MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 33958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017326	TGATT	2	10	177040	177049	20 %	60 %	20 %	0 %	384538403
4002	NC_017326	GAC	2	6	177257	177262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538404
4003	NC_017326	CGGA	2	8	177271	177278	25 %	0 %	50 %	25 %	384538404
4004	NC_017326	GCG	2	6	177287	177292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538404
4005	NC_017326	GCT	2	6	177353	177358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538404
4006	NC_017326	CAT	2	6	177389	177394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538404
4007	NC_017326	CGC	2	6	177408	177413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538404
4008	NC_017326	CGA	2	6	177419	177424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538404
4009	NC_017326	CCGC	2	8	177496	177503	0 %	0 %	25 %	75 %	384538404
4010	NC_017326	GCG	2	6	177550	177555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538404
4011	NC_017326	CGG	2	6	177569	177574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538404
4012	NC_017326	CAA	2	6	177656	177661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538404
4013	NC_017326	GAC	2	6	177693	177698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538404
4014	NC_017326	TCG	2	6	177709	177714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538404
4015	NC_017326	CG	3	6	177776	177781	0 %	0 %	50 %	50 %	384538404
4016	NC_017326	GCCT	2	8	177864	177871	0 %	25 %	25 %	50 %	384538404
4017	NC_017326	GAG	2	6	177888	177893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538404
4018	NC_017326	CGG	2	6	177935	177940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538404
4019	NC_017326	CAT	2	6	177965	177970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538404
4020	NC_017326	CGG	2	6	177976	177981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538404
4021	NC_017326	TCC	2	6	178042	178047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538404
4022	NC_017326	GAAG	2	8	178055	178062	50 %	0 %	50 %	0 %	384538404
4023	NC_017326	TGA	2	6	178075	178080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538404
4024	NC_017326	ATC	2	6	178116	178121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538404
4025	NC_017326	GAT	2	6	178142	178147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538404
4026	NC_017326	CGCC	2	8	178174	178181	0 %	0 %	25 %	75 %	384538404
4027	NC_017326	GAA	2	6	178268	178273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538404
4028	NC_017326	GCT	2	6	178290	178295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538404
4029	NC_017326	A	6	6	178380	178385	100 %	0 %	0 %	0 %	384538405
4030	NC_017326	GCC	2	6	178410	178415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538405
4031	NC_017326	TCG	2	6	178471	178476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4032	NC_017326	CCG	2	6	178480	178485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538405
4033	NC_017326	CGG	3	9	178490	178498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538405
4034	NC_017326	CG	3	6	178511	178516	0 %	0 %	50 %	50 %	384538405
4035	NC_017326	ATC	2	6	178530	178535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538405
4036	NC_017326	TGA	2	6	178549	178554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538405
4037	NC_017326	GTC	3	9	178563	178571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4038	NC_017326	CAA	2	6	178574	178579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538405
4039	NC_017326	CGG	2	6	178589	178594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538405
4040	NC_017326	GGCT	2	8	178616	178623	0 %	25 %	50 %	25 %	384538405
4041	NC_017326	CAA	2	6	178658	178663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538405
4042	NC_017326	CTG	2	6	178671	178676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4043	NC_017326	CTCG	2	8	178727	178734	0 %	25 %	25 %	50 %	384538405
4044	NC_017326	CGA	2	6	178739	178744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4045	NC_017326	GAAG	2	8	178808	178815	50 %	0 %	50 %	0 %	384538405
4046	NC_017326	CGG	2	6	178829	178834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538405
4047	NC_017326	GAT	2	6	178871	178876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538405
4048	NC_017326	ACG	2	6	178879	178884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4049	NC_017326	GCG	3	9	178921	178929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538405
4050	NC_017326	GGC	2	6	178931	178936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538405
4051	NC_017326	CAA	2	6	178973	178978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538405
4052	NC_017326	CGAG	2	8	178981	178988	25 %	0 %	50 %	25 %	384538405
4053	NC_017326	ACT	2	6	179131	179136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538405
4054	NC_017326	GCCG	2	8	179159	179166	0 %	0 %	50 %	50 %	384538405
4055	NC_017326	GTC	2	6	179181	179186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4056	NC_017326	CGA	2	6	179282	179287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538405
4057	NC_017326	GGCT	2	8	179346	179353	0 %	25 %	50 %	25 %	384538405
4058	NC_017326	TGAG	2	8	179470	179477	25 %	25 %	50 %	0 %	384538406
4059	NC_017326	CGC	2	6	179522	179527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538406
4060	NC_017326	CGC	2	6	179765	179770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538406
4061	NC_017326	CTGG	2	8	179780	179787	0 %	25 %	50 %	25 %	384538406
4062	NC_017326	CGC	2	6	179816	179821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538406
4063	NC_017326	TGG	2	6	179850	179855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538406
4064	NC_017326	TCT	2	6	179887	179892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538406
4065	NC_017326	GCT	2	6	179927	179932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538406
4066	NC_017326	TCT	2	6	180018	180023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538407
4067	NC_017326	CTG	2	6	180064	180069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4068	NC_017326	TCG	2	6	180074	180079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4069	NC_017326	TCG	2	6	180098	180103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4070	NC_017326	TGC	2	6	180107	180112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4072	NC_017326	GCT	2	6	180141	180146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4073	NC_017326	ATC	2	6	180184	180189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538407
4074	NC_017326	TCCTG	2	10	180191	180200	0 %	40 %	20 %	40 %	384538407
4075	NC_017326	GC	3	6	180212	180217	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
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4079	NC_017326	GC	3	6	180362	180367	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
