MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 33958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017326	CGA	2	6	579750	579755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538808
12502	NC_017326	ATC	2	6	579821	579826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538808
12503	NC_017326	CGA	2	6	579852	579857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538808
12504	NC_017326	GTT	2	6	580117	580122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538809
12505	NC_017326	GACG	2	8	580163	580170	25 %	0 %	50 %	25 %	384538809
12506	NC_017326	CCG	2	6	580179	580184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538809
12507	NC_017326	CGA	2	6	580243	580248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12508	NC_017326	GGCTGC	2	12	580259	580270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538809
12509	NC_017326	CTG	2	6	580277	580282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12510	NC_017326	GC	3	6	580291	580296	0 %	0 %	50 %	50 %	384538809
12511	NC_017326	CGC	2	6	580298	580303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538809
12512	NC_017326	CGAGG	2	10	580308	580317	20 %	0 %	60 %	20 %	384538809
12513	NC_017326	GACGA	2	10	580341	580350	40 %	0 %	40 %	20 %	384538809
12514	NC_017326	TGA	2	6	580360	580365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538809
12515	NC_017326	AAG	2	6	580413	580418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538809
12516	NC_017326	GA	4	8	580445	580452	50 %	0 %	50 %	0 %	384538809
12517	NC_017326	CGA	2	6	580469	580474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12518	NC_017326	GAC	2	6	580608	580613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12519	NC_017326	CCG	2	6	580642	580647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538809
12520	NC_017326	ACT	2	6	580702	580707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538809
12521	NC_017326	GCC	2	6	580731	580736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538809
12522	NC_017326	GAC	2	6	580893	580898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12523	NC_017326	CG	3	6	580942	580947	0 %	0 %	50 %	50 %	384538809
12524	NC_017326	GAC	2	6	580979	580984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12525	NC_017326	GC	3	6	581051	581056	0 %	0 %	50 %	50 %	384538809
12526	NC_017326	CGC	2	6	581060	581065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538809
12527	NC_017326	CGA	2	6	581134	581139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12528	NC_017326	CGA	2	6	581144	581149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12529	NC_017326	CCGC	2	8	581211	581218	0 %	0 %	25 %	75 %	384538809
12530	NC_017326	CAA	2	6	581243	581248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538809
12531	NC_017326	GCATCG	2	12	581302	581313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384538809
12532	NC_017326	CGG	2	6	581401	581406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538809
12533	NC_017326	CGC	2	6	581558	581563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538810
12534	NC_017326	CTG	2	6	581604	581609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538810
12535	NC_017326	GGA	2	6	581620	581625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538810
12536	NC_017326	TCGC	2	8	581660	581667	0 %	25 %	25 %	50 %	384538810
12537	NC_017326	TTG	2	6	581701	581706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384538810
12538	NC_017326	CAG	2	6	581709	581714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538810
12539	NC_017326	CGT	2	6	581759	581764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538810
12540	NC_017326	TCG	2	6	582121	582126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538811
12541	NC_017326	CAG	2	6	582128	582133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538811
12542	NC_017326	GCG	3	9	582187	582195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538811
12543	NC_017326	CGGCC	2	10	582243	582252	0 %	0 %	40 %	60 %	384538811
12544	NC_017326	CG	4	8	582349	582356	0 %	0 %	50 %	50 %	384538811
12545	NC_017326	GCC	2	6	582365	582370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538811
12546	NC_017326	TTC	2	6	582401	582406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538811
12547	NC_017326	CGA	2	6	582451	582456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538811
12548	NC_017326	TCG	2	6	582477	582482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538811
12549	NC_017326	GCG	2	6	582503	582508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538811
12550	NC_017326	CG	3	6	582514	582519	0 %	0 %	50 %	50 %	384538811
12551	NC_017326	GTCGAG	2	12	582560	582571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384538811
12552	NC_017326	CGGC	2	8	582579	582586	0 %	0 %	50 %	50 %	384538811
12553	NC_017326	CG	4	8	582697	582704	0 %	0 %	50 %	50 %	384538811
12554	NC_017326	ACG	2	6	582705	582710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538811
12555	NC_017326	TCGG	2	8	582723	582730	0 %	25 %	50 %	25 %	384538811
12556	NC_017326	GAGCA	2	10	582744	582753	40 %	0 %	40 %	20 %	384538811
12557	NC_017326	CTGC	2	8	582787	582794	0 %	25 %	25 %	50 %	384538811
