MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 65185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017098	CTG	2	6	217117	217122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789418
4502	NC_017098	GCG	2	6	217210	217215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789418
4503	NC_017098	TCTG	2	8	217247	217254	0 %	50 %	25 %	25 %	383789418
4504	NC_017098	CTG	2	6	217260	217265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789418
4505	NC_017098	TGG	2	6	217284	217289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789418
4506	NC_017098	CTG	2	6	217304	217309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789418
4507	NC_017098	TCT	2	6	217356	217361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789418
4508	NC_017098	GCG	2	6	217405	217410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789418
4509	NC_017098	GCA	2	6	217431	217436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789418
4510	NC_017098	GCC	2	6	217658	217663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789419
4511	NC_017098	GGTC	2	8	217678	217685	0 %	25 %	50 %	25 %	383789419
4512	NC_017098	GCC	2	6	217723	217728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789419
4513	NC_017098	CTG	2	6	217744	217749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789419
4514	NC_017098	AG	4	8	217762	217769	50 %	0 %	50 %	0 %	383789419
4515	NC_017098	GC	3	6	217827	217832	0 %	0 %	50 %	50 %	383789419
4516	NC_017098	ACC	2	6	217836	217841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789419
4517	NC_017098	TCC	2	6	217860	217865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789419
4518	NC_017098	GTCAT	2	10	217875	217884	20 %	40 %	20 %	20 %	383789419
4519	NC_017098	TGG	2	6	217885	217890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789419
4520	NC_017098	CAG	2	6	217898	217903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789419
4521	NC_017098	GCC	2	6	217943	217948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789419
4522	NC_017098	GCAG	2	8	217951	217958	25 %	0 %	50 %	25 %	383789419
4523	NC_017098	TGC	2	6	218041	218046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789419
4524	NC_017098	GGT	2	6	218047	218052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789419
4525	NC_017098	GGCG	2	8	218080	218087	0 %	0 %	75 %	25 %	383789419
4526	NC_017098	GCA	2	6	218089	218094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789419
4527	NC_017098	GGC	2	6	218141	218146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789419
4528	NC_017098	TGA	2	6	218167	218172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789419
4529	NC_017098	TCC	2	6	218243	218248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789419
4530	NC_017098	TGGC	2	8	218274	218281	0 %	25 %	50 %	25 %	383789419
4531	NC_017098	GCG	2	6	218286	218291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789419
4532	NC_017098	CGG	2	6	218305	218310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789419
4533	NC_017098	GCT	2	6	218312	218317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789419
4534	NC_017098	CGG	2	6	218341	218346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789419
4535	NC_017098	GGTG	2	8	218347	218354	0 %	25 %	75 %	0 %	383789419
4536	NC_017098	ATG	2	6	218472	218477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789419
4537	NC_017098	GCCA	2	8	218520	218527	25 %	0 %	25 %	50 %	383789419
4538	NC_017098	GCC	2	6	218619	218624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789419
4539	NC_017098	TC	3	6	218680	218685	0 %	50 %	0 %	50 %	383789419
4540	NC_017098	TGC	2	6	218749	218754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789419
4541	NC_017098	GC	3	6	218787	218792	0 %	0 %	50 %	50 %	383789419
4542	NC_017098	AAT	2	6	218797	218802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383789419
4543	NC_017098	GGC	3	9	218831	218839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789419
4544	NC_017098	GCA	2	6	218981	218986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4545	NC_017098	GGT	2	6	218998	219003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789420
4546	NC_017098	GCC	2	6	219053	219058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789420
4547	NC_017098	TCC	2	6	219101	219106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789420
4548	NC_017098	AAG	2	6	219182	219187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789420
4549	NC_017098	CCG	2	6	219245	219250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789420
4550	NC_017098	GAT	2	6	219268	219273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789420
4551	NC_017098	GCA	2	6	219291	219296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4552	NC_017098	G	7	7	219349	219355	0 %	0 %	100 %	0 %	383789420
4553	NC_017098	GGT	2	6	219409	219414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789420
4554	NC_017098	T	6	6	219476	219481	0 %	100 %	0 %	0 %	383789420
4555	NC_017098	CT	3	6	219484	219489	0 %	50 %	0 %	50 %	383789420
4556	NC_017098	GTTCA	2	10	219532	219541	20 %	40 %	20 %	20 %	383789420
4557	NC_017098	CAT	2	6	219559	219564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789420
4558	NC_017098	AGC	2	6	219585	219590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4559	NC_017098	ATC	2	6	219656	219661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789420
4560	NC_017098	CGG	2	6	219672	219677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789420
4561	NC_017098	GCA	2	6	219687	219692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4562	NC_017098	CGC	2	6	219705	219710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789420
4563	NC_017098	GCG	2	6	219725	219730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789420
4564	NC_017098	GCG	2	6	219773	219778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789420
4565	NC_017098	CAG	2	6	219889	219894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4566	NC_017098	GGT	2	6	219910	219915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789420
4567	NC_017098	A	6	6	219943	219948	100 %	0 %	0 %	0 %	383789420
4568	NC_017098	TCGT	2	8	219958	219965	0 %	50 %	25 %	25 %	383789420
4569	NC_017098	GTGC	2	8	220067	220074	0 %	25 %	50 %	25 %	383789420
4570	NC_017098	TCC	2	6	220088	220093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789420
4571	NC_017098	GAT	2	6	220207	220212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789420
4572	NC_017098	GGC	2	6	220224	220229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789420
4573	NC_017098	CTC	2	6	220273	220278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789420
4574	NC_017098	GTC	2	6	220294	220299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4575	NC_017098	TGC	2	6	220311	220316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789420
4576	NC_017098	TTA	2	6	220403	220408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789421
