MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017328	GCT	2	6	369380	369385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541950
6502	NC_017328	CAT	2	6	369407	369412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541950
6503	NC_017328	TCGCT	2	10	369436	369445	0 %	40 %	20 %	40 %	384541950
6504	NC_017328	CTG	2	6	369483	369488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541950
6505	NC_017328	GCC	2	6	369515	369520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541950
6506	NC_017328	AGA	2	6	369521	369526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541950
6507	NC_017328	CGG	2	6	369575	369580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541950
6508	NC_017328	TAT	2	6	369599	369604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541950
6509	NC_017328	TTG	2	6	369664	369669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541950
6510	NC_017328	CGC	2	6	369696	369701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541950
6511	NC_017328	GCTG	2	8	369713	369720	0 %	25 %	50 %	25 %	384541950
6512	NC_017328	AAT	2	6	369727	369732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541950
6513	NC_017328	ATG	2	6	369887	369892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541951
6514	NC_017328	CAAAG	2	10	369932	369941	60 %	0 %	20 %	20 %	384541951
6515	NC_017328	TGC	2	6	369996	370001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6516	NC_017328	GAA	2	6	370019	370024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541951
6517	NC_017328	AGC	2	6	370044	370049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6518	NC_017328	GCG	2	6	370085	370090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
6519	NC_017328	TC	3	6	370096	370101	0 %	50 %	0 %	50 %	384541951
6520	NC_017328	CGG	2	6	370115	370120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
6521	NC_017328	CTG	2	6	370136	370141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6522	NC_017328	GCC	2	6	370189	370194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541951
6523	NC_017328	T	6	6	370260	370265	0 %	100 %	0 %	0 %	384541951
6524	NC_017328	CAT	2	6	370334	370339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541951
6525	NC_017328	ATC	2	6	370355	370360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541951
6526	NC_017328	GGCG	2	8	370393	370400	0 %	0 %	75 %	25 %	384541951
6527	NC_017328	GGC	2	6	370415	370420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
6528	NC_017328	TGC	2	6	370575	370580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6529	NC_017328	GCA	2	6	370597	370602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6530	NC_017328	G	6	6	370687	370692	0 %	0 %	100 %	0 %	384541951
6531	NC_017328	TGA	2	6	370741	370746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541951
6532	NC_017328	TGGCT	2	10	370763	370772	0 %	40 %	40 %	20 %	384541951
6533	NC_017328	TGAA	2	8	370815	370822	50 %	25 %	25 %	0 %	384541951
6534	NC_017328	GGC	2	6	370887	370892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
6535	NC_017328	GC	3	6	370928	370933	0 %	0 %	50 %	50 %	384541951
6536	NC_017328	AAT	2	6	370934	370939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541951
6537	NC_017328	GCA	2	6	370942	370947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541951
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6539	NC_017328	TGC	2	6	371053	371058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6540	NC_017328	GCA	2	6	371128	371133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541951
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6542	NC_017328	TCA	2	6	371188	371193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541951
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6544	NC_017328	GCT	2	6	371251	371256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6545	NC_017328	GC	3	6	371270	371275	0 %	0 %	50 %	50 %	384541951
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6547	NC_017328	CCTGG	2	10	371304	371313	0 %	20 %	40 %	40 %	384541951
6548	NC_017328	TTA	2	6	371326	371331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541951
6549	NC_017328	TGA	2	6	371335	371340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541951
6550	NC_017328	TGC	2	6	371445	371450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6551	NC_017328	CGT	2	6	371471	371476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541951
6552	NC_017328	GGC	2	6	371477	371482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541951
6553	NC_017328	TGG	2	6	371550	371555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541951
6554	NC_017328	GTG	2	6	371582	371587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541951
6555	NC_017328	GCAATG	2	12	371617	371628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384541951
6556	NC_017328	AAG	2	6	371631	371636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541951
6557	NC_017328	ACTG	2	8	371647	371654	25 %	25 %	25 %	25 %	384541951
6558	NC_017328	TGCC	2	8	371670	371677	0 %	25 %	25 %	50 %	384541951
6559	NC_017328	TG	3	6	371720	371725	0 %	50 %	50 %	0 %	384541952
6560	NC_017328	CAT	2	6	371736	371741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541952
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6562	NC_017328	TCA	2	6	371960	371965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541952
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6564	NC_017328	GTCA	2	8	372132	372139	25 %	25 %	25 %	25 %	384541952
6565	NC_017328	GC	3	6	372481	372486	0 %	0 %	50 %	50 %	384541953
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6569	NC_017328	CGA	2	6	372632	372637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541953
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6572	NC_017328	ATG	2	6	372769	372774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541953
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6595	NC_017328	CGG	2	6	374135	374140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541954
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6604	NC_017328	ATTAAT	2	12	374623	374634	50 %	50 %	0 %	0 %	384541954
6605	NC_017328	T	6	6	374656	374661	0 %	100 %	0 %	0 %	384541955
6606	NC_017328	TTTGAT	2	12	374715	374726	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384541955
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