MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 29351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017327	TGC	2	6	658163	658168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540540
11502	NC_017327	GCG	2	6	658192	658197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540540
11503	NC_017327	TTG	2	6	658205	658210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540540
11504	NC_017327	CTGCT	2	10	658632	658641	0 %	40 %	20 %	40 %	384540541
11505	NC_017327	GTC	2	6	658674	658679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11506	NC_017327	TGA	2	6	658684	658689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540541
11507	NC_017327	GGC	2	6	658792	658797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540541
11508	NC_017327	GCT	2	6	658892	658897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11509	NC_017327	GAG	2	6	658986	658991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540541
11510	NC_017327	GGC	2	6	658997	659002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540541
11511	NC_017327	GC	3	6	659001	659006	0 %	0 %	50 %	50 %	384540541
11512	NC_017327	CGG	2	6	659096	659101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540541
11513	NC_017327	CGT	2	6	659146	659151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11514	NC_017327	TCT	2	6	659197	659202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540541
11515	NC_017327	GGCA	2	8	659249	659256	25 %	0 %	50 %	25 %	384540541
11516	NC_017327	CAG	2	6	659316	659321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11517	NC_017327	TTC	2	6	659337	659342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540541
11518	NC_017327	TCCGA	2	10	659375	659384	20 %	20 %	20 %	40 %	384540541
11519	NC_017327	CTC	2	6	659409	659414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540541
11520	NC_017327	CGG	2	6	659449	659454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540541
11521	NC_017327	GGA	2	6	659459	659464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540541
11522	NC_017327	GGT	2	6	659471	659476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540541
11523	NC_017327	TCG	3	9	659521	659529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11524	NC_017327	GAG	2	6	659598	659603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540541
11525	NC_017327	TCG	2	6	659629	659634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11526	NC_017327	GTC	2	6	659664	659669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11527	NC_017327	CGGC	2	8	659686	659693	0 %	0 %	50 %	50 %	384540541
11528	NC_017327	CGC	2	6	659696	659701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540541
11529	NC_017327	TAC	2	6	659708	659713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540541
11530	NC_017327	TCG	2	6	659730	659735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540541
11531	NC_017327	CCGC	2	8	659767	659774	0 %	0 %	25 %	75 %	384540542
11532	NC_017327	CGT	2	6	659794	659799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11533	NC_017327	CGC	2	6	659862	659867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540542
11534	NC_017327	GGA	2	6	659917	659922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540542
11535	NC_017327	GTC	2	6	659980	659985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11536	NC_017327	CAA	2	6	659995	660000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540542
11537	NC_017327	GC	3	6	660137	660142	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11538	NC_017327	CG	3	6	660189	660194	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11539	NC_017327	TCA	2	6	660204	660209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540542
11540	NC_017327	GCC	2	6	660218	660223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540542
11541	NC_017327	GTCC	2	8	660282	660289	0 %	25 %	25 %	50 %	384540542
11542	NC_017327	CGGC	2	8	660390	660397	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11543	NC_017327	GAG	2	6	660473	660478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540542
11544	NC_017327	ATC	2	6	660491	660496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540542
11545	NC_017327	CG	4	8	660541	660548	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11546	NC_017327	GC	3	6	660558	660563	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11547	NC_017327	GTC	2	6	660611	660616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11548	NC_017327	ACA	2	6	660731	660736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540542
11549	NC_017327	TCA	2	6	660741	660746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540542
11550	NC_017327	TGG	2	6	660795	660800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540542
11551	NC_017327	ACTT	2	8	660809	660816	25 %	50 %	0 %	25 %	384540542
11552	NC_017327	CTT	3	9	660814	660822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540542
11553	NC_017327	GGCG	2	8	660831	660838	0 %	0 %	75 %	25 %	384540542
11554	NC_017327	ACT	2	6	660906	660911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540542
11555	NC_017327	GTC	2	6	660959	660964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11556	NC_017327	GAC	2	6	660965	660970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11557	NC_017327	ATC	2	6	660974	660979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540542
