MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	TGA	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080677
2	NC_017070	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080677
3	NC_017070	GAC	2	6	62	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080677
4	NC_017070	AAAG	2	8	195	202	75 %	0 %	25 %	0 %	383080677
5	NC_017070	AAC	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080677
6	NC_017070	TTCA	2	8	446	453	25 %	50 %	0 %	25 %	383080677
7	NC_017070	ATT	2	6	468	473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080677
8	NC_017070	ATG	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080677
9	NC_017070	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080677
10	NC_017070	AGA	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080677
11	NC_017070	AATAT	2	10	647	656	60 %	40 %	0 %	0 %	383080677
12	NC_017070	ATA	2	6	688	693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080677
13	NC_017070	ATTT	2	8	696	703	25 %	75 %	0 %	0 %	383080677
14	NC_017070	T	6	6	701	706	0 %	100 %	0 %	0 %	383080677
15	NC_017070	GCCA	2	8	730	737	25 %	0 %	25 %	50 %	383080677
16	NC_017070	AAAGG	2	10	780	789	60 %	0 %	40 %	0 %	383080677
17	NC_017070	AAC	2	6	822	827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080677
18	NC_017070	A	6	6	854	859	100 %	0 %	0 %	0 %	383080677
19	NC_017070	ACA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080677
20	NC_017070	AATG	2	8	1009	1016	50 %	25 %	25 %	0 %	383080677
21	NC_017070	GTT	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080677
22	NC_017070	TGG	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080677
23	NC_017070	GAAG	2	8	1068	1075	50 %	0 %	50 %	0 %	383080677
24	NC_017070	AAAAT	2	10	1094	1103	80 %	20 %	0 %	0 %	383080677
25	NC_017070	AGA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080677
26	NC_017070	GTA	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080678
27	NC_017070	GGC	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080678
28	NC_017070	GAC	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080678
29	NC_017070	GCA	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080678
30	NC_017070	ATGG	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	383080678
31	NC_017070	TCT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080678
32	NC_017070	A	7	7	1597	1603	100 %	0 %	0 %	0 %	383080678
33	NC_017070	ATT	2	6	1788	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080678
34	NC_017070	TTA	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080678
35	NC_017070	TGG	2	6	1834	1839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080678
36	NC_017070	TAA	2	6	1852	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080678
37	NC_017070	AT	3	6	1993	1998	50 %	50 %	0 %	0 %	383080678
38	NC_017070	TA	4	8	2114	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	383080678
39	NC_017070	GGAA	2	8	2180	2187	50 %	0 %	50 %	0 %	383080678
40	NC_017070	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080678
41	NC_017070	TGAT	2	8	2225	2232	25 %	50 %	25 %	0 %	383080679
42	NC_017070	A	8	8	2261	2268	100 %	0 %	0 %	0 %	383080679
43	NC_017070	A	6	6	2272	2277	100 %	0 %	0 %	0 %	383080679
44	NC_017070	A	6	6	2284	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	383080679
45	NC_017070	AGA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080679
46	NC_017070	CGT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080679
47	NC_017070	AAG	2	6	2344	2349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080679
48	NC_017070	TTA	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080679
49	NC_017070	AGA	2	6	2641	2646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
50	NC_017070	GAA	3	9	2666	2674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
51	NC_017070	GAA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
52	NC_017070	TGT	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080680
53	NC_017070	GTATT	2	10	2852	2861	20 %	60 %	20 %	0 %	383080680
54	NC_017070	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080680
55	NC_017070	AATG	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	383080680
56	NC_017070	GCA	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080680
57	NC_017070	A	7	7	3004	3010	100 %	0 %	0 %	0 %	383080680
58	NC_017070	GGTCA	2	10	3017	3026	20 %	20 %	40 %	20 %	383080680
59	NC_017070	AGA	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
60	NC_017070	ATG	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080680
61	NC_017070	AAG	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
62	NC_017070	TGA	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080680
63	NC_017070	TA	3	6	3150	3155	50 %	50 %	0 %	0 %	383080680
64	NC_017070	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080681
65	NC_017070	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080681
66	NC_017070	TCA	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080681
67	NC_017070	AT	3	6	3558	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	383080681
