MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 5148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	TAAC	2	8	11	18	50 %	25 %	0 %	25 %	383760689
2	NC_017078	CAC	3	9	30	38	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760689
3	NC_017078	AAAG	2	8	81	88	75 %	0 %	25 %	0 %	383760689
4	NC_017078	TGA	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
5	NC_017078	AGG	2	6	140	145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760689
6	NC_017078	AAG	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
7	NC_017078	CAA	3	9	198	206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
8	NC_017078	GCG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760689
9	NC_017078	AAC	2	6	222	227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
10	NC_017078	AGC	2	6	234	239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
11	NC_017078	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760689
12	NC_017078	AAG	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
13	NC_017078	TGA	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
14	NC_017078	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760689
15	NC_017078	ACT	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
16	NC_017078	GGT	2	6	526	531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760689
17	NC_017078	ATC	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
18	NC_017078	CAT	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
19	NC_017078	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
20	NC_017078	AAC	2	6	625	630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
21	NC_017078	TCA	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
22	NC_017078	CAC	2	6	732	737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760689
23	NC_017078	AGC	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
24	NC_017078	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760689
25	NC_017078	TCA	2	6	887	892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
26	NC_017078	CCTG	2	8	931	938	0 %	25 %	25 %	50 %	383760689
27	NC_017078	AT	3	6	954	959	50 %	50 %	0 %	0 %	383760689
28	NC_017078	TGA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
29	NC_017078	GGT	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760689
30	NC_017078	AGC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
31	NC_017078	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760690
32	NC_017078	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760690
33	NC_017078	A	6	6	1045	1050	100 %	0 %	0 %	0 %	383760690
34	NC_017078	TCC	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760690
35	NC_017078	GAA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
36	NC_017078	GGC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760690
37	NC_017078	AGC	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
38	NC_017078	CAG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
39	NC_017078	GCC	2	6	1413	1418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760690
40	NC_017078	TGACC	2	10	1471	1480	20 %	20 %	20 %	40 %	383760690
41	NC_017078	AAG	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
42	NC_017078	AGC	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
43	NC_017078	CGG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760690
44	NC_017078	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	383760690
45	NC_017078	GCC	2	6	1802	1807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760690
46	NC_017078	ATG	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760690
47	NC_017078	TCA	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760690
48	NC_017078	GCCA	2	8	1934	1941	25 %	0 %	25 %	50 %	383760690
49	NC_017078	GAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
50	NC_017078	CCAT	2	8	2010	2017	25 %	25 %	0 %	50 %	383760690
51	NC_017078	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760690
52	NC_017078	CAA	2	6	2092	2097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760690
53	NC_017078	TCA	2	6	2109	2114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760690
54	NC_017078	GAAACC	2	12	2126	2137	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383760690
55	NC_017078	TA	6	12	2945	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	383760691
56	NC_017078	ATGAA	2	10	3080	3089	60 %	20 %	20 %	0 %	383760691
57	NC_017078	AATAT	2	10	3155	3164	60 %	40 %	0 %	0 %	383760691
58	NC_017078	TCAACA	2	12	3185	3196	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383760691
59	NC_017078	CAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
60	NC_017078	ATCA	2	8	3367	3374	50 %	25 %	0 %	25 %	383760691
61	NC_017078	TGG	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760691
62	NC_017078	ATCG	2	8	3520	3527	25 %	25 %	25 %	25 %	383760691
63	NC_017078	A	6	6	3598	3603	100 %	0 %	0 %	0 %	383760691
64	NC_017078	CAG	2	6	3610	3615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
65	NC_017078	AGC	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
66	NC_017078	GTA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760691
67	NC_017078	ACT	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
68	NC_017078	CGA	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
69	NC_017078	TCC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760691
70	NC_017078	TCA	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
71	NC_017078	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760691
72	NC_017078	A	6	6	3910	3915	100 %	0 %	0 %	0 %	383760691
73	NC_017078	A	6	6	3967	3972	100 %	0 %	0 %	0 %	383760691
74	NC_017078	CGG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760691
75	NC_017078	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760691
76	NC_017078	GGA	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760691
77	NC_017078	AAT	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760691
78	NC_017078	GCT	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760691
79	NC_017078	GCT	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
80	NC_017078	GTG	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760692
81	NC_017078	CGG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760692
