MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 65185

< Previous12...119120121122123124125126127128129130131Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_017098	GCA	2	6	3275499	3275504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65002	NC_017098	CTG	2	6	3275564	3275569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65003	NC_017098	CTGA	2	8	3275593	3275600	25 %	25 %	25 %	25 %	383792019
65004	NC_017098	TGC	2	6	3275610	3275615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65005	NC_017098	CTG	2	6	3275629	3275634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65006	NC_017098	TGAG	2	8	3275654	3275661	25 %	25 %	50 %	0 %	383792019
65007	NC_017098	CTGTTG	2	12	3275663	3275674	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383792019
65008	NC_017098	CCG	2	6	3275689	3275694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792019
65009	NC_017098	CTG	2	6	3275696	3275701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65010	NC_017098	TGC	2	6	3275706	3275711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65011	NC_017098	CTGG	2	8	3275733	3275740	0 %	25 %	50 %	25 %	383792019
65012	NC_017098	CGC	2	6	3275801	3275806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792019
65013	NC_017098	CTG	2	6	3275858	3275863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65014	NC_017098	CGGCG	2	10	3275881	3275890	0 %	0 %	60 %	40 %	383792019
65015	NC_017098	CAG	2	6	3275912	3275917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65016	NC_017098	TA	3	6	3275930	3275935	50 %	50 %	0 %	0 %	383792019
65017	NC_017098	GAC	2	6	3275944	3275949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65018	NC_017098	GCC	2	6	3276004	3276009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792019
65019	NC_017098	CAG	3	9	3276020	3276028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65020	NC_017098	GCTC	2	8	3276052	3276059	0 %	25 %	25 %	50 %	383792019
65021	NC_017098	GCA	4	12	3276133	3276144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65022	NC_017098	CCA	2	6	3276286	3276291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792019
65023	NC_017098	CCT	2	6	3276391	3276396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792019
65024	NC_017098	GCA	2	6	3276466	3276471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65025	NC_017098	GCT	2	6	3276472	3276477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65026	NC_017098	GGT	2	6	3276548	3276553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383792019
65027	NC_017098	AGG	2	6	3276575	3276580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383792019
65028	NC_017098	CTC	2	6	3276584	3276589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792019
65029	NC_017098	TCG	2	6	3276639	3276644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792019
65030	NC_017098	TCGATC	2	12	3276738	3276749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383792019
65031	NC_017098	GC	4	8	3276834	3276841	0 %	0 %	50 %	50 %	383792019
65032	NC_017098	CG	3	6	3276874	3276879	0 %	0 %	50 %	50 %	383792019
65033	NC_017098	CAA	3	9	3276940	3276948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383792019
65034	NC_017098	GTC	2	6	3277769	3277774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65035	NC_017098	CTC	2	6	3277856	3277861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792020
65036	NC_017098	TCA	2	6	3277870	3277875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792020
65037	NC_017098	CGC	2	6	3277909	3277914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792020
65038	NC_017098	G	8	8	3277950	3277957	0 %	0 %	100 %	0 %	383792020
65039	NC_017098	CGC	2	6	3277961	3277966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792020
65040	NC_017098	CTC	2	6	3277985	3277990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792020
65041	NC_017098	CGAG	2	8	3277995	3278002	25 %	0 %	50 %	25 %	383792020
65042	NC_017098	ATG	2	6	3278037	3278042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792020
65043	NC_017098	GCT	2	6	3278053	3278058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65044	NC_017098	CTG	2	6	3278132	3278137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65045	NC_017098	CCT	2	6	3278263	3278268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792020
65046	NC_017098	TCG	2	6	3278393	3278398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65047	NC_017098	GCT	2	6	3278431	3278436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65048	NC_017098	CAG	2	6	3278444	3278449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65049	NC_017098	GCT	2	6	3278524	3278529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65050	NC_017098	CAGC	2	8	3278548	3278555	25 %	0 %	25 %	50 %	383792020
65051	NC_017098	CTC	2	6	3278588	3278593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792020
65052	NC_017098	GCA	2	6	3278608	3278613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792020
65053	NC_017098	TTG	2	6	3278713	3278718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383792021
65054	NC_017098	AAT	2	6	3278766	3278771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383792021
65055	NC_017098	TGC	2	6	3278786	3278791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792021
65056	NC_017098	CAC	2	6	3278814	3278819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792021
65057	NC_017098	CTG	2	6	3278820	3278825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792021
65058	NC_017098	A	6	6	3278856	3278861	100 %	0 %	0 %	0 %	383792021
65059	NC_017098	AATA	2	8	3278967	3278974	75 %	25 %	0 %	0 %	383792021
65060	NC_017098	CAAT	2	8	3279028	3279035	50 %	25 %	0 %	25 %	383792021
65061	NC_017098	ATAGTC	2	12	3279042	3279053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383792021
65062	NC_017098	GTG	2	6	3279062	3279067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383792021
