MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 65185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017098	TCAGT	2	10	24	33	20 %	40 %	20 %	20 %	383789244
2	NC_017098	CTG	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
3	NC_017098	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
4	NC_017098	GCGCA	2	10	250	259	20 %	0 %	40 %	40 %	383789244
5	NC_017098	CAG	2	6	286	291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789244
6	NC_017098	AAC	3	9	415	423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789244
7	NC_017098	TGC	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
8	NC_017098	ATC	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789244
9	NC_017098	GAG	2	6	589	594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789244
10	NC_017098	CTG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
11	NC_017098	GAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789244
12	NC_017098	GAA	2	6	721	726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
13	NC_017098	CCGG	2	8	786	793	0 %	0 %	50 %	50 %	383789244
14	NC_017098	AAG	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
15	NC_017098	ATCTG	2	10	947	956	20 %	40 %	20 %	20 %	383789244
16	NC_017098	ACC	2	6	967	972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
17	NC_017098	CAG	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789244
18	NC_017098	AGCG	2	8	1121	1128	25 %	0 %	50 %	25 %	383789244
19	NC_017098	ACT	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789244
20	NC_017098	A	7	7	1170	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	383789244
21	NC_017098	CTG	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
22	NC_017098	CCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
23	NC_017098	G	6	6	1270	1275	0 %	0 %	100 %	0 %	383789244
24	NC_017098	CAC	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
25	NC_017098	AGA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
26	NC_017098	CAC	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789245
27	NC_017098	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789245
28	NC_017098	TCA	2	6	1696	1701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
29	NC_017098	TGC	3	9	1730	1738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
30	NC_017098	AAC	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789245
31	NC_017098	TGC	2	6	1812	1817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
32	NC_017098	CTA	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
33	NC_017098	TTC	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789245
34	NC_017098	GCCG	2	8	1875	1882	0 %	0 %	50 %	50 %	383789245
35	NC_017098	GAT	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
36	NC_017098	ACT	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
37	NC_017098	GAT	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
38	NC_017098	GAT	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
39	NC_017098	CAG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789245
40	NC_017098	GCG	2	6	2261	2266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789245
41	NC_017098	GAG	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789245
42	NC_017098	CTG	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
43	NC_017098	TTG	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789245
44	NC_017098	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
45	NC_017098	TG	3	6	2814	2819	0 %	50 %	50 %	0 %	383789246
46	NC_017098	TTG	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789246
47	NC_017098	CTG	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
48	NC_017098	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
49	NC_017098	GCA	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
50	NC_017098	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789246
51	NC_017098	T	6	6	3139	3144	0 %	100 %	0 %	0 %	383789246
52	NC_017098	CTG	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
53	NC_017098	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
54	NC_017098	GCA	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
55	NC_017098	CAG	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
56	NC_017098	ACT	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
57	NC_017098	GGAT	2	8	3530	3537	25 %	25 %	50 %	0 %	383789246
58	NC_017098	TGG	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789246
59	NC_017098	TGC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
60	NC_017098	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789246
61	NC_017098	CTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
62	NC_017098	GCG	2	6	3678	3683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789246
63	NC_017098	GAG	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789246
64	NC_017098	CTG	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789247
65	NC_017098	GCA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
66	NC_017098	TGA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789247
67	NC_017098	TGG	3	9	3972	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789247
68	NC_017098	ATC	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789247
69	NC_017098	GCA	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
70	NC_017098	GAA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789247
71	NC_017098	AGC	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
72	NC_017098	AGC	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
73	NC_017098	GTC	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789248
74	NC_017098	CGT	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789248
75	NC_017098	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789248
76	NC_017098	CTGT	2	8	4563	4570	0 %	50 %	25 %	25 %	383789248
77	NC_017098	AAG	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789248
78	NC_017098	TATT	2	8	4676	4683	25 %	75 %	0 %	0 %	383789249
79	NC_017098	AC	3	6	4703	4708	50 %	0 %	0 %	50 %	383789249
80	NC_017098	GTA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789249
81	NC_017098	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
82	NC_017098	TTC	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
83	NC_017098	C	6	6	5027	5032	0 %	0 %	0 %	100 %	383789250
84	NC_017098	ATC	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789250
85	NC_017098	ACAGG	2	10	5097	5106	40 %	0 %	40 %	20 %	383789250
86	NC_017098	CCGCA	2	10	5113	5122	20 %	0 %	20 %	60 %	383789250
87	NC_017098	TGC	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
88	NC_017098	GCT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
89	NC_017098	CG	3	6	5325	5330	0 %	0 %	50 %	50 %	383789250
90	NC_017098	TGG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
91	NC_017098	T	6	6	5382	5387	0 %	100 %	0 %	0 %	383789250
92	NC_017098	CGC	2	6	5388	5393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
93	NC_017098	CA	3	6	5409	5414	50 %	0 %	0 %	50 %	383789250
94	NC_017098	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789250
95	NC_017098	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
96	NC_017098	GCC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
97	NC_017098	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
98	NC_017098	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
99	NC_017098	GAG	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789250
100	NC_017098	GGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
101	NC_017098	CTG	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
102	NC_017098	GTG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
103	NC_017098	GCT	3	9	6101	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
104	NC_017098	GAT	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789250
105	NC_017098	AAG	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789250
106	NC_017098	GGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789250
