MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017328	T	6	6	880473	880478	0 %	100 %	0 %	0 %	384542420
15002	NC_017328	TGA	2	6	880515	880520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542420
15003	NC_017328	TGC	2	6	880611	880616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
15004	NC_017328	CG	3	6	880690	880695	0 %	0 %	50 %	50 %	384542420
15005	NC_017328	TC	3	6	880741	880746	0 %	50 %	0 %	50 %	384542420
15006	NC_017328	ATT	2	6	880797	880802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542420
15007	NC_017328	GCG	3	9	880843	880851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542420
15008	NC_017328	CAT	2	6	880888	880893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542420
15009	NC_017328	GAT	2	6	880900	880905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542420
15010	NC_017328	GACC	2	8	880907	880914	25 %	0 %	25 %	50 %	384542420
15011	NC_017328	CG	3	6	880999	881004	0 %	0 %	50 %	50 %	384542420
15012	NC_017328	ACC	2	6	881105	881110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542420
15013	NC_017328	GCT	2	6	881122	881127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
15014	NC_017328	GCC	2	6	881154	881159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542420
15015	NC_017328	TCT	2	6	881171	881176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542420
15016	NC_017328	GCC	2	6	881183	881188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542420
15017	NC_017328	GCC	2	6	881226	881231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542420
15018	NC_017328	CGTC	2	8	881258	881265	0 %	25 %	25 %	50 %	384542420
15019	NC_017328	GCT	2	6	881280	881285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
15020	NC_017328	TGG	2	6	881292	881297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542420
15021	NC_017328	GGAAAC	2	12	881302	881313	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384542420
15022	NC_017328	CAT	2	6	881348	881353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542420
15023	NC_017328	CCG	2	6	881422	881427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542420
15024	NC_017328	GAA	2	6	881473	881478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542420
15025	NC_017328	CGT	2	6	881720	881725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
15026	NC_017328	GCT	2	6	881746	881751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542420
15027	NC_017328	A	7	7	881753	881759	100 %	0 %	0 %	0 %	384542420
15028	NC_017328	TGGC	2	8	881777	881784	0 %	25 %	50 %	25 %	384542420
15029	NC_017328	GC	3	6	881783	881788	0 %	0 %	50 %	50 %	384542420
15030	NC_017328	CG	3	6	881792	881797	0 %	0 %	50 %	50 %	384542420
15031	NC_017328	T	6	6	881875	881880	0 %	100 %	0 %	0 %	384542421
15032	NC_017328	CGC	2	6	881952	881957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542421
15033	NC_017328	CTT	2	6	882000	882005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542421
15034	NC_017328	AAT	2	6	882055	882060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542421
15035	NC_017328	ACAG	2	8	882087	882094	50 %	0 %	25 %	25 %	384542421
15036	NC_017328	TCG	2	6	882141	882146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542421
15037	NC_017328	CA	3	6	882228	882233	50 %	0 %	0 %	50 %	384542421
15038	NC_017328	CTT	2	6	882297	882302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542421
15039	NC_017328	ATC	2	6	882314	882319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542421
15040	NC_017328	TTC	2	6	882406	882411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542421
15041	NC_017328	GTAAC	2	10	882445	882454	40 %	20 %	20 %	20 %	384542421
15042	NC_017328	AAC	2	6	882536	882541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542421
15043	NC_017328	GTTC	2	8	882567	882574	0 %	50 %	25 %	25 %	384542421
15044	NC_017328	GCA	2	6	882612	882617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542421
15045	NC_017328	GCT	2	6	882700	882705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542421
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15047	NC_017328	GAA	2	6	882927	882932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542422
15048	NC_017328	CGTTA	2	10	882934	882943	20 %	40 %	20 %	20 %	384542422
15049	NC_017328	GC	3	6	883100	883105	0 %	0 %	50 %	50 %	384542422
15050	NC_017328	A	7	7	883155	883161	100 %	0 %	0 %	0 %	384542422
15051	NC_017328	AGG	2	6	883211	883216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542422
15052	NC_017328	CG	3	6	883240	883245	0 %	0 %	50 %	50 %	384542422
15053	NC_017328	GCA	2	6	883251	883256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542422
15054	NC_017328	CCG	2	6	883349	883354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542422
15055	NC_017328	CT	3	6	883422	883427	0 %	50 %	0 %	50 %	384542422
15056	NC_017328	CAC	2	6	883497	883502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542422
15057	NC_017328	AGCA	2	8	883532	883539	50 %	0 %	25 %	25 %	384542422
15058	NC_017328	ACG	2	6	883715	883720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542422
15059	NC_017328	TGC	2	6	883766	883771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542422
