MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 3662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	384545967
2	NC_017319	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545967
3	NC_017319	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545967
4	NC_017319	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	384545968
5	NC_017319	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545968
6	NC_017319	TTG	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545968
7	NC_017319	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545968
8	NC_017319	GAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545968
9	NC_017319	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
10	NC_017319	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	384545969
11	NC_017319	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545969
12	NC_017319	AGC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545969
13	NC_017319	T	7	7	1309	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	384545969
14	NC_017319	GA	3	6	1318	1323	50 %	0 %	50 %	0 %	384545969
15	NC_017319	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545969
16	NC_017319	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	384545969
17	NC_017319	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545969
18	NC_017319	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	384545969
19	NC_017319	TAA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
20	NC_017319	ATG	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545969
21	NC_017319	TGC	3	9	1514	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545969
22	NC_017319	A	7	7	1535	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	384545969
23	NC_017319	TAA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
24	NC_017319	TCA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545969
25	NC_017319	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	384545969
26	NC_017319	CTG	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545969
27	NC_017319	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	384545969
28	NC_017319	CT	3	6	1799	1804	0 %	50 %	0 %	50 %	384545969
29	NC_017319	T	7	7	1808	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	384545969
30	NC_017319	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	384545969
31	NC_017319	CTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545969
32	NC_017319	AAG	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545969
33	NC_017319	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545969
34	NC_017319	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
35	NC_017319	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545970
36	NC_017319	T	6	6	2393	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	384545970
37	NC_017319	CAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545970
38	NC_017319	CCG	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545970
39	NC_017319	AGT	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545970
40	NC_017319	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	384545970
41	NC_017319	TAC	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545970
42	NC_017319	GTT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545970
43	NC_017319	TAC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545970
44	NC_017319	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	384545970
45	NC_017319	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	384545970
46	NC_017319	GTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545970
47	NC_017319	ATA	2	6	3023	3028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545970
48	NC_017319	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	384545970
49	NC_017319	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545970
50	NC_017319	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	384545971
51	NC_017319	A	7	7	3507	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	384545971
52	NC_017319	CATTG	2	10	3540	3549	20 %	40 %	20 %	20 %	384545971
53	NC_017319	T	6	6	3585	3590	0 %	100 %	0 %	0 %	384545971
54	NC_017319	ATT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545971
55	NC_017319	TAAG	2	8	3656	3663	50 %	25 %	25 %	0 %	384545971
56	NC_017319	CAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545971
57	NC_017319	AAATT	2	10	3736	3745	60 %	40 %	0 %	0 %	384545971
58	NC_017319	TAAA	2	8	3753	3760	75 %	25 %	0 %	0 %	384545971
59	NC_017319	T	6	6	3774	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	384545971
60	NC_017319	TGA	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
61	NC_017319	T	7	7	3815	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	384545971
62	NC_017319	TCC	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384545971
63	NC_017319	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	384545971
64	NC_017319	CT	3	6	4011	4016	0 %	50 %	0 %	50 %	384545971
65	NC_017319	A	6	6	4196	4201	100 %	0 %	0 %	0 %	384545971
66	NC_017319	AT	3	6	4240	4245	50 %	50 %	0 %	0 %	384545971
67	NC_017319	ATG	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
68	NC_017319	TTTA	2	8	4308	4315	25 %	75 %	0 %	0 %	384545971
69	NC_017319	TGA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
70	NC_017319	A	8	8	4353	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	384545971
71	NC_017319	GTAT	2	8	4398	4405	25 %	50 %	25 %	0 %	384545971
72	NC_017319	AAT	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545971
73	NC_017319	TAA	3	9	4514	4522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545971
74	NC_017319	AAGT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	25 %	0 %	384545971
75	NC_017319	GAA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545971