4080	NC_017326	CGT	2	6	180375	180380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4083	NC_017326	GAT	2	6	180519	180524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538407
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4087	NC_017326	CGA	2	6	180776	180781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538407
4088	NC_017326	GCCG	2	8	180807	180814	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
4089	NC_017326	CCG	2	6	180821	180826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538407
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4091	NC_017326	GC	3	6	180862	180867	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
4092	NC_017326	CG	3	6	180896	180901	0 %	0 %	50 %	50 %	384538407
4093	NC_017326	TCG	2	6	180905	180910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4099	NC_017326	GCCCG	2	10	181032	181041	0 %	0 %	40 %	60 %	384538407
4100	NC_017326	GTC	2	6	181105	181110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4103	NC_017326	TCT	2	6	181202	181207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538407
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4105	NC_017326	GGC	2	6	181378	181383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538407
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4109	NC_017326	TCT	3	9	181460	181468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538407
4110	NC_017326	GCGCAA	2	12	181485	181496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538407
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4121	NC_017326	AGA	2	6	181996	182001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538408
4122	NC_017326	GAA	2	6	182033	182038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538408
4123	NC_017326	CGA	2	6	182042	182047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538408
4124	NC_017326	GCC	2	6	182092	182097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538408
4125	NC_017326	GAA	2	6	182103	182108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538408
4126	NC_017326	AGG	2	6	182185	182190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538408
4127	NC_017326	ATG	2	6	182271	182276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538408
4128	NC_017326	GGC	2	6	182399	182404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538408
4129	NC_017326	TGGCGC	2	12	182413	182424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538408
4130	NC_017326	CGG	2	6	182459	182464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538408
4131	NC_017326	GCC	2	6	182484	182489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538408
4132	NC_017326	AAG	2	6	182524	182529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538408
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4134	NC_017326	CGT	2	6	182691	182696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4135	NC_017326	CGG	3	9	182700	182708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
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4140	NC_017326	CGA	2	6	182949	182954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4141	NC_017326	TCG	2	6	183011	183016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4142	NC_017326	CGA	2	6	183060	183065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4143	NC_017326	CG	3	6	183078	183083	0 %	0 %	50 %	50 %	384538409
4144	NC_017326	CGG	2	6	183123	183128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
4145	NC_017326	TGC	2	6	183144	183149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4146	NC_017326	GCTCGG	2	12	183186	183197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538409
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4149	NC_017326	CTT	2	6	183274	183279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538409
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4152	NC_017326	CGG	2	6	183368	183373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
4153	NC_017326	TCG	2	6	183407	183412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
4154	NC_017326	GCG	2	6	183422	183427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538409
4155	NC_017326	GCT	2	6	183455	183460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
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4157	NC_017326	GC	4	8	183504	183511	0 %	0 %	50 %	50 %	384538409
4158	NC_017326	TGC	2	6	183527	183532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538409
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4177	NC_017326	GGCGCC	2	12	184621	184632	0 %	0 %	50 %	50 %	384538410
4178	NC_017326	CGT	2	6	184695	184700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538410
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4182	NC_017326	TGGT	2	8	184820	184827	0 %	50 %	50 %	0 %	384538410
4183	NC_017326	ATG	2	6	184901	184906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538410
4184	NC_017326	TCG	2	6	184931	184936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538410
4185	NC_017326	ACG	2	6	184985	184990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538410
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4188	NC_017326	GAT	2	6	185073	185078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538411
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4194	NC_017326	TCG	2	6	185209	185214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538411
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4201	NC_017326	CGC	2	6	185367	185372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538411
4202	NC_017326	CGA	2	6	185399	185404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538411
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4204	NC_017326	CGT	2	6	185460	185465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538411
4205	NC_017326	GCG	2	6	185466	185471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538411
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4210	NC_017326	ACG	2	6	185620	185625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538411
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4212	NC_017326	GAA	2	6	185783	185788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538412
4213	NC_017326	GAG	2	6	185799	185804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538412
4214	NC_017326	CG	3	6	185819	185824	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4215	NC_017326	TCG	2	6	185827	185832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538412
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4217	NC_017326	TCA	2	6	185876	185881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538412
4218	NC_017326	CAT	2	6	185883	185888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538412
4219	NC_017326	AGG	2	6	185899	185904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538412
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4222	NC_017326	GCC	2	6	186087	186092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4223	NC_017326	GC	3	6	186100	186105	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4224	NC_017326	TCG	2	6	186112	186117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538412
