MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017328	AT	3	6	630029	630034	50 %	50 %	0 %	0 %	384542190
11002	NC_017328	GT	3	6	630071	630076	0 %	50 %	50 %	0 %	384542190
11003	NC_017328	TGA	2	6	630088	630093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542190
11004	NC_017328	CG	3	6	630126	630131	0 %	0 %	50 %	50 %	384542190
11005	NC_017328	ATA	2	6	630146	630151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542190
11006	NC_017328	CGC	2	6	630314	630319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542191
11007	NC_017328	CGA	2	6	630465	630470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542191
11008	NC_017328	GCA	2	6	630537	630542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542191
11009	NC_017328	GCC	2	6	630558	630563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542191
11010	NC_017328	GCCA	2	8	630568	630575	25 %	0 %	25 %	50 %	384542191
11011	NC_017328	TTA	2	6	630579	630584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542191
11012	NC_017328	ATCA	2	8	630599	630606	50 %	25 %	0 %	25 %	384542191
11013	NC_017328	TCGC	2	8	630623	630630	0 %	25 %	25 %	50 %	384542191
11014	NC_017328	CAA	2	6	630647	630652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542191
11015	NC_017328	ATC	2	6	630678	630683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542191
11016	NC_017328	CCAG	2	8	630701	630708	25 %	0 %	25 %	50 %	384542191
11017	NC_017328	AAT	2	6	630737	630742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542191
11018	NC_017328	TCA	2	6	630859	630864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542191
11019	NC_017328	CAA	2	6	630947	630952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542191
11020	NC_017328	GGCGA	2	10	630967	630976	20 %	0 %	60 %	20 %	384542191
11021	NC_017328	CCCG	2	8	630980	630987	0 %	0 %	25 %	75 %	384542191
11022	NC_017328	GTT	2	6	631039	631044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542191
11023	NC_017328	CGC	2	6	631094	631099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542191
11024	NC_017328	TTC	2	6	631103	631108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542191
11025	NC_017328	ATGG	2	8	631158	631165	25 %	25 %	50 %	0 %	384542191
11026	NC_017328	CTA	2	6	631185	631190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542191
11027	NC_017328	TCA	2	6	631294	631299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542191
11028	NC_017328	CGG	2	6	631307	631312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542191
11029	NC_017328	TCA	2	6	631326	631331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542191
11030	NC_017328	CA	3	6	631339	631344	50 %	0 %	0 %	50 %	384542191
11031	NC_017328	CGCT	2	8	631382	631389	0 %	25 %	25 %	50 %	384542191
11032	NC_017328	A	6	6	631414	631419	100 %	0 %	0 %	0 %	384542191
11033	NC_017328	GTG	2	6	631600	631605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542191
11034	NC_017328	GGC	2	6	631649	631654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542191
11035	NC_017328	GCG	2	6	631827	631832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542192
11036	NC_017328	AAG	2	6	631834	631839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542192
11037	NC_017328	CAGC	2	8	631875	631882	25 %	0 %	25 %	50 %	384542192
11038	NC_017328	CG	3	6	631953	631958	0 %	0 %	50 %	50 %	384542192
11039	NC_017328	ATC	2	6	632014	632019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542192
11040	NC_017328	TGA	2	6	632033	632038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542192
11041	NC_017328	CG	3	6	632133	632138	0 %	0 %	50 %	50 %	384542192
11042	NC_017328	TCA	2	6	632201	632206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542192
11043	NC_017328	CCA	2	6	632432	632437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542193
11044	NC_017328	TAT	2	6	632463	632468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542193
11045	NC_017328	G	6	6	632558	632563	0 %	0 %	100 %	0 %	384542193
11046	NC_017328	CAT	2	6	632570	632575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542193
11047	NC_017328	GGGAT	2	10	632605	632614	20 %	20 %	60 %	0 %	384542193
11048	NC_017328	TTA	2	6	632691	632696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542194
11049	NC_017328	TCA	2	6	632707	632712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542194
11050	NC_017328	ATG	2	6	632819	632824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542194
11051	NC_017328	ATG	2	6	632858	632863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542194
11052	NC_017328	CATT	2	8	632899	632906	25 %	50 %	0 %	25 %	384542194
11053	NC_017328	ATCTA	2	10	632940	632949	40 %	40 %	0 %	20 %	384542194
11054	NC_017328	ATT	2	6	633073	633078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542195
11055	NC_017328	AT	3	6	633097	633102	50 %	50 %	0 %	0 %	384542195
11056	NC_017328	CCA	2	6	633114	633119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11057	NC_017328	TGA	2	6	633123	633128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542195
11058	NC_017328	ATC	2	6	633218	633223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542195
11059	NC_017328	ACT	2	6	633389	633394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542195
11060	NC_017328	TAA	2	6	633398	633403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542195
11061	NC_017328	CCG	2	6	633630	633635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11062	NC_017328	GC	3	6	633721	633726	0 %	0 %	50 %	50 %	384542195
11063	NC_017328	TCCG	2	8	633936	633943	0 %	25 %	25 %	50 %	384542195
11064	NC_017328	GTC	2	6	633987	633992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11065	NC_017328	CCA	2	6	633997	634002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11066	NC_017328	CAT	2	6	634015	634020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542195
11067	NC_017328	CCT	2	6	634048	634053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542195
11068	NC_017328	CAC	2	6	634093	634098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11069	NC_017328	CAC	2	6	634124	634129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11070	NC_017328	CG	3	6	634157	634162	0 %	0 %	50 %	50 %	384542195
11071	NC_017328	CAG	2	6	634169	634174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11072	NC_017328	CGC	2	6	634181	634186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11073	NC_017328	GCC	2	6	634304	634309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11074	NC_017328	GGTC	2	8	634315	634322	0 %	25 %	50 %	25 %	384542195
