MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017328	GGAG	2	8	762333	762340	25 %	0 %	75 %	0 %	384542311
13002	NC_017328	AG	3	6	762348	762353	50 %	0 %	50 %	0 %	384542311
13003	NC_017328	GA	3	6	762407	762412	50 %	0 %	50 %	0 %	384542311
13004	NC_017328	GGCT	2	8	762440	762447	0 %	25 %	50 %	25 %	384542311
13005	NC_017328	TCT	2	6	762495	762500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542311
13006	NC_017328	GCA	2	6	762504	762509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542311
13007	NC_017328	CCTT	2	8	762510	762517	0 %	50 %	0 %	50 %	384542311
13008	NC_017328	A	6	6	762609	762614	100 %	0 %	0 %	0 %	384542311
13009	NC_017328	TGGC	2	8	762750	762757	0 %	25 %	50 %	25 %	384542312
13010	NC_017328	CTGA	2	8	762792	762799	25 %	25 %	25 %	25 %	384542312
13011	NC_017328	A	6	6	762804	762809	100 %	0 %	0 %	0 %	384542312
13012	NC_017328	TCA	2	6	762832	762837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542312
13013	NC_017328	AGT	2	6	762842	762847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542312
13014	NC_017328	CAC	2	6	762853	762858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542312
13015	NC_017328	CAT	2	6	762861	762866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542312
13016	NC_017328	AG	3	6	763254	763259	50 %	0 %	50 %	0 %	384542313
13017	NC_017328	CGC	2	6	763288	763293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542313
13018	NC_017328	CGG	2	6	763370	763375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542313
13019	NC_017328	ACCAG	2	10	763443	763452	40 %	0 %	20 %	40 %	384542313
13020	NC_017328	AAC	2	6	763496	763501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542313
13021	NC_017328	CCA	2	6	763511	763516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542313
13022	NC_017328	ACA	2	6	763554	763559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542313
13023	NC_017328	CAT	2	6	763582	763587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542313
13024	NC_017328	TGA	2	6	763684	763689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542313
13025	NC_017328	A	7	7	763763	763769	100 %	0 %	0 %	0 %	384542314
13026	NC_017328	CG	3	6	763785	763790	0 %	0 %	50 %	50 %	384542314
13027	NC_017328	AAT	2	6	763830	763835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542314
13028	NC_017328	GGC	2	6	763840	763845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542314
13029	NC_017328	GCC	2	6	763912	763917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
13030	NC_017328	GCC	2	6	764032	764037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
13031	NC_017328	CTG	3	9	764040	764048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542314
13032	NC_017328	TGC	2	6	764085	764090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542314
13033	NC_017328	AGC	2	6	764135	764140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542314
13034	NC_017328	CG	3	6	764174	764179	0 %	0 %	50 %	50 %	384542314
13035	NC_017328	GCC	2	6	764208	764213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
13036	NC_017328	TCG	2	6	764308	764313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542314
13037	NC_017328	GCC	2	6	764446	764451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
13038	NC_017328	ACCA	2	8	764466	764473	50 %	0 %	0 %	50 %	384542314
13039	NC_017328	CCAT	2	8	764494	764501	25 %	25 %	0 %	50 %	384542314
13040	NC_017328	GCGGG	2	10	764510	764519	0 %	0 %	80 %	20 %	384542314
13041	NC_017328	GC	3	6	764643	764648	0 %	0 %	50 %	50 %	384542314
13042	NC_017328	GCG	2	6	764744	764749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542314
13043	NC_017328	CCA	2	6	764756	764761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542314
13044	NC_017328	GGCG	2	8	764781	764788	0 %	0 %	75 %	25 %	384542314
13045	NC_017328	CGC	2	6	764844	764849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
13046	NC_017328	CGC	2	6	764880	764885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542314
13047	NC_017328	CCA	2	6	764886	764891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542314
13048	NC_017328	GAC	2	6	764893	764898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542314
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13050	NC_017328	A	6	6	765106	765111	100 %	0 %	0 %	0 %	384542314
13051	NC_017328	ATT	2	6	765172	765177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542315
13052	NC_017328	CTG	2	6	765197	765202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542315
13053	NC_017328	GCA	2	6	765211	765216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542315
13054	NC_017328	GC	3	6	765383	765388	0 %	0 %	50 %	50 %	384542315
13055	NC_017328	AAAGCG	2	12	765389	765400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384542315
