MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10005	NC_017328	TGC	2	6	569885	569890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542135
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10010	NC_017328	TGC	2	6	570230	570235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542135
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10012	NC_017328	TCC	2	6	570285	570290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542135
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10015	NC_017328	TGG	2	6	570427	570432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542136
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10017	NC_017328	ATC	2	6	570516	570521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542136
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10031	NC_017328	TAAA	2	8	571358	571365	75 %	25 %	0 %	0 %	384542137
10032	NC_017328	TCAGT	2	10	571401	571410	20 %	40 %	20 %	20 %	384542137
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10065	NC_017328	AGGG	2	8	573417	573424	25 %	0 %	75 %	0 %	384542139
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10101	NC_017328	CCCG	2	8	575564	575571	0 %	0 %	25 %	75 %	384542142
10102	NC_017328	GCCA	2	8	575588	575595	25 %	0 %	25 %	50 %	384542142
10103	NC_017328	ATC	2	6	575615	575620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542142
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10110	NC_017328	CGG	2	6	575946	575951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542142
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10115	NC_017328	ACAGC	2	10	576177	576186	40 %	0 %	20 %	40 %	384542142
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10118	NC_017328	CTGC	2	8	576216	576223	0 %	25 %	25 %	50 %	384542142
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10239	NC_017328	GCT	2	6	583426	583431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542150
10240	NC_017328	ATCAGG	2	12	583455	583466	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384542150
10241	NC_017328	CGG	2	6	583582	583587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542150
10242	NC_017328	GAT	2	6	583664	583669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542150
10243	NC_017328	CGA	2	6	583723	583728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542150
10244	NC_017328	TGA	2	6	583876	583881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542150
10245	NC_017328	GGC	2	6	583883	583888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542150
10246	NC_017328	ACG	2	6	583896	583901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542150
10247	NC_017328	ATC	2	6	583949	583954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542150
10248	NC_017328	CGA	3	9	583972	583980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542150
10249	NC_017328	GGC	2	6	584047	584052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542150
10250	NC_017328	CAG	2	6	584064	584069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542150
10251	NC_017328	ACC	2	6	584096	584101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542150
10252	NC_017328	CGG	2	6	584137	584142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542150
10253	NC_017328	GAACC	2	10	584157	584166	40 %	0 %	20 %	40 %	384542150
10254	NC_017328	ACC	2	6	584223	584228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542150
10255	NC_017328	CTGGTT	2	12	584529	584540	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384542151
10256	NC_017328	ACG	2	6	584590	584595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10257	NC_017328	TCTG	2	8	584600	584607	0 %	50 %	25 %	25 %	384542151
10258	NC_017328	AGC	2	6	584630	584635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10259	NC_017328	GCT	2	6	584642	584647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10260	NC_017328	GAAC	2	8	584774	584781	50 %	0 %	25 %	25 %	384542151
10261	NC_017328	CTG	2	6	584821	584826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10262	NC_017328	CGA	2	6	584837	584842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10263	NC_017328	CGT	2	6	584859	584864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10264	NC_017328	CCG	2	6	584880	584885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542151
10265	NC_017328	GAT	2	6	584898	584903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542151
10266	NC_017328	ATC	2	6	585051	585056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542151
10267	NC_017328	TGCG	2	8	585076	585083	0 %	25 %	50 %	25 %	384542151
10268	NC_017328	GAA	2	6	585111	585116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542151
10269	NC_017328	CGA	2	6	585167	585172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10270	NC_017328	TAT	2	6	585195	585200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542151
10271	NC_017328	AGC	3	9	585230	585238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542151
10272	NC_017328	CCA	2	6	585567	585572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542152
10273	NC_017328	CCA	2	6	585582	585587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542152
10274	NC_017328	AAT	2	6	585595	585600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542152
10275	NC_017328	CTG	2	6	585622	585627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542152
10276	NC_017328	CATC	2	8	585645	585652	25 %	25 %	0 %	50 %	384542152
10277	NC_017328	ATC	2	6	585695	585700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542152
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10280	NC_017328	GCG	2	6	585867	585872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542152
10281	NC_017328	CGG	2	6	585876	585881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542152
10282	NC_017328	AAGA	2	8	585945	585952	75 %	0 %	25 %	0 %	384542152
10283	NC_017328	TCA	2	6	586014	586019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542152
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10285	NC_017328	CGC	2	6	586063	586068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542152
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10288	NC_017328	CAC	2	6	586315	586320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542152
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10290	NC_017328	AGG	2	6	586429	586434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384542152
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10296	NC_017328	TGC	2	6	587012	587017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542153
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10300	NC_017328	CA	3	6	587311	587316	50 %	0 %	0 %	50 %	384542154
10301	NC_017328	AGA	2	6	587333	587338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542154
10302	NC_017328	TAA	2	6	587339	587344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384542154
10303	NC_017328	TCG	2	6	587348	587353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542154
10304	NC_017328	TTG	2	6	587355	587360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542154
10305	NC_017328	TGG	2	6	587405	587410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542154
