MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 1111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017073	ATGT	2	8	33471	33478	25 %	50 %	25 %	0 %	383755788
502	NC_017073	CCT	2	6	33492	33497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755789
503	NC_017073	TCT	2	6	33636	33641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755789
504	NC_017073	CAG	2	6	33859	33864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755790
505	NC_017073	CAT	2	6	33918	33923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755790
506	NC_017073	AAC	2	6	33926	33931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755790
507	NC_017073	TAA	2	6	34011	34016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755790
508	NC_017073	CAGG	2	8	34077	34084	25 %	0 %	50 %	25 %	383755790
509	NC_017073	GTA	2	6	34244	34249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755790
510	NC_017073	CAA	2	6	34371	34376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755790
511	NC_017073	TTC	2	6	34424	34429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755790
512	NC_017073	GAA	2	6	34444	34449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755790
513	NC_017073	CG	3	6	34567	34572	0 %	0 %	50 %	50 %	383755790
514	NC_017073	CAA	2	6	34716	34721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755790
515	NC_017073	TCA	2	6	34964	34969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755791
516	NC_017073	CCA	2	6	34974	34979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755791
517	NC_017073	TCGCCC	2	12	35081	35092	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383755791
518	NC_017073	GCT	2	6	35102	35107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755791
519	NC_017073	CGT	2	6	35124	35129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755791
520	NC_017073	GCT	2	6	35259	35264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755791
521	NC_017073	TTTGCT	2	12	35345	35356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383755791
522	NC_017073	CACAAC	2	12	35415	35426	50 %	0 %	0 %	50 %	383755791
523	NC_017073	ATAA	2	8	35443	35450	75 %	25 %	0 %	0 %	383755791
524	NC_017073	CA	3	6	35555	35560	50 %	0 %	0 %	50 %	383755791
525	NC_017073	TCC	2	6	35645	35650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755791
526	NC_017073	ACC	2	6	35749	35754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755791
527	NC_017073	TAG	2	6	35902	35907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755792
528	NC_017073	CCA	2	6	35937	35942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
529	NC_017073	GTA	2	6	36065	36070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755792
530	NC_017073	CCA	2	6	36076	36081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
531	NC_017073	AT	3	6	36126	36131	50 %	50 %	0 %	0 %	383755792
532	NC_017073	GTT	2	6	36176	36181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755792
533	NC_017073	TCC	2	6	36189	36194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755792
534	NC_017073	ATC	2	6	36195	36200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755792
535	NC_017073	GACCA	2	10	36275	36284	40 %	0 %	20 %	40 %	383755792
536	NC_017073	TTC	2	6	36444	36449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755792
537	NC_017073	TC	3	6	36466	36471	0 %	50 %	0 %	50 %	383755792
538	NC_017073	GTT	2	6	36472	36477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755792
539	NC_017073	TGG	2	6	36526	36531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755792
540	NC_017073	CAT	2	6	36587	36592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755792
541	NC_017073	CTG	3	9	36683	36691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755792
542	NC_017073	ACC	2	6	36732	36737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
543	NC_017073	TCG	2	6	36745	36750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755792
544	NC_017073	CAT	2	6	36835	36840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755792
545	NC_017073	GAAC	2	8	36857	36864	50 %	0 %	25 %	25 %	383755792
546	NC_017073	TTTC	2	8	36926	36933	0 %	75 %	0 %	25 %	383755792
547	NC_017073	CCA	2	6	36939	36944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755792
548	NC_017073	TTA	2	6	37077	37082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755792
549	NC_017073	TTGC	2	8	37140	37147	0 %	50 %	25 %	25 %	383755792
550	NC_017073	T	6	6	37155	37160	0 %	100 %	0 %	0 %	383755792
551	NC_017073	A	7	7	37195	37201	100 %	0 %	0 %	0 %	383755793
552	NC_017073	TATTCA	2	12	37236	37247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383755793
553	NC_017073	TCC	2	6	37255	37260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755793
554	NC_017073	TGC	2	6	37269	37274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755793
555	NC_017073	TCA	2	6	37343	37348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755793
556	NC_017073	TCT	2	6	37386	37391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
557	NC_017073	CTGC	2	8	37506	37513	0 %	25 %	25 %	50 %	383755793
558	NC_017073	GAA	2	6	37535	37540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755793
559	NC_017073	A	7	7	37539	37545	100 %	0 %	0 %	0 %	383755793
560	NC_017073	ATA	2	6	37591	37596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755793
561	NC_017073	TCC	2	6	37631	37636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755793
562	NC_017073	ATA	2	6	37703	37708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755793
563	NC_017073	ACC	2	6	37732	37737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755793
