MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 80662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017325	CGT	2	6	656583	656588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14002	NC_017325	CGG	2	6	656595	656600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535073
14003	NC_017325	CGA	2	6	656601	656606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14004	NC_017325	TCA	2	6	656609	656614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535073
14005	NC_017325	TCC	2	6	656615	656620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535073
14006	NC_017325	CGT	2	6	656646	656651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14007	NC_017325	GGA	2	6	656664	656669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535073
14008	NC_017325	CT	3	6	656712	656717	0 %	50 %	0 %	50 %	384535073
14009	NC_017325	GCA	2	6	656729	656734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14010	NC_017325	CGG	2	6	656768	656773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535073
14011	NC_017325	CAA	2	6	656829	656834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535073
14012	NC_017325	GAG	2	6	656851	656856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535073
14013	NC_017325	GCC	2	6	656860	656865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535073
14014	NC_017325	GAG	2	6	656920	656925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535073
14015	NC_017325	CTG	2	6	656929	656934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14016	NC_017325	GCA	2	6	657000	657005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14017	NC_017325	CAT	2	6	657018	657023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535073
14018	NC_017325	GCC	2	6	657104	657109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535073
14019	NC_017325	GCC	2	6	657138	657143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535073
14020	NC_017325	CG	3	6	657168	657173	0 %	0 %	50 %	50 %	384535073
14021	NC_017325	GGC	2	6	657207	657212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535073
14022	NC_017325	GGA	2	6	657219	657224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535073
14023	NC_017325	ATGC	2	8	657307	657314	25 %	25 %	25 %	25 %	384535073
14024	NC_017325	CGA	2	6	657345	657350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14025	NC_017325	GC	3	6	657377	657382	0 %	0 %	50 %	50 %	384535073
14026	NC_017325	GATC	2	8	657411	657418	25 %	25 %	25 %	25 %	384535073
14027	NC_017325	CGA	2	6	657450	657455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14028	NC_017325	ATC	2	6	657475	657480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535073
14029	NC_017325	CGA	2	6	657567	657572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14030	NC_017325	CTT	2	6	657585	657590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535073
14031	NC_017325	CAGC	2	8	657591	657598	25 %	0 %	25 %	50 %	384535073
14032	NC_017325	TGC	2	6	657623	657628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535073
14033	NC_017325	GCG	2	6	657639	657644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535073
14034	NC_017325	GTTAGA	2	12	657823	657834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535074
14035	NC_017325	TCA	2	6	657837	657842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535074
14036	NC_017325	TCC	2	6	657868	657873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535074
14037	NC_017325	CCG	2	6	657898	657903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535074
14038	NC_017325	C	6	6	658001	658006	0 %	0 %	0 %	100 %	384535074
14039	NC_017325	GCC	2	6	658052	658057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535074
14040	NC_017325	CGCGG	2	10	658085	658094	0 %	0 %	60 %	40 %	384535074
14041	NC_017325	GGC	2	6	658101	658106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535074
14042	NC_017325	CAGA	2	8	658130	658137	50 %	0 %	25 %	25 %	384535074
14043	NC_017325	TCG	3	9	658198	658206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535074
14044	NC_017325	CGGG	2	8	658240	658247	0 %	0 %	75 %	25 %	384535074
14045	NC_017325	CG	3	6	658248	658253	0 %	0 %	50 %	50 %	384535074
14046	NC_017325	CGC	2	6	658342	658347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535074
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14048	NC_017325	GGC	2	6	658401	658406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535074
14049	NC_017325	GCC	2	6	658409	658414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535074
14050	NC_017325	GCTCG	2	10	658430	658439	0 %	20 %	40 %	40 %	384535074
14051	NC_017325	CG	4	8	658438	658445	0 %	0 %	50 %	50 %	384535074
14052	NC_017325	ATCG	2	8	658508	658515	25 %	25 %	25 %	25 %	384535074
14053	NC_017325	TTC	2	6	658526	658531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535074
14054	NC_017325	GATC	2	8	658562	658569	25 %	25 %	25 %	25 %	384535074
14055	NC_017325	CAA	2	6	658586	658591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535074
14056	NC_017325	CCT	2	6	658727	658732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535075
14057	NC_017325	GCC	2	6	658800	658805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535075
14058	NC_017325	CCG	2	6	658838	658843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535075
14059	NC_017325	CGG	2	6	658855	658860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535075
14060	NC_017325	GCT	2	6	658870	658875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535075
14061	NC_017325	CTG	2	6	658956	658961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535075
14062	NC_017325	AG	3	6	658964	658969	50 %	0 %	50 %	0 %	384535075
14063	NC_017325	AGC	2	6	658972	658977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535075
14064	NC_017325	GCC	2	6	659047	659052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535075
14065	NC_017325	AGCGCC	2	12	659083	659094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384535075
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14067	NC_017325	CGG	2	6	659279	659284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535076
14068	NC_017325	GGCCA	2	10	659292	659301	20 %	0 %	40 %	40 %	384535076
14069	NC_017325	GC	4	8	659362	659369	0 %	0 %	50 %	50 %	384535076
14070	NC_017325	GCC	2	6	659394	659399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535076
