	153645	153650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601437
3105	NC_017333	TCA	2	6	153672	153677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601437
3106	NC_017333	ATC	2	6	153679	153684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601437
3107	NC_017333	CAA	2	6	153698	153703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601437
3108	NC_017333	A	6	6	153702	153707	100 %	0 %	0 %	0 %	387601437
3109	NC_017333	GCT	2	6	153717	153722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601437
3110	NC_017333	ACT	2	6	153767	153772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601437
3111	NC_017333	GAC	2	6	153802	153807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601437
3112	NC_017333	CAA	2	6	153811	153816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601437
3113	NC_017333	TAA	2	6	154016	154021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601438
3114	NC_017333	TTA	2	6	154079	154084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601438
3115	NC_017333	AAT	2	6	154123	154128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601438
3116	NC_017333	CAA	2	6	154133	154138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601438
3117	NC_017333	TGAT	2	8	154210	154217	25 %	50 %	25 %	0 %	387601438
3118	NC_017333	AACG	2	8	154243	154250	50 %	0 %	25 %	25 %	387601438
3119	NC_017333	GTC	2	6	154258	154263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601438
3120	NC_017333	GCTT	2	8	154334	154341	0 %	50 %	25 %	25 %	387601438
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3122	NC_017333	ATA	2	6	154363	154368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601438
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3231	NC_017333	TG	3	6	159932	159937	0 %	50 %	50 %	0 %	387601443
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3240	NC_017333	TGA	2	6	160445	160450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601444
3241	NC_017333	ATA	2	6	160467	160472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601444
3242	NC_017333	TGT	2	6	160556	160561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601444
3243	NC_017333	TTTG	2	8	160587	160594	0 %	75 %	25 %	0 %	387601444
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3492	NC_017333	CAT	2	6	173832	173837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601455
3493	NC_017333	ATTT	2	8	173846	173853	25 %	75 %	0 %	0 %	387601455
3494	NC_017333	ATC	2	6	173863	173868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601455
3495	NC_017333	GTGA	2	8	173889	173896	25 %	25 %	50 %	0 %	387601455
3496	NC_017333	GAC	2	6	173921	173926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601455
3497	NC_017333	TTA	2	6	173935	173940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601455
3498	NC_017333	TGG	2	6	173944	173949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601455
3499	NC_017333	T	6	6	173979	173984	0 %	100 %	0 %	0 %	387601455
3500	NC_017333	GAT	2	6	174005	174010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601455

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