MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 33958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	GCA	2	6	6	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
2	NC_017326	GAG	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538251
3	NC_017326	AGA	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538251
4	NC_017326	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538251
5	NC_017326	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538251
6	NC_017326	CCG	2	6	279	284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538251
7	NC_017326	CGA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
8	NC_017326	GCA	2	6	299	304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
9	NC_017326	AT	3	6	315	320	50 %	50 %	0 %	0 %	384538251
10	NC_017326	TCG	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
11	NC_017326	GTC	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
12	NC_017326	GGT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538251
13	NC_017326	GAC	3	9	390	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
14	NC_017326	CGAT	2	8	449	456	25 %	25 %	25 %	25 %	384538251
15	NC_017326	TCA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538251
16	NC_017326	C	6	6	554	559	0 %	0 %	0 %	100 %	384538251
17	NC_017326	GGT	2	6	573	578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538251
18	NC_017326	GAT	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538251
19	NC_017326	TTC	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538251
20	NC_017326	TCG	2	6	740	745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
21	NC_017326	CGC	2	6	758	763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538251
22	NC_017326	TCA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538251
23	NC_017326	CGAG	2	8	872	879	25 %	0 %	50 %	25 %	384538251
24	NC_017326	CGG	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538251
25	NC_017326	ACG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
26	NC_017326	GC	3	6	993	998	0 %	0 %	50 %	50 %	384538251
27	NC_017326	TGC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
28	NC_017326	TCGCTC	2	12	1135	1146	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384538251
29	NC_017326	GAT	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538251
30	NC_017326	GGA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538251
31	NC_017326	GC	3	6	1204	1209	0 %	0 %	50 %	50 %	384538252
32	NC_017326	GTCG	2	8	1270	1277	0 %	25 %	50 %	25 %	384538252
33	NC_017326	GCCC	2	8	1296	1303	0 %	0 %	25 %	75 %	384538252
34	NC_017326	TCG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538252
35	NC_017326	CGAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	384538252
36	NC_017326	GGA	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538252
37	NC_017326	GC	3	6	1404	1409	0 %	0 %	50 %	50 %	384538252
38	NC_017326	TCG	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538252
39	NC_017326	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538252
40	NC_017326	CAG	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538252
41	NC_017326	ACA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538252
42	NC_017326	CGG	2	6	1550	1555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538252
43	NC_017326	GGC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538252
44	NC_017326	TCAAGG	2	12	1619	1630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384538252
45	NC_017326	ACG	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538252
46	NC_017326	AAC	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538252
47	NC_017326	AGCG	2	8	1715	1722	25 %	0 %	50 %	25 %	384538252
48	NC_017326	GGC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538252
49	NC_017326	GAT	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538252
50	NC_017326	CGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538252
51	NC_017326	CCG	2	6	1824	1829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538252
52	NC_017326	CAT	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538252
53	NC_017326	GATG	2	8	1886	1893	25 %	25 %	50 %	0 %	384538252
54	NC_017326	ACG	2	6	2101	2106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538252
55	NC_017326	AAG	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538252
56	NC_017326	GAC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
57	NC_017326	GCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538253
58	NC_017326	CGC	2	6	2432	2437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
59	NC_017326	CCG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
60	NC_017326	CGGT	2	8	2457	2464	0 %	25 %	50 %	25 %	384538253
61	NC_017326	TC	3	6	2487	2492	0 %	50 %	0 %	50 %	384538253
62	NC_017326	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
63	NC_017326	ACG	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
64	NC_017326	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
65	NC_017326	GCG	2	6	2702	2707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538253
66	NC_017326	TCG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
67	NC_017326	GCC	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
68	NC_017326	ATC	2	6	2851	2856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538253
69	NC_017326	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
70	NC_017326	AGC	3	9	2947	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
71	NC_017326	CT	3	6	2983	2988	0 %	50 %	0 %	50 %	384538253
72	NC_017326	CAAT	2	8	3059	3066	50 %	25 %	0 %	25 %	384538253
73	NC_017326	A	7	7	3087	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	384538253
74	NC_017326	GCA	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
75	NC_017326	CGGC	2	8	3196	3203	0 %	0 %	50 %	50 %	384538253
76	NC_017326	GCC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
77	NC_017326	TCC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538253
78	NC_017326	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
79	NC_017326	GTC	3	9	3429	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
80	NC_017326	ATGC	2	8	3475	3482	25 %	25 %	25 %	25 %	384538253
81	NC_017326	TGC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
82	NC_017326	GA	3	6	3531	3536	50 %	0 %	50 %	0 %	384538253
83	NC_017326	GGC	2	6	3558	3563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538253
84	NC_017326	GC	4	8	3635	3642	0 %	0 %	50 %	50 %	384538253
85	NC_017326	T	6	6	4200	4205	0 %	100 %	0 %	0 %	384538254
86	NC_017326	GA	3	6	4218	4223	50 %	0 %	50 %	0 %	384538254
87	NC_017326	TGC	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538254
88	NC_017326	GCA	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538254
89	NC_017326	CG	3	6	4308	4313	0 %	0 %	50 %	50 %	384538254
90	NC_017326	CCG	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
91	NC_017326	GGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
92	NC_017326	AGT	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538254
93	NC_017326	GCC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
94	NC_017326	CGC	2	6	4412	4417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
95	NC_017326	GAA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538254
96	NC_017326	CTC	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538254
97	NC_017326	TCG	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538254
98	NC_017326	GCG	2	6	4578	4583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
99	NC_017326	TCA	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538254
100	NC_017326	TCG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538254
101	NC_017326	CCG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
102	NC_017326	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538254
103	NC_017326	AGATCG	2	12	4661	4672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384538254
104	NC_017326	GC	3	6	4720	4725	0 %	0 %	50 %	50 %	384538254
105	NC_017326	GCG	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
106	NC_017326	CCGA	2	8	4800	4807	25 %	0 %	25 %	50 %	384538254
107	NC_017326	AGGTGA	2	12	4833	4844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384538254
