MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C chromosome

Total Repeats: 75648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017322	GAC	2	6	549095	549100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528607
11502	NC_017322	TGA	2	6	549368	549373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528608
11503	NC_017322	GCG	2	6	549383	549388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528608
11504	NC_017322	TCA	2	6	549389	549394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528608
11505	NC_017322	GGCC	2	8	549537	549544	0 %	0 %	50 %	50 %	384528608
11506	NC_017322	GACC	2	8	549555	549562	25 %	0 %	25 %	50 %	384528608
11507	NC_017322	CGAT	2	8	549569	549576	25 %	25 %	25 %	25 %	384528608
11508	NC_017322	CG	3	6	549696	549701	0 %	0 %	50 %	50 %	384528608
11509	NC_017322	CGG	2	6	549731	549736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528608
11510	NC_017322	CGC	2	6	549738	549743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528608
11511	NC_017322	ACG	2	6	549764	549769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528608
11512	NC_017322	GGC	2	6	549846	549851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528608
11513	NC_017322	CCG	2	6	549920	549925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528608
11514	NC_017322	TGC	2	6	549942	549947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528608
11515	NC_017322	TCGA	2	8	550018	550025	25 %	25 %	25 %	25 %	384528608
11516	NC_017322	GCG	2	6	550070	550075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528608
11517	NC_017322	GCC	2	6	550361	550366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528609
11518	NC_017322	GCA	2	6	550407	550412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528609
11519	NC_017322	ATC	2	6	550444	550449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528609
11520	NC_017322	GCG	2	6	550454	550459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528609
11521	NC_017322	CAG	2	6	550479	550484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528609
11522	NC_017322	CG	3	6	550499	550504	0 %	0 %	50 %	50 %	384528609
11523	NC_017322	CGG	2	6	550522	550527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528609
11524	NC_017322	CGA	2	6	550560	550565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528609
11525	NC_017322	GAAG	2	8	550572	550579	50 %	0 %	50 %	0 %	384528609
11526	NC_017322	TCCTG	2	10	550709	550718	0 %	40 %	20 %	40 %	384528609
11527	NC_017322	GGC	2	6	550774	550779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528609
11528	NC_017322	GCT	2	6	550800	550805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528609
11529	NC_017322	GATG	2	8	550812	550819	25 %	25 %	50 %	0 %	384528609
11530	NC_017322	GGC	3	9	550827	550835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528609
11531	NC_017322	CTG	2	6	550858	550863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528609
11532	NC_017322	GGCT	2	8	550885	550892	0 %	25 %	50 %	25 %	384528609
11533	NC_017322	TGA	2	6	550930	550935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528610
11534	NC_017322	AGA	2	6	550960	550965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528610
11535	NC_017322	CGGT	2	8	551055	551062	0 %	25 %	50 %	25 %	384528610
11536	NC_017322	GCG	2	6	551116	551121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528610
11537	NC_017322	GTC	2	6	551683	551688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528611
11538	NC_017322	CGT	2	6	551782	551787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528611
11539	NC_017322	GAC	2	6	551791	551796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528611
11540	NC_017322	GAC	2	6	551830	551835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528611
11541	NC_017322	GAT	2	6	551844	551849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528611
11542	NC_017322	GAT	3	9	551871	551879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528611
11543	NC_017322	ATT	2	6	551906	551911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528611
11544	NC_017322	CGG	3	9	551988	551996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528611
11545	NC_017322	CTC	2	6	552000	552005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528611
11546	NC_017322	GC	3	6	552007	552012	0 %	0 %	50 %	50 %	384528611
11547	NC_017322	GC	3	6	552022	552027	0 %	0 %	50 %	50 %	384528611
11548	NC_017322	GGC	2	6	552030	552035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528611
11549	NC_017322	CG	3	6	552045	552050	0 %	0 %	50 %	50 %	384528611
11550	NC_017322	TGG	2	6	552068	552073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528611
11551	NC_017322	AAC	2	6	552142	552147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528611
11552	NC_017322	TTC	2	6	552154	552159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528611
11553	NC_017322	ACCCG	2	10	552162	552171	20 %	0 %	20 %	60 %	384528611
11554	NC_017322	GAA	2	6	552190	552195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528611
11555	NC_017322	TCG	2	6	552223	552228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528611
11556	NC_017322	GGT	2	6	552246	552251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528611
11557	NC_017322	CCGG	2	8	552265	552272	0 %	0 %	50 %	50 %	384528611
11558	NC_017322	GC	3	6	552278	552283	0 %	0 %	50 %	50 %	384528611
11559	NC_017322	CGC	2	6	552312	552317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528611
11560	NC_017322	GCG	2	6	552386	552391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528611
11561	NC_017322	CGA	2	6	552402	552407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528611
11562	NC_017322	CAA	2	6	552447	552452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528611
11563	NC_017322	CGG	2	6	552456	552461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528611
11564	NC_017322	GC	3	6	552499	552504	0 %	0 %	50 %	50 %	384528611
11565	NC_017322	TCGA	2	8	552547	552554	25 %	25 %	25 %	25 %	384528611