65063	NC_017098	GCT	2	6	3279098	3279103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792021
65064	NC_017098	CCA	2	6	3279107	3279112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792021
65065	NC_017098	GGT	2	6	3279141	3279146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383792021
65066	NC_017098	GTC	2	6	3279175	3279180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792021
65067	NC_017098	CAG	2	6	3279213	3279218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792021
65068	NC_017098	CACTG	2	10	3279336	3279345	20 %	20 %	20 %	40 %	383792021
65069	NC_017098	GCT	2	6	3279560	3279565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65070	NC_017098	CGA	2	6	3279697	3279702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65071	NC_017098	TAA	2	6	3279904	3279909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383792022
65072	NC_017098	GGA	2	6	3279919	3279924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383792022
65073	NC_017098	GCA	2	6	3279959	3279964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65074	NC_017098	CTG	2	6	3279992	3279997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65075	NC_017098	GCA	2	6	3280008	3280013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65076	NC_017098	GAT	2	6	3280030	3280035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792022
65077	NC_017098	ATC	2	6	3280076	3280081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792022
65078	NC_017098	TCC	2	6	3280114	3280119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792022
65079	NC_017098	CAG	2	6	3280205	3280210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65080	NC_017098	TCGA	2	8	3280220	3280227	25 %	25 %	25 %	25 %	383792022
65081	NC_017098	TGCA	2	8	3280233	3280240	25 %	25 %	25 %	25 %	383792022
65082	NC_017098	CAG	2	6	3280286	3280291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65083	NC_017098	CGA	2	6	3280423	3280428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65084	NC_017098	TA	3	6	3280463	3280468	50 %	50 %	0 %	0 %	383792022
65085	NC_017098	A	6	6	3280557	3280562	100 %	0 %	0 %	0 %	383792022
65086	NC_017098	TGC	2	6	3280569	3280574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792022
65087	NC_017098	CAC	2	6	3280606	3280611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792022
65088	NC_017098	AAT	3	9	3280658	3280666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383792023
65089	NC_017098	GCC	2	6	3280667	3280672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792023
65090	NC_017098	GGTC	2	8	3280681	3280688	0 %	25 %	50 %	25 %	383792023
65091	NC_017098	TC	3	6	3280771	3280776	0 %	50 %	0 %	50 %	383792023
65092	NC_017098	CAG	2	6	3280829	3280834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792023
65093	NC_017098	CCG	2	6	3280920	3280925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792023
65094	NC_017098	GCC	2	6	3280940	3280945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792023
65095	NC_017098	CCAG	2	8	3280989	3280996	25 %	0 %	25 %	50 %	383792023
65096	NC_017098	CAT	2	6	3281038	3281043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792023
65097	NC_017098	GCC	2	6	3281072	3281077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792023
65098	NC_017098	ACGCA	2	10	3281123	3281132	40 %	0 %	20 %	40 %	383792023
65099	NC_017098	TTC	2	6	3281159	3281164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383792023
65100	NC_017098	T	6	6	3281195	3281200	0 %	100 %	0 %	0 %	383792023
65101	NC_017098	ATC	2	6	3281370	3281375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792024
65102	NC_017098	GCA	2	6	3281449	3281454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65103	NC_017098	TGG	2	6	3281500	3281505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383792024
65104	NC_017098	ACC	2	6	3281551	3281556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792024
65105	NC_017098	CCG	2	6	3281593	3281598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792024
65106	NC_017098	ATC	2	6	3281682	3281687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792024
65107	NC_017098	ACC	2	6	3281689	3281694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792024
65108	NC_017098	CACG	2	8	3281735	3281742	25 %	0 %	25 %	50 %	383792024
65109	NC_017098	CTGG	2	8	3281745	3281752	0 %	25 %	50 %	25 %	383792024
65110	NC_017098	ATCAGC	2	12	3281812	3281823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383792024
65111	NC_017098	GCA	2	6	3281921	3281926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65112	NC_017098	CTT	2	6	3281931	3281936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383792024
65113	NC_017098	CG	3	6	3281947	3281952	0 %	0 %	50 %	50 %	383792024
65114	NC_017098	CG	3	6	3282056	3282061	0 %	0 %	50 %	50 %	383792024
65115	NC_017098	TAG	2	6	3282100	3282105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792024
65116	NC_017098	GCT	2	6	3282117	3282122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65117	NC_017098	TGAT	2	8	3282163	3282170	25 %	50 %	25 %	0 %	383792024
65118	NC_017098	TGC	2	6	3282191	3282196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65119	NC_017098	GTC	2	6	3282220	3282225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65120	NC_017098	CGG	2	6	3282271	3282276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383792024
65121	NC_017098	CAC	2	6	3282285	3282290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792024
65122	NC_017098	ATC	2	6	3282363	3282368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792024
65123	NC_017098	TG	3	6	3282422	3282427	0 %	50 %	50 %	0 %	383792024
65124	NC_017098	CAG	2	6	3282435	3282440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65125	NC_017098	TCC	2	6	3282472	3282477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792024
