MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017328	AG	3	6	821383	821388	50 %	0 %	50 %	0 %	384542365
14002	NC_017328	GTT	2	6	821467	821472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542365
14003	NC_017328	CGC	2	6	821535	821540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542365
14004	NC_017328	A	6	6	821545	821550	100 %	0 %	0 %	0 %	384542365
14005	NC_017328	TGT	2	6	821559	821564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542365
14006	NC_017328	CTG	2	6	821630	821635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542365
14007	NC_017328	TAT	2	6	821670	821675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542365
14008	NC_017328	GTG	2	6	821686	821691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542365
14009	NC_017328	GCT	2	6	821790	821795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542365
14010	NC_017328	ATGC	2	8	821902	821909	25 %	25 %	25 %	25 %	384542365
14011	NC_017328	GAT	2	6	822018	822023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542365
14012	NC_017328	CGG	2	6	822032	822037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542365
14013	NC_017328	CATCG	2	10	822344	822353	20 %	20 %	20 %	40 %	384542366
14014	NC_017328	CAG	2	6	822395	822400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542366
14015	NC_017328	CAAA	2	8	822490	822497	75 %	0 %	0 %	25 %	384542366
14016	NC_017328	CAAT	2	8	822673	822680	50 %	25 %	0 %	25 %	384542366
14017	NC_017328	AGC	2	6	822849	822854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542366
14018	NC_017328	CCT	2	6	822949	822954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542366
14019	NC_017328	TCAAAA	2	12	822960	822971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384542366
14020	NC_017328	GCA	2	6	823000	823005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542366
14021	NC_017328	AAC	2	6	823043	823048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542367
14022	NC_017328	AT	3	6	823146	823151	50 %	50 %	0 %	0 %	384542367
14023	NC_017328	GGT	2	6	823168	823173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542367
14024	NC_017328	GCGTT	2	10	823196	823205	0 %	40 %	40 %	20 %	384542367
14025	NC_017328	GCA	2	6	823206	823211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542367
14026	NC_017328	CGC	2	6	823212	823217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542367
14027	NC_017328	T	7	7	823242	823248	0 %	100 %	0 %	0 %	384542367
14028	NC_017328	GC	3	6	823276	823281	0 %	0 %	50 %	50 %	384542367
14029	NC_017328	CGAACG	2	12	823407	823418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542367
14030	NC_017328	CCG	2	6	823511	823516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542367
14031	NC_017328	GCG	2	6	823559	823564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542367
14032	NC_017328	TCG	2	6	823580	823585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542367
14033	NC_017328	TCA	2	6	823703	823708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542367
14034	NC_017328	A	6	6	823716	823721	100 %	0 %	0 %	0 %	384542367
14035	NC_017328	CCG	2	6	823809	823814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542367
14036	NC_017328	AAC	2	6	823819	823824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542367
14037	NC_017328	CAG	2	6	823881	823886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542367
14038	NC_017328	ACGC	2	8	823891	823898	25 %	0 %	25 %	50 %	384542367
14039	NC_017328	CAC	2	6	823930	823935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542367
14040	NC_017328	ATA	2	6	823970	823975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542367
14041	NC_017328	TCGC	2	8	824138	824145	0 %	25 %	25 %	50 %	384542367
14042	NC_017328	GGT	2	6	824188	824193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542367
14043	NC_017328	GGT	2	6	824251	824256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542367
14044	NC_017328	TGG	2	6	824495	824500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542368
14045	NC_017328	CG	3	6	824517	824522	0 %	0 %	50 %	50 %	384542368
14046	NC_017328	TTG	2	6	824572	824577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542368
14047	NC_017328	CTG	2	6	824643	824648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542368
14048	NC_017328	TGA	2	6	824696	824701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542368
14049	NC_017328	TG	3	6	824721	824726	0 %	50 %	50 %	0 %	384542368
14050	NC_017328	ATGG	2	8	824727	824734	25 %	25 %	50 %	0 %	384542368
14051	NC_017328	CGGTG	2	10	824750	824759	0 %	20 %	60 %	20 %	384542368
14052	NC_017328	GCC	2	6	824793	824798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542368
14053	NC_017328	TGA	3	9	824827	824835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542368
14054	NC_017328	CATGG	2	10	824868	824877	20 %	20 %	40 %	20 %	384542368
