MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803

Total Repeats: 58361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017277	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435231
2	NC_017277	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435231
3	NC_017277	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435231
4	NC_017277	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	384435231
5	NC_017277	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435231
6	NC_017277	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435231
7	NC_017277	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	384435231
8	NC_017277	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384435231
9	NC_017277	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435231
10	NC_017277	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	384435231
11	NC_017277	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435232
12	NC_017277	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435232
13	NC_017277	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	384435232
14	NC_017277	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435232
15	NC_017277	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	384435232
16	NC_017277	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435232
17	NC_017277	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435232
18	NC_017277	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435232
19	NC_017277	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435232
20	NC_017277	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435232
21	NC_017277	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	384435232
22	NC_017277	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	384435233
23	NC_017277	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435233
24	NC_017277	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	384435233
25	NC_017277	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435233
26	NC_017277	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435233
27	NC_017277	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435233
28	NC_017277	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	384435233
29	NC_017277	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435233
30	NC_017277	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435233
31	NC_017277	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435234
32	NC_017277	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	384435234
33	NC_017277	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435234
34	NC_017277	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435234
35	NC_017277	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435234
36	NC_017277	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435234
37	NC_017277	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435234
38	NC_017277	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	384435234
39	NC_017277	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435234
40	NC_017277	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435234
41	NC_017277	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435234
42	NC_017277	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435234
43	NC_017277	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435234
44	NC_017277	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435235
45	NC_017277	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435235
46	NC_017277	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435235
47	NC_017277	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435235
48	NC_017277	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435235
49	NC_017277	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435235
50	NC_017277	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435235
51	NC_017277	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435235
52	NC_017277	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435235
53	NC_017277	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	384435235
54	NC_017277	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	384435235
55	NC_017277	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435235
56	NC_017277	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435235
57	NC_017277	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	384435235
58	NC_017277	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	384435235
59	NC_017277	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435235
60	NC_017277	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	384435235
61	NC_017277	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435236
62	NC_017277	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435236
63	NC_017277	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435236
64	NC_017277	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435236
65	NC_017277	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435236
66	NC_017277	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	384435236
67	NC_017277	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435236
68	NC_017277	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435236
69	NC_017277	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435236
70	NC_017277	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435236
71	NC_017277	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435236
72	NC_017277	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435236
73	NC_017277	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435236
74	NC_017277	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435236
75	NC_017277	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435236
76	NC_017277	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
77	NC_017277	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	384435237
78	NC_017277	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435237
79	NC_017277	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435237
80	NC_017277	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435237
81	NC_017277	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435237
82	NC_017277	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	384435237
83	NC_017277	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
84	NC_017277	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435237
85	NC_017277	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435237
86	NC_017277	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435237
87	NC_017277	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435237
88	NC_017277	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435237
89	NC_017277	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435237
90	NC_017277	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	384435237
91	NC_017277	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435237
92	NC_017277	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435237
93	NC_017277	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435237
94	NC_017277	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435237
95	NC_017277	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435237
96	NC_017277	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
97	NC_017277	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435237
98	NC_017277	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435237
99	NC_017277	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
100	NC_017277	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435237
101	NC_017277	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435237
102	NC_017277	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435237
103	NC_017277	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435238
104	NC_017277	CGG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435238
105	NC_017277	A	8	8	8543	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	384435238
106	NC_017277	CCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435238
107	NC_017277	GAA	2	6	8567	8572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435238
108	NC_017277	G	6	6	8601	8606	0 %	0 %	100 %	0 %	384435238
109	NC_017277	TC	3	6	8646	8651	0 %	50 %	0 %	50 %	384435238
110	NC_017277	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435238
111	NC_017277	TGG	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435238
112	NC_017277	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	384435238
113	NC_017277	GTT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435238
114	NC_017277	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435238
115	NC_017277	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435238
116	NC_017277	ACC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435238
117	NC_017277	CAT	4	12	9076	9087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435238
118	NC_017277	AAC	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435238
119	NC_017277	TAC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435238
120	NC_017277	TC	3	6	9123	9128	0 %	50 %	0 %	50 %	384435238
121	NC_017277	AAT	2	6	9281	9286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435238
122	NC_017277	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435238
123	NC_017277	AGCC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	384435238
124	NC_017277	G	6	6	9430	9435	0 %	0 %	100 %	0 %	384435238
125	NC_017277	ACA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435238
126	NC_017277	GGC	2	6	9523	9528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435238
127	NC_017277	GGGC	2	8	9587	9594	0 %	0 %	75 %	25 %	384435238
128	NC_017277	GCA	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384435238
129	NC_017277	C	6	6	9668	9673	0 %	0 %	0 %	100 %	384435238
130	NC_017277	A	6	6	9697	9702	100 %	0 %	0 %	0 %	384435238
131	NC_017277	ATG	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435238
132	NC_017277	TAG	2	6	9784	9789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435238
133	NC_017277	TTG	2	6	9853	9858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435238
134	NC_017277	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435238
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259	NC_017277	ATTT	2	8	17346	17353	25 %	75 %	0 %	0 %	384435244
260	NC_017277	GCAG	2	8	17381	17388	25 %	0 %	50 %	25 %	384435244
261	NC_017277	GCA	2	6	17524	17529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384435244
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263	NC_017277	GTT	2	6	17574	17579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435244
264	NC_017277	GCC	2	6	17640	17645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435244
265	NC_017277	CTA	2	6	17652	17657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435244
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267	NC_017277	GCG	2	6	17896	17901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435245
268	NC_017277	ACC	2	6	17935	17940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435245
269	NC_017277	AGT	2	6	17945	17950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435245
270	NC_017277	GGT	2	6	18126	18131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435245
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285	NC_017277	GCC	2	6	18930	18935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435245
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388	NC_017277	AG	3	6	24465	24470	50 %	0 %	50 %	0 %	384435249
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