MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 55789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	GAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
2	NC_017068	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	383752829
3	NC_017068	GCA	2	6	530	535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
4	NC_017068	GAA	3	9	539	547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
5	NC_017068	A	6	6	572	577	100 %	0 %	0 %	0 %	383752829
6	NC_017068	CTC	2	6	676	681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752829
7	NC_017068	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752829
8	NC_017068	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
9	NC_017068	TATG	2	8	796	803	25 %	50 %	25 %	0 %	383752829
10	NC_017068	ATC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
11	NC_017068	CAG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
12	NC_017068	GAA	2	6	1031	1036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
13	NC_017068	TTC	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
14	NC_017068	ATG	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752829
15	NC_017068	TCA	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
16	NC_017068	GAA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
17	NC_017068	CGA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
18	NC_017068	ATC	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
19	NC_017068	CTT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
20	NC_017068	AGA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
21	NC_017068	AAG	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
22	NC_017068	CTT	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
23	NC_017068	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752829
24	NC_017068	ACC	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752829
25	NC_017068	ATCA	2	8	1622	1629	50 %	25 %	0 %	25 %	383752829
26	NC_017068	TGAA	2	8	1665	1672	50 %	25 %	25 %	0 %	383752829
27	NC_017068	CCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
28	NC_017068	CCA	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
29	NC_017068	CCT	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752830
30	NC_017068	GCA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752830
31	NC_017068	GCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
32	NC_017068	GCT	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
33	NC_017068	ATC	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752830
34	NC_017068	GCT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
35	NC_017068	ATCAG	2	10	2642	2651	40 %	20 %	20 %	20 %	383752830
36	NC_017068	TGA	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752830
37	NC_017068	GGC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752830
38	NC_017068	CTT	2	6	2861	2866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752830
39	NC_017068	GAA	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
40	NC_017068	GATG	2	8	2955	2962	25 %	25 %	50 %	0 %	383752830
41	NC_017068	GAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
42	NC_017068	AGG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752830
43	NC_017068	GCG	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752831
44	NC_017068	CGC	3	9	3251	3259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752831
45	NC_017068	GTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752831
46	NC_017068	AGC	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
47	NC_017068	TTCAG	2	10	3572	3581	20 %	40 %	20 %	20 %	383752832
48	NC_017068	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
49	NC_017068	ACC	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752832
50	NC_017068	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752832
51	NC_017068	T	6	6	3662	3667	0 %	100 %	0 %	0 %	383752832
52	NC_017068	T	6	6	3717	3722	0 %	100 %	0 %	0 %	383752832
53	NC_017068	TCAG	2	8	3734	3741	25 %	25 %	25 %	25 %	383752832
54	NC_017068	GAA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752832
55	NC_017068	GGC	2	6	3870	3875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
56	NC_017068	AGG	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752832
57	NC_017068	GCG	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
58	NC_017068	TAA	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752832
59	NC_017068	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
60	NC_017068	ATC	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752832
61	NC_017068	CAG	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
62	NC_017068	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
63	NC_017068	TGA	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
64	NC_017068	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
65	NC_017068	TCA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752833
66	NC_017068	A	7	7	4523	4529	100 %	0 %	0 %	0 %	383752833
67	NC_017068	TAT	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752833
68	NC_017068	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
69	NC_017068	GAAT	2	8	4656	4663	50 %	25 %	25 %	0 %	383752833
70	NC_017068	GAT	3	9	4668	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
71	NC_017068	GATT	2	8	4718	4725	25 %	50 %	25 %	0 %	383752833
72	NC_017068	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752833
73	NC_017068	ACG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
74	NC_017068	GGC	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752833
75	NC_017068	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
76	NC_017068	GCC	2	6	5035	5040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
77	NC_017068	AGC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
78	NC_017068	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
