MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017328	CAAC	2	8	667017	667024	50 %	0 %	0 %	50 %	384542218
11502	NC_017328	A	7	7	667025	667031	100 %	0 %	0 %	0 %	384542218
11503	NC_017328	ACC	2	6	667064	667069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542218
11504	NC_017328	GC	3	6	667077	667082	0 %	0 %	50 %	50 %	384542218
11505	NC_017328	CGA	2	6	667170	667175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542218
11506	NC_017328	TTTGCC	2	12	667189	667200	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384542218
11507	NC_017328	ATC	2	6	667252	667257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542218
11508	NC_017328	GAAAT	2	10	667306	667315	60 %	20 %	20 %	0 %	384542218
11509	NC_017328	CGG	2	6	667352	667357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542218
11510	NC_017328	TTA	2	6	667395	667400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542218
11511	NC_017328	TGG	2	6	667530	667535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542218
11512	NC_017328	ATT	2	6	667549	667554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542218
11513	NC_017328	TGG	2	6	667615	667620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542218
11514	NC_017328	AGC	2	6	667671	667676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542218
11515	NC_017328	TTCAC	2	10	667718	667727	20 %	40 %	0 %	40 %	384542218
11516	NC_017328	ATG	2	6	667781	667786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542218
11517	NC_017328	TGA	2	6	667878	667883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542218
11518	NC_017328	CTG	2	6	667957	667962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542218
11519	NC_017328	GC	5	10	667982	667991	0 %	0 %	50 %	50 %	384542218
11520	NC_017328	CAA	2	6	667992	667997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542218
11521	NC_017328	CGTTC	2	10	668028	668037	0 %	40 %	20 %	40 %	384542218
11522	NC_017328	A	6	6	668044	668049	100 %	0 %	0 %	0 %	384542218
11523	NC_017328	GGC	2	6	668165	668170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542218
11524	NC_017328	GGC	2	6	668229	668234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542218
11525	NC_017328	GCA	2	6	668235	668240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542218
11526	NC_017328	CGCTTC	2	12	668269	668280	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384542218
11527	NC_017328	ACA	2	6	668285	668290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542218
11528	NC_017328	AAG	2	6	668303	668308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542218
11529	NC_017328	GAA	2	6	668332	668337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542218
11530	NC_017328	GTGC	2	8	668364	668371	0 %	25 %	50 %	25 %	384542218
11531	NC_017328	TTC	2	6	668394	668399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542218
11532	NC_017328	A	7	7	668431	668437	100 %	0 %	0 %	0 %	384542218
11533	NC_017328	TAAG	2	8	668484	668491	50 %	25 %	25 %	0 %	384542218
11534	NC_017328	GCC	2	6	669781	669786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542219
11535	NC_017328	GCG	2	6	669815	669820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542219
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11537	NC_017328	ATCA	2	8	669963	669970	50 %	25 %	0 %	25 %	384542219
11538	NC_017328	GGAT	2	8	670018	670025	25 %	25 %	50 %	0 %	384542219
11539	NC_017328	CCA	2	6	670043	670048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542219
11540	NC_017328	GTAAC	2	10	670120	670129	40 %	20 %	20 %	20 %	384542219
11541	NC_017328	CATATT	2	12	670176	670187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384542219
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11543	NC_017328	ACGC	2	8	670259	670266	25 %	0 %	25 %	50 %	384542219
11544	NC_017328	GTCC	2	8	670268	670275	0 %	25 %	25 %	50 %	384542219
11545	NC_017328	TGC	2	6	670285	670290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542219
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11550	NC_017328	GTTG	2	8	670885	670892	0 %	50 %	50 %	0 %	384542219
11551	NC_017328	A	6	6	671053	671058	100 %	0 %	0 %	0 %	384542220
11552	NC_017328	CTG	2	6	671119	671124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542220
11553	NC_017328	CCAC	2	8	671129	671136	25 %	0 %	0 %	75 %	384542220
11554	NC_017328	GAA	2	6	671161	671166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542220
11555	NC_017328	CTG	2	6	671179	671184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542220
11556	NC_017328	AGA	2	6	671258	671263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542220
11557	NC_017328	AAG	2	6	671306	671311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542220
11558	NC_017328	GC	3	6	671328	671333	0 %	0 %	50 %	50 %	384542220
11559	NC_017328	ATT	2	6	671347	671352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542220
11560	NC_017328	GAT	2	6	671385	671390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542220
11561	NC_017328	GCG	2	6	671402	671407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542220
11562	NC_017328	CG	3	6	671471	671476	0 %	0 %	50 %	50 %	384542220
11563	NC_017328	CAT	2	6	671502	671507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542220
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11565	NC_017328	GTG	2	6	671539	671544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542220
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11567	NC_017328	CCGT	2	8	671571	671578	0 %	25 %	25 %	50 %	384542220
11568	NC_017328	GCGT	2	8	671621	671628	0 %	25 %	50 %	25 %	384542220
11569	NC_017328	GTG	2	6	671666	671671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542220
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11572	NC_017328	TGC	2	6	671721	671726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542220
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11585	NC_017328	GAA	2	6	672117	672122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542220
11586	NC_017328	ATCA	2	8	672151	672158	50 %	25 %	0 %	25 %	384542220
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11591	NC_017328	GTG	2	6	672361	672366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542220
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11596	NC_017328	TGA	2	6	672698	672703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542221
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11602	NC_017328	CTG	2	6	673128	673133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542221
11603	NC_017328	CGG	2	6	673141	673146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542221
11604	NC_017328	CCTG	2	8	673172	673179	0 %	25 %	25 %	50 %	384542221
11605	NC_017328	ACG	2	6	673222	673227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542221
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11607	NC_017328	ACG	2	6	673327	673332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542221
11608	NC_017328	CA	3	6	673436	673441	50 %	0 %	0 %	50 %	384542221
11609	NC_017328	CTT	2	6	673523	673528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542221
11610	NC_017328	GGT	2	6	673556	673561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542221
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11615	NC_017328	AG	3	6	673720	673725	50 %	0 %	50 %	0 %	384542222
11616	NC_017328	CCG	2	6	673803	673808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542222
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11618	NC_017328	GGT	2	6	673933	673938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542222
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11620	NC_017328	TGG	2	6	673992	673997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542222
11621	NC_017328	AGA	2	6	674050	674055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542222
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11639	NC_017328	GAA	2	6	674917	674922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542223
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11729	NC_017328	GCT	3	9	679341	679349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542227
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11736	NC_017328	A	6	6	679620	679625	100 %	0 %	0 %	0 %	384542228
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11978	NC_017328	CCG	2	6	694040	694045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542239
11979	NC_017328	ATG	2	6	694050	694055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542239
11980	NC_017328	GTCA	2	8	694147	694154	25 %	25 %	25 %	25 %	384542239
11981	NC_017328	TCT	2	6	694181	694186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542239
11982	NC_017328	GGC	2	6	694255	694260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542240
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