68	NC_017070	CAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080681
69	NC_017070	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080681
70	NC_017070	TAA	2	6	3744	3749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080681
71	NC_017070	AGC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080681
72	NC_017070	TC	3	6	3776	3781	0 %	50 %	0 %	50 %	383080681
73	NC_017070	ACA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
74	NC_017070	CTT	2	6	3790	3795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080681
75	NC_017070	ACA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
76	NC_017070	GTT	2	6	3826	3831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080681
77	NC_017070	CAA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
78	NC_017070	CTG	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080681
79	NC_017070	ATA	2	6	3989	3994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080681
80	NC_017070	T	7	7	3996	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	383080681
81	NC_017070	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080681
82	NC_017070	CAG	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080681
83	NC_017070	TGA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080681
84	NC_017070	GGT	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080681
85	NC_017070	TGGAA	2	10	4161	4170	40 %	20 %	40 %	0 %	383080681
86	NC_017070	AAC	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
87	NC_017070	AT	3	6	4487	4492	50 %	50 %	0 %	0 %	383080681
88	NC_017070	TA	3	6	4493	4498	50 %	50 %	0 %	0 %	383080681
89	NC_017070	ATC	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080682
90	NC_017070	CTT	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080682
91	NC_017070	CTT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080682
92	NC_017070	GCG	2	6	4836	4841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080682
93	NC_017070	TCA	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080682
94	NC_017070	TGC	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080682
95	NC_017070	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080682
96	NC_017070	TTC	2	6	5048	5053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080682
97	NC_017070	T	6	6	5058	5063	0 %	100 %	0 %	0 %	383080682
98	NC_017070	T	6	6	5210	5215	0 %	100 %	0 %	0 %	383080682
99	NC_017070	TCA	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080682
100	NC_017070	GACA	2	8	5349	5356	50 %	0 %	25 %	25 %	383080682
101	NC_017070	T	6	6	5423	5428	0 %	100 %	0 %	0 %	383080682
102	NC_017070	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080682
103	NC_017070	CTG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080682
104	NC_017070	CAC	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080682
105	NC_017070	T	6	6	5554	5559	0 %	100 %	0 %	0 %	383080682
106	NC_017070	GTAG	2	8	5666	5673	25 %	25 %	50 %	0 %	383080682
107	NC_017070	TATG	2	8	5696	5703	25 %	50 %	25 %	0 %	383080682
108	NC_017070	ACA	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080682
109	NC_017070	GAA	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080683
110	NC_017070	GCT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080683
111	NC_017070	CCCT	2	8	6277	6284	0 %	25 %	0 %	75 %	383080683
112	NC_017070	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080683
113	NC_017070	AAG	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
114	NC_017070	AGC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080684
115	NC_017070	TGGTC	2	10	6496	6505	0 %	40 %	40 %	20 %	383080684
116	NC_017070	TTG	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080684
117	NC_017070	TGC	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080684
118	NC_017070	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080684
119	NC_017070	AGG	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
120	NC_017070	GC	3	6	6807	6812	0 %	0 %	50 %	50 %	383080684
121	NC_017070	TGG	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080684
122	NC_017070	CGG	2	6	6919	6924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080684
123	NC_017070	TATC	2	8	7016	7023	25 %	50 %	0 %	25 %	383080684
124	NC_017070	TG	3	6	7027	7032	0 %	50 %	50 %	0 %	383080684
125	NC_017070	TTG	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080684
126	NC_017070	GAA	2	6	7065	7070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
127	NC_017070	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
128	NC_017070	GGA	2	6	7239	7244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
129	NC_017070	GAT	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080684
130	NC_017070	TCC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383080684
131	NC_017070	GGA	2	6	7352	7357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
132	NC_017070	CCG	2	6	7369	7374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080684
