MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC7

Total Repeats: 554

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017077	GTTCA	2	10	26307	26316	20 %	40 %	20 %	20 %	383760684
502	NC_017077	CTTT	2	8	26368	26375	0 %	75 %	0 %	25 %	383760684
503	NC_017077	TTG	2	6	26383	26388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760684
504	NC_017077	CTG	2	6	26457	26462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760684
505	NC_017077	TCT	2	6	26516	26521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760684
506	NC_017077	TGA	2	6	26600	26605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760684
507	NC_017077	CTT	2	6	26706	26711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760684
508	NC_017077	CTG	2	6	26727	26732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760684
509	NC_017077	ACGCTC	2	12	26739	26750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383760684
510	NC_017077	CAT	2	6	26786	26791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760684
511	NC_017077	GGC	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760684
512	NC_017077	TGC	2	6	26823	26828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760684
513	NC_017077	CCA	2	6	26842	26847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760684
514	NC_017077	TGC	2	6	26859	26864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760684
515	NC_017077	TTTC	2	8	26884	26891	0 %	75 %	0 %	25 %	383760684
516	NC_017077	TCAT	2	8	27121	27128	25 %	50 %	0 %	25 %	383760685
517	NC_017077	T	7	7	27247	27253	0 %	100 %	0 %	0 %	383760685
518	NC_017077	GCA	2	6	27347	27352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760685
519	NC_017077	TCCT	2	8	27353	27360	0 %	50 %	0 %	50 %	383760685
520	NC_017077	TGG	2	6	27373	27378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760685
521	NC_017077	CT	3	6	27385	27390	0 %	50 %	0 %	50 %	383760685
522	NC_017077	CCTG	2	8	27422	27429	0 %	25 %	25 %	50 %	383760685
523	NC_017077	CAG	2	6	27472	27477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760685
524	NC_017077	GCCT	2	8	27492	27499	0 %	25 %	25 %	50 %	383760685
525	NC_017077	CAG	2	6	27652	27657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760685
526	NC_017077	TCA	2	6	27713	27718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760685
527	NC_017077	TCCA	2	8	27724	27731	25 %	25 %	0 %	50 %	383760685
528	NC_017077	GCT	2	6	27735	27740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760685
529	NC_017077	GTT	2	6	27744	27749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760685
530	NC_017077	T	6	6	28128	28133	0 %	100 %	0 %	0 %	383760686
531	NC_017077	TCC	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760686
532	NC_017077	CTC	2	6	28232	28237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760686
533	NC_017077	T	7	7	28250	28256	0 %	100 %	0 %	0 %	383760686
534	NC_017077	CA	3	6	28275	28280	50 %	0 %	0 %	50 %	383760686
535	NC_017077	CAAC	2	8	28282	28289	50 %	0 %	0 %	50 %	383760686
536	NC_017077	GCC	2	6	28344	28349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760686
537	NC_017077	TAT	2	6	28408	28413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760686
538	NC_017077	CTT	2	6	28438	28443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760686
539	NC_017077	CAG	2	6	28516	28521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760686
540	NC_017077	ATC	2	6	28547	28552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760686
541	NC_017077	TTA	2	6	28671	28676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760686
542	NC_017077	CCTGC	2	10	28723	28732	0 %	20 %	20 %	60 %	383760686
543	NC_017077	GCT	2	6	28818	28823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760686
544	NC_017077	TTCTG	2	10	28866	28875	0 %	60 %	20 %	20 %	383760686
545	NC_017077	GAA	2	6	28903	28908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760686
546	NC_017077	ATT	2	6	28950	28955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760686
547	NC_017077	GCT	2	6	29005	29010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760686
548	NC_017077	TA	3	6	29012	29017	50 %	50 %	0 %	0 %	383760686
549	NC_017077	AT	3	6	29156	29161	50 %	50 %	0 %	0 %	383760687
550	NC_017077	CTTTTA	2	12	29163	29174	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383760687
551	NC_017077	T	7	7	29275	29281	0 %	100 %	0 %	0 %	383760687
552	NC_017077	CTA	2	6	29295	29300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760687
553	NC_017077	TTTTC	2	10	29340	29349	0 %	80 %	0 %	20 %	383760687
554	NC_017077	CTG	2	6	29478	29483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760687

< Previous 12Next >