MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 33958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017326	CGGG	2	8	512439	512446	0 %	0 %	75 %	25 %	384538746
11002	NC_017326	GCC	2	6	512453	512458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538746
11003	NC_017326	CGG	2	6	512464	512469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538746
11004	NC_017326	GCT	2	6	512473	512478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11005	NC_017326	CGC	2	6	512502	512507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538746
11006	NC_017326	TCG	2	6	512541	512546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11007	NC_017326	ACC	2	6	512609	512614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538746
11008	NC_017326	GAG	2	6	512687	512692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538746
11009	NC_017326	AAG	2	6	512696	512701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538746
11010	NC_017326	GGA	2	6	512779	512784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538746
11011	NC_017326	AAG	2	6	512801	512806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538746
11012	NC_017326	GGT	2	6	512851	512856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538746
11013	NC_017326	CGT	2	6	512869	512874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11014	NC_017326	ATC	2	6	512900	512905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538746
11015	NC_017326	CGT	2	6	512932	512937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11016	NC_017326	TGC	2	6	512953	512958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11017	NC_017326	TCG	2	6	512976	512981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11018	NC_017326	GTG	2	6	512990	512995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538746
11019	NC_017326	ATCCG	2	10	513013	513022	20 %	20 %	20 %	40 %	384538746
11020	NC_017326	CGC	2	6	513058	513063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538746
11021	NC_017326	GAT	2	6	513082	513087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538746
11022	NC_017326	CGA	2	6	513091	513096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538746
11023	NC_017326	CAA	2	6	513118	513123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538746
11024	NC_017326	TCA	2	6	513274	513279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
11025	NC_017326	CCT	2	6	513292	513297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538747
11026	NC_017326	TGCTC	2	10	513374	513383	0 %	40 %	20 %	40 %	384538747
11027	NC_017326	GCCGCG	2	12	513434	513445	0 %	0 %	50 %	50 %	384538747
11028	NC_017326	GCC	2	6	513459	513464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11029	NC_017326	GCG	2	6	513480	513485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11030	NC_017326	GTCG	2	8	513527	513534	0 %	25 %	50 %	25 %	384538747
11031	NC_017326	CGC	2	6	513605	513610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11032	NC_017326	TTC	2	6	513687	513692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538747
11033	NC_017326	CAT	2	6	513722	513727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
11034	NC_017326	CAG	2	6	513761	513766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538747
11035	NC_017326	G	6	6	513768	513773	0 %	0 %	100 %	0 %	384538747
11036	NC_017326	CTT	2	6	513788	513793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538747
11037	NC_017326	GCC	2	6	513810	513815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11038	NC_017326	CGA	2	6	513823	513828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538747
11039	NC_017326	GCC	2	6	513846	513851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11040	NC_017326	TCT	2	6	513854	513859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538747
11041	NC_017326	CGC	2	6	513860	513865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11042	NC_017326	ATC	2	6	513867	513872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
11043	NC_017326	GC	3	6	513912	513917	0 %	0 %	50 %	50 %	384538747
11044	NC_017326	CAT	2	6	513923	513928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
11045	NC_017326	TCG	2	6	513958	513963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538747
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11048	NC_017326	GGC	2	6	514106	514111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11049	NC_017326	CCTT	2	8	514120	514127	0 %	50 %	0 %	50 %	384538747
11050	NC_017326	CGG	2	6	514132	514137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11051	NC_017326	CGG	2	6	514171	514176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11052	NC_017326	CGG	2	6	514228	514233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11053	NC_017326	ATC	2	6	514284	514289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
11054	NC_017326	CGG	2	6	514307	514312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11055	NC_017326	CCG	2	6	514322	514327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11056	NC_017326	TCG	3	9	514354	514362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538747
11057	NC_017326	CCG	2	6	514458	514463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538747
11058	NC_017326	TCG	2	6	514480	514485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538747
11059	NC_017326	GCG	2	6	514566	514571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11060	NC_017326	GCA	2	6	514573	514578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538747
11061	NC_017326	TGG	2	6	514609	514614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538747
11062	NC_017326	ATC	2	6	514635	514640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
11063	NC_017326	TCT	2	6	514786	514791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538747
11064	NC_017326	CGG	2	6	514810	514815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538747
11065	NC_017326	TCA	2	6	514822	514827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538747
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11067	NC_017326	GCC	2	6	514948	514953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538748
11068	NC_017326	CGG	2	6	514988	514993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538748
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11070	NC_017326	CGAT	2	8	515084	515091	25 %	25 %	25 %	25 %	384538748
11071	NC_017326	TCA	2	6	515096	515101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538748
11072	NC_017326	GCT	2	6	515211	515216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538748
11073	NC_017326	CTGG	2	8	515227	515234	0 %	25 %	50 %	25 %	384538748
11074	NC_017326	TCG	2	6	515246	515251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538748
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11078	NC_017326	GCG	2	6	515335	515340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538748
11079	NC_017326	GGC	2	6	515434	515439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538748
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11087	NC_017326	GC	3	6	515745	515750	0 %	0 %	50 %	50 %	384538749
11088	NC_017326	GAG	2	6	515753	515758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538749
11089	NC_017326	CG	4	8	515791	515798	0 %	0 %	50 %	50 %	384538749
