MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 80662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017325	CTC	2	6	22959	22964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534489
502	NC_017325	GCC	2	6	22975	22980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534489
503	NC_017325	GTC	2	6	23041	23046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534489
504	NC_017325	GC	3	6	23051	23056	0 %	0 %	50 %	50 %	384534489
505	NC_017325	TCG	2	6	23087	23092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534489
506	NC_017325	GCG	2	6	23104	23109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534489
507	NC_017325	CTT	2	6	23122	23127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534489
508	NC_017325	TCA	2	6	23174	23179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534489
509	NC_017325	GAG	2	6	23185	23190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534489
510	NC_017325	CGG	2	6	23217	23222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534489
511	NC_017325	GA	3	6	23254	23259	50 %	0 %	50 %	0 %	384534489
512	NC_017325	TGC	2	6	23273	23278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534489
513	NC_017325	GGC	2	6	23282	23287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534489
514	NC_017325	ACGCG	2	10	23304	23313	20 %	0 %	40 %	40 %	384534489
515	NC_017325	ACA	2	6	23321	23326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534489
516	NC_017325	TGC	2	6	23333	23338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534489
517	NC_017325	TGA	2	6	23360	23365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534489
518	NC_017325	GAC	2	6	23398	23403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534489
519	NC_017325	CCGCC	2	10	23510	23519	0 %	0 %	20 %	80 %	384534489
520	NC_017325	GCG	2	6	23552	23557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534489
521	NC_017325	GGC	2	6	23595	23600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534489
522	NC_017325	AGGC	2	8	23604	23611	25 %	0 %	50 %	25 %	384534489
523	NC_017325	GC	3	6	23644	23649	0 %	0 %	50 %	50 %	384534489
524	NC_017325	CCG	2	6	23705	23710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534489
525	NC_017325	GCGA	2	8	23962	23969	25 %	0 %	50 %	25 %	384534490
526	NC_017325	CGGA	2	8	23976	23983	25 %	0 %	50 %	25 %	384534490
527	NC_017325	TCG	2	6	24059	24064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534490
528	NC_017325	GGCC	2	8	24093	24100	0 %	0 %	50 %	50 %	384534490
529	NC_017325	ACC	2	6	24140	24145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534490
530	NC_017325	TCGA	2	8	24163	24170	25 %	25 %	25 %	25 %	384534490
531	NC_017325	GGA	2	6	24180	24185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534490
532	NC_017325	TCG	2	6	24191	24196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534490
533	NC_017325	CTG	2	6	24208	24213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534490
534	NC_017325	CGG	2	6	24237	24242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534490
535	NC_017325	TC	3	6	24279	24284	0 %	50 %	0 %	50 %	384534490
536	NC_017325	TGC	2	6	24329	24334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534490
537	NC_017325	GCT	2	6	24363	24368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534490
538	NC_017325	CGATG	2	10	24408	24417	20 %	20 %	40 %	20 %	384534490
539	NC_017325	CGCGCT	2	12	24459	24470	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534490
540	NC_017325	TCCT	2	8	24472	24479	0 %	50 %	0 %	50 %	384534490
541	NC_017325	CAT	2	6	24481	24486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534490
542	NC_017325	GTCCGG	2	12	24490	24501	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384534490
543	NC_017325	CCGG	2	8	24522	24529	0 %	0 %	50 %	50 %	384534490
544	NC_017325	GAA	2	6	24576	24581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534490
545	NC_017325	GCC	2	6	24597	24602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534490
546	NC_017325	CAC	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534490
547	NC_017325	ATT	2	6	24728	24733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534490
548	NC_017325	GACC	2	8	25145	25152	25 %	0 %	25 %	50 %	384534492
549	NC_017325	AGC	2	6	25153	25158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534492
550	NC_017325	GCC	2	6	25176	25181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534492
551	NC_017325	TCG	2	6	25199	25204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
552	NC_017325	CGG	2	6	25307	25312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534492
553	NC_017325	GGCC	2	8	25463	25470	0 %	0 %	50 %	50 %	384534492
554	NC_017325	CTC	2	6	25494	25499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534492
555	NC_017325	CGA	2	6	25532	25537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534492
556	NC_017325	GCG	2	6	25608	25613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534492
557	NC_017325	CCA	2	6	25682	25687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534492
558	NC_017325	GGC	2	6	25692	25697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534492
559	NC_017325	CGGT	2	8	25708	25715	0 %	25 %	50 %	25 %	384534492
560	NC_017325	GC	3	6	25809	25814	0 %	0 %	50 %	50 %	384534492
561	NC_017325	GGTCGA	2	12	25838	25849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384534492
562	NC_017325	CGG	2	6	25862	25867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534492
563	NC_017325	GCT	2	6	25913	25918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
564	NC_017325	CAT	2	6	25944	25949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534492
565	NC_017325	GGC	2	6	25991	25996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534492
566	NC_017325	CGA	2	6	26006	26011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534492