11566	NC_017322	AGG	2	6	552566	552571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528611
11567	NC_017322	GCC	2	6	552590	552595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528611
11568	NC_017322	GGC	2	6	552692	552697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528611
11569	NC_017322	AT	4	8	552791	552798	50 %	50 %	0 %	0 %	384528612
11570	NC_017322	CGT	2	6	552817	552822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11571	NC_017322	TCG	3	9	552855	552863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11572	NC_017322	CGA	2	6	552868	552873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11573	NC_017322	CGG	2	6	552874	552879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528612
11574	NC_017322	TCG	2	6	552903	552908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11575	NC_017322	TGCAC	2	10	552915	552924	20 %	20 %	20 %	40 %	384528612
11576	NC_017322	CG	3	6	552984	552989	0 %	0 %	50 %	50 %	384528612
11577	NC_017322	AGG	2	6	552990	552995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528612
11578	NC_017322	CAC	2	6	553045	553050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528612
11579	NC_017322	GTCG	2	8	553063	553070	0 %	25 %	50 %	25 %	384528612
11580	NC_017322	GAC	2	6	553106	553111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11581	NC_017322	CCGG	2	8	553168	553175	0 %	0 %	50 %	50 %	384528612
11582	NC_017322	GC	3	6	553196	553201	0 %	0 %	50 %	50 %	384528612
11583	NC_017322	GCG	2	6	553206	553211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528612
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11585	NC_017322	GCC	2	6	553270	553275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528612
11586	NC_017322	GCA	2	6	553501	553506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11587	NC_017322	CGGCCG	2	12	553591	553602	0 %	0 %	50 %	50 %	384528612
11588	NC_017322	CGA	2	6	553609	553614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11589	NC_017322	CGC	2	6	553630	553635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528612
11590	NC_017322	GAGGG	2	10	553637	553646	20 %	0 %	80 %	0 %	384528612
11591	NC_017322	GAGG	2	8	553720	553727	25 %	0 %	75 %	0 %	384528612
11592	NC_017322	GC	3	6	553779	553784	0 %	0 %	50 %	50 %	384528612
11593	NC_017322	CTT	2	6	553820	553825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528612
11594	NC_017322	TCG	2	6	553826	553831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528612
11595	NC_017322	CG	3	6	553830	553835	0 %	0 %	50 %	50 %	384528612
11596	NC_017322	CGC	2	6	553876	553881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528612
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11599	NC_017322	AGC	2	6	554115	554120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528613
11600	NC_017322	AGC	2	6	554130	554135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528613
11601	NC_017322	GAGGCC	2	12	554176	554187	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384528613
11602	NC_017322	GCG	2	6	554208	554213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528613
11603	NC_017322	CGG	2	6	554244	554249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528613
11604	NC_017322	GAC	3	9	554257	554265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528613
11605	NC_017322	GA	3	6	554267	554272	50 %	0 %	50 %	0 %	384528613
11606	NC_017322	GC	3	6	554313	554318	0 %	0 %	50 %	50 %	384528613
11607	NC_017322	GCGTT	2	10	554394	554403	0 %	40 %	40 %	20 %	384528613
11608	NC_017322	TGC	2	6	554422	554427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528613
11609	NC_017322	GGC	2	6	554440	554445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528613
11610	NC_017322	GGGC	2	8	554463	554470	0 %	0 %	75 %	25 %	384528613
11611	NC_017322	GGC	2	6	554999	555004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528614
11612	NC_017322	CAT	2	6	555014	555019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528614
11613	NC_017322	GAA	2	6	555021	555026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528614
11614	NC_017322	TCA	2	6	555058	555063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528614
11615	NC_017322	CTG	3	9	555087	555095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528614
11616	NC_017322	GTC	2	6	555105	555110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528614
11617	NC_017322	GTC	2	6	555171	555176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528614
11618	NC_017322	TGC	2	6	555199	555204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528614
11619	NC_017322	TCT	2	6	555413	555418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528614
11620	NC_017322	GTC	2	6	555435	555440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528614
11621	NC_017322	TAT	2	6	555585	555590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528614
11622	NC_017322	GTT	2	6	555648	555653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528614
11623	NC_017322	ACG	2	6	555667	555672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528614
11624	NC_017322	CGC	4	12	555680	555691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528614
11625	NC_017322	GCGAA	2	10	555703	555712	40 %	0 %	40 %	20 %	384528614
11626	NC_017322	CGTC	2	8	555727	555734	0 %	25 %	25 %	50 %	384528614
11627	NC_017322	CGC	2	6	555770	555775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528614
11628	NC_017322	TCA	2	6	555819	555824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528615
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11630	NC_017322	ACCA	2	8	555910	555917	50 %	0 %	0 %	50 %	384528615
11631	NC_017322	ATC	2	6	555952	555957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528615
11632	NC_017322	CAT	2	6	555963	555968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528615
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11635	NC_017322	TGC	2	6	556068	556073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528615