13056	NC_017328	GAA	2	6	765436	765441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542315
13057	NC_017328	TAC	2	6	765575	765580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542315
13058	NC_017328	ATC	2	6	765620	765625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542315
13059	NC_017328	ATT	2	6	765742	765747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542315
13060	NC_017328	CGC	2	6	765771	765776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542315
13061	NC_017328	GGTGAA	2	12	765802	765813	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384542315
13062	NC_017328	CGC	2	6	765819	765824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542315
13063	NC_017328	ATG	2	6	765887	765892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542315
13064	NC_017328	GAAC	2	8	765934	765941	50 %	0 %	25 %	25 %	384542315
13065	NC_017328	CTG	2	6	765998	766003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542315
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13069	NC_017328	TGA	2	6	766125	766130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542315
13070	NC_017328	CGA	2	6	766141	766146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542315
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13073	NC_017328	TGC	2	6	766212	766217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542316
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13079	NC_017328	GTG	2	6	766417	766422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542316
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13085	NC_017328	TGCT	2	8	766649	766656	0 %	50 %	25 %	25 %	384542316
13086	NC_017328	GCA	2	6	766671	766676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542316
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13088	NC_017328	GC	3	6	766718	766723	0 %	0 %	50 %	50 %	384542316
13089	NC_017328	CAG	2	6	766738	766743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542316
13090	NC_017328	GAT	2	6	766777	766782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542316
13091	NC_017328	CACGG	2	10	766786	766795	20 %	0 %	40 %	40 %	384542316
13092	NC_017328	GCT	2	6	766823	766828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542316
13093	NC_017328	CTG	2	6	766930	766935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542316
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13100	NC_017328	CGCC	2	8	767212	767219	0 %	0 %	25 %	75 %	384542316
13101	NC_017328	CTG	2	6	767293	767298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542316
13102	NC_017328	TGC	2	6	767303	767308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542316
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13104	NC_017328	CTGG	2	8	767466	767473	0 %	25 %	50 %	25 %	384542317
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13107	NC_017328	GCC	2	6	767527	767532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542317
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13110	NC_017328	GCGT	2	8	767838	767845	0 %	25 %	50 %	25 %	384542317
13111	NC_017328	CAT	2	6	767852	767857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542317
13112	NC_017328	TCA	2	6	767865	767870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542317
13113	NC_017328	TGA	2	6	767881	767886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542317
13114	NC_017328	CTGGC	2	10	767990	767999	0 %	20 %	40 %	40 %	384542317
13115	NC_017328	CAA	2	6	768002	768007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542317
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13117	NC_017328	T	7	7	768036	768042	0 %	100 %	0 %	0 %	384542317
13118	NC_017328	CAG	2	6	768242	768247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542318
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13120	NC_017328	CAT	2	6	768308	768313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542318
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13122	NC_017328	AAC	2	6	768376	768381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542318
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13225	NC_017328	CGCTA	2	10	774001	774010	20 %	20 %	20 %	40 %	384542323
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13236	NC_017328	CGTG	2	8	774428	774435	0 %	25 %	50 %	25 %	384542324
13237	NC_017328	GCGG	2	8	774440	774447	0 %	0 %	75 %	25 %	384542324
13238	NC_017328	GAT	2	6	774482	774487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542324
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13480	NC_017328	GAT	2	6	788755	788760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542338
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