MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_017328	GGTT	2	8	1252360	1252367	0 %	50 %	50 %	0 %	384542782
21003	NC_017328	CAC	2	6	1252425	1252430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542782
21004	NC_017328	GCAA	2	8	1252431	1252438	50 %	0 %	25 %	25 %	384542782
21005	NC_017328	GCG	2	6	1252578	1252583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542783
21006	NC_017328	CAGC	2	8	1252620	1252627	25 %	0 %	25 %	50 %	384542783
21007	NC_017328	TGG	2	6	1252628	1252633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542783
21008	NC_017328	TGG	2	6	1252656	1252661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542783
21009	NC_017328	CAT	2	6	1252724	1252729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542783
21010	NC_017328	TG	3	6	1252768	1252773	0 %	50 %	50 %	0 %	384542783
21011	NC_017328	ATA	2	6	1252794	1252799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542783
21012	NC_017328	CTG	2	6	1252898	1252903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542783
21013	NC_017328	GAA	2	6	1252970	1252975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542783
21014	NC_017328	T	6	6	1253084	1253089	0 %	100 %	0 %	0 %	384542783
21015	NC_017328	GTG	2	6	1253251	1253256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542784
21016	NC_017328	AAAGT	2	10	1253299	1253308	60 %	20 %	20 %	0 %	384542784
21017	NC_017328	GTT	2	6	1253310	1253315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542784
21018	NC_017328	AAG	2	6	1253328	1253333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542785
21019	NC_017328	TGGA	2	8	1253487	1253494	25 %	25 %	50 %	0 %	384542785
21020	NC_017328	CA	3	6	1253516	1253521	50 %	0 %	0 %	50 %	384542785
21021	NC_017328	CTGC	2	8	1253544	1253551	0 %	25 %	25 %	50 %	384542785
21022	NC_017328	TGG	2	6	1253615	1253620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542785
21023	NC_017328	TC	3	6	1253631	1253636	0 %	50 %	0 %	50 %	384542785
21024	NC_017328	CTGC	2	8	1253672	1253679	0 %	25 %	25 %	50 %	384542785
21025	NC_017328	GAA	2	6	1253849	1253854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542785
21026	NC_017328	CGGTAT	2	12	1253876	1253887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384542785
21027	NC_017328	GAA	2	6	1253901	1253906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542785
21028	NC_017328	CAT	2	6	1253990	1253995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542785
21029	NC_017328	GAA	2	6	1254045	1254050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542785
21030	NC_017328	CGG	2	6	1254071	1254076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542785
21031	NC_017328	CTG	2	6	1254162	1254167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542785
21032	NC_017328	ATG	2	6	1254181	1254186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542785
21033	NC_017328	CGGTAT	2	12	1254248	1254259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384542785
21034	NC_017328	CCAC	2	8	1254304	1254311	25 %	0 %	0 %	75 %	384542785
21035	NC_017328	TAT	2	6	1254359	1254364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542785
21036	NC_017328	TC	3	6	1254365	1254370	0 %	50 %	0 %	50 %	384542785
21037	NC_017328	GAT	2	6	1254377	1254382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542785
21038	NC_017328	CTG	2	6	1254498	1254503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542785
21039	NC_017328	ATC	2	6	1254528	1254533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542785
21040	NC_017328	TGT	2	6	1254752	1254757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542786
21041	NC_017328	TCAGAT	2	12	1254759	1254770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384542786
21042	NC_017328	GCCA	2	8	1254846	1254853	25 %	0 %	25 %	50 %	384542786
21043	NC_017328	CAG	2	6	1254886	1254891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542786
21044	NC_017328	AGA	2	6	1254896	1254901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542786
21045	NC_017328	TCC	2	6	1254951	1254956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542786
21046	NC_017328	CAGC	2	8	1254979	1254986	25 %	0 %	25 %	50 %	384542786
21047	NC_017328	ATCAC	2	10	1255043	1255052	40 %	20 %	0 %	40 %	384542786
21048	NC_017328	T	6	6	1255093	1255098	0 %	100 %	0 %	0 %	384542786
21049	NC_017328	TGCG	2	8	1255136	1255143	0 %	25 %	50 %	25 %	384542786
21050	NC_017328	TTA	2	6	1255486	1255491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542787
21051	NC_017328	GCC	2	6	1255563	1255568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542787
21052	NC_017328	ATCA	2	8	1255575	1255582	50 %	25 %	0 %	25 %	384542787
21053	NC_017328	GAA	2	6	1255590	1255595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542787
21054	NC_017328	GGAA	2	8	1255633	1255640	50 %	0 %	50 %	0 %	384542787
21055	NC_017328	GAG	2	6	1255650	1255655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542787
21056	NC_017328	AGC	2	6	1255676	1255681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542787
21057	NC_017328	ATC	2	6	1255704	1255709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542787
21058	NC_017328	CCTG	2	8	1255742	1255749	0 %	25 %	25 %	50 %	384542787
21059	NC_017328	CTG	2	6	1255761	1255766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542787
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21063	NC_017328	TGATG	2	10	1255982	1255991	20 %	40 %	40 %	0 %	384542787
21064	NC_017328	TAT	2	6	1256051	1256056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542787
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21067	NC_017328	AATA	2	8	1256210	1256217	75 %	25 %	0 %	0 %	384542787
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21073	NC_017328	ATT	2	6	1256478	1256483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542787
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21085	NC_017328	GAAGGT	2	12	1256942	1256953	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384542787
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21088	NC_017328	ATT	2	6	1257120	1257125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542788
21089	NC_017328	CT	3	6	1257129	1257134	0 %	50 %	0 %	50 %	384542788
21090	NC_017328	ATC	2	6	1257137	1257142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542788
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21099	NC_017328	GCGTGT	2	12	1258250	1258261	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384542790
21100	NC_017328	TCT	2	6	1258265	1258270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542790
21101	NC_017328	TGA	2	6	1258273	1258278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542790
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21107	NC_017328	ATC	2	6	1258765	1258770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542790
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21109	NC_017328	GAT	2	6	1258862	1258867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542790
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21111	NC_017328	ATA	2	6	1258950	1258955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542790
21112	NC_017328	CAA	2	6	1258998	1259003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542790
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21114	NC_017328	GAT	3	9	1259066	1259074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542790
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21118	NC_017328	TTA	2	6	1259217	1259222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542790
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21462	NC_017328	CTG	2	6	1282965	1282970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542820
21463	NC_017328	AT	3	6	1283028	1283033	50 %	50 %	0 %	0 %	384542820
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21465	NC_017328	AC	3	6	1283164	1283169	50 %	0 %	0 %	50 %	384542820
21466	NC_017328	TGC	2	6	1283195	1283200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542820
21467	NC_017328	AC	3	6	1283287	1283292	50 %	0 %	0 %	50 %	384542820
21468	NC_017328	AAAC	2	8	1283315	1283322	75 %	0 %	0 %	25 %	384542820
21469	NC_017328	ACC	2	6	1283389	1283394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542820
21470	NC_017328	T	6	6	1283403	1283408	0 %	100 %	0 %	0 %	384542820
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21485	NC_017328	GCA	2	6	1283939	1283944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542820
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21492	NC_017328	GCA	2	6	1284166	1284171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542820
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21496	NC_017328	CGC	2	6	1284234	1284239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542820
21497	NC_017328	CAT	2	6	1284240	1284245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542820
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21499	NC_017328	CGCCAG	2	12	1284360	1284371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384542820
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