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14072	NC_017325	ACG	2	6	659472	659477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535076
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14084	NC_017325	CCA	2	6	660325	660330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535078
14085	NC_017325	GGC	2	6	660375	660380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535078
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14087	NC_017325	CG	3	6	660535	660540	0 %	0 %	50 %	50 %	384535078
14088	NC_017325	GC	3	6	660549	660554	0 %	0 %	50 %	50 %	384535078
14089	NC_017325	GACGCC	2	12	660632	660643	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384535078
14090	NC_017325	GAC	2	6	660662	660667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14091	NC_017325	CGA	2	6	660682	660687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14092	NC_017325	TCG	2	6	660723	660728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14093	NC_017325	AAG	2	6	660729	660734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535078
14094	NC_017325	CAG	2	6	660803	660808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14095	NC_017325	TCA	3	9	660832	660840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535078
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14098	NC_017325	TGG	2	6	660883	660888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535078
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14101	NC_017325	CTG	2	6	660944	660949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14102	NC_017325	GCTC	2	8	661021	661028	0 %	25 %	25 %	50 %	384535078
14103	NC_017325	AGC	2	6	661050	661055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14104	NC_017325	AGC	2	6	661077	661082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14105	NC_017325	GCC	2	6	661088	661093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535078
14106	NC_017325	TCG	2	6	661095	661100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14107	NC_017325	CGTC	2	8	661138	661145	0 %	25 %	25 %	50 %	384535078
14108	NC_017325	TCA	2	6	661150	661155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535078
14109	NC_017325	AGC	2	6	661167	661172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14110	NC_017325	TGG	2	6	661189	661194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535078
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14112	NC_017325	GC	3	6	661284	661289	0 %	0 %	50 %	50 %	384535078
14113	NC_017325	CAG	2	6	661292	661297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535078
14114	NC_017325	AGA	2	6	661357	661362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535078
14115	NC_017325	TTG	2	6	661485	661490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535078
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14117	NC_017325	CG	3	6	661853	661858	0 %	0 %	50 %	50 %	384535079
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14119	NC_017325	GAT	2	6	661908	661913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535079
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14235	NC_017325	CCGGT	2	10	667841	667850	0 %	20 %	40 %	40 %	384535085
14236	NC_017325	GC	3	6	667861	667866	0 %	0 %	50 %	50 %	384535085
14237	NC_017325	CGGA	2	8	668068	668075	25 %	0 %	50 %	25 %	384535086
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14347	NC_017325	GCGT	2	8	672871	672878	0 %	25 %	50 %	25 %	384535092
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14352	NC_017325	CGA	2	6	673333	673338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535093
14353	NC_017325	CGC	2	6	673426	673431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535093
14354	NC_017325	GCTC	2	8	673447	673454	0 %	25 %	25 %	50 %	384535093
14355	NC_017325	CGTG	2	8	673500	673507	0 %	25 %	50 %	25 %	384535093
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14467	NC_017325	GATC	2	8	679327	679334	25 %	25 %	25 %	25 %	384535098
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14471	NC_017325	GC	3	6	679481	679486	0 %	0 %	50 %	50 %	384535098
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14475	NC_017325	CGTGGC	2	12	679697	679708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384535098
14476	NC_017325	GTC	2	6	679722	679727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535098
14477	NC_017325	GCAT	2	8	679740	679747	25 %	25 %	25 %	25 %	384535098
14478	NC_017325	AT	3	6	679761	679766	50 %	50 %	0 %	0 %	384535098
14479	NC_017325	GCC	2	6	679788	679793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535098
14480	NC_017325	CGC	2	6	679801	679806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535098
14481	NC_017325	CGT	2	6	679851	679856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535098
14482	NC_017325	CGCC	2	8	679857	679864	0 %	0 %	25 %	75 %	384535098
14483	NC_017325	CGTC	2	8	679896	679903	0 %	25 %	25 %	50 %	384535098
14484	NC_017325	TGG	2	6	679932	679937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535098
14485	NC_017325	CGC	2	6	679997	680002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535098
14486	NC_017325	GCGG	2	8	680050	680057	0 %	0 %	75 %	25 %	384535098
14487	NC_017325	TGT	2	6	680137	680142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535098
14488	NC_017325	GGAAC	2	10	680181	680190	40 %	0 %	40 %	20 %	384535098
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14490	NC_017325	GC	3	6	680459	680464	0 %	0 %	50 %	50 %	384535099
14491	NC_017325	AGCTTC	2	12	680487	680498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384535099
14492	NC_017325	CCA	2	6	680572	680577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535099
14493	NC_017325	CGG	2	6	680593	680598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535099
14494	NC_017325	GGC	2	6	680601	680606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535099
14495	NC_017325	CAG	2	6	680624	680629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535099
14496	NC_017325	GTC	2	6	680675	680680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535099
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14499	NC_017325	CAGG	2	8	680770	680777	25 %	0 %	50 %	25 %	384535099
14500	NC_017325	GAC	2	6	680789	680794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535099

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