79	NC_017068	GCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
80	NC_017068	GCC	2	6	5256	5261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
81	NC_017068	AGC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
82	NC_017068	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
83	NC_017068	GAG	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752833
84	NC_017068	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752834
85	NC_017068	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752834
86	NC_017068	ATC	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752834
87	NC_017068	GCG	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
88	NC_017068	GGC	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
89	NC_017068	GATG	2	8	5676	5683	25 %	25 %	50 %	0 %	383752834
90	NC_017068	CTG	2	6	5684	5689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752834
91	NC_017068	ATG	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752834
92	NC_017068	GAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
93	NC_017068	ACC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752835
94	NC_017068	AGC	2	6	5823	5828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
95	NC_017068	CAGATC	2	12	5868	5879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383752835
96	NC_017068	GTAT	2	8	5914	5921	25 %	50 %	25 %	0 %	383752835
97	NC_017068	GCA	2	6	5926	5931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
98	NC_017068	AGT	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
99	NC_017068	CGA	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
100	NC_017068	CCAT	2	8	6025	6032	25 %	25 %	0 %	50 %	383752835
101	NC_017068	CATG	2	8	6083	6090	25 %	25 %	25 %	25 %	383752835
102	NC_017068	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
103	NC_017068	CGG	2	6	6137	6142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
104	NC_017068	CGG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
105	NC_017068	GT	3	6	6193	6198	0 %	50 %	50 %	0 %	383752835
106	NC_017068	CGT	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
107	NC_017068	TCT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752835
108	NC_017068	GAC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
109	NC_017068	ATG	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
110	NC_017068	GGC	2	6	6498	6503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
111	NC_017068	AAG	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
112	NC_017068	GAT	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
113	NC_017068	GGC	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
114	NC_017068	TGC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
115	NC_017068	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
116	NC_017068	TCA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
117	NC_017068	AGACCA	2	12	6844	6855	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383752835
118	NC_017068	TC	3	6	6908	6913	0 %	50 %	0 %	50 %	383752835
119	NC_017068	GAA	2	6	6924	6929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
120	NC_017068	TGCCCG	2	12	6974	6985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383752835
121	NC_017068	GCAAG	2	10	6997	7006	40 %	0 %	40 %	20 %	383752835
122	NC_017068	ATCT	2	8	7098	7105	25 %	50 %	0 %	25 %	383752835
123	NC_017068	GGC	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
124	NC_017068	CCG	2	6	7151	7156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
125	NC_017068	GAT	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
126	NC_017068	ATC	3	9	7314	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
127	NC_017068	GCC	2	6	7430	7435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
128	NC_017068	ACT	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
129	NC_017068	GCCG	2	8	7599	7606	0 %	0 %	50 %	50 %	383752835
130	NC_017068	TGC	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
131	NC_017068	GAA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
132	NC_017068	GAGC	2	8	7864	7871	25 %	0 %	50 %	25 %	383752836
133	NC_017068	TTAC	2	8	7901	7908	25 %	50 %	0 %	25 %	383752836
134	NC_017068	GTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
135	NC_017068	TGG	2	6	8001	8006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
136	NC_017068	GCT	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
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138	NC_017068	TGG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
139	NC_017068	TGG	2	6	8070	8075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
140	NC_017068	GGCA	2	8	8116	8123	25 %	0 %	50 %	25 %	383752836
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142	NC_017068	CTG	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
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146	NC_017068	TA	3	6	8438	8443	50 %	50 %	0 %	0 %	383752836
147	NC_017068	GCGG	2	8	8444	8451	0 %	0 %	75 %	25 %	383752836
148	NC_017068	CTT	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752836
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152	NC_017068	TGC	2	6	8640	8645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
153	NC_017068	CTGT	2	8	8665	8672	0 %	50 %	25 %	25 %	383752836
154	NC_017068	T	6	6	8737	8742	0 %	100 %	0 %	0 %	383752836
155	NC_017068	CGG	2	6	8792	8797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
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159	NC_017068	TGGC	2	8	8952	8959	0 %	25 %	50 %	25 %	383752837
160	NC_017068	GAAAC	2	10	9147	9156	60 %	0 %	20 %	20 %	383752837
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163	NC_017068	ATC	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
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248	NC_017068	AAAG	2	8	13325	13332	75 %	0 %	25 %	0 %	383752840
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259	NC_017068	GC	3	6	13875	13880	0 %	0 %	50 %	50 %	383752840
