MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017328	GC	3	6	1002772	1002777	0 %	0 %	50 %	50 %	384542523
17003	NC_017328	TGA	2	6	1002822	1002827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542523
17004	NC_017328	GAA	2	6	1002850	1002855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542523
17005	NC_017328	CTG	2	6	1003084	1003089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542523
17006	NC_017328	GTT	2	6	1003102	1003107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542523
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17008	NC_017328	CAT	2	6	1003265	1003270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542524
17009	NC_017328	T	6	6	1003284	1003289	0 %	100 %	0 %	0 %	384542524
17010	NC_017328	CG	3	6	1003344	1003349	0 %	0 %	50 %	50 %	384542524
17011	NC_017328	TTG	2	6	1003401	1003406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542524
17012	NC_017328	GTT	2	6	1003460	1003465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542524
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17017	NC_017328	ACC	2	6	1003789	1003794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542524
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17021	NC_017328	TTG	2	6	1003996	1004001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542524
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17023	NC_017328	TG	3	6	1004032	1004037	0 %	50 %	50 %	0 %	384542524
17024	NC_017328	TG	3	6	1004062	1004067	0 %	50 %	50 %	0 %	384542524
17025	NC_017328	CAT	2	6	1004126	1004131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542524
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17042	NC_017328	CTG	2	6	1005543	1005548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542525
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17059	NC_017328	CTG	2	6	1006646	1006651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542525
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17117	NC_017328	GTA	2	6	1009440	1009445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542527
17118	NC_017328	GCT	2	6	1009492	1009497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542527
17119	NC_017328	CAT	2	6	1009507	1009512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542527
17120	NC_017328	CAT	2	6	1009540	1009545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542527
17121	NC_017328	TTA	2	6	1009556	1009561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542527
17122	NC_017328	CGA	2	6	1009578	1009583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542527
17123	NC_017328	TAT	2	6	1009654	1009659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542527
17124	NC_017328	GAT	2	6	1009675	1009680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542527
17125	NC_017328	GTT	2	6	1009757	1009762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542527
17126	NC_017328	GAT	2	6	1009783	1009788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542527
17127	NC_017328	GTC	2	6	1009883	1009888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542527
17128	NC_017328	GAG	2	6	1009961	1009966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542527
17129	NC_017328	TAA	2	6	1009985	1009990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542528
17130	NC_017328	GAA	2	6	1010015	1010020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542528
17131	NC_017328	T	6	6	1010077	1010082	0 %	100 %	0 %	0 %	384542528
17132	NC_017328	GGAA	2	8	1010132	1010139	50 %	0 %	50 %	0 %	384542528
17133	NC_017328	ACC	2	6	1010154	1010159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542528
17134	NC_017328	TGA	2	6	1010210	1010215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542528
17135	NC_017328	TGC	2	6	1010266	1010271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542528
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17137	NC_017328	GCT	2	6	1010339	1010344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542528
17138	NC_017328	GCA	2	6	1010383	1010388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542528
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17140	NC_017328	A	6	6	1010469	1010474	100 %	0 %	0 %	0 %	384542528
17141	NC_017328	TCA	2	6	1010584	1010589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542528
17142	NC_017328	GCT	2	6	1010702	1010707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542528
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17144	NC_017328	AGA	2	6	1010797	1010802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542528
17145	NC_017328	GAT	2	6	1010967	1010972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542528
17146	NC_017328	TGT	2	6	1011041	1011046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542528
17147	NC_017328	TTG	2	6	1011063	1011068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542528
17148	NC_017328	GCG	2	6	1011208	1011213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542528
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17154	NC_017328	TGAAT	2	10	1011422	1011431	40 %	40 %	20 %	0 %	384542528
17155	NC_017328	GCA	2	6	1011433	1011438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542528
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17159	NC_017328	GCA	2	6	1011638	1011643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542529
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17173	NC_017328	GC	3	6	1012870	1012875	0 %	0 %	50 %	50 %	384542531
17174	NC_017328	CGC	2	6	1012888	1012893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542531
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17187	NC_017328	CTT	2	6	1013451	1013456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542532
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17190	NC_017328	ATC	3	9	1013807	1013815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542532
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17193	NC_017328	GCA	2	6	1014066	1014071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542532
17194	NC_017328	GCT	2	6	1014081	1014086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542532
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17200	NC_017328	CAG	2	6	1014532	1014537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542532
17201	NC_017328	GAT	2	6	1014550	1014555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542532
17202	NC_017328	ACCAG	2	10	1014581	1014590	40 %	0 %	20 %	40 %	384542532
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17207	NC_017328	CG	3	6	1014785	1014790	0 %	0 %	50 %	50 %	384542532
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17215	NC_017328	A	6	6	1015472	1015477	100 %	0 %	0 %	0 %	384542533
17216	NC_017328	TCGA	2	8	1015478	1015485	25 %	25 %	25 %	25 %	384542533
17217	NC_017328	CTGG	2	8	1015511	1015518	0 %	25 %	50 %	25 %	384542533
17218	NC_017328	TCT	2	6	1015610	1015615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542533
17219	NC_017328	CGA	2	6	1015785	1015790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542534
17220	NC_017328	GCA	2	6	1015815	1015820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542534
17221	NC_017328	CAA	2	6	1015924	1015929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542534
17222	NC_017328	AAC	2	6	1016000	1016005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542534
17223	NC_017328	GCTG	2	8	1016038	1016045	0 %	25 %	50 %	25 %	384542534
17224	NC_017328	AGC	2	6	1016060	1016065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542534
17225	NC_017328	GTTGAA	2	12	1016093	1016104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542534
17226	NC_017328	GCT	2	6	1016175	1016180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542534
17227	NC_017328	CAG	2	6	1016216	1016221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542534
17228	NC_017328	TGT	2	6	1016263	1016268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542534
17229	NC_017328	ACC	2	6	1016324	1016329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542534
17230	NC_017328	CCA	2	6	1016376	1016381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542534
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17232	NC_017328	TGT	2	6	1016512	1016517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542534
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17344	NC_017328	CAA	2	6	1022428	1022433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542542
17345	NC_017328	CGTTGC	2	12	1022453	1022464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542542
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17349	NC_017328	T	6	6	1022601	1022606	0 %	100 %	0 %	0 %	384542542
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17462	NC_017328	CG	3	6	1027347	1027352	0 %	0 %	50 %	50 %	384542547
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17465	NC_017328	GGCT	2	8	1027434	1027441	0 %	25 %	50 %	25 %	384542547
17466	NC_017328	CGA	2	6	1027487	1027492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542547
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17492	NC_017328	GCA	2	6	1028925	1028930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542550
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