11090	NC_017326	TCT	2	6	515890	515895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538749
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11092	NC_017326	GCT	2	6	515968	515973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538749
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11097	NC_017326	TGC	2	6	516141	516146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538749
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11101	NC_017326	CG	3	6	516337	516342	0 %	0 %	50 %	50 %	384538749
11102	NC_017326	GCTG	2	8	516343	516350	0 %	25 %	50 %	25 %	384538749
11103	NC_017326	GGC	2	6	516442	516447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538749
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11105	NC_017326	CGCC	2	8	516553	516560	0 %	0 %	25 %	75 %	384538749
11106	NC_017326	CG	3	6	516598	516603	0 %	0 %	50 %	50 %	384538749
11107	NC_017326	GGT	2	6	516604	516609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538749
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11109	NC_017326	AGCC	2	8	516675	516682	25 %	0 %	25 %	50 %	384538749
11110	NC_017326	GC	3	6	516746	516751	0 %	0 %	50 %	50 %	384538749
11111	NC_017326	TGCA	2	8	516909	516916	25 %	25 %	25 %	25 %	384538749
11112	NC_017326	GAC	2	6	516947	516952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538749
11113	NC_017326	GACC	2	8	516972	516979	25 %	0 %	25 %	50 %	384538749
11114	NC_017326	GGGCGA	2	12	517000	517011	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384538749
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11116	NC_017326	CGG	2	6	517126	517131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538749
11117	NC_017326	ATC	2	6	517167	517172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538749
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11119	NC_017326	GA	3	6	517230	517235	50 %	0 %	50 %	0 %	384538749
11120	NC_017326	CGT	2	6	517252	517257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538749
11121	NC_017326	TTCCG	2	10	517267	517276	0 %	40 %	20 %	40 %	384538749
11122	NC_017326	TCG	2	6	517287	517292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538749
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11225	NC_017326	CTG	2	6	522103	522108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538753
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11231	NC_017326	TCG	3	9	522278	522286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538753
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11234	NC_017326	TCG	2	6	522323	522328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538753
11235	NC_017326	GACGC	2	10	522359	522368	20 %	0 %	40 %	40 %	384538753
11236	NC_017326	TGC	3	9	522377	522385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538753
11237	NC_017326	ATG	2	6	522394	522399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538753
11238	NC_017326	GAT	2	6	522417	522422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538753
11239	NC_017326	GCTGG	2	10	522447	522456	0 %	20 %	60 %	20 %	384538753
11240	NC_017326	CTT	2	6	522504	522509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538753
11241	NC_017326	CAT	2	6	522531	522536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538753
11242	NC_017326	CGA	2	6	522555	522560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538753
11243	NC_017326	AGC	2	6	522561	522566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538753
11244	NC_017326	CATC	2	8	522606	522613	25 %	25 %	0 %	50 %	384538753
11245	NC_017326	TGC	2	6	522623	522628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538753
11246	NC_017326	CTGC	2	8	522801	522808	0 %	25 %	25 %	50 %	384538753
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11250	NC_017326	CGA	2	6	522944	522949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538754
11251	NC_017326	GCG	3	9	523001	523009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538754
11252	NC_017326	TGTCG	2	10	523036	523045	0 %	40 %	40 %	20 %	384538754
11253	NC_017326	GGCC	2	8	523063	523070	0 %	0 %	50 %	50 %	384538754
11254	NC_017326	GGC	2	6	523071	523076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538754
11255	NC_017326	GCGT	2	8	523187	523194	0 %	25 %	50 %	25 %	384538754
11256	NC_017326	CGG	2	6	523239	523244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538754
11257	NC_017326	ATTC	2	8	523281	523288	25 %	50 %	0 %	25 %	384538754
11258	NC_017326	TTTC	2	8	523398	523405	0 %	75 %	0 %	25 %	384538754
11259	NC_017326	CGC	2	6	523415	523420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538754
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11261	NC_017326	ATCG	2	8	523484	523491	25 %	25 %	25 %	25 %	384538754
11262	NC_017326	CGG	2	6	523496	523501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538754
11263	NC_017326	AGG	2	6	523514	523519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538754
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11265	NC_017326	CGGC	2	8	523585	523592	0 %	0 %	50 %	50 %	384538754
11266	NC_017326	CGC	2	6	523662	523667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538754
11267	NC_017326	CGA	2	6	523671	523676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538754
11268	NC_017326	CTG	2	6	523732	523737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538754
11269	NC_017326	C	6	6	523783	523788	0 %	0 %	0 %	100 %	384538754
11270	NC_017326	GC	3	6	523816	523821	0 %	0 %	50 %	50 %	384538754
11271	NC_017326	GCGAT	2	10	523865	523874	20 %	20 %	40 %	20 %	384538754
11272	NC_017326	GGCA	2	8	523876	523883	25 %	0 %	50 %	25 %	384538754
11273	NC_017326	CTT	2	6	523974	523979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538754
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11292	NC_017326	CTG	3	9	524551	524559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538754
11293	NC_017326	CGA	2	6	524574	524579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538754
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11324	NC_017326	GGCC	2	8	526008	526015	0 %	0 %	50 %	50 %	384538756
11325	NC_017326	CGG	2	6	526040	526045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538756
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11330	NC_017326	GC	3	6	526192	526197	0 %	0 %	50 %	50 %	384538756
11331	NC_017326	CACGA	2	10	526255	526264	40 %	0 %	20 %	40 %	384538756
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11343	NC_017326	CGGCCG	2	12	526731	526742	0 %	0 %	50 %	50 %	384538756
11344	NC_017326	AGC	3	9	526757	526765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538756
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11350	NC_017326	CGG	2	6	527096	527101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538756
11351	NC_017326	GAG	2	6	527218	527223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538756
11352	NC_017326	TCG	2	6	527228	527233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538756
11353	NC_017326	GGT	2	6	527259	527264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538756
11354	NC_017326	GC	4	8	527270	527277	0 %	0 %	50 %	50 %	384538756
11355	NC_017326	GCA	2	6	527282	527287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538756
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