82	NC_017078	GATG	2	8	4726	4733	25 %	25 %	50 %	0 %	383760692
83	NC_017078	TGC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
84	NC_017078	GGA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760692
85	NC_017078	ATC	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760692
86	NC_017078	ATG	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760692
87	NC_017078	GAA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
88	NC_017078	AAGGC	2	10	5070	5079	40 %	0 %	40 %	20 %	383760692
89	NC_017078	GGC	2	6	5099	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760692
90	NC_017078	AAGGGC	2	12	5237	5248	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383760692
91	NC_017078	AGC	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
92	NC_017078	TGG	2	6	5316	5321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760692
93	NC_017078	GAA	2	6	5360	5365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
94	NC_017078	GCA	2	6	5380	5385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
95	NC_017078	GCA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
96	NC_017078	TGA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760692
97	NC_017078	CAGG	2	8	5558	5565	25 %	0 %	50 %	25 %	383760692
98	NC_017078	GATCA	2	10	5645	5654	40 %	20 %	20 %	20 %	383760692
99	NC_017078	CAAC	2	8	5695	5702	50 %	0 %	0 %	50 %	383760692
100	NC_017078	TGC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
101	NC_017078	GAA	3	9	5714	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
102	NC_017078	AAT	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760693
103	NC_017078	AGA	2	6	6031	6036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760693
104	NC_017078	ATC	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
105	NC_017078	G	6	6	6101	6106	0 %	0 %	100 %	0 %	383760693
106	NC_017078	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760693
107	NC_017078	A	6	6	6182	6187	100 %	0 %	0 %	0 %	383760693
108	NC_017078	TGT	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760693
109	NC_017078	TGA	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
110	NC_017078	GCA	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
111	NC_017078	TCG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
112	NC_017078	A	6	6	6475	6480	100 %	0 %	0 %	0 %	383760693
113	NC_017078	GTG	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760693
114	NC_017078	GAT	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
115	NC_017078	TCA	2	6	6580	6585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
116	NC_017078	AGC	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
117	NC_017078	CTG	2	6	6609	6614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
118	NC_017078	AGA	2	6	6674	6679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760693
119	NC_017078	TA	3	6	6733	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	383760693
120	NC_017078	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
121	NC_017078	GCTGGC	2	12	6761	6772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383760693
122	NC_017078	TCA	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
123	NC_017078	TGG	2	6	6880	6885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760693
124	NC_017078	TGG	2	6	6917	6922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760693
125	NC_017078	CCAT	2	8	7042	7049	25 %	25 %	0 %	50 %	383760693
126	NC_017078	GAG	2	6	7068	7073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760693
127	NC_017078	GCT	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
128	NC_017078	ACGG	2	8	7219	7226	25 %	0 %	50 %	25 %	383760693
129	NC_017078	GAT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
130	NC_017078	GAT	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
131	NC_017078	ATC	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
132	NC_017078	CAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
133	NC_017078	CAG	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
134	NC_017078	GAT	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
135	NC_017078	CAGC	2	8	7490	7497	25 %	0 %	25 %	50 %	383760693
136	NC_017078	TGC	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
137	NC_017078	GCA	3	9	7538	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
138	NC_017078	ATG	2	6	7585	7590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
139	NC_017078	GATG	2	8	7676	7683	25 %	25 %	50 %	0 %	383760693
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141	NC_017078	GGTGCT	2	12	7775	7786	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383760693
142	NC_017078	CTG	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
143	NC_017078	T	6	6	7964	7969	0 %	100 %	0 %	0 %	383760694
144	NC_017078	GACA	2	8	8065	8072	50 %	0 %	25 %	25 %	383760694
145	NC_017078	CTGA	2	8	8107	8114	25 %	25 %	25 %	25 %	383760694
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147	NC_017078	TGC	2	6	8313	8318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760694
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149	NC_017078	TGT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760694
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151	NC_017078	GCAG	2	8	8463	8470	25 %	0 %	50 %	25 %	383760694
152	NC_017078	CCT	2	6	8505	8510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760694
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158	NC_017078	TGC	2	6	8861	8866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760694
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162	NC_017078	A	8	8	9194	9201	100 %	0 %	0 %	0 %	383760695
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164	NC_017078	GTCC	2	8	9585	9592	0 %	25 %	25 %	50 %	383760696
165	NC_017078	GAA	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760696
166	NC_017078	GCC	2	6	9664	9669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760696
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255	NC_017078	ATGG	2	8	13997	14004	25 %	25 %	50 %	0 %	383760699
256	NC_017078	GAG	2	6	14090	14095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760699
257	NC_017078	A	6	6	14192	14197	100 %	0 %	0 %	0 %	383760699
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