MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_017328	GCA	2	6	695225	695230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542241
12002	NC_017328	TGCC	2	8	695383	695390	0 %	25 %	25 %	50 %	384542241
12003	NC_017328	TGA	2	6	695808	695813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542242
12004	NC_017328	CAT	2	6	695829	695834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542242
12005	NC_017328	ATC	2	6	695878	695883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542242
12006	NC_017328	AG	3	6	696042	696047	50 %	0 %	50 %	0 %	384542242
12007	NC_017328	CGT	2	6	696160	696165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542243
12008	NC_017328	CCGG	2	8	696202	696209	0 %	0 %	50 %	50 %	384542243
12009	NC_017328	GGC	2	6	696270	696275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542243
12010	NC_017328	CGC	2	6	696329	696334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542243
12011	NC_017328	GCCT	2	8	696414	696421	0 %	25 %	25 %	50 %	384542243
12012	NC_017328	GCG	2	6	696427	696432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542243
12013	NC_017328	AG	3	6	696498	696503	50 %	0 %	50 %	0 %	384542243
12014	NC_017328	CAC	2	6	696525	696530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542243
12015	NC_017328	GTGA	2	8	696548	696555	25 %	25 %	50 %	0 %	384542243
12016	NC_017328	TGC	2	6	696671	696676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542244
12017	NC_017328	ATG	2	6	696853	696858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542244
12018	NC_017328	GCA	2	6	696879	696884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542244
12019	NC_017328	TGC	2	6	696933	696938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542244
12020	NC_017328	GC	3	6	696951	696956	0 %	0 %	50 %	50 %	384542244
12021	NC_017328	CTAAC	2	10	696992	697001	40 %	20 %	0 %	40 %	384542244
12022	NC_017328	CGT	2	6	697072	697077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542244
12023	NC_017328	AAT	2	6	697156	697161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542244
12024	NC_017328	TGC	2	6	697235	697240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542244
12025	NC_017328	AAC	2	6	697273	697278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542244
12026	NC_017328	ACC	2	6	697311	697316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542244
12027	NC_017328	AT	3	6	697365	697370	50 %	50 %	0 %	0 %	384542244
12028	NC_017328	GCT	2	6	697377	697382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542244
12029	NC_017328	GTT	2	6	697405	697410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542244
12030	NC_017328	TGTT	2	8	697472	697479	0 %	75 %	25 %	0 %	384542244
12031	NC_017328	ATT	2	6	697499	697504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542244
12032	NC_017328	CA	3	6	697548	697553	50 %	0 %	0 %	50 %	384542244
12033	NC_017328	TCC	2	6	697563	697568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542244
12034	NC_017328	ACG	2	6	697633	697638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542244
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12036	NC_017328	A	6	6	697696	697701	100 %	0 %	0 %	0 %	384542244
12037	NC_017328	GAA	2	6	697738	697743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542244
12038	NC_017328	CTT	2	6	697755	697760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542244
12039	NC_017328	GATC	2	8	697785	697792	25 %	25 %	25 %	25 %	384542244
12040	NC_017328	ATGG	2	8	697803	697810	25 %	25 %	50 %	0 %	384542244
12041	NC_017328	GAA	2	6	697852	697857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542244
12042	NC_017328	A	6	6	697903	697908	100 %	0 %	0 %	0 %	384542244
12043	NC_017328	TGA	2	6	697991	697996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542244
12044	NC_017328	TGA	2	6	698036	698041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542244
12045	NC_017328	CCG	2	6	698045	698050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542244
12046	NC_017328	ATTC	2	8	698104	698111	25 %	50 %	0 %	25 %	384542244
12047	NC_017328	AATA	2	8	698176	698183	75 %	25 %	0 %	0 %	384542244
12048	NC_017328	GCG	2	6	698209	698214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542244
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12050	NC_017328	TGA	2	6	698303	698308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542244
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12053	NC_017328	CGG	2	6	698378	698383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542244
12054	NC_017328	AAC	2	6	698431	698436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542244
12055	NC_017328	CTGC	2	8	698443	698450	0 %	25 %	25 %	50 %	384542244
12056	NC_017328	GGA	2	6	698475	698480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542244
12057	NC_017328	TGC	2	6	698548	698553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542245
12058	NC_017328	ATG	2	6	698622	698627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542245
12059	NC_017328	TCA	2	6	698662	698667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542245
12060	NC_017328	TGG	2	6	698668	698673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542245
12061	NC_017328	TCC	2	6	698687	698692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542245
12062	NC_017328	ATC	2	6	698727	698732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542245
12063	NC_017328	TAT	2	6	698735	698740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542245
12064	NC_017328	TGG	2	6	698746	698751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542245
12065	NC_017328	GCTG	2	8	698791	698798	0 %	25 %	50 %	25 %	384542245
12066	NC_017328	GC	3	6	698862	698867	0 %	0 %	50 %	50 %	384542245
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12069	NC_017328	CT	3	6	699015	699020	0 %	50 %	0 %	50 %	384542245
12070	NC_017328	AGT	2	6	699050	699055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542245
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12072	NC_017328	TTC	2	6	699087	699092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542245
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12080	NC_017328	CTG	2	6	699345	699350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542245
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12107	NC_017328	T	6	6	700850	700855	0 %	100 %	0 %	0 %	384542247
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12117	NC_017328	GAAT	2	8	701457	701464	50 %	25 %	25 %	0 %	384542247
12118	NC_017328	AAAGAA	2	12	701476	701487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384542247
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12120	NC_017328	TTG	2	6	701597	701602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542247
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12357	NC_017328	CAG	2	6	716831	716836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542265
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12482	NC_017328	CAT	2	6	724109	724114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542275
12483	NC_017328	ACC	2	6	724185	724190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542275
12484	NC_017328	CAT	2	6	724214	724219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542275
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