10306	NC_017328	TTTC	2	8	587412	587419	0 %	75 %	0 %	25 %	384542154
10307	NC_017328	GCC	2	6	587469	587474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542154
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10309	NC_017328	CCA	2	6	587518	587523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542154
10310	NC_017328	CGC	2	6	587638	587643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542154
10311	NC_017328	GAGG	2	8	587652	587659	25 %	0 %	75 %	0 %	384542154
10312	NC_017328	ATG	3	9	587661	587669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542154
10313	NC_017328	CTTT	2	8	587703	587710	0 %	75 %	0 %	25 %	384542154
10314	NC_017328	TCA	2	6	587720	587725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542154
10315	NC_017328	AGC	2	6	587756	587761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542154
10316	NC_017328	CTG	2	6	587784	587789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542154
10317	NC_017328	TAT	2	6	587804	587809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542154
10318	NC_017328	ATT	2	6	587820	587825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542154
10319	NC_017328	CTGG	2	8	587833	587840	0 %	25 %	50 %	25 %	384542154
10320	NC_017328	CTG	2	6	587845	587850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542154
10321	NC_017328	TC	3	6	587858	587863	0 %	50 %	0 %	50 %	384542154
10322	NC_017328	TGAA	2	8	587920	587927	50 %	25 %	25 %	0 %	384542154
10323	NC_017328	CTGAA	2	10	587962	587971	40 %	20 %	20 %	20 %	384542154
10324	NC_017328	CGT	2	6	587973	587978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542154
10325	NC_017328	CATGTA	2	12	588015	588026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384542154
10326	NC_017328	TGA	2	6	588049	588054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542154
10327	NC_017328	CACGAT	2	12	588081	588092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384542154
10328	NC_017328	TTG	2	6	588096	588101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542154
10329	NC_017328	CAC	2	6	588146	588151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542154
10330	NC_017328	TGAA	2	8	588196	588203	50 %	25 %	25 %	0 %	384542154
10331	NC_017328	CAT	2	6	588222	588227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542154
10332	NC_017328	GC	3	6	588244	588249	0 %	0 %	50 %	50 %	384542155
10333	NC_017328	GAT	2	6	588314	588319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542155
10334	NC_017328	ACG	2	6	588363	588368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542155
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10336	NC_017328	TCA	2	6	588421	588426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542155
10337	NC_017328	GATA	2	8	588440	588447	50 %	25 %	25 %	0 %	384542155
10338	NC_017328	CAT	2	6	588452	588457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542155
10339	NC_017328	TCA	2	6	588583	588588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542155
10340	NC_017328	AAC	2	6	588599	588604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542155
10341	NC_017328	GAAA	2	8	588763	588770	75 %	0 %	25 %	0 %	384542155
10342	NC_017328	AGT	2	6	588808	588813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542155
10343	NC_017328	TCT	2	6	588820	588825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542155
10344	NC_017328	GA	3	6	588885	588890	50 %	0 %	50 %	0 %	384542155
10345	NC_017328	CCGC	2	8	588897	588904	0 %	0 %	25 %	75 %	384542155
10346	NC_017328	A	7	7	588941	588947	100 %	0 %	0 %	0 %	384542155
10347	NC_017328	CT	3	6	589045	589050	0 %	50 %	0 %	50 %	384542156
10348	NC_017328	CTTC	2	8	589084	589091	0 %	50 %	0 %	50 %	384542156
10349	NC_017328	TCAT	2	8	589123	589130	25 %	50 %	0 %	25 %	384542156
10350	NC_017328	GC	3	6	589148	589153	0 %	0 %	50 %	50 %	384542156
10351	NC_017328	CTG	2	6	589218	589223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542156
10352	NC_017328	TGA	2	6	589267	589272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542156
10353	NC_017328	GCA	2	6	589285	589290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542156
10354	NC_017328	TGG	2	6	589304	589309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542156
10355	NC_017328	ACCG	2	8	589311	589318	25 %	0 %	25 %	50 %	384542156
10356	NC_017328	GCA	2	6	589369	589374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542156
10357	NC_017328	TTC	2	6	589383	589388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542156
10358	NC_017328	TCA	2	6	589420	589425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542156
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10361	NC_017328	GAT	2	6	589538	589543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542156
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10476	NC_017328	ATC	2	6	597802	597807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542166
10477	NC_017328	CAC	2	6	597816	597821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542166
10478	NC_017328	CAG	2	6	597828	597833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542166
10479	NC_017328	GAA	2	6	597855	597860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542166
10480	NC_017328	GTA	2	6	597870	597875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542166
10481	NC_017328	TCA	2	6	597889	597894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542166
10482	NC_017328	GCG	2	6	597947	597952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542166
10483	NC_017328	TTC	2	6	598005	598010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542166
10484	NC_017328	ACCG	2	8	598032	598039	25 %	0 %	25 %	50 %	384542166
10485	NC_017328	GAA	2	6	598044	598049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542166
10486	NC_017328	ATC	2	6	598069	598074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542166
10487	NC_017328	GCA	2	6	598120	598125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542166
10488	NC_017328	GCC	2	6	598134	598139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542166
10489	NC_017328	GTG	2	6	598175	598180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542166
10490	NC_017328	CAG	2	6	598284	598289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542166
10491	NC_017328	CAG	2	6	598299	598304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542166
10492	NC_017328	CCA	2	6	598305	598310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542166
10493	NC_017328	AGT	2	6	598371	598376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542167
10494	NC_017328	GCT	2	6	598416	598421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542167
10495	NC_017328	CCA	2	6	598463	598468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384542167
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10497	NC_017328	GGC	2	6	598580	598585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542167
10498	NC_017328	GCGCG	2	10	598646	598655	0 %	0 %	60 %	40 %	384542167
10499	NC_017328	T	6	6	598665	598670	0 %	100 %	0 %	0 %	384542167
10500	NC_017328	AG	3	6	598704	598709	50 %	0 %	50 %	0 %	384542167

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