MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 58253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017052	CAG	2	6	181748	181753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490131
3002	NC_017052	CTA	2	6	181796	181801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490131
3003	NC_017052	GTG	3	9	181823	181831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490131
3004	NC_017052	AG	3	6	182002	182007	50 %	0 %	50 %	0 %	383490131
3005	NC_017052	CCAGG	2	10	182032	182041	20 %	0 %	40 %	40 %	383490131
3006	NC_017052	GGC	2	6	182050	182055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490131
3007	NC_017052	AGCC	2	8	182072	182079	25 %	0 %	25 %	50 %	383490131
3008	NC_017052	CAA	2	6	182132	182137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490131
3009	NC_017052	C	6	6	182153	182158	0 %	0 %	0 %	100 %	383490131
3010	NC_017052	TGG	2	6	182391	182396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490132
3011	NC_017052	ATT	2	6	182419	182424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490132
3012	NC_017052	CAAT	2	8	182507	182514	50 %	25 %	0 %	25 %	383490132
3013	NC_017052	TGG	2	6	182568	182573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490132
3014	NC_017052	C	6	6	182669	182674	0 %	0 %	0 %	100 %	383490132
3015	NC_017052	GCC	2	6	182746	182751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490132
3016	NC_017052	GTG	2	6	182762	182767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490132
3017	NC_017052	TTTA	2	8	182833	182840	25 %	75 %	0 %	0 %	383490132
3018	NC_017052	GTG	2	6	182846	182851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490132
3019	NC_017052	TCC	2	6	182857	182862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490132
3020	NC_017052	CAAA	2	8	182875	182882	75 %	0 %	0 %	25 %	383490132
3021	NC_017052	CAG	2	6	182897	182902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490132
3022	NC_017052	AGA	2	6	182956	182961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490132
3023	NC_017052	AGA	2	6	182986	182991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490132
3024	NC_017052	TGG	2	6	183033	183038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490132
3025	NC_017052	A	6	6	183039	183044	100 %	0 %	0 %	0 %	383490132
3026	NC_017052	ATC	2	6	183051	183056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490132
3027	NC_017052	CCTC	2	8	183087	183094	0 %	25 %	0 %	75 %	383490132
3028	NC_017052	GTTG	2	8	183096	183103	0 %	50 %	50 %	0 %	383490132
3029	NC_017052	CCG	2	6	183176	183181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490132
3030	NC_017052	TGGCAT	2	12	183226	183237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383490132
3031	NC_017052	TGA	2	6	183238	183243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490132
3032	NC_017052	AGCCA	2	10	183484	183493	40 %	0 %	20 %	40 %	383490133
3033	NC_017052	CCT	2	6	183543	183548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490133
3034	NC_017052	AAC	2	6	183560	183565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490133
3035	NC_017052	ATG	2	6	183628	183633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490133
3036	NC_017052	GAA	2	6	183640	183645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490133
3037	NC_017052	ATG	2	6	183665	183670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490133
3038	NC_017052	TGG	2	6	183765	183770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490133
3039	NC_017052	TGTGGT	2	12	183808	183819	0 %	50 %	50 %	0 %	383490133
3040	NC_017052	T	6	6	183936	183941	0 %	100 %	0 %	0 %	383490134
3041	NC_017052	CAC	2	6	184055	184060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490134
3042	NC_017052	AAT	2	6	184085	184090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490134
3043	NC_017052	TAAA	2	8	184153	184160	75 %	25 %	0 %	0 %	383490134
3044	NC_017052	ACA	2	6	184165	184170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490134
3045	NC_017052	GTG	2	6	184254	184259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490134
3046	NC_017052	TTG	2	6	184382	184387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490134
3047	NC_017052	TAA	2	6	184493	184498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490134
3048	NC_017052	GTAA	2	8	184514	184521	50 %	25 %	25 %	0 %	383490134
3049	NC_017052	A	6	6	184520	184525	100 %	0 %	0 %	0 %	383490134
3050	NC_017052	GTT	2	6	184642	184647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490134
3051	NC_017052	TAG	2	6	184733	184738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490134
3052	NC_017052	AAG	2	6	184739	184744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490134
3053	NC_017052	AGA	2	6	184849	184854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490134
3054	NC_017052	AGG	2	6	184863	184868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490134
3055	NC_017052	GAG	2	6	185007	185012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490135
3056	NC_017052	GCG	2	6	185086	185091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490135
3057	NC_017052	A	6	6	185140	185145	100 %	0 %	0 %	0 %	383490135
3058	NC_017052	CTT	2	6	185171	185176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490135
3059	NC_017052	CGC	2	6	185301	185306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490135
3060	NC_017052	GCT	2	6	185342	185347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490135
3061	NC_017052	TGG	3	9	185411	185419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490135
3062	NC_017052	TAAC	2	8	185422	185429	50 %	25 %	0 %	25 %	383490135
3063	NC_017052	AGGC	2	8	185486	185493	25 %	0 %	50 %	25 %	383490135
3064	NC_017052	TGG	2	6	185495	185500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490135
3065	NC_017052	TTC	2	6	185511	185516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490135
3066	NC_017052	GTG	2	6	185545	185550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490135
3067	NC_017052	TGG	2	6	185575	185580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490135
3068	NC_017052	TCA	2	6	185590	185595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490135
3069	NC_017052	AAT	2	6	185755	185760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490136
3070	NC_017052	CGGT	2	8	185881	185888	0 %	25 %	50 %	25 %	383490136
3071	NC_017052	TGG	2	6	185911	185916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490136
3072	NC_017052	AAC	3	9	185930	185938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490136
