MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017328	AGCC	2	8	944198	944205	25 %	0 %	25 %	50 %	384542478
16003	NC_017328	CGC	2	6	944311	944316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542478
16004	NC_017328	GAA	2	6	944363	944368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542478
16005	NC_017328	ATC	2	6	944388	944393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542478
16006	NC_017328	GCA	2	6	944402	944407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542478
16007	NC_017328	GTT	2	6	944426	944431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542478
16008	NC_017328	AGA	2	6	944471	944476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542478
16009	NC_017328	GCG	2	6	944496	944501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542478
16010	NC_017328	CAACC	2	10	945758	945767	40 %	0 %	0 %	60 %	384542479
16011	NC_017328	ACC	2	6	945773	945778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542479
16012	NC_017328	ATA	2	6	945783	945788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542479
16013	NC_017328	TGA	2	6	945820	945825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542479
16014	NC_017328	TCA	2	6	945829	945834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542479
16015	NC_017328	CAA	2	6	945964	945969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542479
16016	NC_017328	GCA	2	6	945982	945987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542479
16017	NC_017328	AGAC	2	8	946074	946081	50 %	0 %	25 %	25 %	384542479
16018	NC_017328	CGG	2	6	946114	946119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542479
16019	NC_017328	CAG	2	6	946193	946198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542479
16020	NC_017328	CAA	3	9	946279	946287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542479
16021	NC_017328	ACA	2	6	946323	946328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542479
16022	NC_017328	AG	3	6	946344	946349	50 %	0 %	50 %	0 %	384542479
16023	NC_017328	GCC	2	6	946358	946363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542479
16024	NC_017328	TGTGCC	2	12	946391	946402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542479
16025	NC_017328	AGA	2	6	946420	946425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542479
16026	NC_017328	CGG	2	6	946450	946455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542479
16027	NC_017328	GCA	2	6	946533	946538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542479
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16029	NC_017328	TTA	2	6	946587	946592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542479
16030	NC_017328	CGA	2	6	946599	946604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542479
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16032	NC_017328	ATTTT	2	10	946977	946986	20 %	80 %	0 %	0 %	384542480
16033	NC_017328	TGC	2	6	946995	947000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542480
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16035	NC_017328	CAA	2	6	947031	947036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542480
16036	NC_017328	GCA	2	6	947047	947052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542480
16037	NC_017328	CGC	2	6	947094	947099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542480
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16039	NC_017328	GGC	2	6	947121	947126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542480
16040	NC_017328	TCT	2	6	947188	947193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542480
16041	NC_017328	TAA	2	6	947205	947210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542480
16042	NC_017328	GCAG	2	8	947219	947226	25 %	0 %	50 %	25 %	384542480
16043	NC_017328	ATA	2	6	947229	947234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542480
16044	NC_017328	TGA	2	6	947259	947264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542480
16045	NC_017328	CCAGA	2	10	947289	947298	40 %	0 %	20 %	40 %	384542480
16046	NC_017328	CCA	2	6	947314	947319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542480
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16048	NC_017328	CACG	2	8	947402	947409	25 %	0 %	25 %	50 %	384542480
16049	NC_017328	TCA	2	6	947419	947424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542480
16050	NC_017328	CTT	2	6	947429	947434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542480
16051	NC_017328	TCT	2	6	947464	947469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542480
16052	NC_017328	ATA	2	6	947584	947589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542480
16053	NC_017328	CTT	2	6	947633	947638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542480
16054	NC_017328	TCT	2	6	947641	947646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542480
16055	NC_017328	TTG	2	6	947647	947652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542480
16056	NC_017328	CTT	2	6	947678	947683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542480
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16059	NC_017328	CAT	2	6	947810	947815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542480
16060	NC_017328	GCA	2	6	947864	947869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542480
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16062	NC_017328	CAT	2	6	947996	948001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542480
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16090	NC_017328	TCGT	2	8	950320	950327	0 %	50 %	25 %	25 %	384542481
16091	NC_017328	ATT	2	6	950374	950379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542481
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16101	NC_017328	ATGCC	2	10	950713	950722	20 %	20 %	20 %	40 %	384542481
16102	NC_017328	TTGC	2	8	950941	950948	0 %	50 %	25 %	25 %	384542482
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16109	NC_017328	TGCGC	2	10	951246	951255	0 %	20 %	40 %	40 %	384542482
16110	NC_017328	GGGCG	2	10	951258	951267	0 %	0 %	80 %	20 %	384542482
16111	NC_017328	CCG	2	6	951298	951303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542482
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16120	NC_017328	GGC	2	6	951622	951627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542482
16121	NC_017328	A	6	6	951695	951700	100 %	0 %	0 %	0 %	384542482
16122	NC_017328	GAT	2	6	951724	951729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542482
16123	NC_017328	GTG	2	6	951746	951751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542482
16124	NC_017328	GATATG	2	12	951766	951777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542482
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16133	NC_017328	T	7	7	952274	952280	0 %	100 %	0 %	0 %	384542483
16134	NC_017328	TC	3	6	952375	952380	0 %	50 %	0 %	50 %	384542483
16135	NC_017328	TTGCC	2	10	952382	952391	0 %	40 %	20 %	40 %	384542483
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16141	NC_017328	CTG	2	6	952665	952670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542483
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16143	NC_017328	CTG	2	6	952806	952811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542483
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16233	NC_017328	CTT	2	6	960246	960251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542488
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16239	NC_017328	ATG	2	6	960417	960422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542488
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16476	NC_017328	TGC	2	6	971851	971856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542498
16477	NC_017328	GAC	2	6	971871	971876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542498
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