MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 29351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_017327	TGC	2	6	1355343	1355348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24002	NC_017327	GA	3	6	1355423	1355428	50 %	0 %	50 %	0 %	384541253
24003	NC_017327	CTG	2	6	1355453	1355458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24004	NC_017327	CCA	2	6	1355475	1355480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541253
24005	NC_017327	CGG	2	6	1355482	1355487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541253
24006	NC_017327	GTC	2	6	1355509	1355514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24007	NC_017327	GCGT	2	8	1355515	1355522	0 %	25 %	50 %	25 %	384541253
24008	NC_017327	TGG	2	6	1355541	1355546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541253
24009	NC_017327	GTC	2	6	1355579	1355584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24010	NC_017327	TCG	2	6	1355585	1355590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24011	NC_017327	CCAT	2	8	1355667	1355674	25 %	25 %	0 %	50 %	384541253
24012	NC_017327	AGC	2	6	1355780	1355785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24013	NC_017327	GCC	2	6	1355800	1355805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541253
24014	NC_017327	GAT	2	6	1355809	1355814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541253
24015	NC_017327	CGG	2	6	1355899	1355904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541253
24016	NC_017327	CCGG	2	8	1355966	1355973	0 %	0 %	50 %	50 %	384541253
24017	NC_017327	GGC	2	6	1356013	1356018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541253
24018	NC_017327	TGCG	2	8	1356179	1356186	0 %	25 %	50 %	25 %	384541253
24019	NC_017327	TCT	2	6	1356237	1356242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541253
24020	NC_017327	CG	3	6	1356257	1356262	0 %	0 %	50 %	50 %	384541253
24021	NC_017327	CG	3	6	1356309	1356314	0 %	0 %	50 %	50 %	384541253
24022	NC_017327	CGT	2	6	1356348	1356353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541253
24023	NC_017327	TTGG	2	8	1356485	1356492	0 %	50 %	50 %	0 %	384541254
24024	NC_017327	TCT	2	6	1356498	1356503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541254
24025	NC_017327	GGC	2	6	1356559	1356564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541254
24026	NC_017327	CTC	2	6	1356592	1356597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541254
24027	NC_017327	CCA	2	6	1356634	1356639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541254
24028	NC_017327	CGC	2	6	1356851	1356856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541255
24029	NC_017327	CAC	2	6	1356864	1356869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541255
24030	NC_017327	CG	4	8	1356917	1356924	0 %	0 %	50 %	50 %	384541255
24031	NC_017327	CCT	2	6	1356932	1356937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541255
24032	NC_017327	CAAC	2	8	1356962	1356969	50 %	0 %	0 %	50 %	384541255
24033	NC_017327	GC	4	8	1357027	1357034	0 %	0 %	50 %	50 %	384541255
24034	NC_017327	CAA	2	6	1357059	1357064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541255
24035	NC_017327	GCGCC	2	10	1357116	1357125	0 %	0 %	40 %	60 %	384541255
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24037	NC_017327	AGT	2	6	1357408	1357413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541256
24038	NC_017327	CGG	2	6	1357451	1357456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541256
24039	NC_017327	AGG	2	6	1357556	1357561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541256
24040	NC_017327	CGA	2	6	1357646	1357651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541256
24041	NC_017327	TGC	2	6	1357734	1357739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541256
24042	NC_017327	GGC	3	9	1357848	1357856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541256
24043	NC_017327	CAT	2	6	1357878	1357883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541256
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24045	NC_017327	GTA	2	6	1357908	1357913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541256
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24047	NC_017327	AGT	2	6	1357990	1357995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541256
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24049	NC_017327	CAT	3	9	1358066	1358074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541256
24050	NC_017327	GTA	2	6	1358091	1358096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541256
24051	NC_017327	GTT	2	6	1358182	1358187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541256
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24053	NC_017327	GCTC	2	8	1358207	1358214	0 %	25 %	25 %	50 %	384541256
24054	NC_017327	TCCTG	2	10	1358258	1358267	0 %	40 %	20 %	40 %	384541256
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24057	NC_017327	CCA	2	6	1358648	1358653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541257