108	NC_017326	GGC	2	6	4847	4852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
109	NC_017326	CGC	2	6	4941	4946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
110	NC_017326	GCG	2	6	4952	4957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
111	NC_017326	GCT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
112	NC_017326	GCC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
113	NC_017326	GCG	3	9	5492	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
114	NC_017326	CG	4	8	5566	5573	0 %	0 %	50 %	50 %	384538255
115	NC_017326	GCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
116	NC_017326	CGC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
117	NC_017326	GCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
118	NC_017326	GGC	2	6	5695	5700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
119	NC_017326	CT	3	6	5713	5718	0 %	50 %	0 %	50 %	384538255
120	NC_017326	CGG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
121	NC_017326	GCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
122	NC_017326	CG	3	6	5839	5844	0 %	0 %	50 %	50 %	384538255
123	NC_017326	GCT	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
124	NC_017326	GTC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
125	NC_017326	GAC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538255
126	NC_017326	GCGTG	2	10	5981	5990	0 %	20 %	60 %	20 %	384538255
127	NC_017326	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
128	NC_017326	CGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
129	NC_017326	CTT	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538255
130	NC_017326	GCA	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538255
131	NC_017326	GGCTC	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	384538255
132	NC_017326	CTT	2	6	6098	6103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538255
133	NC_017326	CGG	2	6	6246	6251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
134	NC_017326	TCGC	2	8	6284	6291	0 %	25 %	25 %	50 %	384538255
135	NC_017326	CCG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
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137	NC_017326	CG	3	6	6397	6402	0 %	0 %	50 %	50 %	384538255
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164	NC_017326	CGA	2	6	7635	7640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538257
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172	NC_017326	CG	3	6	8289	8294	0 %	0 %	50 %	50 %	384538258
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229	NC_017326	GCC	2	6	11262	11267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538261
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243	NC_017326	CCG	2	6	11992	11997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538261
244	NC_017326	TCA	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538262
245	NC_017326	TCC	2	6	12225	12230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538262
246	NC_017326	AC	3	6	12244	12249	50 %	0 %	0 %	50 %	384538262
247	NC_017326	CGG	2	6	12278	12283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538262
248	NC_017326	GTT	2	6	12302	12307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538262
249	NC_017326	GAT	2	6	12308	12313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538262
250	NC_017326	GATC	2	8	12337	12344	25 %	25 %	25 %	25 %	384538262
251	NC_017326	TGA	2	6	12355	12360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538262
252	NC_017326	TCG	2	6	12391	12396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538262
253	NC_017326	CGA	2	6	12418	12423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
254	NC_017326	GAG	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538262
255	NC_017326	GCG	2	6	12489	12494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538262
256	NC_017326	GC	3	6	12496	12501	0 %	0 %	50 %	50 %	384538262
257	NC_017326	CCG	2	6	12538	12543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538262
258	NC_017326	CGA	2	6	12550	12555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
259	NC_017326	ACG	2	6	12564	12569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
260	NC_017326	GAC	2	6	12632	12637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
261	NC_017326	CGG	2	6	12661	12666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538262
262	NC_017326	GAT	3	9	12716	12724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538262
263	NC_017326	CGA	2	6	12754	12759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
264	NC_017326	CGG	2	6	12791	12796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538262
265	NC_017326	CGA	2	6	12820	12825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
266	NC_017326	ATC	2	6	12855	12860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538262
267	NC_017326	CGC	2	6	12904	12909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538262
268	NC_017326	GAT	2	6	12959	12964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538262
269	NC_017326	GAGGCG	2	12	12966	12977	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384538262
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271	NC_017326	CAT	2	6	13019	13024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538262
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274	NC_017326	CGA	2	6	13108	13113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
275	NC_017326	CGC	2	6	13123	13128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538262
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277	NC_017326	CGA	2	6	13159	13164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538262
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279	NC_017326	GCC	2	6	13178	13183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538262
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282	NC_017326	TCG	2	6	13396	13401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538262
283	NC_017326	CCT	2	6	13402	13407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538263
284	NC_017326	GTC	2	6	13449	13454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538263
285	NC_017326	GCT	2	6	13459	13464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538263
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289	NC_017326	CCAG	2	8	13667	13674	25 %	0 %	25 %	50 %	384538263
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291	NC_017326	GC	4	8	13723	13730	0 %	0 %	50 %	50 %	384538263
292	NC_017326	TGA	2	6	13742	13747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538263
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300	NC_017326	GAA	2	6	14294	14299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538264
301	NC_017326	GGA	2	6	14342	14347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538264
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303	NC_017326	GAT	2	6	14417	14422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538264
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375	NC_017326	CGGT	2	8	17507	17514	0 %	25 %	50 %	25 %	384538267
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379	NC_017326	TCA	2	6	17709	17714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538267
380	NC_017326	GCG	2	6	17723	17728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538267
381	NC_017326	GC	3	6	18012	18017	0 %	0 %	50 %	50 %	384538268
382	NC_017326	TCG	2	6	18075	18080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538268
383	NC_017326	GGCC	2	8	18120	18127	0 %	0 %	50 %	50 %	384538268
384	NC_017326	TA	3	6	18189	18194	50 %	50 %	0 %	0 %	384538269
385	NC_017326	GGT	2	6	18262	18267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538269
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387	NC_017326	TCG	2	6	18384	18389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538269
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392	NC_017326	CCG	2	6	18701	18706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538269
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500	NC_017326	GGC	2	6	23353	23358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538273

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