14055	NC_017328	AAC	2	6	824920	824925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542368
14056	NC_017328	GC	3	6	824934	824939	0 %	0 %	50 %	50 %	384542368
14057	NC_017328	GGC	2	6	825041	825046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542368
14058	NC_017328	CG	3	6	825180	825185	0 %	0 %	50 %	50 %	384542368
14059	NC_017328	GGC	2	6	825188	825193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542368
14060	NC_017328	CGC	2	6	825203	825208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542368
14061	NC_017328	CGG	2	6	825221	825226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542368
14062	NC_017328	GTA	2	6	825255	825260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542368
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14064	NC_017328	CA	3	6	825425	825430	50 %	0 %	0 %	50 %	384542368
14065	NC_017328	TGA	2	6	825432	825437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542368
14066	NC_017328	CAG	2	6	825496	825501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542369
14067	NC_017328	TC	3	6	825522	825527	0 %	50 %	0 %	50 %	384542369
14068	NC_017328	GGCG	2	8	825624	825631	0 %	0 %	75 %	25 %	384542369
14069	NC_017328	GCG	3	9	825660	825668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542369
14070	NC_017328	GTGAT	2	10	825674	825683	20 %	40 %	40 %	0 %	384542369
14071	NC_017328	GAT	2	6	825741	825746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542369
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14074	NC_017328	TGA	2	6	825950	825955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542369
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14085	NC_017328	TGG	2	6	826484	826489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542369
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14087	NC_017328	TGC	2	6	826529	826534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542369
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14091	NC_017328	CG	3	6	826846	826851	0 %	0 %	50 %	50 %	384542369
14092	NC_017328	CGA	2	6	826881	826886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542369
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14101	NC_017328	GGAA	2	8	827590	827597	50 %	0 %	50 %	0 %	384542370
14102	NC_017328	ATC	2	6	827673	827678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542370
14103	NC_017328	CGAT	2	8	827721	827728	25 %	25 %	25 %	25 %	384542370
14104	NC_017328	TTA	2	6	827772	827777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542370
14105	NC_017328	GAT	2	6	827803	827808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542370
14106	NC_017328	A	6	6	827915	827920	100 %	0 %	0 %	0 %	384542370
14107	NC_017328	AAC	2	6	827987	827992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542370
14108	NC_017328	CG	3	6	827996	828001	0 %	0 %	50 %	50 %	384542370
14109	NC_017328	TGC	2	6	828006	828011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542370
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14112	NC_017328	GTC	2	6	828367	828372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542370
14113	NC_017328	TGC	2	6	828399	828404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542370
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14116	NC_017328	GCGG	2	8	828472	828479	0 %	0 %	75 %	25 %	384542370
14117	NC_017328	AG	3	6	828505	828510	50 %	0 %	50 %	0 %	384542370
14118	NC_017328	CTGG	2	8	828531	828538	0 %	25 %	50 %	25 %	384542370
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14120	NC_017328	CGG	2	6	828681	828686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542370
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14221	NC_017328	CT	3	6	836686	836691	0 %	50 %	0 %	50 %	384542376
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14230	NC_017328	GGCG	2	8	837081	837088	0 %	0 %	75 %	25 %	384542376
14231	NC_017328	GACC	2	8	837194	837201	25 %	0 %	25 %	50 %	384542376
14232	NC_017328	GAT	2	6	837216	837221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542376
14233	NC_017328	GC	4	8	837246	837253	0 %	0 %	50 %	50 %	384542376
14234	NC_017328	TGAA	2	8	837325	837332	50 %	25 %	25 %	0 %	384542376
14235	NC_017328	CG	3	6	837340	837345	0 %	0 %	50 %	50 %	384542376
14236	NC_017328	GTG	2	6	837346	837351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542376
14237	NC_017328	TCG	2	6	837454	837459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542376
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14480	NC_017328	GAA	2	6	853710	853715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542392
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14482	NC_017328	CTG	2	6	853831	853836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542392
14483	NC_017328	GTA	2	6	853846	853851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542392
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