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24060	NC_017327	CAC	2	6	1358765	1358770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541257
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24062	NC_017327	GTC	2	6	1358945	1358950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541257
24063	NC_017327	CGA	2	6	1358956	1358961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541257
24064	NC_017327	GGC	2	6	1359009	1359014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541257
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24066	NC_017327	CCA	2	6	1359073	1359078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541257
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24101	NC_017327	GTC	2	6	1360811	1360816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541260
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24108	NC_017327	GTC	2	6	1361175	1361180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541260
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24116	NC_017327	AC	3	6	1361568	1361573	50 %	0 %	0 %	50 %	384541260
24117	NC_017327	CGTC	2	8	1361586	1361593	0 %	25 %	25 %	50 %	384541260
24118	NC_017327	GC	4	8	1361619	1361626	0 %	0 %	50 %	50 %	384541260
24119	NC_017327	CTG	2	6	1361672	1361677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541260
24120	NC_017327	ATG	2	6	1361820	1361825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541260
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24200	NC_017327	TGA	2	6	1366717	1366722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541266
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24216	NC_017327	CGGAT	2	10	1367450	1367459	20 %	20 %	40 %	20 %	384541266
24217	NC_017327	ACG	2	6	1367502	1367507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541266
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24219	NC_017327	CAC	2	6	1367608	1367613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541266
24220	NC_017327	C	6	6	1367670	1367675	0 %	0 %	0 %	100 %	384541266
24221	NC_017327	GTG	2	6	1367691	1367696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541266
24222	NC_017327	CTTCT	2	10	1367724	1367733	0 %	60 %	0 %	40 %	384541266
24223	NC_017327	CGC	2	6	1367828	1367833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541267
24224	NC_017327	GGC	2	6	1367872	1367877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541267
24225	NC_017327	GTC	3	9	1367902	1367910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541267
24226	NC_017327	TTC	2	6	1367941	1367946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541267
24227	NC_017327	AGCG	2	8	1368010	1368017	25 %	0 %	50 %	25 %	384541267
24228	NC_017327	TTC	2	6	1368220	1368225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541267
24229	NC_017327	GAT	2	6	1368235	1368240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541267
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24462	NC_017327	CGTG	2	8	1382080	1382087	0 %	25 %	50 %	25 %	384541284
24463	NC_017327	GGCG	2	8	1382113	1382120	0 %	0 %	75 %	25 %	384541284
24464	NC_017327	GATCG	2	10	1382143	1382152	20 %	20 %	40 %	20 %	384541284
24465	NC_017327	TCA	2	6	1382177	1382182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541284
24466	NC_017327	GCCA	2	8	1382213	1382220	25 %	0 %	25 %	50 %	384541284
24467	NC_017327	GC	3	6	1382284	1382289	0 %	0 %	50 %	50 %	384541284
24468	NC_017327	CG	3	6	1382312	1382317	0 %	0 %	50 %	50 %	384541284
24469	NC_017327	GGTGGA	2	12	1382362	1382373	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384541284
24470	NC_017327	TTC	2	6	1382389	1382394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541284
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24472	NC_017327	GC	3	6	1382625	1382630	0 %	0 %	50 %	50 %	384541285
24473	NC_017327	CGG	2	6	1382647	1382652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541285
24474	NC_017327	TGA	2	6	1382719	1382724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541285
24475	NC_017327	CG	3	6	1382743	1382748	0 %	0 %	50 %	50 %	384541285
24476	NC_017327	GAC	2	6	1382831	1382836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541285
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24480	NC_017327	GATCGA	2	12	1382953	1382964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384541285
24481	NC_017327	CCG	2	6	1383027	1383032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541285
24482	NC_017327	CGC	2	6	1383044	1383049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541285
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24490	NC_017327	GGCG	2	8	1383410	1383417	0 %	0 %	75 %	25 %	384541285
24491	NC_017327	CTTC	2	8	1383556	1383563	0 %	50 %	0 %	50 %	384541285
24492	NC_017327	CGC	2	6	1383694	1383699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541285
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24496	NC_017327	CCG	2	6	1383891	1383896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541285
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