564	NC_017073	CATA	2	8	37908	37915	50 %	25 %	0 %	25 %	383755793
565	NC_017073	TTC	2	6	37960	37965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
566	NC_017073	CAC	2	6	38010	38015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755793
567	NC_017073	AGG	2	6	38103	38108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755793
568	NC_017073	CAT	2	6	38118	38123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755793
569	NC_017073	AGC	2	6	38138	38143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755793
570	NC_017073	CAT	2	6	38145	38150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755793
571	NC_017073	AAG	2	6	38174	38179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755793
572	NC_017073	CATCA	2	10	38203	38212	40 %	20 %	0 %	40 %	383755793
573	NC_017073	CCG	2	6	38265	38270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755793
574	NC_017073	ATC	2	6	38401	38406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755793
575	NC_017073	TTC	2	6	38408	38413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
576	NC_017073	ATG	2	6	38471	38476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755793
577	NC_017073	AC	3	6	38540	38545	50 %	0 %	0 %	50 %	383755793
578	NC_017073	TTC	2	6	38617	38622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
579	NC_017073	TCT	2	6	38645	38650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755793
580	NC_017073	ATA	2	6	38713	38718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755793
581	NC_017073	ACC	2	6	38791	38796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755793
582	NC_017073	ACCA	2	8	39187	39194	50 %	0 %	0 %	50 %	383755794
583	NC_017073	ATTG	2	8	39253	39260	25 %	50 %	25 %	0 %	383755794
584	NC_017073	GAA	2	6	39263	39268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755794
585	NC_017073	CAT	2	6	39303	39308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755794
586	NC_017073	CAT	2	6	39501	39506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755794
587	NC_017073	GCT	2	6	39547	39552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755794
588	NC_017073	TCT	2	6	39594	39599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755794
589	NC_017073	CCA	2	6	39605	39610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755794
590	NC_017073	ATC	2	6	39626	39631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755794
591	NC_017073	TAT	2	6	39672	39677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755794
592	NC_017073	ACC	2	6	39714	39719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755794
593	NC_017073	TTTCT	2	10	39812	39821	0 %	80 %	0 %	20 %	383755795
594	NC_017073	TGACG	2	10	39878	39887	20 %	20 %	40 %	20 %	383755795
595	NC_017073	TTC	2	6	39903	39908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755795
596	NC_017073	TTC	2	6	40004	40009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755796
597	NC_017073	GAA	2	6	40036	40041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755796
598	NC_017073	TGA	2	6	40048	40053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755796
599	NC_017073	GGA	2	6	40115	40120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755796
600	NC_017073	TTG	2	6	40127	40132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755796
601	NC_017073	GTT	2	6	40250	40255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755796
602	NC_017073	ACC	2	6	40296	40301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755796
603	NC_017073	CAC	2	6	40350	40355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755796
604	NC_017073	CA	3	6	40471	40476	50 %	0 %	0 %	50 %	383755796
605	NC_017073	GGT	2	6	40545	40550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755796
606	NC_017073	GAT	2	6	40558	40563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755796
607	NC_017073	CTT	2	6	41016	41021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755797
608	NC_017073	T	6	6	41020	41025	0 %	100 %	0 %	0 %	383755797
609	NC_017073	GTATCC	2	12	41154	41165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383755797
610	NC_017073	GTG	2	6	41166	41171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755797
611	NC_017073	CCAA	2	8	41178	41185	50 %	0 %	0 %	50 %	383755797
612	NC_017073	ATC	2	6	41190	41195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755797
613	NC_017073	A	7	7	43053	43059	100 %	0 %	0 %	0 %	383755798
614	NC_017073	TGA	3	9	43076	43084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755798
615	NC_017073	AAGC	2	8	43117	43124	50 %	0 %	25 %	25 %	383755798
616	NC_017073	ATG	2	6	43180	43185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755798
617	NC_017073	AGC	2	6	43289	43294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755798
618	NC_017073	AGA	2	6	43319	43324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755798
619	NC_017073	GAACCG	2	12	43332	43343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755798
620	NC_017073	AACC	2	8	43357	43364	50 %	0 %	0 %	50 %	383755798
621	NC_017073	CGT	2	6	43404	43409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755798
622	NC_017073	TAA	2	6	43448	43453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755798
623	NC_017073	A	6	6	43548	43553	100 %	0 %	0 %	0 %	383755798
624	NC_017073	AAT	2	6	43677	43682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755799
625	NC_017073	AAC	2	6	43683	43688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755799
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