76	NC_017319	TAT	2	6	4569	4574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545971
77	NC_017319	ATG	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
78	NC_017319	GCT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545971
79	NC_017319	AT	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	384545972
80	NC_017319	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	384545972
81	NC_017319	TTG	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545972
82	NC_017319	CAA	2	6	4861	4866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545972
83	NC_017319	ATT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545972
84	NC_017319	TG	3	6	5273	5278	0 %	50 %	50 %	0 %	384545973
85	NC_017319	TAG	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545973
86	NC_017319	AAC	2	6	5333	5338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545973
87	NC_017319	GTT	2	6	5440	5445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545973
88	NC_017319	GCT	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545973
89	NC_017319	GCT	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545973
90	NC_017319	ACATC	2	10	5493	5502	40 %	20 %	0 %	40 %	384545973
91	NC_017319	CAC	3	9	5518	5526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545973
92	NC_017319	CCGG	2	8	5548	5555	0 %	0 %	50 %	50 %	384545973
93	NC_017319	G	6	6	5563	5568	0 %	0 %	100 %	0 %	384545973
94	NC_017319	TCC	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384545973
95	NC_017319	CAG	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545974
96	NC_017319	CGAC	2	8	5980	5987	25 %	0 %	25 %	50 %	384545974
97	NC_017319	GCC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545974
98	NC_017319	AGGTG	2	10	6061	6070	20 %	20 %	60 %	0 %	384545974
99	NC_017319	T	7	7	6102	6108	0 %	100 %	0 %	0 %	384545975
100	NC_017319	AGC	2	6	6110	6115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545975
101	NC_017319	TGA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545975
102	NC_017319	GAC	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545975
103	NC_017319	TTA	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545975
104	NC_017319	CAGAC	2	10	6341	6350	40 %	0 %	20 %	40 %	384545975
105	NC_017319	GTG	2	6	6404	6409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545975
106	NC_017319	TG	3	6	6558	6563	0 %	50 %	50 %	0 %	384545975
107	NC_017319	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545975
108	NC_017319	GGTTCG	2	12	6655	6666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384545975
109	NC_017319	GAT	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545975
110	NC_017319	GCC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545975
111	NC_017319	TCA	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545975
112	NC_017319	TCTG	2	8	6857	6864	0 %	50 %	25 %	25 %	384545975
113	NC_017319	TAA	2	6	6888	6893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545975
114	NC_017319	T	7	7	7006	7012	0 %	100 %	0 %	0 %	384545976
115	NC_017319	AT	3	6	7014	7019	50 %	50 %	0 %	0 %	384545976
116	NC_017319	CAGC	2	8	7080	7087	25 %	0 %	25 %	50 %	384545976
117	NC_017319	GGC	2	6	7120	7125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545976
118	NC_017319	ATT	2	6	7262	7267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545976
119	NC_017319	A	6	6	7439	7444	100 %	0 %	0 %	0 %	384545977
120	NC_017319	TATT	2	8	7455	7462	25 %	75 %	0 %	0 %	384545977
121	NC_017319	T	7	7	7476	7482	0 %	100 %	0 %	0 %	384545977
122	NC_017319	TCT	2	6	7485	7490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545977
123	NC_017319	TAT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
124	NC_017319	TAC	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545977
125	NC_017319	TTA	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
126	NC_017319	T	6	6	7664	7669	0 %	100 %	0 %	0 %	384545977
127	NC_017319	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	384545977
128	NC_017319	ATA	2	6	7758	7763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
129	NC_017319	TA	3	6	7771	7776	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
130	NC_017319	G	6	6	7787	7792	0 %	0 %	100 %	0 %	384545977
131	NC_017319	TG	3	6	7831	7836	0 %	50 %	50 %	0 %	384545977
132	NC_017319	AAC	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545977
133	NC_017319	AAT	2	6	7877	7882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
134	NC_017319	ACT	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545977
135	NC_017319	TTA	2	6	7913	7918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
136	NC_017319	TGCAA	2	10	7961	7970	40 %	20 %	20 %	20 %	384545977
137	NC_017319	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	384545977
138	NC_017319	GCA	2	6	8135	8140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545977
139	NC_017319	AAT	2	6	8203	8208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
140	NC_017319	TA	3	6	8233	8238	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
141	NC_017319	ATA	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
142	NC_017319	AT	3	6	8368	8373	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
143	NC_017319	TGTT	2	8	8415	8422	0 %	75 %	25 %	0 %	384545977
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152	NC_017319	T	6	6	8796	8801	0 %	100 %	0 %	0 %	384545977
153	NC_017319	ACAT	2	8	8806	8813	50 %	25 %	0 %	25 %	384545977
154	NC_017319	T	6	6	8813	8818	0 %	100 %	0 %	0 %	384545977
155	NC_017319	AAG	2	6	8839	8844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545977
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265	NC_017319	ACCGG	2	10	16926	16935	20 %	0 %	40 %	40 %	384545989
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500	NC_017319	GGAT	2	8	34963	34970	25 %	25 %	50 %	0 %	384546017

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