133	NC_017070	GCCT	2	8	7411	7418	0 %	25 %	25 %	50 %	383080684
134	NC_017070	CTG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080684
135	NC_017070	CAT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080684
136	NC_017070	CCG	2	6	7550	7555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080684
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266	NC_017070	CCAT	2	8	15192	15199	25 %	25 %	0 %	50 %	383080689
267	NC_017070	CAT	2	6	15247	15252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080689
268	NC_017070	GAT	2	6	15272	15277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080689
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393	NC_017070	GCCT	2	8	22995	23002	0 %	25 %	25 %	50 %	383080698
394	NC_017070	CAG	2	6	23155	23160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080698
395	NC_017070	TCA	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080698
396	NC_017070	GCT	2	6	23238	23243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080698
397	NC_017070	GTT	2	6	23247	23252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080698
398	NC_017070	AT	3	6	23786	23791	50 %	50 %	0 %	0 %	383080699
399	NC_017070	TGC	2	6	23924	23929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080699
400	NC_017070	ACTTAA	2	12	23969	23980	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383080699
401	NC_017070	GAA	2	6	24006	24011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080699
402	NC_017070	AAT	2	6	24017	24022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080699
403	NC_017070	TAC	2	6	24050	24055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080700
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405	NC_017070	AATC	2	8	24282	24289	50 %	25 %	0 %	25 %	383080700
406	NC_017070	AAGAA	2	10	24295	24304	80 %	0 %	20 %	0 %	383080700
407	NC_017070	CTG	2	6	24323	24328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080700
408	NC_017070	ATG	2	6	24417	24422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080700
409	NC_017070	CGA	2	6	24502	24507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080700
410	NC_017070	TTC	2	6	24538	24543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080700
411	NC_017070	GGT	2	6	24548	24553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080700
412	NC_017070	AAGG	2	8	24719	24726	50 %	0 %	50 %	0 %	383080700
413	NC_017070	ACT	2	6	24728	24733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080700
414	NC_017070	T	6	6	24733	24738	0 %	100 %	0 %	0 %	383080700
415	NC_017070	CTG	2	6	24879	24884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080700
416	NC_017070	CTTC	2	8	24961	24968	0 %	50 %	0 %	50 %	383080700
417	NC_017070	AAT	2	6	25028	25033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080700
418	NC_017070	GAA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080700
419	NC_017070	CAG	2	6	25116	25121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080700
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422	NC_017070	TAA	2	6	25428	25433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080701
423	NC_017070	TGC	2	6	25500	25505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080701
424	NC_017070	TTG	2	6	25524	25529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080701
425	NC_017070	CCG	2	6	25543	25548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080701
426	NC_017070	TA	3	6	25561	25566	50 %	50 %	0 %	0 %	383080701
427	NC_017070	ACC	2	6	25706	25711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080701
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431	NC_017070	CTG	2	6	25856	25861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080701
432	NC_017070	ACT	2	6	25971	25976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080701
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440	NC_017070	ATA	2	6	27057	27062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080704
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443	NC_017070	GTG	2	6	27251	27256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080704
444	NC_017070	TCA	2	6	27350	27355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
445	NC_017070	AC	3	6	27456	27461	50 %	0 %	0 %	50 %	383080704
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452	NC_017070	A	6	6	27921	27926	100 %	0 %	0 %	0 %	383080704
453	NC_017070	TCA	2	6	28035	28040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080704
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459	NC_017070	AAT	2	6	28535	28540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080705
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462	NC_017070	T	6	6	28756	28761	0 %	100 %	0 %	0 %	383080706
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471	NC_017070	AT	3	6	29595	29600	50 %	50 %	0 %	0 %	383080707
472	NC_017070	TA	3	6	29603	29608	50 %	50 %	0 %	0 %	383080707
473	NC_017070	ATT	2	6	29632	29637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080707