MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017328	AC	3	6	1126473	1126478	50 %	0 %	0 %	50 %	384542651
19003	NC_017328	CTG	2	6	1126541	1126546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542651
19004	NC_017328	AC	3	6	1126575	1126580	50 %	0 %	0 %	50 %	384542651
19005	NC_017328	AGC	2	6	1126605	1126610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542651
19006	NC_017328	AGGC	2	8	1126617	1126624	25 %	0 %	50 %	25 %	384542651
19007	NC_017328	TG	3	6	1126632	1126637	0 %	50 %	50 %	0 %	384542651
19008	NC_017328	TAA	2	6	1126719	1126724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542651
19009	NC_017328	TCC	2	6	1126737	1126742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542651
19010	NC_017328	TGA	2	6	1126764	1126769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542651
19011	NC_017328	ATG	2	6	1126828	1126833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542651
19012	NC_017328	GTT	2	6	1126969	1126974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542652
19013	NC_017328	CAG	2	6	1126994	1126999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542652
19014	NC_017328	CCA	2	6	1127008	1127013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542652
19015	NC_017328	ACCAG	2	10	1127093	1127102	40 %	0 %	20 %	40 %	384542652
19016	NC_017328	CGT	2	6	1127218	1127223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542652
19017	NC_017328	GTC	2	6	1127227	1127232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542652
19018	NC_017328	TCAT	2	8	1127261	1127268	25 %	50 %	0 %	25 %	384542652
19019	NC_017328	TGCC	2	8	1127287	1127294	0 %	25 %	25 %	50 %	384542652
19020	NC_017328	CAG	2	6	1127443	1127448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542653
19021	NC_017328	GGA	2	6	1127477	1127482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542653
19022	NC_017328	AC	3	6	1127728	1127733	50 %	0 %	0 %	50 %	384542654
19023	NC_017328	GCT	2	6	1127827	1127832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542654
19024	NC_017328	AGCGA	2	10	1127997	1128006	40 %	0 %	40 %	20 %	384542654
19025	NC_017328	AAC	2	6	1128025	1128030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542654
19026	NC_017328	CAA	2	6	1128143	1128148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542654
19027	NC_017328	CAT	2	6	1128241	1128246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542656
19028	NC_017328	CATT	2	8	1128295	1128302	25 %	50 %	0 %	25 %	384542656
19029	NC_017328	A	6	6	1128335	1128340	100 %	0 %	0 %	0 %	384542656
19030	NC_017328	GTT	2	6	1128389	1128394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542656
19031	NC_017328	GTTC	2	8	1128478	1128485	0 %	50 %	25 %	25 %	384542656
19032	NC_017328	TAA	2	6	1128502	1128507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542656
19033	NC_017328	TTG	2	6	1128516	1128521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542656
19034	NC_017328	CAG	2	6	1128590	1128595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542656
19035	NC_017328	TCA	2	6	1128630	1128635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542656
19036	NC_017328	CAAC	2	8	1128651	1128658	50 %	0 %	0 %	50 %	384542656
19037	NC_017328	TAA	2	6	1128714	1128719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542656
19038	NC_017328	TC	3	6	1128728	1128733	0 %	50 %	0 %	50 %	384542656
19039	NC_017328	GCC	2	6	1128768	1128773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542656
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19042	NC_017328	AGTC	2	8	1128842	1128849	25 %	25 %	25 %	25 %	384542656
19043	NC_017328	TGA	2	6	1128859	1128864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542656
19044	NC_017328	TCG	2	6	1128923	1128928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542656
19045	NC_017328	GCA	2	6	1128957	1128962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542656
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19049	NC_017328	ACT	2	6	1129220	1129225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542656
19050	NC_017328	A	6	6	1129229	1129234	100 %	0 %	0 %	0 %	384542656
19051	NC_017328	GAT	2	6	1129645	1129650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542657
19052	NC_017328	AG	3	6	1129674	1129679	50 %	0 %	50 %	0 %	384542657
19053	NC_017328	AGATG	2	10	1129686	1129695	40 %	20 %	40 %	0 %	384542657
19054	NC_017328	AAG	2	6	1129714	1129719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542657
19055	NC_017328	TCAA	2	8	1130150	1130157	50 %	25 %	0 %	25 %	384542658
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19057	NC_017328	TAA	2	6	1130168	1130173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542658
19058	NC_017328	T	7	7	1130185	1130191	0 %	100 %	0 %	0 %	384542658
19059	NC_017328	TGG	2	6	1130217	1130222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542658
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19062	NC_017328	ATT	2	6	1131562	1131567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542659
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19091	NC_017328	ATT	2	6	1134357	1134362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542662
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19099	NC_017328	A	6	6	1134622	1134627	100 %	0 %	0 %	0 %	384542663
19100	NC_017328	GCG	2	6	1134832	1134837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542663
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19102	NC_017328	T	6	6	1134932	1134937	0 %	100 %	0 %	0 %	384542664
19103	NC_017328	TCT	2	6	1134945	1134950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542664
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19110	NC_017328	A	6	6	1135212	1135217	100 %	0 %	0 %	0 %	384542664
19111	NC_017328	CAA	2	6	1135279	1135284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542664
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19117	NC_017328	TGC	2	6	1135451	1135456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542664
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19351	NC_017328	TAA	2	6	1151439	1151444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542677
19352	NC_017328	ATC	2	6	1151855	1151860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542678
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19450	NC_017328	CAG	2	6	1159745	1159750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542688
19451	NC_017328	ACC	2	6	1159757	1159762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542688
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19454	NC_017328	TCA	2	6	1159915	1159920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542688
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19456	NC_017328	GT	3	6	1160096	1160101	0 %	50 %	50 %	0 %	384542688
19457	NC_017328	CAATAT	2	12	1160171	1160182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384542688
19458	NC_017328	TAG	2	6	1160214	1160219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542688
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19463	NC_017328	GGC	2	6	1160594	1160599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542689
19464	NC_017328	CGA	2	6	1160626	1160631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542689
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