MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 65185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017098	GAT	2	6	121405	121410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789342
2502	NC_017098	GTA	2	6	121597	121602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789342
2503	NC_017098	GA	3	6	121640	121645	50 %	0 %	50 %	0 %	383789342
2504	NC_017098	CGG	2	6	121675	121680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789342
2505	NC_017098	AGCTG	2	10	121683	121692	20 %	20 %	40 %	20 %	383789342
2506	NC_017098	GCC	2	6	121819	121824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789342
2507	NC_017098	CAG	2	6	121849	121854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789342
2508	NC_017098	CG	3	6	121959	121964	0 %	0 %	50 %	50 %	383789342
2509	NC_017098	CCAG	2	8	122043	122050	25 %	0 %	25 %	50 %	383789342
2510	NC_017098	CTT	2	6	122118	122123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789342
2511	NC_017098	GCC	3	9	122158	122166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789342
2512	NC_017098	TCC	2	6	122189	122194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789342
2513	NC_017098	GC	3	6	122210	122215	0 %	0 %	50 %	50 %	383789342
2514	NC_017098	CAG	2	6	122227	122232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789342
2515	NC_017098	GGC	2	6	122256	122261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789342
2516	NC_017098	ATG	2	6	122407	122412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789342
2517	NC_017098	TCG	2	6	122522	122527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789342
2518	NC_017098	TCGG	2	8	122541	122548	0 %	25 %	50 %	25 %	383789342
2519	NC_017098	GGC	2	6	122629	122634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789342
2520	NC_017098	GCT	2	6	122655	122660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789342
2521	NC_017098	CCT	2	6	122664	122669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789342
2522	NC_017098	GGA	2	6	122682	122687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789342
2523	NC_017098	TCT	2	6	122690	122695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789342
2524	NC_017098	TCG	2	6	122738	122743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789342
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2527	NC_017098	GCA	2	6	122856	122861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789342
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2530	NC_017098	TCCT	2	8	123261	123268	0 %	50 %	0 %	50 %	383789343
2531	NC_017098	CCA	2	6	123285	123290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789343
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2533	NC_017098	ATGA	2	8	123508	123515	50 %	25 %	25 %	0 %	383789343
2534	NC_017098	CAG	2	6	123516	123521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789343
2535	NC_017098	TCG	2	6	123522	123527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789343
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2538	NC_017098	GCCA	2	8	123883	123890	25 %	0 %	25 %	50 %	383789343
2539	NC_017098	CAT	2	6	123902	123907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789343
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2542	NC_017098	CCA	2	6	124077	124082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789343
2543	NC_017098	CGG	2	6	124161	124166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789343
2544	NC_017098	TCA	2	6	124232	124237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789343
2545	NC_017098	CATC	2	8	124265	124272	25 %	25 %	0 %	50 %	383789343
2546	NC_017098	GAC	2	6	124280	124285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789343
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2551	NC_017098	TTTGA	2	10	124639	124648	20 %	60 %	20 %	0 %	383789343
2552	NC_017098	CTGT	2	8	124799	124806	0 %	50 %	25 %	25 %	383789343
2553	NC_017098	GCA	2	6	124826	124831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789343
2554	NC_017098	GGT	2	6	125019	125024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789344
2555	NC_017098	GATGC	2	10	125062	125071	20 %	20 %	40 %	20 %	383789344
2556	NC_017098	GT	3	6	125087	125092	0 %	50 %	50 %	0 %	383789344
2557	NC_017098	CTG	2	6	125113	125118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789344
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2560	NC_017098	C	6	6	125248	125253	0 %	0 %	0 %	100 %	383789344
2561	NC_017098	TGC	2	6	125279	125284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789344
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2568	NC_017098	GAT	2	6	125631	125636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789344
2569	NC_017098	TGA	2	6	125765	125770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789345
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2572	NC_017098	CGA	2	6	125873	125878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789345
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2581	NC_017098	AGAT	2	8	126685	126692	50 %	25 %	25 %	0 %	383789347
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2589	NC_017098	TGC	2	6	127126	127131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789348
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2591	NC_017098	CG	3	6	127218	127223	0 %	0 %	50 %	50 %	383789348
2592	NC_017098	GAT	2	6	127280	127285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789348
2593	NC_017098	CCGG	2	8	127313	127320	0 %	0 %	50 %	50 %	383789348