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4578	NC_017098	ACCA	2	8	220431	220438	50 %	0 %	0 %	50 %	383789421
4579	NC_017098	GCA	2	6	220447	220452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789421
4580	NC_017098	CGG	2	6	220460	220465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789421
4581	NC_017098	CAT	2	6	220509	220514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789421
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4583	NC_017098	ATA	2	6	220786	220791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383789421
4584	NC_017098	AGT	2	6	220823	220828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789421
4585	NC_017098	ATC	2	6	220857	220862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789421
4586	NC_017098	AAT	2	6	220863	220868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383789421
4587	NC_017098	GCT	2	6	220895	220900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789421
4588	NC_017098	GC	3	6	221014	221019	0 %	0 %	50 %	50 %	383789421
4589	NC_017098	GCGGCA	2	12	221102	221113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383789421
4590	NC_017098	GCGTG	2	10	221298	221307	0 %	20 %	60 %	20 %	383789421
4591	NC_017098	GCT	2	6	221325	221330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789421
4592	NC_017098	GGT	2	6	221349	221354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789421
4593	NC_017098	GTT	2	6	221424	221429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789421
4594	NC_017098	A	7	7	221460	221466	100 %	0 %	0 %	0 %	383789421
4595	NC_017098	TGC	2	6	221566	221571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789421
4596	NC_017098	GCA	2	6	221759	221764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4597	NC_017098	GCT	2	6	221773	221778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4598	NC_017098	GCAG	2	8	221779	221786	25 %	0 %	50 %	25 %	383789422
4599	NC_017098	TCG	2	6	221791	221796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4600	NC_017098	ACTGC	2	10	221845	221854	20 %	20 %	20 %	40 %	383789422
4601	NC_017098	GTA	2	6	221889	221894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789422
4602	NC_017098	GGCG	2	8	221975	221982	0 %	0 %	75 %	25 %	383789422
4603	NC_017098	GAT	2	6	222026	222031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789422
4604	NC_017098	ACC	2	6	222037	222042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789422
4605	NC_017098	GGT	2	6	222045	222050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789422
4606	NC_017098	GGCAGC	2	12	222060	222071	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383789422
4607	NC_017098	TGC	2	6	222134	222139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4608	NC_017098	AGG	2	6	222191	222196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789422
4609	NC_017098	TGC	2	6	222247	222252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4610	NC_017098	GGCT	2	8	222304	222311	0 %	25 %	50 %	25 %	383789422
4611	NC_017098	TGGC	2	8	222404	222411	0 %	25 %	50 %	25 %	383789422
4612	NC_017098	CTC	2	6	222489	222494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789422
4613	NC_017098	GCT	2	6	222530	222535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4614	NC_017098	AGG	2	6	222554	222559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789422
4615	NC_017098	GCG	2	6	222574	222579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789422
4616	NC_017098	CGT	2	6	222587	222592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
4617	NC_017098	CGCA	2	8	222596	222603	25 %	0 %	25 %	50 %	383789422
4618	NC_017098	TGCA	2	8	222604	222611	25 %	25 %	25 %	25 %	383789422
4619	NC_017098	GC	3	6	222676	222681	0 %	0 %	50 %	50 %	383789422
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4621	NC_017098	GCT	2	6	222765	222770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789422
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4623	NC_017098	CTG	2	6	223042	223047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789423
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4630	NC_017098	TG	3	6	223397	223402	0 %	50 %	50 %	0 %	383789423
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4653	NC_017098	GGA	2	6	224810	224815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789424
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4743	NC_017098	TGC	2	6	228250	228255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789428
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4764	NC_017098	TGA	2	6	229278	229283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789429
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4778	NC_017098	GCGG	2	8	230023	230030	0 %	0 %	75 %	25 %	383789430
4779	NC_017098	GACC	2	8	230060	230067	25 %	0 %	25 %	50 %	383789430
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4783	NC_017098	TACCG	2	10	230268	230277	20 %	20 %	20 %	40 %	383789430
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4863	NC_017098	TTG	2	6	234736	234741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789433
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4981	NC_017098	CAGCG	2	10	240879	240888	20 %	0 %	40 %	40 %	383789438
4982	NC_017098	GCA	2	6	240893	240898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789438
4983	NC_017098	CAG	2	6	240929	240934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789438
4984	NC_017098	GGT	2	6	240944	240949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789438
4985	NC_017098	ATG	2	6	241137	241142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789439
4986	NC_017098	GGC	2	6	241161	241166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789439
4987	NC_017098	TTC	2	6	241200	241205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789439
4988	NC_017098	CGC	2	6	241277	241282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789439
4989	NC_017098	CTC	2	6	241311	241316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789439
4990	NC_017098	TC	3	6	241440	241445	0 %	50 %	0 %	50 %	383789439
4991	NC_017098	AGC	2	6	241519	241524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789439
4992	NC_017098	CAG	2	6	241602	241607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789439
4993	NC_017098	ACC	2	6	241621	241626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789439
4994	NC_017098	GCA	2	6	241643	241648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789439
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4996	NC_017098	GAT	2	6	241695	241700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789439
4997	NC_017098	CGA	2	6	241745	241750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789439
4998	NC_017098	GCA	3	9	241787	241795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789439
4999	NC_017098	CCT	2	6	241853	241858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789439
5000	NC_017098	TCC	2	6	241885	241890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789439

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