11075	NC_017328	TTC	2	6	634340	634345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542195
11076	NC_017328	GTC	2	6	634362	634367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11077	NC_017328	GTCC	2	8	634441	634448	0 %	25 %	25 %	50 %	384542195
11078	NC_017328	CTGCG	2	10	634461	634470	0 %	20 %	40 %	40 %	384542195
11079	NC_017328	GTG	2	6	634511	634516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542195
11080	NC_017328	TAA	2	6	634569	634574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542195
11081	NC_017328	CGC	2	6	634582	634587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11082	NC_017328	TCG	2	6	634620	634625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11083	NC_017328	GCA	2	6	634639	634644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11084	NC_017328	GGCC	2	8	634678	634685	0 %	0 %	50 %	50 %	384542195
11085	NC_017328	ACG	2	6	634700	634705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11086	NC_017328	CAG	2	6	634706	634711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11087	NC_017328	CCG	2	6	634754	634759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11088	NC_017328	GCC	2	6	634767	634772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11089	NC_017328	GCT	2	6	634801	634806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11090	NC_017328	CGC	2	6	634810	634815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11091	NC_017328	GTC	2	6	634838	634843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11092	NC_017328	GTA	2	6	634844	634849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542195
11093	NC_017328	GTG	2	6	634907	634912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542195
11094	NC_017328	GCT	2	6	634949	634954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11095	NC_017328	CAC	2	6	634975	634980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11096	NC_017328	C	6	6	635019	635024	0 %	0 %	0 %	100 %	384542195
11097	NC_017328	TTCC	2	8	635152	635159	0 %	50 %	0 %	50 %	384542195
11098	NC_017328	CTG	2	6	635175	635180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11099	NC_017328	GTCATC	2	12	635231	635242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384542195
11100	NC_017328	GGC	2	6	635264	635269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542195
11101	NC_017328	TGG	2	6	635293	635298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542195
11102	NC_017328	GCA	2	6	635331	635336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11103	NC_017328	GAA	2	6	635371	635376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542195
11104	NC_017328	CCA	2	6	635395	635400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11105	NC_017328	ACC	2	6	635436	635441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11106	NC_017328	CAC	2	6	635501	635506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11107	NC_017328	GGCT	2	8	635547	635554	0 %	25 %	50 %	25 %	384542195
11108	NC_017328	CG	3	6	635571	635576	0 %	0 %	50 %	50 %	384542195
11109	NC_017328	AT	3	6	635586	635591	50 %	50 %	0 %	0 %	384542195
11110	NC_017328	GCGG	2	8	635598	635605	0 %	0 %	75 %	25 %	384542195
11111	NC_017328	TGC	2	6	635635	635640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11112	NC_017328	CAG	2	6	635693	635698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11113	NC_017328	GGC	2	6	635732	635737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542195
11114	NC_017328	T	8	8	635738	635745	0 %	100 %	0 %	0 %	384542195
11115	NC_017328	AGGA	2	8	635767	635774	50 %	0 %	50 %	0 %	384542195
11116	NC_017328	CCA	2	6	635878	635883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542195
11117	NC_017328	CTT	2	6	635896	635901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542195
11118	NC_017328	TCC	2	6	636027	636032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542195
11119	NC_017328	CTT	2	6	636043	636048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542195
11120	NC_017328	CGC	2	6	636107	636112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542195
11121	NC_017328	CG	3	6	636117	636122	0 %	0 %	50 %	50 %	384542195
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11123	NC_017328	ACG	2	6	636409	636414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
11124	NC_017328	GCA	2	6	636418	636423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542195
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11235	NC_017328	CG	3	6	650937	650942	0 %	0 %	50 %	50 %	384542204
11236	NC_017328	GTCA	2	8	650957	650964	25 %	25 %	25 %	25 %	384542204
11237	NC_017328	AGC	2	6	651002	651007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542204
11238	NC_017328	GC	3	6	651014	651019	0 %	0 %	50 %	50 %	384542204
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11240	NC_017328	CCG	2	6	651199	651204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542204
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11360	NC_017328	CGAT	2	8	658742	658749	25 %	25 %	25 %	25 %	384542213
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11469	NC_017328	GGCG	2	8	663944	663951	0 %	0 %	75 %	25 %	384542216
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11479	NC_017328	AAG	2	6	664596	664601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542217
11480	NC_017328	CAG	2	6	664607	664612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542217
11481	NC_017328	GCC	2	6	664626	664631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542217
11482	NC_017328	GTC	2	6	664689	664694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542217
11483	NC_017328	CCA	2	6	664701	664706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542217
11484	NC_017328	CAG	2	6	664723	664728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542217
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11486	NC_017328	CAG	2	6	664772	664777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542217
11487	NC_017328	CTG	2	6	664793	664798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542217
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11491	NC_017328	ACT	2	6	665019	665024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542217
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11497	NC_017328	TGC	2	6	665457	665462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542217
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11499	NC_017328	TTG	2	6	666983	666988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542218
11500	NC_017328	CT	3	6	667010	667015	0 %	50 %	0 %	50 %	384542218

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