2594	NC_017098	GGAAT	2	10	127389	127398	40 %	20 %	40 %	0 %	383789348
2595	NC_017098	TCG	2	6	127411	127416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789348
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2599	NC_017098	CG	3	6	127491	127496	0 %	0 %	50 %	50 %	383789348
2600	NC_017098	AT	3	6	127503	127508	50 %	50 %	0 %	0 %	383789348
2601	NC_017098	ATG	2	6	127533	127538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789348
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2604	NC_017098	GAG	2	6	127793	127798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789348
2605	NC_017098	TCGA	2	8	127820	127827	25 %	25 %	25 %	25 %	383789348
2606	NC_017098	CAG	2	6	127835	127840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789348
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2609	NC_017098	CAC	2	6	127972	127977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789348
2610	NC_017098	CAG	3	9	127994	128002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789348
2611	NC_017098	AGCG	2	8	128003	128010	25 %	0 %	50 %	25 %	383789348
2612	NC_017098	AGG	2	6	128058	128063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789348
2613	NC_017098	TTGA	2	8	128102	128109	25 %	50 %	25 %	0 %	383789348
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2617	NC_017098	GTTT	2	8	128209	128216	0 %	75 %	25 %	0 %	383789349
2618	NC_017098	TGG	2	6	128225	128230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789349
2619	NC_017098	CGC	2	6	128237	128242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789349
2620	NC_017098	ACTGGC	2	12	128272	128283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383789349
2621	NC_017098	GCT	2	6	128297	128302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789349
2622	NC_017098	CGG	2	6	128305	128310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789349
2623	NC_017098	CTG	2	6	128360	128365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789349
2624	NC_017098	GAT	2	6	128380	128385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789349
2625	NC_017098	TGC	2	6	128409	128414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789349
2626	NC_017098	T	7	7	128452	128458	0 %	100 %	0 %	0 %	383789349
2627	NC_017098	TGA	2	6	128461	128466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789349
2628	NC_017098	CTG	3	9	128504	128512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789349
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2630	NC_017098	GCT	4	12	128524	128535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789349
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2632	NC_017098	TGG	2	6	128727	128732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789349
2633	NC_017098	GCTG	2	8	128737	128744	0 %	25 %	50 %	25 %	383789349
2634	NC_017098	ATT	2	6	128906	128911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789349
2635	NC_017098	GGT	2	6	128938	128943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789349
2636	NC_017098	GCG	2	6	129017	129022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789349
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2645	NC_017098	TGC	2	6	129559	129564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789349
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2652	NC_017098	TACGG	2	10	129937	129946	20 %	20 %	40 %	20 %	383789349
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2733	NC_017098	GCT	2	6	134736	134741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789355
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2736	NC_017098	CGAT	2	8	134934	134941	25 %	25 %	25 %	25 %	383789355
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2739	NC_017098	GT	3	6	135072	135077	0 %	50 %	50 %	0 %	383789355
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2982	NC_017098	CTG	2	6	146822	146827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789362
2983	NC_017098	TCG	2	6	146856	146861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789362
2984	NC_017098	CGG	2	6	146896	146901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789362
2985	NC_017098	CG	3	6	146971	146976	0 %	0 %	50 %	50 %	383789362
2986	NC_017098	CAG	2	6	146990	146995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789362
2987	NC_017098	GTG	2	6	147048	147053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789362
2988	NC_017098	GCTG	2	8	147080	147087	0 %	25 %	50 %	25 %	383789362
2989	NC_017098	CCA	2	6	147130	147135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789362
2990	NC_017098	GGTCGG	2	12	147268	147279	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383789362
2991	NC_017098	GTC	2	6	147326	147331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789362
2992	NC_017098	G	6	6	147343	147348	0 %	0 %	100 %	0 %	383789362
2993	NC_017098	AGGCG	2	10	147386	147395	20 %	0 %	60 %	20 %	383789362
2994	NC_017098	CAG	3	9	147416	147424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789362
2995	NC_017098	CG	3	6	147454	147459	0 %	0 %	50 %	50 %	383789362
2996	NC_017098	GC	4	8	147466	147473	0 %	0 %	50 %	50 %	383789362
2997	NC_017098	A	6	6	147488	147493	100 %	0 %	0 %	0 %	383789362
2998	NC_017098	GCT	2	6	147704	147709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789363
2999	NC_017098	GCG	2	6	147717	147722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789363
3000	NC_017098	GTG	2	6	147723	147728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789363

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