11558	NC_017327	GTC	2	6	660980	660985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11559	NC_017327	ACG	2	6	661029	661034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11560	NC_017327	CCG	2	6	661039	661044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540542
11561	NC_017327	TG	3	6	661221	661226	0 %	50 %	50 %	0 %	384540542
11562	NC_017327	CG	3	6	661245	661250	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11563	NC_017327	AGC	2	6	661251	661256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11564	NC_017327	CGG	2	6	661337	661342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540542
11565	NC_017327	TTC	2	6	661362	661367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540542
11566	NC_017327	CG	3	6	661400	661405	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11567	NC_017327	CGAG	2	8	661425	661432	25 %	0 %	50 %	25 %	384540542
11568	NC_017327	CAG	2	6	661493	661498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11569	NC_017327	TGG	2	6	661575	661580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540542
11570	NC_017327	GCG	3	9	661581	661589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540542
11571	NC_017327	CGT	2	6	661714	661719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11572	NC_017327	CGG	2	6	661759	661764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540542
11573	NC_017327	GC	3	6	661784	661789	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11574	NC_017327	CAG	2	6	661802	661807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11575	NC_017327	CCG	3	9	661921	661929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540542
11576	NC_017327	CGA	2	6	661956	661961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540542
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11578	NC_017327	TCT	2	6	662016	662021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540542
11579	NC_017327	CG	3	6	662022	662027	0 %	0 %	50 %	50 %	384540542
11580	NC_017327	CCA	2	6	662148	662153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540542
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11582	NC_017327	TCGC	2	8	662261	662268	0 %	25 %	25 %	50 %	384540542
11583	NC_017327	TCG	2	6	662391	662396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11584	NC_017327	GTCG	2	8	662437	662444	0 %	25 %	50 %	25 %	384540542
11585	NC_017327	TCGA	2	8	662486	662493	25 %	25 %	25 %	25 %	384540542
11586	NC_017327	CGC	2	6	662539	662544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540542
11587	NC_017327	GAA	2	6	662545	662550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540542
11588	NC_017327	TCG	2	6	662562	662567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11589	NC_017327	GCG	2	6	662618	662623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540542
11590	NC_017327	CATC	2	8	662667	662674	25 %	25 %	0 %	50 %	384540542
11591	NC_017327	GCC	2	6	662721	662726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540542
11592	NC_017327	CGG	2	6	662749	662754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540542
11593	NC_017327	TCG	2	6	662760	662765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
11594	NC_017327	CGT	2	6	662770	662775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540542
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11599	NC_017327	CGA	2	6	663554	663559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540543
11600	NC_017327	GGTGC	2	10	663570	663579	0 %	20 %	60 %	20 %	384540543
11601	NC_017327	GC	3	6	663594	663599	0 %	0 %	50 %	50 %	384540543
11602	NC_017327	ACC	2	6	663646	663651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540543
11603	NC_017327	CG	3	6	663743	663748	0 %	0 %	50 %	50 %	384540543
11604	NC_017327	GCGATC	2	12	663751	663762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384540543
11605	NC_017327	GTTCG	2	10	663848	663857	0 %	40 %	40 %	20 %	384540543
11606	NC_017327	TGC	2	6	664368	664373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540544
11607	NC_017327	CGAG	2	8	664388	664395	25 %	0 %	50 %	25 %	384540544
11608	NC_017327	CGC	2	6	664413	664418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540544
11609	NC_017327	C	6	6	664420	664425	0 %	0 %	0 %	100 %	384540544
11610	NC_017327	CGC	2	6	664440	664445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540544
11611	NC_017327	CGC	2	6	664475	664480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540544
11612	NC_017327	GA	3	6	664652	664657	50 %	0 %	50 %	0 %	384540545
11613	NC_017327	AGC	2	6	664661	664666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540545
11614	NC_017327	CGTT	2	8	664669	664676	0 %	50 %	25 %	25 %	384540545
11615	NC_017327	CAA	2	6	664687	664692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540545
11616	NC_017327	ATCGCA	2	12	664716	664727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384540545
11617	NC_017327	CTG	2	6	664776	664781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540545
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11619	NC_017327	AGC	2	6	664903	664908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540545
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11976	NC_017327	GCC	2	6	686422	686427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540571
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11979	NC_017327	ATA	2	6	686572	686577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384540571
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