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4226	NC_017326	GCCG	2	8	186225	186232	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4227	NC_017326	CCG	2	6	186254	186259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538412
4228	NC_017326	GC	3	6	186321	186326	0 %	0 %	50 %	50 %	384538412
4229	NC_017326	CGA	2	6	186362	186367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4230	NC_017326	AGC	2	6	186406	186411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4231	NC_017326	CGA	2	6	186437	186442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538412
4232	NC_017326	CCT	2	6	186559	186564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538413
4233	NC_017326	CTTT	2	8	186567	186574	0 %	75 %	0 %	25 %	384538413
4234	NC_017326	CGG	2	6	186577	186582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538413
4235	NC_017326	GCCC	2	8	186658	186665	0 %	0 %	25 %	75 %	384538413
4236	NC_017326	GTC	2	6	186668	186673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4237	NC_017326	CAC	2	6	186677	186682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538413
4238	NC_017326	TCG	2	6	186684	186689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4239	NC_017326	GAC	2	6	186773	186778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4240	NC_017326	GGC	2	6	186789	186794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538413
4241	NC_017326	CGGC	2	8	186816	186823	0 %	0 %	50 %	50 %	384538413
4242	NC_017326	TCGGCG	2	12	186874	186885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538413
4243	NC_017326	CATG	2	8	186979	186986	25 %	25 %	25 %	25 %	384538413
4244	NC_017326	TTC	2	6	186995	187000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538413
4245	NC_017326	GCAT	2	8	187005	187012	25 %	25 %	25 %	25 %	384538413
4246	NC_017326	CG	3	6	187030	187035	0 %	0 %	50 %	50 %	384538413
4247	NC_017326	CTC	2	6	187103	187108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538413
4248	NC_017326	GAT	2	6	187130	187135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538413
4249	NC_017326	CGT	2	6	187145	187150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4250	NC_017326	GTG	2	6	187155	187160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538413
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4252	NC_017326	TCG	2	6	187210	187215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4253	NC_017326	GTC	2	6	187217	187222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4254	NC_017326	CGT	2	6	187249	187254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538413
4255	NC_017326	CCG	2	6	187287	187292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538413
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4257	NC_017326	ATC	2	6	187383	187388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538413
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4262	NC_017326	CGA	2	6	187629	187634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4263	NC_017326	TCG	2	6	187640	187645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4264	NC_017326	TCG	2	6	187649	187654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4265	NC_017326	CGACAT	2	12	187678	187689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384538414
4266	NC_017326	GCTC	2	8	187698	187705	0 %	25 %	25 %	50 %	384538414
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4268	NC_017326	TCGACC	2	12	187844	187855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384538414
4269	NC_017326	CGA	2	6	187875	187880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538414
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4272	NC_017326	TCG	2	6	187940	187945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538414
4273	NC_017326	CG	3	6	187974	187979	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
4274	NC_017326	CG	3	6	188001	188006	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
4275	NC_017326	CGCC	2	8	188013	188020	0 %	0 %	25 %	75 %	384538414
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4281	NC_017326	CG	3	6	188340	188345	0 %	0 %	50 %	50 %	384538414
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4302	NC_017326	TCA	2	6	189148	189153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538415
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4320	NC_017326	GCG	2	6	190093	190098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538417
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4347	NC_017326	GC	3	6	191105	191110	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4348	NC_017326	GCTT	2	8	191133	191140	0 %	50 %	25 %	25 %	384538418
4349	NC_017326	TCT	2	6	191143	191148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538418
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4354	NC_017326	CGG	2	6	191296	191301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538418
4355	NC_017326	CCT	2	6	191320	191325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538418
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4358	NC_017326	CGA	2	6	191464	191469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538418
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4360	NC_017326	GCGG	2	8	191522	191529	0 %	0 %	75 %	25 %	384538418
4361	NC_017326	TCG	2	6	191556	191561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538418
4362	NC_017326	GCC	2	6	191588	191593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538418
4363	NC_017326	TGT	3	9	191632	191640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538418
4364	NC_017326	GCA	2	6	191689	191694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538418
4365	NC_017326	CG	3	6	191751	191756	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4366	NC_017326	GC	3	6	191757	191762	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4367	NC_017326	CGC	2	6	191768	191773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538418
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4370	NC_017326	GCCG	2	8	191815	191822	0 %	0 %	50 %	50 %	384538418
4371	NC_017326	TCG	2	6	191829	191834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538418
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4471	NC_017326	TCT	2	6	196090	196095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538420
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4479	NC_017326	CTTGCC	2	12	196316	196327	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384538420
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4483	NC_017326	C	6	6	196356	196361	0 %	0 %	0 %	100 %	384538420
4484	NC_017326	CG	3	6	196403	196408	0 %	0 %	50 %	50 %	384538420
4485	NC_017326	AAT	2	6	196688	196693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384538421
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