MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017328	CTA	2	6	450798	450803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542028
8002	NC_017328	AGC	2	6	450835	450840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8003	NC_017328	CTG	2	6	450853	450858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8004	NC_017328	CTG	2	6	450880	450885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8005	NC_017328	GAT	2	6	450909	450914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542028
8006	NC_017328	CTGA	2	8	450922	450929	25 %	25 %	25 %	25 %	384542028
8007	NC_017328	TGA	2	6	450999	451004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542028
8008	NC_017328	AAG	2	6	451013	451018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542028
8009	NC_017328	CGAC	2	8	451127	451134	25 %	0 %	25 %	50 %	384542028
8010	NC_017328	GCG	2	6	451174	451179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542028
8011	NC_017328	CTG	3	9	451291	451299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8012	NC_017328	GCT	2	6	451308	451313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8013	NC_017328	TCG	2	6	451353	451358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8014	NC_017328	GCT	2	6	451368	451373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542028
8015	NC_017328	TGG	2	6	451505	451510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542029
8016	NC_017328	A	7	7	451530	451536	100 %	0 %	0 %	0 %	384542029
8017	NC_017328	TCA	2	6	451619	451624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542029
8018	NC_017328	TGC	2	6	451664	451669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542029
8019	NC_017328	TGC	2	6	451671	451676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542029
8020	NC_017328	CGA	2	6	451743	451748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542029
8021	NC_017328	GCAG	2	8	451836	451843	25 %	0 %	50 %	25 %	384542029
8022	NC_017328	AAG	2	6	451853	451858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542029
8023	NC_017328	TTG	2	6	451910	451915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542029
8024	NC_017328	ATCGT	2	10	451916	451925	20 %	40 %	20 %	20 %	384542029
8025	NC_017328	GCC	2	6	451928	451933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542029
8026	NC_017328	CCG	2	6	451978	451983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542029
8027	NC_017328	GAC	2	6	451999	452004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542029
8028	NC_017328	GAA	2	6	452014	452019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542029
8029	NC_017328	GAA	2	6	452044	452049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384542029
8030	NC_017328	CTA	2	6	452103	452108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542029
8031	NC_017328	GAAGCG	2	12	452116	452127	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384542029
8032	NC_017328	A	6	6	452192	452197	100 %	0 %	0 %	0 %	384542029
8033	NC_017328	CTG	2	6	452364	452369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542030
8034	NC_017328	GTT	2	6	452465	452470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542030
8035	NC_017328	TGG	2	6	452472	452477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542030
8036	NC_017328	TGC	2	6	452482	452487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542030
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8038	NC_017328	CGC	2	6	452512	452517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542030
8039	NC_017328	TGGA	2	8	452544	452551	25 %	25 %	50 %	0 %	384542030
8040	NC_017328	CGC	2	6	452560	452565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542030
8041	NC_017328	GCC	2	6	452578	452583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542030
8042	NC_017328	CAG	2	6	452589	452594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542030
8043	NC_017328	TGC	2	6	452710	452715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542030
8044	NC_017328	CGGT	2	8	452743	452750	0 %	25 %	50 %	25 %	384542030
8045	NC_017328	GC	3	6	452781	452786	0 %	0 %	50 %	50 %	384542030
8046	NC_017328	CTT	2	6	452872	452877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542030
8047	NC_017328	CTG	3	9	452901	452909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542030
8048	NC_017328	CT	3	6	452910	452915	0 %	50 %	0 %	50 %	384542030
8049	NC_017328	GAT	2	6	452952	452957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542030
8050	NC_017328	TGA	3	9	453025	453033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542030
8051	NC_017328	CGA	2	6	453080	453085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542030
8052	NC_017328	TGC	2	6	453146	453151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542030
8053	NC_017328	GCGG	2	8	453210	453217	0 %	0 %	75 %	25 %	384542030
8054	NC_017328	A	6	6	453219	453224	100 %	0 %	0 %	0 %	384542030
8055	NC_017328	AT	3	6	453230	453235	50 %	50 %	0 %	0 %	384542030
8056	NC_017328	ATG	2	6	453270	453275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542030
8057	NC_017328	TTG	2	6	453283	453288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384542030
8058	NC_017328	CAG	2	6	453464	453469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542031
8059	NC_017328	ATT	2	6	453524	453529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384542031
8060	NC_017328	ACAG	2	8	453532	453539	50 %	0 %	25 %	25 %	384542031
8061	NC_017328	CGT	2	6	453562	453567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542031
8062	NC_017328	GAC	2	6	453637	453642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542031
8063	NC_017328	TTGAT	2	10	453795	453804	20 %	60 %	20 %	0 %	384542031
8064	NC_017328	TCC	2	6	453807	453812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384542031
8065	NC_017328	CTG	2	6	453815	453820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542031
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8068	NC_017328	TAAT	2	8	453891	453898	50 %	50 %	0 %	0 %	384542031
8069	NC_017328	CAG	2	6	453929	453934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542031
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8071	NC_017328	AAATA	2	10	453990	453999	80 %	20 %	0 %	0 %	384542031
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8080	NC_017328	GAC	2	6	454728	454733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542032
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8090	NC_017328	GGGC	2	8	455441	455448	0 %	0 %	75 %	25 %	384542032
8091	NC_017328	A	6	6	455452	455457	100 %	0 %	0 %	0 %	384542032
8092	NC_017328	TGC	2	6	455500	455505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542032
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8099	NC_017328	TTCG	2	8	456111	456118	0 %	50 %	25 %	25 %	384542033
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8109	NC_017328	A	6	6	456666	456671	100 %	0 %	0 %	0 %	384542033
8110	NC_017328	GGC	2	6	456711	456716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384542033
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8116	NC_017328	TTC	2	6	457110	457115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384542033
8117	NC_017328	GC	3	6	457120	457125	0 %	0 %	50 %	50 %	384542033
8118	NC_017328	CCAGC	2	10	457188	457197	20 %	0 %	20 %	60 %	384542033
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8241	NC_017328	GTC	2	6	464512	464517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542039
8242	NC_017328	GCA	2	6	464522	464527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542039
8243	NC_017328	T	6	6	464561	464566	0 %	100 %	0 %	0 %	384542039
8244	NC_017328	GC	3	6	464586	464591	0 %	0 %	50 %	50 %	384542039
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8479	NC_017328	GTA	2	6	475832	475837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384542052
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8481	NC_017328	TGC	2	6	475869	475874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542052
8482	NC_017328	CGC	2	6	475886	475891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542052
8483	NC_017328	GCC	2	6	475929	475934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542052
8484	NC_017328	TGC	2	6	475992	475997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542052
8485	NC_017328	CTG	3	9	476003	476011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542052
8486	NC_017328	TGC	2	6	476013	476018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542052
8487	NC_017328	GCA	3	9	476041	476049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384542052
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8489	NC_017328	TTAA	2	8	476078	476085	50 %	50 %	0 %	0 %	384542052
8490	NC_017328	CAT	2	6	476132	476137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384542052
8491	NC_017328	GCC	2	6	476296	476301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384542052
8492	NC_017328	TATTT	2	10	476456	476465	20 %	80 %	0 %	0 %	384542052
8493	NC_017328	GGTC	2	8	476605	476612	0 %	25 %	50 %	25 %	384542052
8494	NC_017328	TGG	2	6	476649	476654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384542052
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8500	NC_017328	CTG	2	6	476765	476770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384542052

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