MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_017328	CGG	2	6	508163	508168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542082
9003	NC_017328	GTC	2	6	508173	508178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9004	NC_017328	GGC	2	6	508230	508235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542082
9005	NC_017328	TGC	2	6	508251	508256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9006	NC_017328	CAG	2	6	508308	508313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9007	NC_017328	GTC	2	6	508320	508325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9008	NC_017328	ATT	2	6	508326	508331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542082
9009	NC_017328	AGC	2	6	508339	508344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9010	NC_017328	CAG	3	9	508432	508440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9011	NC_017328	GGT	2	6	508443	508448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542082
9012	NC_017328	CAG	2	6	508537	508542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9013	NC_017328	ATTT	2	8	508699	508706	25 %	75 %	0 %	0 %	384542082
9014	NC_017328	GCA	2	6	508731	508736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542082
9015	NC_017328	A	6	6	508767	508772	100 %	0 %	0 %	0 %	384542083
9016	NC_017328	CAT	3	9	508836	508844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542083
9017	NC_017328	A	7	7	508917	508923	100 %	0 %	0 %	0 %	384542083
9018	NC_017328	CCAT	2	8	508927	508934	25 %	25 %	0 %	50 %	384542083
9019	NC_017328	TGC	2	6	508946	508951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542083
9020	NC_017328	CAG	2	6	509049	509054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542083
9021	NC_017328	CTTT	2	8	509061	509068	0 %	75 %	0 %	25 %	384542083
9022	NC_017328	A	7	7	509115	509121	100 %	0 %	0 %	0 %	384542084
9023	NC_017328	TTA	2	6	509128	509133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542084
9024	NC_017328	GCA	2	6	509137	509142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542084
9025	NC_017328	TAT	2	6	509156	509161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542084
9026	NC_017328	CGCA	2	8	509200	509207	25 %	0 %	25 %	50 %	384542084
9027	NC_017328	A	6	6	509209	509214	100 %	0 %	0 %	0 %	384542084
9028	NC_017328	TATGGA	2	12	509300	509311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542084
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9030	NC_017328	CG	3	6	509410	509415	0 %	0 %	50 %	50 %	384542084
9031	NC_017328	CGA	2	6	509443	509448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542084
9032	NC_017328	CGG	2	6	509624	509629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542084
9033	NC_017328	A	6	6	509716	509721	100 %	0 %	0 %	0 %	384542084
9034	NC_017328	GC	3	6	509780	509785	0 %	0 %	50 %	50 %	384542084
9035	NC_017328	GAAT	2	8	509788	509795	50 %	25 %	25 %	0 %	384542084
9036	NC_017328	AGGT	2	8	509828	509835	25 %	25 %	50 %	0 %	384542084
9037	NC_017328	TGTC	2	8	509846	509853	0 %	50 %	25 %	25 %	384542084
9038	NC_017328	TTAA	2	8	509878	509885	50 %	50 %	0 %	0 %	384542084
9039	NC_017328	GCTGAT	2	12	510103	510114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384542085
9040	NC_017328	TCCAGT	2	12	510149	510160	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384542085
9041	NC_017328	TGGCA	2	10	510172	510181	20 %	20 %	40 %	20 %	384542085
9042	NC_017328	CAGA	2	8	510234	510241	50 %	0 %	25 %	25 %	384542085
9043	NC_017328	CTG	2	6	510245	510250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542085
9044	NC_017328	ACT	2	6	510341	510346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542085
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9047	NC_017328	TTCTGC	2	12	510445	510456	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384542086
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9050	NC_017328	TG	3	6	510671	510676	0 %	50 %	50 %	0 %	384542086
9051	NC_017328	ATAC	2	8	510687	510694	50 %	25 %	0 %	25 %	384542086
9052	NC_017328	ATG	2	6	510833	510838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542086
9053	NC_017328	GTAA	2	8	510874	510881	50 %	25 %	25 %	0 %	384542086
9054	NC_017328	CCAC	2	8	510888	510895	25 %	0 %	0 %	75 %	384542086
9055	NC_017328	AAC	2	6	511064	511069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384542086
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9059	NC_017328	GGT	2	6	511409	511414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542087
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9062	NC_017328	TGC	2	6	512885	512890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542088
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9089	NC_017328	GCT	2	6	514406	514411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542090
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9110	NC_017328	AT	3	6	515479	515484	50 %	50 %	0 %	0 %	384542091
9111	NC_017328	GC	3	6	515488	515493	0 %	0 %	50 %	50 %	384542091
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9243	NC_017328	GAC	2	6	522435	522440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542097
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9486	NC_017328	GCG	2	6	537803	537808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542109
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