MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017328	CAG	2	6	225007	225012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541778
4002	NC_017328	GA	3	6	225029	225034	50 %	0 %	50 %	0 %	384541778
4003	NC_017328	CTT	2	6	225056	225061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541778
4004	NC_017328	CGC	2	6	225391	225396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541778
4005	NC_017328	GTC	3	9	225425	225433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541778
4006	NC_017328	CAT	2	6	225455	225460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541778
4007	NC_017328	GTT	2	6	225474	225479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541778
4008	NC_017328	CAA	2	6	225484	225489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541778
4009	NC_017328	CG	3	6	225498	225503	0 %	0 %	50 %	50 %	384541778
4010	NC_017328	GTA	3	9	225622	225630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541778
4011	NC_017328	T	6	6	225653	225658	0 %	100 %	0 %	0 %	384541778
4012	NC_017328	TTTCTG	2	12	225737	225748	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384541778
4013	NC_017328	TCG	2	6	225789	225794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541778
4014	NC_017328	TCCA	2	8	225843	225850	25 %	25 %	0 %	50 %	384541778
4015	NC_017328	TGC	2	6	225872	225877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541778
4016	NC_017328	GTGC	2	8	225907	225914	0 %	25 %	50 %	25 %	384541778
4017	NC_017328	TG	4	8	225985	225992	0 %	50 %	50 %	0 %	384541778
4018	NC_017328	TCTT	2	8	226067	226074	0 %	75 %	0 %	25 %	384541779
4019	NC_017328	GTT	2	6	226104	226109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541779
4020	NC_017328	AAT	2	6	226112	226117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541779
4021	NC_017328	TTC	2	6	226120	226125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541779
4022	NC_017328	ATTA	2	8	226135	226142	50 %	50 %	0 %	0 %	384541779
4023	NC_017328	A	7	7	226163	226169	100 %	0 %	0 %	0 %	384541779
4024	NC_017328	T	6	6	226217	226222	0 %	100 %	0 %	0 %	384541779
4025	NC_017328	ATA	2	6	226246	226251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541779
4026	NC_017328	TGAT	2	8	226369	226376	25 %	50 %	25 %	0 %	384541779
4027	NC_017328	AAC	2	6	226400	226405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541779
4028	NC_017328	CACC	2	8	226412	226419	25 %	0 %	0 %	75 %	384541779
4029	NC_017328	CGC	2	6	226434	226439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541779
4030	NC_017328	TGT	2	6	226555	226560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541779
4031	NC_017328	CCA	2	6	226614	226619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541779
4032	NC_017328	CGC	2	6	226629	226634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541779
4033	NC_017328	GTG	2	6	226645	226650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541779
4034	NC_017328	TGG	2	6	226652	226657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541779
4035	NC_017328	TCA	2	6	226754	226759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541779
4036	NC_017328	TCA	2	6	226781	226786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541779
4037	NC_017328	TGA	2	6	226844	226849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541780
4038	NC_017328	TCA	2	6	227034	227039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541780
4039	NC_017328	GTG	2	6	227148	227153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541780
4040	NC_017328	TTA	2	6	227170	227175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541780
4041	NC_017328	TGAT	2	8	227195	227202	25 %	50 %	25 %	0 %	384541780
4042	NC_017328	TGGC	2	8	227205	227212	0 %	25 %	50 %	25 %	384541780
4043	NC_017328	ACTGG	2	10	227322	227331	20 %	20 %	40 %	20 %	384541780
4044	NC_017328	CT	3	6	227332	227337	0 %	50 %	0 %	50 %	384541780
4045	NC_017328	TTG	2	6	227338	227343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541780
4046	NC_017328	TGC	2	6	227354	227359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541780
4047	NC_017328	AACA	2	8	227389	227396	75 %	0 %	0 %	25 %	384541780
4048	NC_017328	GGA	2	6	227398	227403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541780
4049	NC_017328	TTG	2	6	227450	227455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541780
4050	NC_017328	CGC	2	6	227610	227615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541781
4051	NC_017328	TCA	2	6	227629	227634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541781
4052	NC_017328	CGTT	2	8	227638	227645	0 %	50 %	25 %	25 %	384541781
4053	NC_017328	CCCATT	2	12	227672	227683	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384541781
4054	NC_017328	TGC	2	6	227692	227697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541781
4055	NC_017328	GCA	2	6	227704	227709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541781
4056	NC_017328	T	6	6	227734	227739	0 %	100 %	0 %	0 %	384541781
4057	NC_017328	T	6	6	227745	227750	0 %	100 %	0 %	0 %	384541781
4058	NC_017328	CTG	2	6	227753	227758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541781
4059	NC_017328	T	6	6	227772	227777	0 %	100 %	0 %	0 %	384541781
4060	NC_017328	GTT	2	6	227898	227903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541781
4061	NC_017328	GGT	2	6	227904	227909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541781
4062	NC_017328	ACC	2	6	228139	228144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541781
4063	NC_017328	AGT	2	6	228207	228212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541782
4064	NC_017328	TGG	2	6	228266	228271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541782
4065	NC_017328	TGA	2	6	228303	228308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541782
4066	NC_017328	CGCGG	2	10	228367	228376	0 %	0 %	60 %	40 %	384541782
4067	NC_017328	AACG	2	8	228569	228576	50 %	0 %	25 %	25 %	384541782
4068	NC_017328	GGT	2	6	228634	228639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541782
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4070	NC_017328	CAG	2	6	228676	228681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541782
4071	NC_017328	CAA	2	6	228682	228687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541782
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4073	NC_017328	AAGT	2	8	228723	228730	50 %	25 %	25 %	0 %	384541782
4074	NC_017328	GTT	2	6	228736	228741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541782
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4077	NC_017328	CAG	2	6	229192	229197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541783
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4083	NC_017328	TCTGC	2	10	229416	229425	0 %	40 %	20 %	40 %	384541783
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4104	NC_017328	CCG	2	6	230181	230186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541783