12558	NC_017326	GAA	2	6	582815	582820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538811
12559	NC_017326	CAT	2	6	582857	582862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538811
12560	NC_017326	GAT	2	6	582869	582874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538811
12561	NC_017326	TGG	2	6	582877	582882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538811
12562	NC_017326	GCC	2	6	582936	582941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538811
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12564	NC_017326	TGC	2	6	583026	583031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538811
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12566	NC_017326	TCG	2	6	583388	583393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538812
12567	NC_017326	CGG	2	6	583433	583438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538812
12568	NC_017326	TCG	2	6	583520	583525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538812
12569	NC_017326	CTG	2	6	583529	583534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538812
12570	NC_017326	CGC	2	6	583537	583542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538812
12571	NC_017326	GCC	2	6	583600	583605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538812
12572	NC_017326	GCC	2	6	583615	583620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538812
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12578	NC_017326	GGC	2	6	583783	583788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538812
12579	NC_017326	GAG	2	6	583795	583800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538812
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12584	NC_017326	CGA	2	6	583959	583964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538812
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12586	NC_017326	CTT	2	6	584112	584117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538812
12587	NC_017326	AGC	2	6	584148	584153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538812
12588	NC_017326	TCG	2	6	584198	584203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538812
12589	NC_017326	CGG	2	6	584234	584239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538812
12590	NC_017326	CGA	2	6	584241	584246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538812
12591	NC_017326	GCG	2	6	584275	584280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538812
12592	NC_017326	TGA	2	6	584331	584336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538813
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12598	NC_017326	GC	3	6	584731	584736	0 %	0 %	50 %	50 %	384538813
12599	NC_017326	GAC	2	6	584858	584863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538813
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12601	NC_017326	CGA	2	6	584973	584978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538813
12602	NC_017326	CAT	2	6	585073	585078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538813
12603	NC_017326	TCGA	2	8	585110	585117	25 %	25 %	25 %	25 %	384538813
12604	NC_017326	GGC	2	6	585206	585211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538813
12605	NC_017326	TCG	2	6	585216	585221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538813
12606	NC_017326	CAA	2	6	585449	585454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538814
12607	NC_017326	CGA	2	6	585497	585502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538814
12608	NC_017326	AGCGA	2	10	585510	585519	40 %	0 %	40 %	20 %	384538814
12609	NC_017326	CAT	2	6	585551	585556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538814
12610	NC_017326	GAT	2	6	585620	585625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538814
12611	NC_017326	GTC	2	6	585639	585644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538814
12612	NC_017326	ACT	2	6	585655	585660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538814
12613	NC_017326	CAAC	2	8	585718	585725	50 %	0 %	0 %	50 %	384538814
12614	NC_017326	TAC	2	6	585738	585743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538814
12615	NC_017326	TCG	2	6	585808	585813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538814
12616	NC_017326	GGC	2	6	585815	585820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538814
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12618	NC_017326	GACC	2	8	585830	585837	25 %	0 %	25 %	50 %	384538814
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12732	NC_017326	GAT	3	9	591537	591545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538820
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12734	NC_017326	TGA	3	9	591554	591562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538820
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12974	NC_017326	GTA	2	6	602421	602426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538830
12975	NC_017326	GGA	2	6	602439	602444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538830
12976	NC_017326	CGC	2	6	602447	602452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538830
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