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11641	NC_017322	TGC	2	6	556271	556276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528615
11642	NC_017322	TCG	2	6	556286	556291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528615
11643	NC_017322	GCGG	2	8	556315	556322	0 %	0 %	75 %	25 %	384528615
11644	NC_017322	TCG	2	6	556414	556419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528615
11645	NC_017322	TCA	2	6	556439	556444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528615
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11647	NC_017322	GC	3	6	556461	556466	0 %	0 %	50 %	50 %	384528615
11648	NC_017322	TCCTGC	2	12	556526	556537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384528615
11649	NC_017322	TGC	2	6	556571	556576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528615
11650	NC_017322	CTT	2	6	556602	556607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528615
11651	NC_017322	GGC	3	9	556618	556626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528615
11652	NC_017322	TTC	2	6	556657	556662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528615
11653	NC_017322	ATTCTG	2	12	556681	556692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384528615
11654	NC_017322	CAT	2	6	556716	556721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528615
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11657	NC_017322	TCT	2	6	556904	556909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528615
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11659	NC_017322	GGC	2	6	556930	556935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528615
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11672	NC_017322	GTC	2	6	557700	557705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528616
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11694	NC_017322	CGG	3	9	558658	558666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528617
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11696	NC_017322	GGAA	2	8	558716	558723	50 %	0 %	50 %	0 %	384528618
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11703	NC_017322	CGA	2	6	559022	559027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528618
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11707	NC_017322	GAC	2	6	559107	559112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528618
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11712	NC_017322	AAAC	2	8	559275	559282	75 %	0 %	0 %	25 %	384528618
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11717	NC_017322	CGG	2	6	559474	559479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528619
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11720	NC_017322	CCA	2	6	559600	559605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528619
11721	NC_017322	CGT	2	6	559612	559617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528619
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11724	NC_017322	CG	4	8	559735	559742	0 %	0 %	50 %	50 %	384528619
11725	NC_017322	CGG	2	6	559753	559758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528619
11726	NC_017322	GCC	2	6	559765	559770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528619
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11729	NC_017322	ACG	2	6	559841	559846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528619
11730	NC_017322	GCT	2	6	559867	559872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528619
11731	NC_017322	GTTCT	2	10	559928	559937	0 %	60 %	20 %	20 %	384528619
11732	NC_017322	CTT	2	6	560005	560010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528619
11733	NC_017322	CTGC	2	8	560068	560075	0 %	25 %	25 %	50 %	384528619
11734	NC_017322	GC	3	6	560077	560082	0 %	0 %	50 %	50 %	384528619
11735	NC_017322	CAC	2	6	560108	560113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528619
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11737	NC_017322	TCG	2	6	560148	560153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528619
11738	NC_017322	CGT	2	6	560155	560160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528619
11739	NC_017322	CTT	2	6	560173	560178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528619
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11744	NC_017322	GTC	2	6	560593	560598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528620
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11755	NC_017322	CGC	2	6	560866	560871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528621
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11845	NC_017322	CG	3	6	565029	565034	0 %	0 %	50 %	50 %	384528626
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11850	NC_017322	GCT	2	6	565283	565288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528626
11851	NC_017322	GC	3	6	565317	565322	0 %	0 %	50 %	50 %	384528626
11852	NC_017322	CGC	2	6	565346	565351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528626
11853	NC_017322	CCG	2	6	565441	565446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528626
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11855	NC_017322	CAT	2	6	565487	565492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528626
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11975	NC_017322	TCA	2	6	571874	571879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528630
11976	NC_017322	GCG	2	6	572041	572046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528631
11977	NC_017322	TTC	2	6	572095	572100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528631
11978	NC_017322	TCG	2	6	572161	572166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528631
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11980	NC_017322	T	7	7	572234	572240	0 %	100 %	0 %	0 %	384528631
11981	NC_017322	CG	3	6	572295	572300	0 %	0 %	50 %	50 %	384528631
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