MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 80662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017325	GCCG	2	8	539945	539952	0 %	0 %	50 %	50 %	384534970
11502	NC_017325	TCG	2	6	539976	539981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534970
11503	NC_017325	TCG	2	6	539997	540002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534970
11504	NC_017325	CGG	2	6	540031	540036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534970
11505	NC_017325	TGA	2	6	540052	540057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534970
11506	NC_017325	CG	3	6	540227	540232	0 %	0 %	50 %	50 %	384534970
11507	NC_017325	GACC	2	8	540271	540278	25 %	0 %	25 %	50 %	384534970
11508	NC_017325	CGA	2	6	540313	540318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534970
11509	NC_017325	CCT	2	6	540358	540363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534970
11510	NC_017325	GGC	2	6	540386	540391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534970
11511	NC_017325	GCC	2	6	540449	540454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534970
11512	NC_017325	CGATC	2	10	540455	540464	20 %	20 %	20 %	40 %	384534970
11513	NC_017325	AGA	2	6	540465	540470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534970
11514	NC_017325	GCCGTC	2	12	540632	540643	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534971
11515	NC_017325	GCG	2	6	540657	540662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11516	NC_017325	GAGCGG	2	12	540701	540712	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384534971
11517	NC_017325	CGC	2	6	540749	540754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534971
11518	NC_017325	CGA	2	6	540829	540834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11519	NC_017325	CGG	2	6	540907	540912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11520	NC_017325	GAT	2	6	540920	540925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534971
11521	NC_017325	CTG	2	6	540926	540931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11522	NC_017325	GTC	2	6	540956	540961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11523	NC_017325	TCGA	2	8	541056	541063	25 %	25 %	25 %	25 %	384534971
11524	NC_017325	TGG	2	6	541188	541193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534971
11525	NC_017325	CCA	2	6	541220	541225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534971
11526	NC_017325	TCG	2	6	541272	541277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11527	NC_017325	CCG	2	6	541341	541346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534971
11528	NC_017325	CGA	2	6	541351	541356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11529	NC_017325	TCG	2	6	541383	541388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11530	NC_017325	CGAG	2	8	541393	541400	25 %	0 %	50 %	25 %	384534971
11531	NC_017325	GCGG	2	8	541460	541467	0 %	0 %	75 %	25 %	384534971
11532	NC_017325	CGG	2	6	541480	541485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11533	NC_017325	GGC	2	6	541502	541507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11534	NC_017325	CAT	2	6	541543	541548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534971
11535	NC_017325	GCC	2	6	541557	541562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534971
11536	NC_017325	CGC	2	6	541636	541641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534971
11537	NC_017325	TCG	2	6	541695	541700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11538	NC_017325	TCG	2	6	541797	541802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11539	NC_017325	CAT	2	6	541807	541812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534971
11540	NC_017325	CCT	2	6	541891	541896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534971
11541	NC_017325	CG	3	6	542074	542079	0 %	0 %	50 %	50 %	384534971
11542	NC_017325	TGA	2	6	542131	542136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534971
11543	NC_017325	GCG	2	6	542138	542143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11544	NC_017325	GAT	2	6	542153	542158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534971
11545	NC_017325	GAG	2	6	542201	542206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534971
11546	NC_017325	GCA	2	6	542218	542223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11547	NC_017325	TCG	2	6	542301	542306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11548	NC_017325	G	6	6	542362	542367	0 %	0 %	100 %	0 %	384534971
11549	NC_017325	CAG	2	6	542411	542416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11550	NC_017325	TTG	2	6	542427	542432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534971
11551	NC_017325	GCCG	2	8	542439	542446	0 %	0 %	50 %	50 %	384534971
11552	NC_017325	CGA	2	6	542464	542469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11553	NC_017325	CGG	2	6	542500	542505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11554	NC_017325	TCG	2	6	542670	542675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534971
11555	NC_017325	GGC	2	6	542828	542833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534971
11556	NC_017325	GA	3	6	542904	542909	50 %	0 %	50 %	0 %	384534971
11557	NC_017325	GATGAG	2	12	542945	542956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384534971
11558	NC_017325	TGA	2	6	542997	543002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534972
11559	NC_017325	GC	3	6	543010	543015	0 %	0 %	50 %	50 %	384534972
11560	NC_017325	CGGA	2	8	543026	543033	25 %	0 %	50 %	25 %	384534972
11561	NC_017325	TTC	2	6	543053	543058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534972
11562	NC_017325	TCGG	2	8	543068	543075	0 %	25 %	50 %	25 %	384534972
11563	NC_017325	TTGC	2	8	543131	543138	0 %	50 %	25 %	25 %	384534972
11564	NC_017325	GCG	2	6	543170	543175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534972
11565	NC_017325	TTGC	2	8	543217	543224	0 %	50 %	25 %	25 %	384534972
11566	NC_017325	CGC	2	6	543339	543344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534972
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11568	NC_017325	GAC	2	6	543400	543405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534972
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11575	NC_017325	CGA	2	6	543783	543788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534972
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11578	NC_017325	TCT	2	6	543879	543884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534972
11579	NC_017325	TCG	2	6	543908	543913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534972
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11585	NC_017325	CCCGG	2	10	544297	544306	0 %	0 %	40 %	60 %	384534973
11586	NC_017325	GAC	2	6	544325	544330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534973
11587	NC_017325	GAT	2	6	544364	544369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534973
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11589	NC_017325	GAC	2	6	544427	544432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534973
11590	NC_017325	GCC	2	6	544487	544492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534973
11591	NC_017325	GCC	2	6	544509	544514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534973
11592	NC_017325	GAGGAA	2	12	544520	544531	50 %	0 %	50 %	0 %	384534973
11593	NC_017325	CTG	2	6	544547	544552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534973
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11597	NC_017325	GACGG	2	10	544700	544709	20 %	0 %	60 %	20 %	384534973
11598	NC_017325	CG	3	6	544718	544723	0 %	0 %	50 %	50 %	384534973
11599	NC_017325	GAA	2	6	544763	544768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534973
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11601	NC_017325	AACC	2	8	544791	544798	50 %	0 %	0 %	50 %	384534973
11602	NC_017325	CAG	2	6	544838	544843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534973
11603	NC_017325	GC	3	6	544852	544857	0 %	0 %	50 %	50 %	384534973
11604	NC_017325	GCC	2	6	544868	544873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534973
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11606	NC_017325	AAGC	2	8	544915	544922	50 %	0 %	25 %	25 %	384534973
11607	NC_017325	GGA	2	6	544934	544939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534973
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11609	NC_017325	GCA	2	6	545110	545115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534973
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11611	NC_017325	ATG	2	6	545220	545225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534973
11612	NC_017325	TGC	2	6	545290	545295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534973
11613	NC_017325	CCG	2	6	545296	545301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534973
11614	NC_017325	GGGA	2	8	545532	545539	25 %	0 %	75 %	0 %	384534974
11615	NC_017325	CACAGC	2	12	545568	545579	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384534974
11616	NC_017325	TGG	2	6	545592	545597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534974
11617	NC_017325	GTG	2	6	545610	545615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534974
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11619	NC_017325	GAT	2	6	545642	545647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534974
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11971	NC_017325	G	6	6	563340	563345	0 %	0 %	100 %	0 %	384534988
11972	NC_017325	CGA	2	6	563381	563386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534988
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11979	NC_017325	GC	3	6	563611	563616	0 %	0 %	50 %	50 %	384534988
11980	NC_017325	CCG	2	6	563651	563656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534988
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