260	NC_017068	GCA	2	6	13939	13944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752840
261	NC_017068	AGC	2	6	13978	13983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752840
262	NC_017068	TGCTC	2	10	13996	14005	0 %	40 %	20 %	40 %	383752840
263	NC_017068	GGC	2	6	14010	14015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752840
264	NC_017068	TGGAA	2	10	14056	14065	40 %	20 %	40 %	0 %	383752840
265	NC_017068	TGG	2	6	14071	14076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752840
266	NC_017068	CTAT	2	8	14104	14111	25 %	50 %	0 %	25 %	383752840
267	NC_017068	TGA	2	6	14114	14119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752840
268	NC_017068	GGCA	2	8	14123	14130	25 %	0 %	50 %	25 %	383752840
269	NC_017068	TCA	3	9	14191	14199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
270	NC_017068	GGGC	2	8	14223	14230	0 %	0 %	75 %	25 %	383752840
271	NC_017068	GCC	2	6	14353	14358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752840
272	NC_017068	TAC	2	6	14448	14453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
273	NC_017068	ATC	2	6	14487	14492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752840
274	NC_017068	CTT	2	6	14534	14539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752840
275	NC_017068	TGG	2	6	15047	15052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752841
276	NC_017068	GAA	2	6	15114	15119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752841
277	NC_017068	CTG	2	6	15217	15222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752841
278	NC_017068	ATG	2	6	15353	15358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752841
279	NC_017068	ACG	2	6	15361	15366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752841
280	NC_017068	TGA	3	9	15474	15482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752841
281	NC_017068	GAAG	2	8	15498	15505	50 %	0 %	50 %	0 %	383752841
282	NC_017068	GGC	2	6	15538	15543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752841
283	NC_017068	CGCCTG	2	12	15580	15591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383752841
284	NC_017068	ATC	2	6	15592	15597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752841
285	NC_017068	CAA	2	6	15756	15761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752841
286	NC_017068	GAA	2	6	15763	15768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752841
287	NC_017068	CGC	2	6	15785	15790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752841
288	NC_017068	AGA	2	6	15794	15799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752841
289	NC_017068	CAT	2	6	15831	15836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752841
290	NC_017068	TGC	2	6	15879	15884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752841
291	NC_017068	GTTCA	2	10	15898	15907	20 %	40 %	20 %	20 %	383752841
292	NC_017068	TGC	3	9	15917	15925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752841
293	NC_017068	CCA	2	6	15983	15988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752841
294	NC_017068	GGC	2	6	16000	16005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752841
295	NC_017068	CGG	2	6	16077	16082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752841
296	NC_017068	CTGC	2	8	16153	16160	0 %	25 %	25 %	50 %	383752841
297	NC_017068	TGC	2	6	16179	16184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752841
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299	NC_017068	ATC	2	6	16285	16290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752841
300	NC_017068	CAT	2	6	16296	16301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752841
301	NC_017068	CT	3	6	16305	16310	0 %	50 %	0 %	50 %	383752841
302	NC_017068	GGC	2	6	16366	16371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752841
303	NC_017068	GGC	2	6	16381	16386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752841
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328	NC_017068	GAA	2	6	17476	17481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752842
329	NC_017068	ATG	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752842
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342	NC_017068	TTC	2	6	18200	18205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752842
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344	NC_017068	GCC	2	6	18221	18226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752842
345	NC_017068	GAA	2	6	18247	18252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752842
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354	NC_017068	CCA	2	6	19438	19443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752843
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372	NC_017068	ATG	2	6	20032	20037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752844
373	NC_017068	TGA	2	6	20045	20050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752844
374	NC_017068	GAAT	2	8	20060	20067	50 %	25 %	25 %	0 %	383752844
375	NC_017068	TGG	2	6	20159	20164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752844
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377	NC_017068	ATC	2	6	20209	20214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752844
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379	NC_017068	CAT	2	6	20286	20291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752844
380	NC_017068	ATG	2	6	20386	20391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752844
381	NC_017068	TGC	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752844
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383	NC_017068	GGCG	2	8	20434	20441	0 %	0 %	75 %	25 %	383752844
384	NC_017068	GAT	2	6	20449	20454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752844
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