567	NC_017325	CGCGC	2	10	26039	26048	0 %	0 %	40 %	60 %	384534492
568	NC_017325	GCT	2	6	26054	26059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
569	NC_017325	AT	3	6	26176	26181	50 %	50 %	0 %	0 %	384534492
570	NC_017325	GCG	2	6	26218	26223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534492
571	NC_017325	CGT	2	6	26225	26230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
572	NC_017325	CCG	2	6	26267	26272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534492
573	NC_017325	CGT	2	6	26288	26293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
574	NC_017325	GC	3	6	26305	26310	0 %	0 %	50 %	50 %	384534492
575	NC_017325	GC	3	6	26318	26323	0 %	0 %	50 %	50 %	384534492
576	NC_017325	GTT	2	6	26352	26357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534492
577	NC_017325	CGA	2	6	26390	26395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534492
578	NC_017325	CGT	2	6	26399	26404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
579	NC_017325	CTT	2	6	26420	26425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534492
580	NC_017325	GAT	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534492
581	NC_017325	GC	3	6	26507	26512	0 %	0 %	50 %	50 %	384534492
582	NC_017325	GAA	2	6	26529	26534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534492
583	NC_017325	CGGT	2	8	26572	26579	0 %	25 %	50 %	25 %	384534492
584	NC_017325	GAT	2	6	26658	26663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534492
585	NC_017325	TGA	2	6	26690	26695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534492
586	NC_017325	CGC	3	9	26712	26720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534492
587	NC_017325	GGTCAG	2	12	26766	26777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384534492
588	NC_017325	GAT	2	6	26802	26807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534492
589	NC_017325	GTC	2	6	26823	26828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
590	NC_017325	GCT	2	6	26864	26869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
591	NC_017325	GAT	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534492
592	NC_017325	GATT	2	8	26906	26913	25 %	50 %	25 %	0 %	384534492
593	NC_017325	CCG	2	6	26914	26919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534492
594	NC_017325	AAGG	2	8	26920	26927	50 %	0 %	50 %	0 %	384534492
595	NC_017325	TCG	2	6	26956	26961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
596	NC_017325	TCGA	2	8	26986	26993	25 %	25 %	25 %	25 %	384534492
597	NC_017325	GCCGAG	2	12	27069	27080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384534492
598	NC_017325	CG	3	6	27119	27124	0 %	0 %	50 %	50 %	384534492
599	NC_017325	TCG	2	6	27151	27156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534492
600	NC_017325	GCGA	2	8	27196	27203	25 %	0 %	50 %	25 %	384534492
601	NC_017325	CGGT	2	8	27313	27320	0 %	25 %	50 %	25 %	384534492
602	NC_017325	GATG	2	8	27452	27459	25 %	25 %	50 %	0 %	384534493
603	NC_017325	GAG	2	6	27507	27512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534493
604	NC_017325	GAT	2	6	27533	27538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534493
605	NC_017325	TTC	2	6	27615	27620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534493
606	NC_017325	CG	4	8	27640	27647	0 %	0 %	50 %	50 %	384534493
607	NC_017325	GCG	2	6	27703	27708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534493
608	NC_017325	CGA	2	6	27725	27730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534493
609	NC_017325	GGA	2	6	27785	27790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534493
610	NC_017325	CGAAG	2	10	27797	27806	40 %	0 %	40 %	20 %	384534493
611	NC_017325	GCA	2	6	27814	27819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534493
612	NC_017325	GCT	2	6	27881	27886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534493
613	NC_017325	TGGCGC	2	12	27913	27924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384534493
614	NC_017325	CGG	2	6	28003	28008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534493
615	NC_017325	GCC	2	6	28012	28017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534493
616	NC_017325	CG	3	6	28045	28050	0 %	0 %	50 %	50 %	384534493
617	NC_017325	GCCG	2	8	28133	28140	0 %	0 %	50 %	50 %	384534493
618	NC_017325	CGG	2	6	28159	28164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534493
619	NC_017325	CTA	2	6	28181	28186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534493
620	NC_017325	CG	4	8	28222	28229	0 %	0 %	50 %	50 %	384534493
621	NC_017325	CGG	3	9	28246	28254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534493
622	NC_017325	GGAAAG	2	12	28307	28318	50 %	0 %	50 %	0 %	384534493
623	NC_017325	CGC	2	6	28319	28324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534493
624	NC_017325	GCT	2	6	28448	28453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534493
625	NC_017325	GACC	2	8	28478	28485	25 %	0 %	25 %	50 %	384534493
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627	NC_017325	ACG	2	6	28545	28550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534493
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749	NC_017325	CGC	3	9	34107	34115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534495
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753	NC_017325	CGGCCT	2	12	34218	34229	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534495
754	NC_017325	TTC	2	6	34267	34272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534495
755	NC_017325	GAT	2	6	34296	34301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534495
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758	NC_017325	CTG	2	6	34468	34473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534495
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