65126	NC_017098	TAT	2	6	3282486	3282491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383792024
65127	NC_017098	CTT	2	6	3282492	3282497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383792024
65128	NC_017098	GAT	2	6	3282607	3282612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792024
65129	NC_017098	TGT	2	6	3282641	3282646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383792024
65130	NC_017098	CTC	2	6	3282684	3282689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792024
65131	NC_017098	CCT	2	6	3282728	3282733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383792024
65132	NC_017098	CGA	2	6	3282752	3282757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65133	NC_017098	CCAGGG	2	12	3282797	3282808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383792024
65134	NC_017098	CTT	2	6	3282882	3282887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383792024
65135	NC_017098	ATT	2	6	3282892	3282897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383792024
65136	NC_017098	AAT	2	6	3283026	3283031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383792024
65137	NC_017098	TCG	2	6	3283057	3283062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65138	NC_017098	GAT	2	6	3283137	3283142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792024
65139	NC_017098	ACC	2	6	3283143	3283148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792024
65140	NC_017098	TGC	2	6	3283174	3283179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65141	NC_017098	CGT	2	6	3283199	3283204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65142	NC_017098	TAT	2	6	3283205	3283210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383792024
65143	NC_017098	GTTG	2	8	3283263	3283270	0 %	50 %	50 %	0 %	383792024
65144	NC_017098	ACCG	2	8	3283275	3283282	25 %	0 %	25 %	50 %	383792024
65145	NC_017098	CAG	2	6	3283305	3283310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65146	NC_017098	T	7	7	3283386	3283392	0 %	100 %	0 %	0 %	383792024
65147	NC_017098	GCA	2	6	3283400	3283405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792024
65148	NC_017098	GGC	2	6	3283449	3283454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383792024
65149	NC_017098	CGG	2	6	3283455	3283460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383792024
65150	NC_017098	TAC	2	6	3283497	3283502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792024
65151	NC_017098	GCG	2	6	3283665	3283670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383792024
65152	NC_017098	CAT	2	6	3283945	3283950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792025
65153	NC_017098	ATA	2	6	3283965	3283970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383792025
65154	NC_017098	GGC	2	6	3284154	3284159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383792025
65155	NC_017098	CAG	3	9	3284219	3284227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65156	NC_017098	ATG	3	9	3284265	3284273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792025
65157	NC_017098	GCCG	2	8	3284312	3284319	0 %	0 %	50 %	50 %	383792025
65158	NC_017098	GAT	2	6	3284336	3284341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792025
65159	NC_017098	CAA	2	6	3284479	3284484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383792025
65160	NC_017098	CGCT	2	8	3284511	3284518	0 %	25 %	25 %	50 %	383792025
65161	NC_017098	CAGC	2	8	3284524	3284531	25 %	0 %	25 %	50 %	383792025
65162	NC_017098	TGC	2	6	3284594	3284599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65163	NC_017098	CAT	2	6	3284618	3284623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792025
65164	NC_017098	GAT	2	6	3284633	3284638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792025
65165	NC_017098	CCA	2	6	3284644	3284649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792025
65166	NC_017098	A	6	6	3284667	3284672	100 %	0 %	0 %	0 %	383792025
65167	NC_017098	CGA	2	6	3284701	3284706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65168	NC_017098	ACC	2	6	3284781	3284786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792025
65169	NC_017098	CAT	2	6	3284806	3284811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792025
65170	NC_017098	GCC	2	6	3284886	3284891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383792025
65171	NC_017098	ACCA	2	8	3284897	3284904	50 %	0 %	0 %	50 %	383792025
65172	NC_017098	ACC	2	6	3284912	3284917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792025
65173	NC_017098	CAT	2	6	3285001	3285006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383792025
65174	NC_017098	CGG	2	6	3285029	3285034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383792025
65175	NC_017098	TGC	2	6	3285052	3285057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65176	NC_017098	TGC	2	6	3285108	3285113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65177	NC_017098	GTC	2	6	3285233	3285238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65178	NC_017098	CAC	2	6	3285251	3285256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792025
65179	NC_017098	AGT	2	6	3285272	3285277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792025
65180	NC_017098	TGA	2	6	3285345	3285350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383792025
65181	NC_017098	ACC	2	6	3285410	3285415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792025
65182	NC_017098	TCG	2	6	3285603	3285608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383792025
65183	NC_017098	TGT	2	6	3285613	3285618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383792025
65184	NC_017098	CCA	2	6	3285619	3285624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383792025
65185	NC_017098	GTT	2	6	3285737	3285742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383792025

< Previous12...119120121122123124125126127128129130131Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.