MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017328	TGT	2	6	340972	340977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541921
6003	NC_017328	TCG	2	6	341011	341016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6004	NC_017328	TGC	2	6	341017	341022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6005	NC_017328	CAG	2	6	341090	341095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6006	NC_017328	TGA	2	6	341176	341181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541921
6007	NC_017328	GA	3	6	341276	341281	50 %	0 %	50 %	0 %	384541921
6008	NC_017328	TGC	2	6	341305	341310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6009	NC_017328	CGA	2	6	341338	341343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6010	NC_017328	CAG	2	6	341396	341401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6011	NC_017328	GCG	2	6	341426	341431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541921
6012	NC_017328	GAA	2	6	341452	341457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541921
6013	NC_017328	CAA	2	6	341494	341499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541921
6014	NC_017328	CAT	2	6	341584	341589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541921
6015	NC_017328	GCT	2	6	341690	341695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6016	NC_017328	CAG	2	6	341732	341737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6017	NC_017328	GCA	2	6	341738	341743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
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6019	NC_017328	GCA	2	6	341770	341775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
6020	NC_017328	GCA	2	6	341831	341836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
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6022	NC_017328	AATGC	2	10	341885	341894	40 %	20 %	20 %	20 %	384541921
6023	NC_017328	GCA	2	6	341944	341949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541921
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6026	NC_017328	TTG	2	6	342166	342171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541922
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6028	NC_017328	TCG	2	6	342341	342346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541922
6029	NC_017328	CAT	2	6	342554	342559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541923
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6031	NC_017328	CCAC	2	8	342614	342621	25 %	0 %	0 %	75 %	384541923
6032	NC_017328	TTGT	2	8	342667	342674	0 %	75 %	25 %	0 %	384541923
6033	NC_017328	T	6	6	342688	342693	0 %	100 %	0 %	0 %	384541923
6034	NC_017328	ACTA	2	8	342708	342715	50 %	25 %	0 %	25 %	384541923
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6036	NC_017328	GCG	2	6	342820	342825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541923
6037	NC_017328	TA	3	6	342852	342857	50 %	50 %	0 %	0 %	384541923
6038	NC_017328	AT	3	6	342884	342889	50 %	50 %	0 %	0 %	384541923
6039	NC_017328	GA	3	6	342934	342939	50 %	0 %	50 %	0 %	384541923
6040	NC_017328	ACC	2	6	343006	343011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541923
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6042	NC_017328	TGT	2	6	343112	343117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541924
6043	NC_017328	ATC	2	6	343284	343289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541924
6044	NC_017328	GCT	2	6	343296	343301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541924
6045	NC_017328	TA	3	6	343312	343317	50 %	50 %	0 %	0 %	384541924
6046	NC_017328	ATG	2	6	343369	343374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541924
6047	NC_017328	TGA	2	6	343451	343456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541924
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6049	NC_017328	AT	3	6	343527	343532	50 %	50 %	0 %	0 %	384541924
6050	NC_017328	ATG	2	6	343591	343596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541924
6051	NC_017328	CTC	2	6	343603	343608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541924
6052	NC_017328	ATG	2	6	343621	343626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541924
6053	NC_017328	GCC	2	6	343876	343881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541924
6054	NC_017328	CTGAA	2	10	343993	344002	40 %	20 %	20 %	20 %	384541924
6055	NC_017328	GGT	2	6	344136	344141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541924
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6057	NC_017328	G	8	8	344217	344224	0 %	0 %	100 %	0 %	384541924
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6062	NC_017328	GTA	2	6	344549	344554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541925
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6064	NC_017328	GCA	2	6	344632	344637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541925
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6093	NC_017328	A	6	6	346011	346016	100 %	0 %	0 %	0 %	384541926
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6095	NC_017328	TAAA	2	8	346195	346202	75 %	25 %	0 %	0 %	384541927
6096	NC_017328	TA	3	6	346210	346215	50 %	50 %	0 %	0 %	384541927
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6121	NC_017328	CT	3	6	348218	348223	0 %	50 %	0 %	50 %	384541929
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6123	NC_017328	AGC	2	6	348270	348275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541930
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6130	NC_017328	CAG	2	6	348786	348791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541930
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6142	NC_017328	TG	3	6	349720	349725	0 %	50 %	50 %	0 %	384541931
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6239	NC_017328	AACAA	2	10	356363	356372	80 %	0 %	0 %	20 %	384541940
6240	NC_017328	TGC	2	6	356411	356416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541940
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6242	NC_017328	TGC	2	6	356474	356479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541940
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6486	NC_017328	TGA	2	6	368773	368778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541950
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6489	NC_017328	CAT	3	9	368864	368872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541950
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