3073	NC_017052	TGT	2	6	186052	186057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490136
3074	NC_017052	TGA	2	6	186065	186070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490136
3075	NC_017052	ATCG	2	8	186128	186135	25 %	25 %	25 %	25 %	383490136
3076	NC_017052	CCA	2	6	186152	186157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490136
3077	NC_017052	TTC	2	6	186168	186173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490136
3078	NC_017052	ACCC	2	8	186285	186292	25 %	0 %	0 %	75 %	383490136
3079	NC_017052	CTT	2	6	186308	186313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490136
3080	NC_017052	CGC	2	6	186353	186358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490136
3081	NC_017052	CAT	2	6	186464	186469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490136
3082	NC_017052	CGC	2	6	186503	186508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490136
3083	NC_017052	AAT	2	6	186516	186521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490136
3084	NC_017052	ACT	2	6	186664	186669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490137
3085	NC_017052	T	6	6	186669	186674	0 %	100 %	0 %	0 %	383490137
3086	NC_017052	GTG	2	6	186679	186684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490137
3087	NC_017052	G	6	6	186705	186710	0 %	0 %	100 %	0 %	383490137
3088	NC_017052	CCAG	2	8	186725	186732	25 %	0 %	25 %	50 %	383490137
3089	NC_017052	TCC	2	6	186893	186898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490137
3090	NC_017052	CCA	2	6	187092	187097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3091	NC_017052	CAC	2	6	187120	187125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3092	NC_017052	TCT	2	6	187178	187183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490137
3093	NC_017052	TCC	2	6	187309	187314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490137
3094	NC_017052	ATT	2	6	187396	187401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490137
3095	NC_017052	CGA	2	6	187413	187418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490137
3096	NC_017052	AATA	2	8	187486	187493	75 %	25 %	0 %	0 %	383490137
3097	NC_017052	TGG	2	6	187509	187514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490137
3098	NC_017052	CAA	2	6	187573	187578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490137
3099	NC_017052	GTT	2	6	187611	187616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490137
3100	NC_017052	AGCT	2	8	187644	187651	25 %	25 %	25 %	25 %	383490137
3101	NC_017052	CTT	2	6	187764	187769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490137
3102	NC_017052	CTT	2	6	187809	187814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490137
3103	NC_017052	GGCT	2	8	187815	187822	0 %	25 %	50 %	25 %	383490137
3104	NC_017052	AAAG	2	8	187918	187925	75 %	0 %	25 %	0 %	383490137
3105	NC_017052	CCA	3	9	187962	187970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3106	NC_017052	ACT	2	6	188047	188052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490137
3107	NC_017052	TAG	2	6	188080	188085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490137
3108	NC_017052	TAA	2	6	188103	188108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490137
3109	NC_017052	GGAT	2	8	188228	188235	25 %	25 %	50 %	0 %	383490137
3110	NC_017052	GAA	2	6	188273	188278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490137
3111	NC_017052	AAG	2	6	188313	188318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490137
3112	NC_017052	CGC	2	6	188330	188335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490137
3113	NC_017052	GTT	2	6	188356	188361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490137
3114	NC_017052	GGT	3	9	188380	188388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490137
3115	NC_017052	GGC	2	6	188602	188607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490137
3116	NC_017052	CCA	2	6	188728	188733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490137
3117	NC_017052	C	6	6	188768	188773	0 %	0 %	0 %	100 %	383490137
3118	NC_017052	GAA	2	6	188774	188779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490137
3119	NC_017052	G	6	6	188801	188806	0 %	0 %	100 %	0 %	383490137
3120	NC_017052	CAG	2	6	188839	188844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490137
3121	NC_017052	CAA	2	6	189146	189151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490138
3122	NC_017052	G	6	6	189175	189180	0 %	0 %	100 %	0 %	383490138
3123	NC_017052	GCC	2	6	189292	189297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490138
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3232	NC_017052	AGGAA	2	10	196687	196696	60 %	0 %	40 %	0 %	383490146
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3245	NC_017052	TCG	2	6	197674	197679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490148
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3265	NC_017052	CTAT	2	8	198733	198740	25 %	50 %	0 %	25 %	383490148
3266	NC_017052	GGA	2	6	198817	198822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490148
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3485	NC_017052	CTT	2	6	211947	211952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490157
3486	NC_017052	GTT	2	6	211991	211996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490157
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3488	NC_017052	TCG	2	6	212069	212074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490157
3489	NC_017052	GCAACT	2	12	212114	212125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383490157
3490	NC_017052	GCG	2	6	212186	212191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490157
3491	NC_017052	G	7	7	212203	212209	0 %	0 %	100 %	0 %	383490157
3492	NC_017052	CCGGTG	2	12	212349	212360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383490157
3493	NC_017052	AGG	2	6	212416	212421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490157
3494	NC_017052	ACA	2	6	212435	212440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490157
3495	NC_017052	GGGGTG	2	12	212448	212459	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	383490157
3496	NC_017052	T	6	6	212485	212490	0 %	100 %	0 %	0 %	383490157
3497	NC_017052	G	6	6	212503	212508	0 %	0 %	100 %	0 %	383490157
3498	NC_017052	TGA	2	6	212569	212574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490157
3499	NC_017052	TGC	2	6	212674	212679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490157
3500	NC_017052	CTGTG	2	10	212768	212777	0 %	40 %	40 %	20 %	383490157

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