15060	NC_017328	TTG	2	6	883885	883890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542422
15061	NC_017328	GTG	2	6	883984	883989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542422
15062	NC_017328	TCG	2	6	884048	884053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
15063	NC_017328	TGA	2	6	884069	884074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542423
15064	NC_017328	TTG	2	6	884134	884139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542423
15065	NC_017328	TGA	2	6	884167	884172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542423
15066	NC_017328	CCA	2	6	884197	884202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542423
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15068	NC_017328	TGC	2	6	884401	884406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
15069	NC_017328	GGCTGG	2	12	884410	884421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384542423
15070	NC_017328	TAT	2	6	884436	884441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542423
15071	NC_017328	GGT	2	6	884457	884462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
15072	NC_017328	CG	3	6	884483	884488	0 %	0 %	50 %	50 %	384542423
15073	NC_017328	TGA	2	6	884494	884499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542423
15074	NC_017328	CGG	2	6	884501	884506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542423
15075	NC_017328	ACCG	2	8	884528	884535	25 %	0 %	25 %	50 %	384542423
15076	NC_017328	GCT	2	6	884637	884642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
15077	NC_017328	TCC	2	6	884690	884695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542423
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15079	NC_017328	CTGG	2	8	884752	884759	0 %	25 %	50 %	25 %	384542423
15080	NC_017328	ATGGC	2	10	884796	884805	20 %	20 %	40 %	20 %	384542423
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15082	NC_017328	GGT	2	6	884873	884878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
15083	NC_017328	GTG	2	6	884889	884894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
15084	NC_017328	CGC	2	6	884900	884905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542423
15085	NC_017328	CAAA	2	8	884906	884913	75 %	0 %	0 %	25 %	384542423
15086	NC_017328	CAG	2	6	885000	885005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542423
15087	NC_017328	ACG	2	6	885016	885021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542423
15088	NC_017328	AAC	2	6	885040	885045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542423
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15090	NC_017328	ATGTTG	2	12	885103	885114	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384542423
15091	NC_017328	GCG	2	6	885136	885141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542423
15092	NC_017328	ATT	2	6	885142	885147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542423
15093	NC_017328	AGC	2	6	885196	885201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542423
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15099	NC_017328	TGG	2	6	885598	885603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542423
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15101	NC_017328	GCT	3	9	885857	885865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542423
15102	NC_017328	TGG	2	6	886102	886107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542424
15103	NC_017328	CCAT	2	8	886150	886157	25 %	25 %	0 %	50 %	384542424
15104	NC_017328	TGG	2	6	886163	886168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542424
15105	NC_017328	AAT	2	6	886169	886174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542424
15106	NC_017328	CGC	3	9	886190	886198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542424
15107	NC_017328	AAACC	2	10	886213	886222	60 %	0 %	0 %	40 %	384542424
15108	NC_017328	TTG	2	6	886231	886236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542424
15109	NC_017328	ACGA	2	8	886594	886601	50 %	0 %	25 %	25 %	384542425
15110	NC_017328	CTGG	2	8	886602	886609	0 %	25 %	50 %	25 %	384542425
15111	NC_017328	GAA	2	6	886627	886632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542425
15112	NC_017328	ATG	2	6	886685	886690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542425
15113	NC_017328	TTCTT	2	10	886732	886741	0 %	80 %	0 %	20 %	384542425
15114	NC_017328	ATG	2	6	886742	886747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542425
15115	NC_017328	CCG	2	6	886814	886819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542425
15116	NC_017328	TCAA	2	8	886940	886947	50 %	25 %	0 %	25 %	384542426
15117	NC_017328	GC	3	6	886984	886989	0 %	0 %	50 %	50 %	384542426
15118	NC_017328	GCT	2	6	887034	887039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542426
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15120	NC_017328	AC	3	6	887165	887170	50 %	0 %	0 %	50 %	384542426
15121	NC_017328	TCC	2	6	887224	887229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542426
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