107	NC_017098	TGC	3	9	6280	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
108	NC_017098	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
109	NC_017098	AAC	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789250
110	NC_017098	TC	3	6	6377	6382	0 %	50 %	0 %	50 %	383789250
111	NC_017098	TCT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
112	NC_017098	ATT	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
113	NC_017098	CTG	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
114	NC_017098	GCT	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
115	NC_017098	TCAG	2	8	6499	6506	25 %	25 %	25 %	25 %	383789250
116	NC_017098	GCA	3	9	6514	6522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
117	NC_017098	CAC	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789250
118	NC_017098	TTC	3	9	6564	6572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
119	NC_017098	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
120	NC_017098	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
121	NC_017098	GTCG	2	8	6629	6636	0 %	25 %	50 %	25 %	383789250
122	NC_017098	GCA	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
123	NC_017098	TAC	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789250
124	NC_017098	GCA	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
125	NC_017098	A	6	6	6737	6742	100 %	0 %	0 %	0 %	383789250
126	NC_017098	GCA	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
127	NC_017098	AGA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789251
128	NC_017098	CTGGGG	2	12	6812	6823	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383789251
129	NC_017098	CAGC	2	8	6853	6860	25 %	0 %	25 %	50 %	383789251
130	NC_017098	GGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789251
131	NC_017098	GGCC	2	8	6951	6958	0 %	0 %	50 %	50 %	383789251
132	NC_017098	TGC	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
133	NC_017098	GCA	2	6	6998	7003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
134	NC_017098	GCA	3	9	7007	7015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
135	NC_017098	GCC	2	6	7016	7021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789251
136	NC_017098	TTA	2	6	7110	7115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789251
137	NC_017098	ATT	3	9	7169	7177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789251
138	NC_017098	CTGG	2	8	7238	7245	0 %	25 %	50 %	25 %	383789251
139	NC_017098	GGT	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789251
140	NC_017098	GTC	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
141	NC_017098	TGA	2	6	7338	7343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789251
142	NC_017098	GCT	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
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147	NC_017098	TGC	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789252
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150	NC_017098	TGAA	2	8	8006	8013	50 %	25 %	25 %	0 %	383789252
151	NC_017098	AGAT	2	8	8081	8088	50 %	25 %	25 %	0 %	383789252
152	NC_017098	TGC	2	6	8091	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789252
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154	NC_017098	AT	3	6	8387	8392	50 %	50 %	0 %	0 %	383789253
155	NC_017098	GCC	2	6	8410	8415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789253
156	NC_017098	GCG	2	6	8416	8421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789253
157	NC_017098	GTG	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789253
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159	NC_017098	GGA	2	6	8457	8462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789253
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161	NC_017098	GGC	2	6	8559	8564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789253
162	NC_017098	TTG	2	6	8627	8632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789253
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172	NC_017098	CTG	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789253
173	NC_017098	GCC	2	6	9380	9385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789253
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181	NC_017098	ACCC	2	8	9968	9975	25 %	0 %	0 %	75 %	383789254
182	NC_017098	ACA	2	6	10078	10083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789254
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242	NC_017098	T	6	6	12853	12858	0 %	100 %	0 %	0 %	383789255
243	NC_017098	ATT	2	6	12890	12895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789255
244	NC_017098	GC	3	6	12900	12905	0 %	0 %	50 %	50 %	383789255
245	NC_017098	TAC	2	6	12949	12954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789255
246	NC_017098	GCT	2	6	13008	13013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
247	NC_017098	TCAG	2	8	13091	13098	25 %	25 %	25 %	25 %	383789255
248	NC_017098	AAT	2	6	13114	13119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383789255
249	NC_017098	CTGTAT	2	12	13180	13191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383789255
250	NC_017098	GGT	2	6	13248	13253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789255
251	NC_017098	G	7	7	13302	13308	0 %	0 %	100 %	0 %	383789255
252	NC_017098	CTG	2	6	13399	13404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
253	NC_017098	ATC	2	6	13424	13429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789255
254	NC_017098	GAT	2	6	13543	13548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789255
255	NC_017098	GT	3	6	13556	13561	0 %	50 %	50 %	0 %	383789255
256	NC_017098	ACA	2	6	13562	13567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789255
257	NC_017098	CTG	2	6	13573	13578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
258	NC_017098	TGCA	2	8	13598	13605	25 %	25 %	25 %	25 %	383789255
259	NC_017098	CGGCA	2	10	13615	13624	20 %	0 %	40 %	40 %	383789255
260	NC_017098	CTG	2	6	13718	13723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
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381	NC_017098	ACC	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789261
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383	NC_017098	GCGA	2	8	20102	20109	25 %	0 %	50 %	25 %	383789261
384	NC_017098	TCACC	2	10	20121	20130	20 %	20 %	0 %	60 %	383789261
385	NC_017098	GCC	2	6	20170	20175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789262
386	NC_017098	TGC	2	6	20178	20183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789262
387	NC_017098	CGC	2	6	20184	20189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789262
388	NC_017098	TCT	2	6	20227	20232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789262
389	NC_017098	GGC	2	6	20242	20247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789262
390	NC_017098	CGA	2	6	20293	20298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789262
391	NC_017098	GCC	2	6	20371	20376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789262
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393	NC_017098	CCG	2	6	20502	20507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789262
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396	NC_017098	CCG	2	6	20754	20759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789262
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420	NC_017098	CGA	2	6	21936	21941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789263
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497	NC_017098	CAGC	2	8	25916	25923	25 %	0 %	25 %	50 %	383789265
498	NC_017098	GCG	2	6	25955	25960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789265
499	NC_017098	CAA	2	6	25964	25969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789265
500	NC_017098	TGG	2	6	25972	25977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789265

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