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4108	NC_017328	G	8	8	230752	230759	0 %	0 %	100 %	0 %	384541785
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4118	NC_017328	GGCG	2	8	231229	231236	0 %	0 %	75 %	25 %	384541786
4119	NC_017328	CGCC	2	8	231248	231255	0 %	0 %	25 %	75 %	384541786
4120	NC_017328	GTGATG	2	12	231340	231351	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384541786
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4122	NC_017328	GCG	2	6	231462	231467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541786
4123	NC_017328	TCA	2	6	231508	231513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541786
4124	NC_017328	GTG	2	6	231556	231561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541786
4125	NC_017328	CCA	3	9	231626	231634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541786
4126	NC_017328	CGT	2	6	231645	231650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541786
4127	NC_017328	TGG	2	6	231739	231744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541786
4128	NC_017328	CGG	2	6	231756	231761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541786
4129	NC_017328	CAG	2	6	231771	231776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541786
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4135	NC_017328	GCCA	2	8	232005	232012	25 %	0 %	25 %	50 %	384541786
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4138	NC_017328	GCAGG	2	10	232193	232202	20 %	0 %	60 %	20 %	384541786
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4142	NC_017328	CG	3	6	232331	232336	0 %	0 %	50 %	50 %	384541786
4143	NC_017328	CTT	2	6	232364	232369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541786
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4146	NC_017328	GCG	2	6	232573	232578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541786
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4152	NC_017328	GGC	2	6	232805	232810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541787
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4154	NC_017328	GGC	2	6	232939	232944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541787
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4163	NC_017328	CCGC	2	8	233499	233506	0 %	0 %	25 %	75 %	384541788
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4215	NC_017328	TTG	2	6	237847	237852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541794
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4224	NC_017328	GGAT	2	8	238327	238334	25 %	25 %	50 %	0 %	384541794
4225	NC_017328	TGG	2	6	238371	238376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541794
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4228	NC_017328	A	6	6	238426	238431	100 %	0 %	0 %	0 %	384541794
4229	NC_017328	ATG	2	6	238495	238500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541794
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4231	NC_017328	AGC	2	6	238528	238533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541794
4232	NC_017328	ATG	2	6	238563	238568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541794
4233	NC_017328	ATG	2	6	238638	238643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541794
4234	NC_017328	GAG	2	6	238689	238694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541794
4235	NC_017328	TGA	2	6	238712	238717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541794
4236	NC_017328	ACG	3	9	238741	238749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541794
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4238	NC_017328	ATG	2	6	238776	238781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541794
4239	NC_017328	CGC	2	6	238782	238787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541794
4240	NC_017328	ATG	2	6	238797	238802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541794
4241	NC_017328	A	6	6	238812	238817	100 %	0 %	0 %	0 %	384541794
4242	NC_017328	CGA	2	6	238877	238882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541795
4243	NC_017328	GCGA	2	8	238929	238936	25 %	0 %	50 %	25 %	384541795
4244	NC_017328	ACTAC	2	10	239008	239017	40 %	20 %	0 %	40 %	384541795
4245	NC_017328	TGT	2	6	239042	239047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541795
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4247	NC_017328	CAA	2	6	239285	239290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541795
4248	NC_017328	AGCA	2	8	239352	239359	50 %	0 %	25 %	25 %	384541795
4249	NC_017328	ATG	2	6	239512	239517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541795
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4252	NC_017328	CAG	2	6	239613	239618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541795
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4346	NC_017328	CAT	2	6	244570	244575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541800
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4476	NC_017328	AGA	2	6	252356	252361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541808
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4481	NC_017328	ACTG	2	8	252425	252432	25 %	25 %	25 %	25 %	384541808
4482	NC_017328	TCA	2	6	252473	252478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541808
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4484	NC_017328	CAA	2	6	252542	252547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541808
4485	NC_017328	CTGG	2	8	252549	252556	0 %	25 %	50 %	25 %	384541808
4486	NC_017328	CCT	2	6	252596	252601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541808
4487	NC_017328	CAA	2	6	252744	252749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541808
4488	NC_017328	GCA	2	6	252952	252957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541808
4489	NC_017328	GCCTGT	2	12	252982	252993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541808
4490	NC_017328	GCC	3	9	253053	253061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541808
4491	NC_017328	AGC	2	6	253087	253092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541808
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4493	NC_017328	GC	3	6	253316	253321	0 %	0 %	50 %	50 %	384541808
4494	NC_017328	T	7	7	253397	253403	0 %	100 %	0 %	0 %	384541808
4495	NC_017328	AGTG	2	8	253415	253422	25 %	25 %	50 %	0 %	384541808
4496	NC_017328	A	6	6	253458	253463	100 %	0 %	0 %	0 %	384541808
4497	NC_017328	GCC	2	6	253464	253469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541808
4498	NC_017328	CCCAT	2	10	253513	253522	20 %	20 %	0 %	60 %	384541808
4499	NC_017328	ATA	2	6	253537	253542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541808
4500	NC_017328	T	6	6	253543	253548	0 %	100 %	0 %	0 %	384541808

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