MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_2

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017332	ATA	2	6	658	663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144418
2	NC_017332	CTT	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144418
3	NC_017332	TCA	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144418
4	NC_017332	ATTA	2	8	745	752	50 %	50 %	0 %	0 %	387144418
5	NC_017332	CCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144418
6	NC_017332	T	7	7	872	878	0 %	100 %	0 %	0 %	387144418
7	NC_017332	A	6	6	893	898	100 %	0 %	0 %	0 %	387144418
8	NC_017332	TTC	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144418
9	NC_017332	TA	3	6	1054	1059	50 %	50 %	0 %	0 %	387144418
10	NC_017332	T	7	7	1066	1072	0 %	100 %	0 %	0 %	387144418
11	NC_017332	CAT	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144418
12	NC_017332	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144418
13	NC_017332	CAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144418
14	NC_017332	TTAG	2	8	1220	1227	25 %	50 %	25 %	0 %	387144418
15	NC_017332	CAAC	2	8	1291	1298	50 %	0 %	0 %	50 %	387144418
16	NC_017332	CTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144418
17	NC_017332	TCGG	2	8	1439	1446	0 %	25 %	50 %	25 %	387144418
18	NC_017332	T	6	6	1490	1495	0 %	100 %	0 %	0 %	387144418
19	NC_017332	TTTTC	2	10	1539	1548	0 %	80 %	0 %	20 %	387144418
20	NC_017332	TC	3	6	1547	1552	0 %	50 %	0 %	50 %	387144418
21	NC_017332	GTT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144418
22	NC_017332	TAT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144418
23	NC_017332	TAG	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144418
24	NC_017332	TAT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144418
25	NC_017332	AATG	2	8	2092	2099	50 %	25 %	25 %	0 %	387144419
26	NC_017332	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	387144419
27	NC_017332	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	387144419
28	NC_017332	AATTTT	2	12	2177	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144419
29	NC_017332	AAG	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144419
30	NC_017332	CAAAA	2	10	2204	2213	80 %	0 %	0 %	20 %	387144419
31	NC_017332	ACA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144419
32	NC_017332	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	387144419
33	NC_017332	ATT	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144419
34	NC_017332	GATATG	2	12	2352	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144419
35	NC_017332	TGG	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144419
36	NC_017332	GCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144419
37	NC_017332	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144419
38	NC_017332	GCA	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144419
39	NC_017332	A	7	7	2572	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	387144419
40	NC_017332	CTA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144419

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.